# TARGET T0210 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0210.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 47 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 Q 0.006 0.059 0.008 0.058 0.017 0.045 0.806 3 N 0.004 0.040 0.003 0.147 0.302 0.023 0.481 4 A 0.001 0.001 0.006 0.948 0.006 0.011 0.029 5 D 0.001 0.001 0.004 0.968 0.003 0.014 0.010 6 D 0.001 0.001 0.003 0.986 0.002 0.007 0.002 7 F 0.001 0.001 0.001 0.991 0.004 0.003 0.002 8 I 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.005 0.003 9 K 0.001 0.001 0.005 0.966 0.002 0.025 0.002 10 F 0.001 0.001 0.010 0.880 0.002 0.105 0.002 11 L 0.001 0.004 0.013 0.427 0.024 0.512 0.018 12 E 0.004 0.010 0.008 0.065 0.121 0.505 0.287 13 L 0.009 0.017 0.007 0.008 0.203 0.032 0.724 14 E 0.049 0.016 0.014 0.007 0.210 0.024 0.681 15 Q 0.077 0.041 0.023 0.008 0.190 0.047 0.613 16 H 0.050 0.038 0.020 0.008 0.099 0.026 0.759 17 V 0.032 0.011 0.053 0.010 0.178 0.289 0.428 18 E 0.012 0.006 0.040 0.009 0.193 0.663 0.077 19 G 0.030 0.012 0.057 0.015 0.225 0.390 0.270 20 G 0.111 0.026 0.036 0.029 0.208 0.096 0.493 21 F 0.399 0.042 0.042 0.066 0.123 0.062 0.266 22 Y 0.590 0.031 0.040 0.106 0.048 0.035 0.151 23 R 0.628 0.016 0.043 0.145 0.027 0.030 0.111 24 S 0.617 0.017 0.040 0.126 0.036 0.038 0.126 25 S 0.492 0.014 0.042 0.120 0.076 0.052 0.204 26 Y 0.443 0.022 0.038 0.070 0.123 0.062 0.241 27 R 0.255 0.026 0.032 0.057 0.188 0.046 0.396 28 S 0.112 0.020 0.029 0.031 0.107 0.041 0.660 29 E 0.023 0.008 0.275 0.122 0.104 0.340 0.127 30 T 0.019 0.011 0.274 0.089 0.174 0.266 0.166 31 A 0.016 0.013 0.224 0.083 0.204 0.161 0.299 32 F 0.009 0.008 0.101 0.091 0.171 0.353 0.268 33 D 0.007 0.006 0.085 0.073 0.171 0.406 0.252 34 P 0.010 0.005 0.061 0.082 0.257 0.295 0.290 35 S 0.016 0.010 0.042 0.157 0.209 0.259 0.308 36 R 0.020 0.025 0.025 0.322 0.190 0.074 0.344 37 Q 0.034 0.014 0.016 0.454 0.113 0.047 0.321 38 L 0.037 0.005 0.017 0.784 0.022 0.049 0.086 39 W 0.060 0.004 0.014 0.819 0.025 0.028 0.051 40 S 0.131 0.002 0.017 0.797 0.011 0.013 0.028 41 S 0.201 0.002 0.016 0.745 0.009 0.011 0.016 42 I 0.100 0.001 0.023 0.854 0.004 0.008 0.010 43 Y 0.075 0.001 0.044 0.847 0.006 0.016 0.011 44 F 0.078 0.001 0.054 0.796 0.007 0.050 0.014 45 L 0.067 0.008 0.063 0.643 0.023 0.169 0.026 46 L 0.069 0.010 0.023 0.296 0.194 0.184 0.225 47 R 0.023 0.007 0.017 0.032 0.209 0.209 0.503 48 T 0.004 0.004 0.030 0.017 0.229 0.652 0.064 49 G 0.010 0.003 0.029 0.006 0.314 0.525 0.113 50 E 0.067 0.016 0.063 0.029 0.252 0.104 0.470 51 V 0.212 0.087 0.052 0.062 0.131 0.069 0.387 52 S 0.215 0.043 0.082 0.073 0.115 0.052 0.420 53 H 0.170 0.016 0.247 0.145 0.083 0.145 0.194 54 F 0.249 0.012 0.232 0.129 0.069 0.133 0.176 55 H 0.335 0.016 0.171 0.099 0.079 0.085 0.217 56 R 0.407 0.038 0.065 0.086 0.080 0.062 0.262 57 L 0.318 0.040 0.016 0.048 0.095 0.029 0.454 58 T 0.204 0.022 0.021 0.040 0.095 0.035 0.584 59 A 0.097 0.013 0.124 0.218 0.136 0.241 0.172 60 D 0.078 0.007 0.107 0.227 0.175 0.305 0.100 61 E 0.310 0.010 0.070 0.286 0.093 0.075 0.156 62 M 0.531 0.012 0.012 0.247 0.025 0.019 0.155 63 W 0.431 0.003 0.012 0.442 0.037 0.016 0.061 64 Y 0.631 0.005 0.016 0.278 0.012 0.014 0.043 65 F 0.535 0.009 0.021 0.322 0.015 0.037 0.062 66 H 0.369 0.011 0.027 0.270 0.065 0.124 0.134 67 A 0.094 0.004 0.023 0.094 0.233 0.377 0.173 68 G 0.026 0.003 0.010 0.006 0.502 0.285 0.168 69 Q 0.066 0.009 0.009 0.002 0.395 0.078 0.440 70 S 0.296 0.011 0.005 0.001 0.226 0.066 0.395 71 L 0.833 0.006 0.002 0.001 0.028 0.006 0.123 72 T 0.978 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.013 73 I 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 74 Y 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 75 M 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 76 I 0.962 0.005 0.001 0.001 0.005 0.001 0.028 77 S 0.507 0.005 0.001 0.001 0.017 0.004 0.465 78 P 0.026 0.002 0.007 0.001 0.081 0.851 0.032 79 E 0.007 0.001 0.008 0.001 0.081 0.891 0.011 80 G 0.059 0.003 0.006 0.001 0.608 0.158 0.165 81 E 0.229 0.017 0.006 0.001 0.136 0.088 0.523 82 L 0.840 0.024 0.001 0.001 0.023 0.007 0.105 83 T 0.925 0.006 0.001 0.001 0.011 0.001 0.056 84 T 0.962 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.028 85 A 0.948 0.003 0.002 0.001 0.006 0.003 0.037 86 Q 0.919 0.005 0.002 0.003 0.011 0.005 0.055 87 L 0.769 0.007 0.003 0.006 0.026 0.011 0.177 88 G 0.550 0.008 0.005 0.010 0.095 0.024 0.308 89 L 0.381 0.009 0.028 0.041 0.148 0.084 0.308 90 D 0.275 0.027 0.058 0.078 0.118 0.125 0.319 91 L 0.130 0.016 0.178 0.181 0.113 0.205 0.177 92 A 0.066 0.009 0.212 0.131 0.149 0.245 0.187 93 A 0.005 0.001 0.082 0.048 0.068 0.776 0.021 94 G 0.007 0.001 0.026 0.009 0.096 0.800 0.060 95 E 0.124 0.019 0.011 0.008 0.170 0.043 0.625 96 R 0.451 0.070 0.005 0.005 0.058 0.011 0.401 97 P 0.427 0.006 0.010 0.005 0.042 0.013 0.497 98 Q 0.857 0.004 0.010 0.002 0.030 0.009 0.088 99 F 0.952 0.002 0.002 0.001 0.007 0.002 0.036 100 L 0.956 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.034 101 V 0.876 0.011 0.001 0.001 0.008 0.001 0.102 102 P 0.372 0.005 0.004 0.001 0.032 0.006 0.580 103 K 0.015 0.001 0.018 0.001 0.098 0.841 0.026 104 G 0.019 0.001 0.018 0.001 0.122 0.815 0.024 105 C 0.411 0.015 0.015 0.004 0.179 0.024 0.351 106 I 0.892 0.030 0.002 0.002 0.005 0.005 0.064 107 F 0.941 0.003 0.004 0.003 0.006 0.005 0.038 108 G 0.950 0.002 0.005 0.002 0.005 0.003 0.033 109 S 0.910 0.002 0.005 0.002 0.013 0.004 0.063 110 A 0.894 0.007 0.004 0.002 0.018 0.005 0.070 111 M 0.619 0.007 0.007 0.005 0.037 0.018 0.307 112 N 0.303 0.015 0.016 0.003 0.084 0.056 0.522 113 Q 0.066 0.005 0.062 0.007 0.220 0.557 0.084 114 D 0.026 0.003 0.050 0.002 0.265 0.587 0.067 115 G 0.222 0.015 0.065 0.008 0.244 0.168 0.278 116 F 0.678 0.015 0.005 0.005 0.029 0.022 0.245 117 S 0.878 0.008 0.004 0.005 0.020 0.007 0.079 118 L 0.921 0.010 0.005 0.005 0.007 0.005 0.047 119 V 0.861 0.006 0.005 0.009 0.014 0.007 0.099 120 G 0.856 0.004 0.008 0.011 0.022 0.009 0.090 121 C 0.761 0.008 0.014 0.016 0.030 0.034 0.136 122 M 0.728 0.020 0.016 0.019 0.040 0.055 0.121 123 V 0.515 0.036 0.027 0.045 0.089 0.095 0.192 124 S 0.173 0.018 0.025 0.029 0.314 0.126 0.316 125 P 0.031 0.005 0.025 0.010 0.200 0.640 0.088 126 G 0.052 0.008 0.011 0.002 0.145 0.590 0.192 127 F 0.163 0.021 0.001 0.002 0.045 0.007 0.761 128 T 0.384 0.043 0.001 0.002 0.013 0.005 0.552 129 F 0.231 0.020 0.106 0.052 0.109 0.139 0.342 130 D 0.100 0.011 0.204 0.055 0.144 0.369 0.117 131 D 0.062 0.005 0.341 0.067 0.109 0.291 0.126 132 F 0.207 0.022 0.192 0.071 0.106 0.129 0.272 133 E 0.378 0.026 0.093 0.068 0.075 0.096 0.263 134 L 0.383 0.026 0.080 0.055 0.107 0.122 0.228 135 F 0.172 0.035 0.020 0.039 0.209 0.041 0.484 136 S 0.042 0.013 0.007 0.019 0.105 0.018 0.796 137 Q 0.007 0.003 0.119 0.616 0.068 0.094 0.093 138 E 0.005 0.002 0.161 0.695 0.033 0.074 0.031 139 A 0.002 0.001 0.183 0.739 0.016 0.039 0.021 140 L 0.002 0.002 0.081 0.837 0.016 0.035 0.026 141 L 0.002 0.002 0.101 0.780 0.015 0.084 0.016 142 A 0.003 0.001 0.133 0.532 0.023 0.290 0.018 143 M 0.002 0.003 0.099 0.452 0.112 0.250 0.082 144 Y 0.003 0.005 0.020 0.075 0.290 0.037 0.572 145 P 0.001 0.002 0.239 0.289 0.065 0.311 0.094 146 Q 0.001 0.007 0.149 0.424 0.096 0.216 0.107 147 H 0.001 0.003 0.068 0.651 0.041 0.046 0.190 148 K 0.001 0.001 0.012 0.953 0.006 0.017 0.011 149 A 0.001 0.001 0.009 0.966 0.005 0.013 0.006 150 V 0.001 0.001 0.008 0.975 0.005 0.007 0.005 151 V 0.001 0.001 0.003 0.984 0.002 0.006 0.003 152 Q 0.001 0.001 0.006 0.969 0.002 0.020 0.002 153 K 0.001 0.001 0.008 0.915 0.004 0.068 0.005 154 L 0.001 0.001 0.015 0.833 0.012 0.121 0.018 155 S 0.004 0.007 0.015 0.624 0.077 0.172 0.102 156 R 0.005 0.005 0.034 0.318 0.137 0.172 0.329 157 P 0.014 0.006 0.069 0.291 0.151 0.166 0.302 158 E 0.025 0.014 0.072 0.265 0.154 0.195 0.277 159 V 0.022 0.014 0.034 0.142 0.015 0.107 0.667 160 N 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.995