# TARGET T0207 # Using neural net t2k-5631-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-CB-burial-14-7-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0207.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 49 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.346 0.280 0.203 0.127 0.037 0.006 0.001 2 A 0.214 0.340 0.237 0.147 0.050 0.010 0.001 3 L 0.024 0.046 0.076 0.187 0.394 0.246 0.027 4 T 0.036 0.154 0.257 0.275 0.200 0.073 0.005 5 L 0.009 0.029 0.079 0.217 0.344 0.301 0.021 6 Y 0.019 0.078 0.184 0.302 0.290 0.121 0.005 7 Q 0.237 0.308 0.257 0.146 0.047 0.005 0.001 8 R 0.546 0.302 0.111 0.036 0.005 0.001 0.001 9 D 0.784 0.185 0.026 0.005 0.001 0.001 0.001 10 D 0.642 0.288 0.055 0.013 0.002 0.001 0.001 11 C 0.258 0.346 0.232 0.135 0.027 0.002 0.001 12 H 0.228 0.334 0.269 0.123 0.039 0.006 0.001 13 L 0.111 0.303 0.212 0.217 0.122 0.033 0.001 14 C 0.043 0.165 0.325 0.298 0.138 0.030 0.001 15 D 0.242 0.431 0.225 0.082 0.018 0.002 0.001 16 Q 0.099 0.417 0.324 0.136 0.022 0.002 0.001 17 A 0.030 0.040 0.069 0.228 0.429 0.195 0.009 18 V 0.047 0.237 0.334 0.295 0.082 0.006 0.001 19 E 0.293 0.597 0.097 0.012 0.001 0.001 0.001 20 A 0.020 0.106 0.360 0.406 0.099 0.010 0.001 21 L 0.020 0.046 0.077 0.264 0.440 0.151 0.003 22 A 0.278 0.453 0.200 0.058 0.010 0.001 0.001 23 Q 0.512 0.368 0.094 0.022 0.004 0.001 0.001 24 A 0.064 0.163 0.303 0.317 0.135 0.016 0.001 25 R 0.291 0.388 0.214 0.086 0.018 0.002 0.001 26 A 0.551 0.296 0.099 0.041 0.011 0.002 0.001 27 G 0.227 0.252 0.236 0.207 0.068 0.010 0.001 28 A 0.314 0.343 0.196 0.099 0.037 0.009 0.001 29 F 0.055 0.063 0.121 0.260 0.332 0.157 0.011 30 F 0.105 0.205 0.224 0.256 0.155 0.051 0.004 31 S 0.126 0.172 0.200 0.219 0.188 0.086 0.008 32 V 0.067 0.172 0.256 0.271 0.169 0.060 0.006 33 F 0.121 0.241 0.235 0.219 0.133 0.048 0.003 34 I 0.076 0.114 0.190 0.296 0.241 0.080 0.003 35 D 0.385 0.313 0.169 0.090 0.033 0.009 0.001 36 D 0.503 0.327 0.122 0.039 0.008 0.001 0.001 37 D 0.258 0.263 0.241 0.172 0.058 0.008 0.001 38 A 0.839 0.146 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 39 A 0.537 0.360 0.087 0.014 0.002 0.001 0.001 40 L 0.072 0.099 0.186 0.351 0.255 0.036 0.001 41 E 0.123 0.312 0.318 0.191 0.050 0.005 0.001 42 S 0.517 0.395 0.069 0.015 0.003 0.001 0.001 43 A 0.138 0.311 0.314 0.190 0.041 0.005 0.001 44 Y 0.046 0.074 0.151 0.325 0.302 0.098 0.004 45 G 0.268 0.358 0.209 0.112 0.045 0.008 0.001 46 L 0.196 0.334 0.225 0.156 0.069 0.019 0.001 47 R 0.098 0.302 0.340 0.204 0.047 0.009 0.001 48 V 0.005 0.024 0.074 0.235 0.439 0.212 0.011 49 P 0.007 0.034 0.107 0.265 0.362 0.208 0.017 50 V 0.005 0.022 0.086 0.201 0.331 0.323 0.032 51 L 0.001 0.002 0.009 0.051 0.236 0.595 0.105 52 R 0.012 0.122 0.303 0.299 0.191 0.069 0.003 53 D 0.014 0.051 0.161 0.381 0.310 0.080 0.003 54 P 0.420 0.383 0.132 0.048 0.014 0.004 0.001 55 M 0.745 0.185 0.048 0.017 0.004 0.001 0.001 56 G 0.693 0.223 0.061 0.018 0.004 0.001 0.001 57 R 0.397 0.284 0.170 0.106 0.036 0.006 0.001 58 E 0.164 0.247 0.275 0.207 0.089 0.017 0.001 59 L 0.107 0.222 0.229 0.250 0.147 0.042 0.002 60 D 0.074 0.221 0.297 0.248 0.125 0.034 0.002 61 W 0.022 0.050 0.096 0.250 0.334 0.230 0.019 62 P 0.090 0.229 0.228 0.222 0.148 0.076 0.006 63 F 0.016 0.041 0.101 0.225 0.353 0.239 0.025 64 D 0.089 0.327 0.264 0.204 0.089 0.024 0.002 65 A 0.087 0.263 0.346 0.219 0.070 0.014 0.001 66 P 0.611 0.334 0.047 0.007 0.001 0.001 0.001 67 R 0.069 0.314 0.374 0.187 0.050 0.006 0.001 68 L 0.006 0.018 0.067 0.269 0.490 0.147 0.003 69 R 0.075 0.356 0.377 0.163 0.027 0.002 0.001 70 A 0.446 0.464 0.076 0.011 0.002 0.001 0.001 71 W 0.029 0.092 0.278 0.414 0.164 0.023 0.001 72 L 0.082 0.079 0.163 0.321 0.296 0.057 0.002 73 D 0.468 0.384 0.117 0.026 0.004 0.001 0.001 74 A 0.633 0.246 0.087 0.028 0.006 0.001 0.001 75 A 0.498 0.291 0.120 0.056 0.024 0.009 0.001 76 P 0.533 0.243 0.125 0.071 0.023 0.005 0.001 77 H 0.645 0.187 0.084 0.056 0.022 0.005 0.001 78 A 0.627 0.197 0.081 0.054 0.030 0.010 0.001