# TARGET T0206 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0206.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 234 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.993 2 A 0.017 0.047 0.009 0.012 0.015 0.064 0.836 3 F 0.012 0.020 0.021 0.014 0.376 0.071 0.487 4 D 0.018 0.009 0.043 0.038 0.237 0.168 0.488 5 P 0.022 0.081 0.053 0.059 0.174 0.121 0.489 6 N 0.011 0.026 0.031 0.021 0.255 0.057 0.600 7 L 0.016 0.021 0.034 0.017 0.170 0.140 0.601 8 V 0.023 0.212 0.037 0.038 0.161 0.114 0.415 9 G 0.007 0.049 0.035 0.016 0.268 0.068 0.557 10 P 0.007 0.024 0.025 0.010 0.162 0.233 0.539 11 T 0.007 0.086 0.037 0.012 0.256 0.264 0.338 12 L 0.003 0.034 0.020 0.009 0.383 0.066 0.485 13 P 0.004 0.036 0.027 0.011 0.184 0.127 0.610 14 P 0.009 0.068 0.037 0.013 0.262 0.164 0.448 15 I 0.009 0.049 0.045 0.015 0.240 0.102 0.540 16 P 0.011 0.164 0.040 0.018 0.150 0.090 0.527 17 P 0.009 0.066 0.039 0.015 0.216 0.089 0.566 18 F 0.006 0.021 0.036 0.013 0.117 0.137 0.671 19 T 0.006 0.130 0.043 0.024 0.183 0.187 0.427 20 L 0.003 0.038 0.024 0.010 0.404 0.062 0.458 21 P 0.003 0.017 0.032 0.011 0.215 0.253 0.470 22 T 0.005 0.160 0.045 0.015 0.199 0.235 0.341 23 G 0.002 0.068 0.028 0.007 0.388 0.053 0.454 24 P 0.002 0.019 0.036 0.010 0.171 0.280 0.481 25 T 0.003 0.085 0.054 0.013 0.209 0.352 0.284 26 G 0.002 0.055 0.039 0.008 0.392 0.066 0.438 27 P 0.004 0.029 0.048 0.016 0.197 0.183 0.523 28 T 0.007 0.186 0.059 0.027 0.181 0.183 0.357 29 G 0.003 0.053 0.036 0.012 0.303 0.052 0.542 30 P 0.003 0.022 0.034 0.013 0.185 0.216 0.525 31 T 0.006 0.184 0.047 0.023 0.198 0.213 0.329 32 G 0.002 0.039 0.024 0.010 0.422 0.049 0.455 33 P 0.002 0.019 0.028 0.011 0.191 0.223 0.526 34 T 0.004 0.158 0.041 0.014 0.192 0.248 0.343 35 G 0.002 0.068 0.031 0.010 0.435 0.062 0.392 36 P 0.002 0.021 0.038 0.016 0.191 0.233 0.499 37 T 0.003 0.106 0.060 0.021 0.196 0.313 0.301 38 G 0.002 0.058 0.045 0.013 0.332 0.071 0.479 39 P 0.004 0.024 0.060 0.020 0.177 0.253 0.462 40 T 0.005 0.135 0.073 0.031 0.199 0.264 0.294 41 G 0.002 0.046 0.043 0.013 0.345 0.061 0.490 42 P 0.004 0.022 0.047 0.016 0.167 0.249 0.496 43 T 0.007 0.183 0.060 0.023 0.173 0.248 0.306 44 G 0.003 0.052 0.030 0.009 0.392 0.051 0.463 45 D 0.003 0.019 0.027 0.010 0.192 0.173 0.576 46 T 0.005 0.161 0.046 0.018 0.210 0.220 0.341 47 G 0.002 0.048 0.033 0.010 0.377 0.057 0.473 48 T 0.003 0.020 0.037 0.012 0.183 0.197 0.548 49 T 0.005 0.213 0.050 0.019 0.183 0.206 0.325 50 G 0.002 0.058 0.024 0.007 0.416 0.042 0.450 51 P 0.002 0.024 0.029 0.009 0.198 0.193 0.546 52 T 0.004 0.184 0.046 0.013 0.198 0.234 0.322 53 G 0.002 0.067 0.035 0.008 0.392 0.061 0.435 54 P 0.002 0.024 0.043 0.012 0.185 0.237 0.497 55 T 0.003 0.148 0.056 0.017 0.207 0.298 0.270 56 G 0.002 0.060 0.034 0.009 0.416 0.060 0.420 57 P 0.002 0.026 0.040 0.012 0.188 0.230 0.501 58 T 0.004 0.180 0.053 0.018 0.191 0.257 0.296 59 G 0.002 0.054 0.027 0.007 0.430 0.047 0.434 60 P 0.002 0.022 0.030 0.008 0.187 0.214 0.537 61 T 0.004 0.183 0.047 0.012 0.198 0.237 0.318 62 G 0.002 0.065 0.028 0.006 0.417 0.048 0.434 63 P 0.002 0.024 0.033 0.008 0.174 0.220 0.539 64 T 0.004 0.164 0.045 0.011 0.196 0.253 0.327 65 G 0.002 0.079 0.027 0.006 0.418 0.051 0.417 66 A 0.003 0.031 0.036 0.011 0.183 0.223 0.514 67 T 0.004 0.143 0.048 0.014 0.197 0.270 0.324 68 G 0.002 0.078 0.033 0.008 0.382 0.064 0.432 69 L 0.003 0.031 0.046 0.012 0.184 0.253 0.472 70 T 0.004 0.126 0.064 0.016 0.196 0.305 0.289 71 G 0.002 0.074 0.046 0.008 0.349 0.076 0.445 72 P 0.003 0.028 0.047 0.012 0.188 0.276 0.445 73 T 0.005 0.122 0.055 0.016 0.214 0.298 0.290 74 G 0.002 0.047 0.025 0.007 0.393 0.052 0.475 75 P 0.004 0.030 0.026 0.009 0.194 0.182 0.557 76 T 0.009 0.183 0.034 0.014 0.193 0.171 0.395 77 G 0.004 0.059 0.021 0.008 0.388 0.046 0.474 78 P 0.006 0.033 0.020 0.011 0.213 0.140 0.576 79 S 0.011 0.120 0.029 0.018 0.208 0.163 0.451 80 G 0.008 0.065 0.039 0.018 0.298 0.087 0.484 81 L 0.011 0.037 0.042 0.025 0.202 0.212 0.472 82 G 0.015 0.070 0.048 0.025 0.247 0.230 0.364 83 L 0.014 0.046 0.041 0.022 0.311 0.091 0.474 84 P 0.022 0.039 0.044 0.029 0.162 0.169 0.534 85 A 0.032 0.048 0.058 0.037 0.220 0.247 0.357 86 G 0.043 0.026 0.050 0.032 0.256 0.158 0.435 87 L 0.075 0.031 0.049 0.044 0.231 0.108 0.461 88 Y 0.151 0.071 0.052 0.066 0.156 0.100 0.403 89 A 0.176 0.056 0.054 0.074 0.109 0.118 0.413 90 F 0.192 0.038 0.058 0.073 0.173 0.152 0.315 91 N 0.200 0.042 0.054 0.072 0.157 0.149 0.325 92 S 0.126 0.054 0.046 0.068 0.167 0.173 0.366 93 G 0.090 0.024 0.030 0.034 0.227 0.180 0.416 94 G 0.065 0.016 0.020 0.016 0.170 0.123 0.590 95 I 0.085 0.065 0.025 0.021 0.207 0.091 0.505 96 S 0.066 0.024 0.022 0.020 0.303 0.066 0.500 97 L 0.055 0.026 0.024 0.018 0.174 0.073 0.631 98 D 0.084 0.106 0.031 0.023 0.168 0.063 0.525 99 L 0.053 0.036 0.049 0.023 0.224 0.093 0.523 100 G 0.043 0.016 0.051 0.020 0.122 0.180 0.567 101 I 0.041 0.030 0.076 0.024 0.190 0.348 0.292 102 N 0.039 0.013 0.042 0.015 0.320 0.169 0.402 103 D 0.084 0.018 0.027 0.015 0.260 0.072 0.524 104 P 0.232 0.082 0.015 0.013 0.135 0.040 0.482 105 V 0.277 0.058 0.011 0.012 0.112 0.029 0.502 106 P 0.355 0.044 0.013 0.012 0.068 0.072 0.437 107 F 0.347 0.034 0.022 0.015 0.170 0.140 0.273 108 N 0.239 0.012 0.023 0.013 0.237 0.082 0.395 109 T 0.294 0.019 0.071 0.043 0.173 0.112 0.286 110 V 0.546 0.041 0.047 0.038 0.093 0.063 0.171 111 G 0.634 0.045 0.036 0.036 0.059 0.044 0.146 112 S 0.496 0.037 0.037 0.040 0.076 0.080 0.234 113 Q 0.247 0.023 0.046 0.031 0.156 0.203 0.295 114 F 0.123 0.013 0.086 0.025 0.186 0.277 0.289 115 G 0.097 0.009 0.085 0.014 0.188 0.445 0.162 116 T 0.156 0.006 0.073 0.007 0.211 0.347 0.199 117 A 0.330 0.037 0.043 0.007 0.170 0.067 0.345 118 I 0.518 0.052 0.016 0.005 0.113 0.029 0.267 119 S 0.611 0.075 0.008 0.005 0.084 0.018 0.199 120 Q 0.413 0.058 0.009 0.004 0.043 0.018 0.455 121 L 0.081 0.011 0.080 0.017 0.071 0.597 0.142 122 D 0.034 0.009 0.044 0.009 0.079 0.780 0.045 123 A 0.044 0.009 0.032 0.009 0.300 0.522 0.085 124 D 0.062 0.005 0.004 0.002 0.585 0.152 0.191 125 T 0.455 0.038 0.003 0.001 0.056 0.023 0.425 126 F 0.926 0.014 0.001 0.001 0.007 0.002 0.051 127 V 0.945 0.008 0.001 0.001 0.007 0.001 0.039 128 I 0.863 0.010 0.001 0.001 0.011 0.002 0.112 129 S 0.622 0.020 0.003 0.001 0.072 0.022 0.261 130 E 0.355 0.017 0.009 0.001 0.158 0.072 0.387 131 T 0.091 0.005 0.013 0.001 0.215 0.582 0.093 132 G 0.220 0.005 0.009 0.001 0.327 0.332 0.107 133 F 0.719 0.013 0.003 0.001 0.039 0.011 0.215 134 Y 0.924 0.007 0.001 0.001 0.016 0.003 0.049 135 K 0.983 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.011 136 I 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 137 T 0.973 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.023 138 V 0.961 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.029 139 I 0.927 0.002 0.001 0.001 0.011 0.002 0.056 140 A 0.874 0.008 0.002 0.001 0.018 0.005 0.091 141 N 0.816 0.012 0.003 0.003 0.028 0.012 0.126 142 T 0.622 0.017 0.014 0.008 0.061 0.098 0.179 143 A 0.303 0.011 0.016 0.014 0.196 0.282 0.177 144 T 0.147 0.010 0.026 0.020 0.310 0.257 0.231 145 A 0.101 0.006 0.041 0.023 0.305 0.253 0.272 146 S 0.290 0.011 0.038 0.031 0.228 0.218 0.184 147 V 0.649 0.017 0.025 0.029 0.068 0.057 0.154 148 L 0.827 0.007 0.006 0.007 0.024 0.011 0.118 149 G 0.908 0.003 0.004 0.004 0.023 0.004 0.054 150 G 0.947 0.003 0.004 0.004 0.010 0.003 0.029 151 L 0.966 0.001 0.002 0.003 0.004 0.001 0.022 152 T 0.973 0.001 0.002 0.003 0.004 0.001 0.016 153 I 0.959 0.003 0.002 0.003 0.004 0.002 0.027 154 Q 0.894 0.006 0.005 0.005 0.013 0.011 0.065 155 V 0.714 0.007 0.014 0.010 0.048 0.073 0.134 156 N 0.098 0.004 0.019 0.012 0.138 0.656 0.073 157 G 0.056 0.002 0.009 0.003 0.192 0.642 0.097 158 V 0.424 0.015 0.002 0.003 0.151 0.018 0.387 159 P 0.650 0.068 0.001 0.004 0.024 0.004 0.249 160 V 0.786 0.017 0.003 0.007 0.022 0.006 0.159 161 P 0.754 0.015 0.011 0.014 0.025 0.024 0.157 162 G 0.596 0.017 0.024 0.027 0.085 0.054 0.197 163 T 0.396 0.017 0.026 0.030 0.166 0.055 0.310 164 G 0.202 0.014 0.096 0.094 0.170 0.123 0.300 165 S 0.170 0.013 0.120 0.091 0.139 0.156 0.311 166 S 0.118 0.018 0.115 0.119 0.156 0.139 0.335 167 L 0.135 0.024 0.099 0.125 0.164 0.122 0.330 168 I 0.136 0.037 0.080 0.119 0.174 0.104 0.351 169 S 0.076 0.044 0.069 0.104 0.155 0.125 0.426 170 L 0.026 0.009 0.042 0.081 0.191 0.422 0.227 171 G 0.013 0.006 0.024 0.032 0.149 0.571 0.205 172 A 0.029 0.016 0.009 0.031 0.208 0.028 0.680 173 P 0.146 0.027 0.014 0.060 0.067 0.059 0.627 174 I 0.391 0.048 0.033 0.062 0.068 0.059 0.338 175 V 0.433 0.068 0.037 0.047 0.066 0.039 0.310 176 I 0.331 0.024 0.035 0.053 0.120 0.048 0.389 177 Q 0.237 0.011 0.046 0.062 0.130 0.054 0.461 178 A 0.197 0.011 0.116 0.088 0.118 0.208 0.262 179 I 0.281 0.012 0.103 0.082 0.134 0.182 0.205 180 T 0.375 0.022 0.074 0.089 0.118 0.079 0.243 181 Q 0.474 0.021 0.039 0.100 0.087 0.058 0.221 182 I 0.601 0.015 0.032 0.059 0.076 0.051 0.167 183 T 0.608 0.017 0.031 0.048 0.058 0.061 0.177 184 T 0.524 0.016 0.021 0.044 0.099 0.128 0.170 185 T 0.391 0.012 0.022 0.023 0.225 0.131 0.196 186 P 0.259 0.008 0.030 0.013 0.283 0.166 0.241 187 S 0.514 0.008 0.017 0.006 0.102 0.046 0.307 188 L 0.900 0.004 0.005 0.003 0.021 0.009 0.058 189 V 0.981 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.013 190 E 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 191 V 0.983 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 192 I 0.910 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.079 193 V 0.678 0.004 0.007 0.001 0.029 0.012 0.269 194 T 0.126 0.004 0.046 0.002 0.172 0.603 0.047 195 G 0.016 0.001 0.024 0.001 0.074 0.871 0.015 196 L 0.256 0.004 0.020 0.001 0.193 0.234 0.291 197 G 0.876 0.009 0.001 0.001 0.010 0.006 0.098 198 L 0.974 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 199 S 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 200 L 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 201 A 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.025 202 L 0.822 0.004 0.003 0.005 0.011 0.016 0.139 203 G 0.338 0.007 0.021 0.028 0.258 0.121 0.227 204 T 0.082 0.003 0.041 0.105 0.407 0.266 0.096 205 S 0.064 0.014 0.051 0.270 0.168 0.248 0.185 206 A 0.065 0.019 0.017 0.578 0.057 0.094 0.171 207 S 0.034 0.002 0.006 0.783 0.059 0.045 0.070 208 I 0.024 0.001 0.002 0.930 0.012 0.012 0.018 209 I 0.022 0.001 0.002 0.958 0.003 0.007 0.007 210 I 0.018 0.001 0.002 0.965 0.004 0.004 0.007 211 E 0.020 0.001 0.005 0.958 0.005 0.005 0.006 212 K 0.014 0.001 0.008 0.950 0.006 0.012 0.009 213 V 0.013 0.001 0.009 0.937 0.008 0.020 0.012 214 A 0.015 0.002 0.015 0.883 0.011 0.050 0.024 215 H 0.016 0.004 0.024 0.775 0.031 0.109 0.042 216 H 0.019 0.005 0.047 0.672 0.038 0.141 0.078 217 H 0.014 0.015 0.045 0.570 0.074 0.195 0.087 218 H 0.021 0.010 0.035 0.323 0.122 0.315 0.174 219 H 0.024 0.020 0.021 0.117 0.090 0.230 0.498 220 H 0.003 0.004 0.004 0.018 0.042 0.013 0.917