Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 | | 1 .....MAFD.P.N.LVG.P...T.L.....P.P.I.....P..PF.TL.PT...GPT...G..PT 2 pft..LPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Pt.GP.TG.PT...GPT...G..PT 3 gpt..GPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Pt.GP.TG.PT...GDT...G..TT 4 gpt..GPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Pt.GP.TG.PT...GDT...G..TT 5 pft..LPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Pt.GP.TG.PT...GPT...G..PT 6 gtt..GPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Dt.GT.TG.PT...GPT...G..PT 7 ftl..----.-.-.---.P...T.G.....P.T.G.....Pt.GP.TG.PT...GPT...G..PT 8 lsa..SAFD.P.N.LVG.P...T.L.....P.P.I.....P..PF.TL.PT...GPT...G..PT 9 gpt..GPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Pt.GP.TG.DT...GTT...G..PT 10 lsa..SAFD.P.N.LVG.P...T.L.....P.P.I.....P..PF.TL.PT...GPT...G..PT 11 lsa..SAFD.P.N.LVG.P...T.L.....P.P.I.....P..PF.TL.PT...GPT...G..-- 12 vpt..GPTG.PtG.PTG.P...T.G.....P.T.G.....Tt.GT.TG.PT...GAT...G..PT 13 gpt..GATG.ItG.ATG.P...T.G.....A.T.G.....Vt.GA.TG.PT...GAT...G..IT 14 gat..GATG.PqG.IQG.P...Q.G.....I.Q.G.....Pq.GI.QG.PT...GAT...G..AT 15 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P...RG..PR...GTK..G..R.....T.GIQG.LT..G..IE...GP.R...GP.RG.I..Q.. 232 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 233 P...LM..GL...N--..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 234 P...KG..HT...GRA..G..E.....P.GTPG.SD..G..AP...GA.R...GP.TG.P..Q.. 235 P...AG..PA...GSVa.S..V.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 236 P...PGsgSX...GAX..G..Q.....X.GRSG.RD..G..AX...GY.X...GQ.QG.R..Q.. 237 S...NN..--...-QS..L..G.....N.FTVN.AS..N..DI...FT.I...PV.TG.R..Y.. 238 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 239 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 240 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 241 E...KL..LL...NI-..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 242 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 243 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 244 K...NI..GT...GSV..M..P.....E.HLNS.EI..-..--...--.-...--.--.-..-.. 245 K...TY..SF...QQY..Fs.A.....R.LLSN.VL..I..NY...FA.V...AN.TN.S..Y.. 246 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 247 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 248 K...EN..IN...GEK..I..T.....E.VAIL.YR..V..GV...TY.S...--.--.-..-.. 249 R...DG..AT...GAT..G..A.....S.GVRG.QT..G..GT...GM.T...GP.GG.R..-.. 250 A...NG..IP...GPI..G..P.....P.GPRG.RS..G..ET...GP.A...GP.PG.N..P.. 251 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 252 D...-G..TN...GPA..T..F.....Y.GSEA.ND..K..RF...AV.R...SS.GG.W..Y.. 253 H...PG..TV...GPA..G..I.....R.GPQG.HQ..G..PA...GP.P...GP.PG.P..P.. 254 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 255 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 256 P...AG..PQ...GEK..G..E.....N.GRPG.RD..G..AT...GP.I...GP.AG.P..Q.. 257 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 258 P...AG..PP...GPP..G..P.....P.GPPG.PN..G..GG...YE.V...GF.DA.E..Y.. 259 M...SG..LP...GPI..G..P.....P.GPRG.RN..G..EI...GP.A...GP.PG.P..P.. 260 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 261 N...VN..NL...PAA..V..Y.....T.INIC.RN..V..PT...NL.T...VP.TS.S..Y.. 262 P...AG..GA...QPS..G..A.....Q.-PTG.PA..G..NVp..VP.T...GP.AGgN..A.. 263 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 264 P...IG..PR...GER..G..E.....T.GRPG.RD..G..ED...GS.T...GP.MG.P..Q.. 265 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 266 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 267 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 268 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 269 P...VG..PV...GPV..G..P.....T.GAPG.PV..G..PI...GP.V...GP.AG.A..D.. 270 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 271 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 272 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 273 P...RG..EA...GPA..G..P.....R.GEAG.KD..G..AK...GD.R...GE.AG.P..A.. 274 -...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 275 L...--..--...---..-..-.....-.----.--..-..--...--.-...--.--.-..-.. 140 150 160 | | | 1 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 2 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 3 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 4 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 5 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 6 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 7 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 8 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 9 K...IT..V..I..V.Y...T..A...A..L.SVLGGLTIQ.VNG....VS.V..PG....TG.. 10 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 11 K...IT..V..I..A.N...T..A...T..A.SVLGGLTIQ.VNG....VP.V..PG....TG.. 12 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Y...IA..Y..T..I.-...N..L...T..A.GLLVSSRIT.VNG....SP.L..AG....TI.. 27 Y...IA..Y..T..I.-...N..L...T..A.GLLVSSRIT.VNG....SP.L..AG....TI.. 28 Y...IA..Y..T..I.-...N..L...T..A.GLLVSSRIT.VNG....SP.L..AG....TI.. 29 Y...IS..Y..T..I.-...N..I...T..A.SLLVSSRIT.ING....AP.L..AG....TI.. 30 F...FS..L..N..V.H...T..W...N..Q.KETY-LHIM.KNEeevvIL.F..AQ....VG.. 31 F...FS..L..N..V.H...T..W...N..Q.KETY-LHIM.KNEeevvIL.F..AQ....VG.. 32 F...FS..L..N..V.H...T..W...N..Q.KETY-LHIM.KNEeevvIL.F..AQ....VG.. 33 F...FS..L..N..V.H...T..W...N..Q.KETY-LHIM.KNEeevvIL.Y..AQ....VS.. 34 V...IS..Vs.I..S.T...T..A...P..G.CAPLGVGIS.INGa...VA.T..DN....FS.. 35 V...IS..Vs.I..S.T...T..A...P..G.CAPLGVGIS.INGa...VA.T..DN....FS.. 36 V...IS..Vs.I..S.T...T..A...P..G.CAPLGVGIS.INGa...VA.T..DN....FS.. 37 V...IS..Vs.I..S.T...T..A...P..G.CAPLGVGIS.INGa...VA.T..DN....FS.. 38 V...IS..Vs.I..S.T...T..A...P..G.CAPLGVGIS.INGa...VA.T..DN....FS.. 39 V...IS..Vs.I..S.T...T..A...P..G.CAPLGVGIS.INGa...VA.T..DN....FS.. 40 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G...DT..C..I..H.I...T..G...T..G.NACGLY---.---....--.-..--....--.. 209 A...IS..I..-..-.-...-..G...P..G.NYIEPLIHL.KAN....VQ.L..VG....TS.. 210 -...--..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 211 G...PA..G..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 212 P...PL..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 213 P...PL..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 214 P...PL..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 215 L...AG..F..F..S.A...T..A...A..L.APLTPVQIQ.MQI....FI.A..PA....AS.. 216 L...AG..F..F..S.A...T..A...A..L.APLTPVQIQ.MQI....FI.A..PA....AS.. 217 I...LS..T..I..T.L...T..T...T..D.KITGTMVFS.IKP....TD.Sg.A-....--.. 218 -...--..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 219 -...--..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 220 -...--..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 221 -...--..-..-..-.-...-..-...-..-.---------.---....--.-..--....--.. 222 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