# TARGET T0210 # Using neural net t2k-5631-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-CB-burial-14-7-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0210.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 47 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.690 0.214 0.070 0.022 0.004 0.001 0.001 2 Q 0.718 0.219 0.048 0.012 0.003 0.001 0.001 3 N 0.355 0.298 0.191 0.112 0.038 0.006 0.001 4 A 0.176 0.215 0.230 0.216 0.126 0.035 0.002 5 D 0.476 0.378 0.117 0.026 0.003 0.001 0.001 6 D 0.334 0.416 0.169 0.061 0.018 0.003 0.001 7 F 0.076 0.096 0.142 0.285 0.304 0.095 0.002 8 I 0.085 0.151 0.270 0.346 0.132 0.016 0.001 9 K 0.460 0.438 0.083 0.016 0.002 0.001 0.001 10 F 0.176 0.322 0.308 0.162 0.030 0.003 0.001 11 L 0.060 0.087 0.133 0.329 0.297 0.088 0.006 12 E 0.283 0.442 0.192 0.059 0.019 0.004 0.001 13 L 0.218 0.160 0.181 0.243 0.152 0.042 0.003 14 E 0.147 0.277 0.217 0.188 0.120 0.045 0.005 15 Q 0.163 0.217 0.209 0.206 0.138 0.056 0.011 16 H 0.174 0.216 0.182 0.163 0.130 0.098 0.037 17 V 0.244 0.203 0.146 0.158 0.121 0.094 0.035 18 E 0.206 0.207 0.186 0.171 0.121 0.077 0.033 19 G 0.211 0.206 0.188 0.169 0.124 0.077 0.024 20 G 0.097 0.152 0.176 0.232 0.181 0.113 0.048 21 F 0.051 0.101 0.142 0.196 0.211 0.196 0.102 22 Y 0.018 0.023 0.044 0.098 0.197 0.361 0.259 23 R 0.047 0.090 0.145 0.223 0.226 0.182 0.087 24 S 0.051 0.091 0.136 0.192 0.207 0.216 0.106 25 S 0.046 0.068 0.114 0.202 0.259 0.248 0.063 26 Y 0.031 0.050 0.089 0.218 0.339 0.239 0.034 27 R 0.113 0.229 0.256 0.222 0.128 0.044 0.007 28 S 0.303 0.235 0.189 0.150 0.085 0.034 0.003 29 E 0.502 0.257 0.117 0.072 0.035 0.015 0.002 30 T 0.523 0.231 0.127 0.077 0.031 0.010 0.001 31 A 0.579 0.216 0.111 0.059 0.026 0.008 0.001 32 F 0.509 0.221 0.134 0.090 0.037 0.008 0.001 33 D 0.628 0.232 0.091 0.038 0.010 0.002 0.001 34 P 0.522 0.267 0.125 0.061 0.019 0.004 0.001 35 S 0.346 0.229 0.153 0.143 0.089 0.034 0.007 36 R 0.105 0.144 0.169 0.208 0.227 0.124 0.022 37 Q 0.030 0.064 0.101 0.217 0.270 0.234 0.086 38 L 0.013 0.023 0.034 0.082 0.171 0.375 0.302 39 W 0.004 0.010 0.018 0.051 0.167 0.368 0.383 40 S 0.002 0.008 0.026 0.087 0.166 0.316 0.396 41 S 0.001 0.003 0.007 0.024 0.072 0.257 0.637 42 I 0.001 0.001 0.001 0.005 0.020 0.170 0.802 43 Y 0.002 0.005 0.014 0.062 0.151 0.461 0.304 44 F 0.002 0.011 0.033 0.103 0.253 0.412 0.186 45 L 0.007 0.016 0.027 0.061 0.152 0.510 0.227 46 L 0.007 0.017 0.038 0.156 0.408 0.352 0.023 47 R 0.042 0.227 0.336 0.295 0.092 0.009 0.001 48 T 0.322 0.374 0.216 0.075 0.011 0.001 0.001 49 G 0.499 0.355 0.097 0.036 0.011 0.002 0.001 50 E 0.237 0.337 0.254 0.134 0.034 0.004 0.001 51 V 0.124 0.239 0.279 0.228 0.107 0.021 0.001 52 S 0.122 0.210 0.225 0.225 0.158 0.054 0.005 53 H 0.138 0.247 0.245 0.210 0.111 0.042 0.007 54 F 0.029 0.062 0.109 0.222 0.297 0.226 0.055 55 H 0.023 0.073 0.127 0.250 0.290 0.196 0.040 56 R 0.029 0.085 0.137 0.223 0.268 0.205 0.051 57 L 0.022 0.042 0.059 0.131 0.277 0.331 0.139 58 T 0.072 0.181 0.240 0.250 0.148 0.087 0.021 59 A 0.026 0.058 0.079 0.153 0.241 0.309 0.133 60 D 0.026 0.077 0.136 0.226 0.232 0.212 0.091 61 E 0.014 0.028 0.041 0.092 0.206 0.388 0.232 62 M 0.009 0.013 0.025 0.056 0.137 0.354 0.406 63 W 0.023 0.033 0.048 0.096 0.143 0.320 0.337 64 Y 0.026 0.039 0.055 0.091 0.158 0.292 0.339 65 F 0.014 0.014 0.022 0.050 0.115 0.316 0.469 66 H 0.025 0.049 0.058 0.123 0.186 0.296 0.263 67 A 0.046 0.066 0.100 0.171 0.212 0.240 0.165 68 G 0.046 0.067 0.088 0.133 0.214 0.276 0.176 69 Q 0.037 0.090 0.164 0.219 0.204 0.197 0.089 70 S 0.026 0.069 0.134 0.207 0.242 0.234 0.088 71 L 0.008 0.021 0.049 0.128 0.284 0.393 0.119 72 T 0.009 0.049 0.108 0.220 0.290 0.261 0.064 73 I 0.002 0.003 0.010 0.034 0.127 0.507 0.316 74 Y 0.015 0.042 0.083 0.183 0.277 0.321 0.080 75 M 0.031 0.056 0.114 0.190 0.269 0.288 0.053 76 I 0.037 0.089 0.146 0.246 0.291 0.178 0.013 77 S 0.067 0.176 0.258 0.297 0.161 0.040 0.002 78 P 0.475 0.310 0.140 0.057 0.014 0.003 0.001 79 E 0.680 0.224 0.063 0.024 0.007 0.002 0.001 80 G 0.515 0.268 0.130 0.065 0.018 0.004 0.001 81 E 0.438 0.347 0.139 0.057 0.015 0.003 0.001 82 L 0.087 0.149 0.219 0.285 0.201 0.054 0.004 83 T 0.132 0.273 0.273 0.211 0.087 0.022 0.002 84 T 0.059 0.131 0.191 0.268 0.232 0.106 0.013 85 A 0.043 0.098 0.159 0.264 0.262 0.155 0.019 86 Q 0.038 0.102 0.166 0.251 0.252 0.162 0.029 87 L 0.016 0.027 0.056 0.140 0.281 0.371 0.108 88 G 0.061 0.144 0.175 0.229 0.223 0.144 0.025 89 L 0.147 0.209 0.192 0.205 0.147 0.081 0.018 90 D 0.200 0.285 0.222 0.165 0.085 0.037 0.006 91 L 0.066 0.100 0.165 0.267 0.265 0.123 0.014 92 A 0.269 0.272 0.192 0.150 0.081 0.031 0.006 93 A 0.422 0.301 0.158 0.077 0.030 0.010 0.002 94 G 0.270 0.268 0.186 0.154 0.085 0.030 0.006 95 E 0.104 0.208 0.215 0.223 0.157 0.074 0.020 96 R 0.090 0.152 0.195 0.220 0.183 0.126 0.034 97 P 0.037 0.051 0.070 0.135 0.226 0.326 0.154 98 Q 0.036 0.046 0.062 0.122 0.197 0.313 0.223 99 F 0.034 0.045 0.069 0.122 0.181 0.315 0.234 100 L 0.020 0.031 0.049 0.107 0.204 0.361 0.229 101 V 0.027 0.061 0.111 0.211 0.262 0.224 0.104 102 P 0.092 0.164 0.183 0.214 0.183 0.119 0.045 103 K 0.141 0.251 0.249 0.199 0.099 0.046 0.015 104 G 0.091 0.187 0.195 0.216 0.175 0.105 0.031 105 C 0.031 0.075 0.127 0.228 0.278 0.215 0.046 106 I 0.031 0.038 0.067 0.144 0.233 0.361 0.127 107 F 0.032 0.061 0.093 0.155 0.213 0.286 0.159 108 G 0.024 0.045 0.076 0.130 0.215 0.319 0.189 109 S 0.012 0.034 0.060 0.133 0.264 0.362 0.134 110 A 0.044 0.139 0.215 0.289 0.193 0.097 0.023 111 M 0.055 0.111 0.159 0.269 0.269 0.119 0.017 112 N 0.316 0.351 0.200 0.099 0.028 0.006 0.001 113 Q 0.421 0.323 0.155 0.076 0.022 0.003 0.001 114 D 0.251 0.420 0.216 0.089 0.020 0.003 0.001 115 G 0.029 0.203 0.306 0.308 0.128 0.025 0.001 116 F 0.001 0.005 0.025 0.146 0.386 0.389 0.047 117 S 0.001 0.002 0.009 0.035 0.149 0.492 0.313 118 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.020 0.200 0.775 119 V 0.001 0.001 0.002 0.006 0.026 0.202 0.764 120 G 0.001 0.001 0.003 0.011 0.041 0.237 0.706 121 C 0.001 0.002 0.006 0.023 0.078 0.303 0.588 122 M 0.001 0.006 0.016 0.049 0.148 0.322 0.459 123 V 0.008 0.030 0.073 0.127 0.199 0.310 0.252 124 S 0.038 0.069 0.095 0.180 0.235 0.259 0.124 125 P 0.064 0.096 0.131 0.179 0.199 0.218 0.113 126 G 0.106 0.165 0.182 0.205 0.175 0.135 0.032 127 F 0.048 0.087 0.128 0.231 0.273 0.184 0.050 128 T 0.159 0.335 0.268 0.151 0.063 0.020 0.003 129 F 0.032 0.085 0.171 0.323 0.286 0.092 0.011 130 D 0.359 0.371 0.177 0.070 0.017 0.004 0.001 131 D 0.402 0.359 0.149 0.063 0.022 0.005 0.001 132 F 0.115 0.154 0.216 0.275 0.179 0.057 0.005 133 E 0.232 0.322 0.209 0.144 0.068 0.023 0.002 134 L 0.156 0.200 0.226 0.230 0.138 0.049 0.002 135 F 0.085 0.162 0.220 0.270 0.199 0.061 0.003 136 S 0.382 0.366 0.160 0.073 0.017 0.002 0.001 137 Q 0.258 0.317 0.236 0.141 0.041 0.006 0.001 138 E 0.753 0.215 0.027 0.004 0.001 0.001 0.001 139 A 0.363 0.425 0.163 0.041 0.007 0.001 0.001 140 L 0.042 0.076 0.199 0.376 0.267 0.041 0.001 141 L 0.174 0.303 0.270 0.184 0.061 0.007 0.001 142 A 0.563 0.347 0.068 0.017 0.004 0.001 0.001 143 M 0.145 0.303 0.302 0.195 0.049 0.006 0.001 144 Y 0.039 0.110 0.231 0.353 0.223 0.043 0.001 145 P 0.452 0.385 0.122 0.033 0.007 0.001 0.001 146 Q 0.264 0.392 0.237 0.088 0.016 0.002 0.001 147 H 0.047 0.074 0.124 0.293 0.343 0.116 0.003 148 K 0.121 0.353 0.312 0.161 0.048 0.005 0.001 149 A 0.435 0.442 0.101 0.019 0.002 0.001 0.001 150 V 0.048 0.103 0.248 0.383 0.187 0.030 0.001 151 V 0.076 0.083 0.110 0.234 0.321 0.164 0.011 152 Q 0.220 0.348 0.248 0.136 0.041 0.007 0.001 153 K 0.228 0.270 0.287 0.163 0.045 0.007 0.001 154 L 0.150 0.122 0.121 0.188 0.260 0.145 0.014 155 S 0.239 0.201 0.200 0.185 0.127 0.045 0.003 156 R 0.449 0.272 0.163 0.090 0.023 0.004 0.001 157 P 0.632 0.248 0.078 0.031 0.009 0.002 0.001 158 E 0.659 0.178 0.090 0.052 0.017 0.004 0.001 159 V 0.759 0.132 0.059 0.037 0.012 0.002 0.001 160 N 0.847 0.116 0.026 0.008 0.002 0.001 0.001