# TARGET T0201 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0201.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 I 0.346 0.027 0.002 0.020 0.005 0.008 0.592 3 K 0.613 0.020 0.002 0.014 0.052 0.008 0.291 4 V 0.730 0.006 0.003 0.014 0.019 0.009 0.218 5 T 0.792 0.006 0.003 0.011 0.027 0.011 0.150 6 V 0.773 0.013 0.005 0.013 0.027 0.022 0.148 7 T 0.532 0.010 0.013 0.017 0.106 0.072 0.250 8 N 0.284 0.007 0.049 0.052 0.251 0.169 0.187 9 S 0.267 0.013 0.078 0.087 0.171 0.169 0.214 10 F 0.504 0.024 0.043 0.079 0.076 0.113 0.160 11 F 0.664 0.017 0.023 0.061 0.053 0.040 0.143 12 E 0.721 0.022 0.017 0.048 0.040 0.032 0.120 13 V 0.635 0.026 0.021 0.059 0.051 0.041 0.168 14 T 0.412 0.019 0.028 0.062 0.127 0.103 0.249 15 G 0.198 0.015 0.027 0.049 0.251 0.156 0.305 16 H 0.116 0.023 0.022 0.032 0.282 0.128 0.399 17 A 0.085 0.027 0.025 0.035 0.243 0.082 0.504 18 P 0.037 0.010 0.045 0.047 0.209 0.328 0.325 19 D 0.030 0.009 0.078 0.063 0.220 0.365 0.236 20 K 0.062 0.013 0.114 0.206 0.216 0.146 0.243 21 T 0.165 0.028 0.078 0.301 0.084 0.107 0.237 22 L 0.235 0.018 0.065 0.398 0.061 0.078 0.144 23 C 0.268 0.014 0.039 0.426 0.041 0.057 0.153 24 A 0.211 0.011 0.039 0.534 0.048 0.055 0.103 25 S 0.188 0.008 0.036 0.586 0.038 0.062 0.082 26 V 0.102 0.005 0.028 0.752 0.021 0.034 0.058 27 S 0.090 0.004 0.029 0.761 0.025 0.037 0.054 28 L 0.073 0.006 0.038 0.762 0.024 0.053 0.044 29 L 0.049 0.005 0.039 0.793 0.020 0.052 0.042 30 T 0.028 0.003 0.025 0.842 0.027 0.035 0.040 31 Q 0.014 0.001 0.025 0.869 0.024 0.036 0.030 32 H 0.011 0.002 0.021 0.870 0.022 0.044 0.031 33 V 0.009 0.003 0.020 0.895 0.013 0.033 0.028 34 A 0.007 0.001 0.028 0.878 0.014 0.053 0.020 35 N 0.007 0.001 0.036 0.821 0.017 0.096 0.022 36 F 0.008 0.004 0.032 0.829 0.024 0.069 0.034 37 L 0.015 0.007 0.027 0.753 0.040 0.081 0.077 38 K 0.017 0.003 0.031 0.680 0.042 0.132 0.094 39 A 0.018 0.003 0.039 0.633 0.074 0.106 0.126 40 E 0.029 0.005 0.050 0.657 0.051 0.090 0.118 41 K 0.039 0.006 0.049 0.627 0.048 0.108 0.123 42 K 0.050 0.007 0.050 0.576 0.056 0.114 0.149 43 A 0.075 0.006 0.045 0.533 0.068 0.100 0.174 44 K 0.127 0.011 0.041 0.512 0.052 0.100 0.157 45 I 0.141 0.015 0.032 0.426 0.070 0.067 0.249 46 K 0.162 0.012 0.043 0.364 0.084 0.091 0.244 47 K 0.105 0.006 0.055 0.358 0.144 0.168 0.163 48 E 0.077 0.007 0.058 0.281 0.151 0.242 0.184 49 S 0.074 0.006 0.046 0.156 0.196 0.349 0.174 50 G 0.123 0.007 0.032 0.083 0.194 0.294 0.267 51 Y 0.360 0.018 0.023 0.070 0.098 0.060 0.371 52 L 0.672 0.015 0.014 0.068 0.040 0.022 0.168 53 K 0.739 0.010 0.007 0.053 0.029 0.015 0.148 54 V 0.705 0.017 0.008 0.055 0.028 0.010 0.177 55 K 0.661 0.016 0.009 0.055 0.030 0.013 0.216 56 F 0.373 0.012 0.065 0.257 0.048 0.043 0.203 57 E 0.231 0.007 0.110 0.361 0.073 0.074 0.144 58 E 0.213 0.009 0.106 0.337 0.089 0.088 0.158 59 L 0.128 0.010 0.114 0.458 0.067 0.062 0.161 60 E 0.072 0.005 0.069 0.493 0.082 0.167 0.112 61 N 0.035 0.003 0.042 0.507 0.090 0.224 0.100 62 C 0.077 0.008 0.013 0.453 0.133 0.066 0.251 63 E 0.138 0.009 0.009 0.473 0.064 0.051 0.256 64 V 0.190 0.008 0.009 0.636 0.023 0.020 0.114 65 K 0.134 0.006 0.010 0.738 0.022 0.019 0.070 66 V 0.087 0.004 0.015 0.806 0.021 0.016 0.053 67 L 0.050 0.002 0.012 0.879 0.013 0.013 0.032 68 A 0.031 0.001 0.012 0.906 0.015 0.016 0.018 69 A 0.030 0.001 0.018 0.903 0.011 0.020 0.018 70 M 0.018 0.002 0.018 0.901 0.013 0.028 0.020 71 V 0.016 0.003 0.014 0.892 0.016 0.035 0.024 72 R 0.011 0.001 0.015 0.830 0.026 0.085 0.031 73 S 0.006 0.002 0.015 0.776 0.029 0.118 0.055 74 L 0.005 0.004 0.020 0.804 0.033 0.055 0.079 75 K 0.005 0.002 0.034 0.844 0.024 0.050 0.041 76 E 0.004 0.001 0.052 0.811 0.021 0.077 0.033 77 L 0.004 0.003 0.057 0.784 0.030 0.080 0.042 78 E 0.009 0.004 0.070 0.733 0.033 0.102 0.050 79 Q 0.014 0.002 0.084 0.564 0.048 0.200 0.089 80 K 0.014 0.006 0.058 0.451 0.122 0.223 0.127 81 F 0.024 0.012 0.025 0.102 0.228 0.066 0.543 82 P 0.024 0.005 0.115 0.089 0.117 0.311 0.338 83 S 0.046 0.006 0.190 0.074 0.123 0.385 0.177 84 Q 0.191 0.013 0.144 0.056 0.123 0.178 0.295 85 I 0.535 0.015 0.016 0.029 0.065 0.022 0.317 86 R 0.742 0.009 0.005 0.015 0.033 0.008 0.189 87 V 0.818 0.011 0.005 0.018 0.014 0.006 0.128 88 E 0.823 0.006 0.006 0.025 0.017 0.006 0.116 89 V 0.737 0.014 0.008 0.033 0.027 0.011 0.170 90 I 0.583 0.012 0.011 0.053 0.054 0.039 0.247 91 D 0.338 0.011 0.012 0.069 0.165 0.115 0.291 92 N 0.104 0.008 0.009 0.049 0.290 0.196 0.342 93 G 0.040 0.010 0.004 0.014 0.021 0.138 0.774 94 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998