# TARGET T0210 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0210.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 47 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.016 0.003 0.005 0.012 0.138 0.826 2 Q 0.082 0.050 0.006 0.035 0.104 0.722 3 N 0.068 0.040 0.003 0.054 0.056 0.780 4 A 0.001 0.001 0.009 0.965 0.013 0.012 5 D 0.001 0.001 0.004 0.979 0.013 0.003 6 D 0.001 0.001 0.004 0.980 0.015 0.002 7 F 0.001 0.001 0.003 0.980 0.015 0.002 8 I 0.001 0.001 0.003 0.969 0.022 0.006 9 K 0.001 0.001 0.006 0.964 0.023 0.007 10 F 0.001 0.001 0.003 0.957 0.019 0.020 11 L 0.002 0.010 0.004 0.733 0.065 0.186 12 E 0.002 0.001 0.001 0.017 0.078 0.901 13 L 0.030 0.005 0.005 0.016 0.174 0.769 14 E 0.244 0.088 0.004 0.008 0.182 0.474 15 Q 0.227 0.037 0.005 0.009 0.147 0.575 16 H 0.146 0.020 0.014 0.006 0.423 0.391 17 V 0.101 0.025 0.017 0.005 0.491 0.361 18 E 0.056 0.011 0.018 0.009 0.578 0.328 19 G 0.053 0.009 0.008 0.007 0.538 0.384 20 G 0.161 0.026 0.009 0.033 0.296 0.474 21 F 0.416 0.044 0.014 0.077 0.188 0.261 22 Y 0.562 0.024 0.021 0.172 0.103 0.118 23 R 0.573 0.012 0.035 0.172 0.106 0.102 24 S 0.535 0.012 0.048 0.114 0.129 0.162 25 S 0.490 0.015 0.037 0.113 0.142 0.204 26 Y 0.500 0.030 0.018 0.072 0.135 0.244 27 R 0.386 0.028 0.016 0.067 0.171 0.332 28 S 0.209 0.029 0.024 0.061 0.392 0.284 29 E 0.102 0.013 0.110 0.116 0.507 0.153 30 T 0.060 0.014 0.177 0.132 0.534 0.083 31 A 0.064 0.014 0.192 0.124 0.530 0.076 32 F 0.060 0.018 0.085 0.143 0.468 0.226 33 D 0.023 0.010 0.074 0.102 0.572 0.219 34 P 0.010 0.003 0.082 0.079 0.636 0.189 35 S 0.021 0.014 0.082 0.077 0.535 0.271 36 R 0.072 0.033 0.069 0.076 0.484 0.264 37 Q 0.101 0.021 0.026 0.084 0.264 0.505 38 L 0.246 0.027 0.032 0.386 0.151 0.158 39 W 0.253 0.004 0.028 0.565 0.089 0.061 40 S 0.435 0.005 0.018 0.471 0.044 0.027 41 S 0.393 0.003 0.021 0.538 0.029 0.015 42 I 0.453 0.003 0.021 0.476 0.029 0.017 43 Y 0.337 0.003 0.025 0.593 0.027 0.015 44 F 0.328 0.003 0.018 0.576 0.033 0.042 45 L 0.491 0.023 0.009 0.319 0.052 0.106 46 L 0.203 0.026 0.009 0.143 0.160 0.458 47 R 0.080 0.020 0.014 0.061 0.593 0.233 48 T 0.020 0.007 0.031 0.024 0.781 0.136 49 G 0.023 0.008 0.050 0.033 0.761 0.124 50 E 0.083 0.055 0.040 0.023 0.651 0.149 51 V 0.106 0.028 0.015 0.037 0.321 0.492 52 S 0.141 0.036 0.049 0.051 0.351 0.372 53 H 0.151 0.027 0.082 0.053 0.410 0.278 54 F 0.124 0.014 0.138 0.053 0.347 0.324 55 H 0.147 0.024 0.123 0.067 0.357 0.283 56 R 0.284 0.025 0.049 0.048 0.308 0.285 57 L 0.207 0.032 0.037 0.053 0.278 0.393 58 T 0.110 0.014 0.065 0.015 0.536 0.261 59 A 0.052 0.003 0.213 0.018 0.595 0.120 60 D 0.158 0.004 0.188 0.010 0.519 0.121 61 E 0.614 0.005 0.042 0.006 0.262 0.070 62 M 0.859 0.005 0.010 0.004 0.064 0.058 63 W 0.947 0.005 0.003 0.004 0.022 0.018 64 Y 0.941 0.002 0.006 0.006 0.027 0.018 65 F 0.873 0.003 0.007 0.014 0.051 0.052 66 H 0.702 0.010 0.015 0.018 0.154 0.101 67 A 0.249 0.009 0.015 0.013 0.437 0.277 68 G 0.070 0.007 0.008 0.003 0.527 0.386 69 Q 0.183 0.027 0.007 0.001 0.401 0.380 70 S 0.374 0.010 0.004 0.001 0.154 0.458 71 L 0.861 0.006 0.002 0.001 0.037 0.094 72 T 0.978 0.001 0.001 0.001 0.006 0.016 73 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 74 Y 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 75 M 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 76 I 0.928 0.009 0.001 0.001 0.012 0.051 77 S 0.464 0.021 0.002 0.001 0.454 0.059 78 P 0.020 0.001 0.007 0.001 0.945 0.025 79 E 0.010 0.004 0.006 0.001 0.962 0.018 80 G 0.029 0.012 0.007 0.001 0.920 0.031 81 E 0.207 0.007 0.002 0.002 0.182 0.600 82 L 0.816 0.031 0.001 0.002 0.031 0.120 83 T 0.933 0.003 0.001 0.001 0.017 0.044 84 T 0.971 0.002 0.001 0.002 0.007 0.017 85 A 0.970 0.002 0.001 0.003 0.009 0.016 86 Q 0.962 0.002 0.001 0.003 0.011 0.020 87 L 0.860 0.003 0.002 0.006 0.039 0.090 88 G 0.493 0.007 0.006 0.012 0.178 0.306 89 L 0.308 0.038 0.021 0.033 0.310 0.290 90 D 0.186 0.031 0.046 0.036 0.463 0.237 91 L 0.081 0.015 0.154 0.105 0.515 0.130 92 A 0.049 0.012 0.157 0.139 0.522 0.120 93 A 0.030 0.007 0.257 0.175 0.439 0.092 94 G 0.037 0.004 0.029 0.031 0.519 0.380 95 E 0.186 0.032 0.019 0.006 0.289 0.468 96 R 0.453 0.025 0.006 0.004 0.128 0.386 97 P 0.665 0.012 0.009 0.004 0.093 0.217 98 Q 0.802 0.013 0.004 0.003 0.054 0.124 99 F 0.937 0.003 0.002 0.001 0.019 0.038 100 L 0.961 0.003 0.001 0.001 0.009 0.025 101 V 0.916 0.007 0.001 0.001 0.021 0.055 102 P 0.583 0.011 0.005 0.004 0.278 0.119 103 K 0.043 0.003 0.050 0.022 0.802 0.081 104 G 0.041 0.003 0.056 0.016 0.813 0.071 105 C 0.380 0.027 0.040 0.022 0.446 0.085 106 I 0.689 0.024 0.005 0.014 0.070 0.198 107 F 0.878 0.014 0.005 0.010 0.033 0.061 108 G 0.805 0.010 0.016 0.011 0.067 0.091 109 S 0.649 0.008 0.017 0.018 0.113 0.195 110 A 0.479 0.019 0.018 0.019 0.173 0.292 111 M 0.404 0.046 0.017 0.022 0.204 0.307 112 N 0.194 0.025 0.008 0.006 0.638 0.128 113 Q 0.053 0.006 0.025 0.004 0.870 0.042 114 D 0.025 0.002 0.025 0.003 0.909 0.036 115 G 0.228 0.012 0.020 0.003 0.671 0.066 116 F 0.699 0.013 0.003 0.004 0.098 0.183 117 S 0.899 0.014 0.001 0.003 0.020 0.064 118 L 0.956 0.006 0.001 0.003 0.010 0.024 119 V 0.935 0.003 0.002 0.008 0.020 0.032 120 G 0.830 0.003 0.007 0.016 0.062 0.082 121 C 0.688 0.005 0.026 0.037 0.144 0.101 122 M 0.681 0.014 0.021 0.024 0.161 0.098 123 V 0.525 0.042 0.018 0.026 0.229 0.160 124 S 0.279 0.017 0.035 0.017 0.525 0.127 125 P 0.129 0.005 0.040 0.021 0.598 0.207 126 G 0.088 0.008 0.058 0.017 0.666 0.163 127 F 0.309 0.030 0.033 0.014 0.479 0.135 128 T 0.339 0.037 0.024 0.016 0.323 0.261 129 F 0.130 0.020 0.188 0.038 0.488 0.136 130 D 0.039 0.003 0.154 0.034 0.620 0.150 131 D 0.065 0.005 0.243 0.051 0.486 0.151 132 F 0.216 0.034 0.185 0.039 0.379 0.146 133 E 0.333 0.019 0.084 0.032 0.248 0.284 134 L 0.381 0.014 0.124 0.037 0.246 0.196 135 F 0.307 0.016 0.032 0.032 0.261 0.351 136 S 0.132 0.007 0.013 0.037 0.288 0.523 137 Q 0.026 0.002 0.072 0.434 0.258 0.208 138 E 0.025 0.003 0.052 0.579 0.204 0.138 139 A 0.006 0.002 0.082 0.794 0.095 0.021 140 L 0.005 0.001 0.058 0.851 0.056 0.029 141 L 0.002 0.001 0.126 0.792 0.060 0.018 142 A 0.001 0.001 0.106 0.794 0.071 0.027 143 M 0.001 0.001 0.056 0.687 0.100 0.155 144 Y 0.001 0.003 0.042 0.358 0.160 0.436 145 P 0.001 0.002 0.071 0.719 0.095 0.111 146 Q 0.001 0.001 0.056 0.842 0.058 0.041 147 H 0.001 0.001 0.014 0.957 0.013 0.014 148 K 0.001 0.001 0.002 0.995 0.002 0.001 149 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 150 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 151 V 0.001 0.001 0.002 0.994 0.003 0.001 152 Q 0.001 0.001 0.003 0.989 0.006 0.002 153 K 0.001 0.001 0.004 0.979 0.010 0.007 154 L 0.001 0.001 0.002 0.950 0.018 0.029 155 S 0.006 0.007 0.007 0.613 0.100 0.268 156 R 0.015 0.005 0.052 0.384 0.243 0.302 157 P 0.017 0.005 0.180 0.191 0.315 0.292 158 E 0.018 0.006 0.243 0.151 0.259 0.323 159 V 0.017 0.013 0.044 0.072 0.138 0.716 160 N 0.001 0.001 0.002 0.006 0.043 0.947