# TARGET T0206 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0206.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 72 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.015 0.004 0.005 0.004 0.008 0.008 0.957 2 A 0.108 0.055 0.012 0.016 0.021 0.046 0.741 3 F 0.089 0.103 0.012 0.019 0.316 0.081 0.378 4 D 0.050 0.028 0.013 0.027 0.181 0.055 0.646 5 P 0.011 0.011 0.200 0.128 0.080 0.432 0.138 6 N 0.013 0.013 0.291 0.085 0.080 0.417 0.101 7 L 0.017 0.023 0.369 0.076 0.110 0.295 0.110 8 V 0.030 0.085 0.157 0.099 0.154 0.227 0.248 9 G 0.016 0.025 0.171 0.047 0.169 0.284 0.287 10 P 0.018 0.016 0.147 0.043 0.184 0.368 0.225 11 T 0.018 0.043 0.133 0.043 0.233 0.341 0.189 12 L 0.025 0.041 0.023 0.023 0.501 0.050 0.336 13 P 0.024 0.019 0.018 0.011 0.148 0.087 0.692 14 P 0.045 0.055 0.048 0.023 0.148 0.153 0.528 15 I 0.050 0.047 0.061 0.036 0.176 0.063 0.568 16 P 0.033 0.019 0.064 0.024 0.162 0.075 0.623 17 P 0.056 0.020 0.086 0.031 0.140 0.192 0.475 18 F 0.060 0.048 0.084 0.043 0.149 0.097 0.520 19 T 0.056 0.146 0.042 0.049 0.174 0.060 0.474 20 L 0.018 0.019 0.016 0.016 0.103 0.041 0.788 21 P 0.009 0.012 0.015 0.006 0.092 0.060 0.806 22 T 0.016 0.258 0.024 0.017 0.124 0.081 0.481 23 G 0.003 0.026 0.017 0.007 0.284 0.049 0.613 24 P 0.001 0.006 0.018 0.004 0.177 0.219 0.574 25 T 0.001 0.099 0.039 0.007 0.263 0.270 0.321 26 G 0.001 0.030 0.015 0.004 0.651 0.034 0.265 27 P 0.001 0.013 0.030 0.011 0.182 0.175 0.588 28 T 0.002 0.166 0.050 0.017 0.158 0.228 0.380 29 G 0.001 0.077 0.035 0.009 0.333 0.043 0.502 30 P 0.002 0.024 0.051 0.013 0.175 0.233 0.502 31 T 0.004 0.194 0.067 0.018 0.168 0.244 0.305 32 G 0.001 0.073 0.039 0.006 0.305 0.048 0.528 33 P 0.001 0.019 0.043 0.008 0.154 0.340 0.435 34 T 0.002 0.104 0.055 0.010 0.198 0.437 0.194 35 G 0.001 0.057 0.027 0.007 0.527 0.050 0.332 36 P 0.001 0.031 0.031 0.011 0.165 0.191 0.570 37 T 0.002 0.185 0.041 0.014 0.197 0.287 0.273 38 G 0.001 0.050 0.017 0.006 0.519 0.037 0.370 39 P 0.001 0.024 0.021 0.006 0.162 0.162 0.624 40 T 0.003 0.230 0.038 0.009 0.169 0.220 0.331 41 G 0.002 0.077 0.030 0.007 0.472 0.050 0.362 42 P 0.002 0.025 0.037 0.009 0.199 0.231 0.495 43 T 0.003 0.152 0.045 0.010 0.193 0.307 0.290 44 G 0.002 0.093 0.033 0.007 0.385 0.053 0.428 45 D 0.002 0.031 0.044 0.011 0.174 0.252 0.487 46 T 0.003 0.128 0.054 0.012 0.210 0.343 0.251 47 G 0.001 0.064 0.029 0.009 0.480 0.052 0.364 48 T 0.002 0.034 0.038 0.012 0.182 0.204 0.528 49 T 0.004 0.209 0.045 0.016 0.180 0.247 0.299 50 G 0.002 0.063 0.024 0.007 0.419 0.045 0.440 51 P 0.002 0.027 0.033 0.008 0.191 0.257 0.482 52 T 0.003 0.166 0.048 0.009 0.191 0.312 0.272 53 G 0.001 0.094 0.044 0.007 0.435 0.070 0.349 54 P 0.001 0.025 0.050 0.011 0.161 0.385 0.365 55 T 0.001 0.081 0.048 0.009 0.177 0.513 0.171 56 G 0.001 0.066 0.018 0.005 0.507 0.041 0.361 57 P 0.002 0.037 0.026 0.007 0.166 0.170 0.593 58 T 0.004 0.199 0.039 0.009 0.198 0.219 0.332 59 G 0.002 0.063 0.024 0.005 0.419 0.045 0.441 60 P 0.002 0.026 0.028 0.007 0.184 0.215 0.539 61 T 0.003 0.138 0.037 0.009 0.209 0.250 0.354 62 G 0.001 0.069 0.025 0.007 0.491 0.050 0.357 63 P 0.002 0.028 0.038 0.015 0.183 0.246 0.488 64 T 0.003 0.100 0.052 0.015 0.189 0.314 0.327 65 G 0.003 0.084 0.048 0.014 0.346 0.076 0.430 66 A 0.004 0.035 0.066 0.021 0.171 0.266 0.437 67 T 0.005 0.142 0.069 0.023 0.174 0.305 0.281 68 G 0.002 0.066 0.039 0.008 0.292 0.059 0.532 69 L 0.003 0.025 0.057 0.010 0.170 0.371 0.365 70 T 0.003 0.116 0.067 0.011 0.184 0.409 0.212 71 G 0.001 0.068 0.049 0.006 0.400 0.081 0.394 72 P 0.001 0.023 0.045 0.011 0.170 0.384 0.365 73 T 0.001 0.074 0.048 0.013 0.207 0.500 0.156 74 G 0.001 0.027 0.011 0.005 0.618 0.034 0.304 75 P 0.001 0.031 0.018 0.006 0.172 0.147 0.625 76 T 0.005 0.268 0.031 0.010 0.162 0.156 0.367 77 G 0.003 0.075 0.028 0.006 0.380 0.049 0.460 78 P 0.003 0.020 0.025 0.007 0.187 0.233 0.525 79 S 0.004 0.080 0.034 0.009 0.237 0.271 0.365 80 G 0.003 0.057 0.047 0.012 0.381 0.100 0.401 81 L 0.002 0.024 0.035 0.022 0.227 0.298 0.392 82 G 0.003 0.052 0.028 0.039 0.279 0.344 0.255 83 L 0.002 0.031 0.010 0.060 0.446 0.041 0.410 84 P 0.004 0.016 0.058 0.402 0.109 0.138 0.273 85 A 0.012 0.018 0.095 0.476 0.052 0.246 0.100 86 G 0.027 0.011 0.138 0.578 0.035 0.146 0.065 87 L 0.054 0.010 0.158 0.577 0.033 0.075 0.092 88 Y 0.109 0.008 0.150 0.408 0.051 0.153 0.121 89 A 0.101 0.029 0.123 0.283 0.012 0.225 0.228 90 F 0.004 0.002 0.007 0.024 0.009 0.005 0.949