# TARGET T0197 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0197.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 43 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 2 H 0.086 0.037 0.023 0.069 0.006 0.046 0.733 3 H 0.084 0.010 0.069 0.106 0.247 0.175 0.308 4 H 0.130 0.013 0.081 0.118 0.123 0.229 0.305 5 H 0.221 0.021 0.051 0.093 0.124 0.156 0.334 6 H 0.276 0.014 0.046 0.062 0.187 0.157 0.259 7 H 0.362 0.013 0.037 0.042 0.172 0.107 0.267 8 G 0.656 0.009 0.013 0.026 0.063 0.031 0.203 9 S 0.847 0.008 0.007 0.015 0.044 0.008 0.070 10 E 0.934 0.007 0.005 0.008 0.006 0.003 0.039 11 V 0.939 0.003 0.008 0.007 0.006 0.005 0.033 12 E 0.940 0.002 0.004 0.005 0.012 0.004 0.034 13 I 0.890 0.002 0.006 0.010 0.012 0.004 0.076 14 K 0.905 0.006 0.003 0.005 0.014 0.003 0.063 15 F 0.876 0.006 0.004 0.006 0.012 0.005 0.092 16 K 0.727 0.023 0.006 0.009 0.040 0.017 0.179 17 I 0.363 0.062 0.003 0.013 0.184 0.022 0.353 18 K 0.049 0.005 0.001 0.010 0.086 0.017 0.831 19 L 0.001 0.001 0.024 0.893 0.025 0.047 0.011 20 E 0.001 0.001 0.019 0.948 0.007 0.022 0.003 21 D 0.001 0.001 0.017 0.963 0.003 0.014 0.003 22 F 0.001 0.001 0.003 0.989 0.001 0.005 0.002 23 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.005 0.002 24 H 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.001 25 T 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.001 26 L 0.001 0.001 0.003 0.984 0.002 0.009 0.002 27 N 0.001 0.001 0.006 0.954 0.002 0.035 0.002 28 T 0.001 0.001 0.007 0.896 0.005 0.088 0.004 29 F 0.001 0.001 0.013 0.736 0.035 0.186 0.029 30 N 0.002 0.004 0.019 0.314 0.075 0.422 0.164 31 P 0.006 0.006 0.065 0.358 0.105 0.160 0.300 32 E 0.018 0.005 0.091 0.436 0.122 0.156 0.170 33 F 0.043 0.009 0.066 0.461 0.093 0.117 0.211 34 V 0.060 0.010 0.048 0.559 0.048 0.066 0.209 35 R 0.122 0.007 0.055 0.516 0.064 0.072 0.164 36 Y 0.176 0.009 0.052 0.564 0.054 0.051 0.094 37 E 0.218 0.011 0.037 0.536 0.041 0.049 0.109 38 E 0.261 0.008 0.043 0.477 0.034 0.063 0.113 39 Q 0.247 0.008 0.047 0.402 0.067 0.073 0.156 40 E 0.234 0.010 0.044 0.274 0.204 0.053 0.182 41 D 0.282 0.008 0.036 0.120 0.115 0.051 0.388 42 V 0.470 0.015 0.043 0.138 0.069 0.079 0.185 43 Y 0.471 0.021 0.048 0.126 0.061 0.101 0.172 44 F 0.382 0.012 0.031 0.073 0.150 0.087 0.265 45 E 0.183 0.037 0.017 0.045 0.240 0.075 0.404 46 V 0.053 0.027 0.013 0.023 0.201 0.033 0.651 47 P 0.013 0.006 0.043 0.034 0.138 0.463 0.303 48 R 0.008 0.005 0.078 0.069 0.169 0.538 0.133 49 P 0.020 0.013 0.086 0.210 0.241 0.167 0.264 50 K 0.022 0.020 0.043 0.362 0.108 0.103 0.341 51 L 0.014 0.011 0.057 0.676 0.045 0.074 0.123 52 L 0.021 0.003 0.043 0.745 0.027 0.073 0.087 53 R 0.043 0.002 0.035 0.765 0.019 0.056 0.079 54 I 0.067 0.004 0.031 0.774 0.026 0.033 0.065 55 R 0.079 0.006 0.024 0.790 0.023 0.028 0.049 56 G 0.075 0.004 0.025 0.799 0.017 0.042 0.038 57 V 0.090 0.006 0.027 0.724 0.023 0.096 0.035 58 H 0.079 0.006 0.023 0.539 0.047 0.232 0.074 59 N 0.075 0.011 0.023 0.229 0.160 0.275 0.228 60 L 0.042 0.004 0.032 0.084 0.263 0.317 0.258 61 K 0.034 0.003 0.031 0.022 0.311 0.439 0.159 62 K 0.167 0.006 0.020 0.018 0.267 0.145 0.377 63 Y 0.568 0.025 0.006 0.009 0.053 0.022 0.317 64 Y 0.833 0.013 0.003 0.006 0.021 0.004 0.120 65 L 0.856 0.013 0.004 0.006 0.011 0.005 0.105 66 T 0.824 0.008 0.008 0.008 0.022 0.014 0.116 67 F 0.741 0.014 0.010 0.012 0.035 0.030 0.157 68 K 0.416 0.019 0.012 0.016 0.104 0.042 0.391 69 E 0.188 0.010 0.015 0.013 0.241 0.055 0.477 70 I 0.080 0.011 0.035 0.026 0.152 0.088 0.608 71 L 0.058 0.035 0.067 0.041 0.143 0.106 0.551 72 D 0.046 0.010 0.083 0.063 0.189 0.254 0.354 73 E 0.037 0.008 0.064 0.075 0.204 0.359 0.253 74 N 0.065 0.010 0.037 0.068 0.329 0.121 0.371 75 N 0.138 0.014 0.022 0.052 0.164 0.071 0.540 76 E 0.347 0.048 0.030 0.072 0.097 0.047 0.359 77 E 0.470 0.019 0.041 0.048 0.063 0.034 0.325 78 F 0.575 0.013 0.044 0.034 0.071 0.029 0.233 79 Y 0.719 0.008 0.033 0.025 0.054 0.017 0.144 80 E 0.835 0.007 0.012 0.014 0.022 0.010 0.101 81 V 0.900 0.004 0.006 0.012 0.016 0.007 0.056 82 E 0.919 0.006 0.003 0.006 0.012 0.005 0.049 83 F 0.811 0.008 0.002 0.004 0.027 0.004 0.144 84 E 0.654 0.021 0.002 0.002 0.037 0.008 0.277 85 I 0.258 0.061 0.005 0.003 0.068 0.021 0.583 86 G 0.041 0.022 0.004 0.002 0.371 0.046 0.515 87 D 0.008 0.004 0.006 0.015 0.486 0.036 0.445 88 F 0.001 0.002 0.062 0.734 0.061 0.067 0.072 89 E 0.001 0.001 0.030 0.913 0.012 0.037 0.006 90 K 0.001 0.001 0.021 0.952 0.005 0.014 0.006 91 A 0.001 0.001 0.003 0.990 0.001 0.004 0.001 92 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 93 E 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 94 V 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 95 F 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.006 0.001 96 K 0.001 0.001 0.014 0.959 0.002 0.024 0.001 97 R 0.001 0.001 0.020 0.870 0.005 0.103 0.002 98 L 0.001 0.001 0.027 0.443 0.018 0.503 0.009 99 G 0.003 0.006 0.009 0.057 0.060 0.794 0.072 100 F 0.032 0.008 0.010 0.020 0.107 0.051 0.771 101 K 0.196 0.014 0.034 0.037 0.134 0.024 0.560 102 I 0.411 0.018 0.049 0.076 0.074 0.033 0.339 103 Q 0.510 0.009 0.038 0.136 0.067 0.036 0.204 104 A 0.538 0.006 0.026 0.186 0.044 0.022 0.176 105 T 0.564 0.009 0.016 0.201 0.043 0.027 0.139 106 I 0.607 0.005 0.008 0.257 0.029 0.017 0.076 107 K 0.736 0.003 0.006 0.159 0.015 0.010 0.071 108 K 0.766 0.006 0.010 0.116 0.020 0.013 0.068 109 K 0.807 0.005 0.016 0.081 0.021 0.018 0.053 110 R 0.652 0.005 0.044 0.145 0.051 0.028 0.076 111 W 0.749 0.003 0.026 0.105 0.037 0.015 0.066 112 V 0.770 0.004 0.023 0.071 0.031 0.027 0.075 113 Y 0.845 0.006 0.008 0.056 0.016 0.021 0.048 114 K 0.748 0.008 0.011 0.052 0.022 0.073 0.086 115 L 0.482 0.006 0.019 0.021 0.134 0.204 0.134 116 N 0.048 0.002 0.011 0.003 0.194 0.710 0.033 117 G 0.126 0.001 0.011 0.001 0.170 0.515 0.176 118 V 0.909 0.002 0.001 0.001 0.009 0.002 0.078 119 T 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 120 L 0.986 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 121 E 0.970 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.026 122 V 0.928 0.002 0.001 0.001 0.013 0.002 0.053 123 N 0.793 0.003 0.003 0.002 0.026 0.008 0.166 124 R 0.496 0.014 0.022 0.008 0.103 0.094 0.264 125 V 0.283 0.023 0.064 0.026 0.181 0.164 0.259 126 E 0.091 0.009 0.075 0.028 0.362 0.261 0.174 127 G 0.070 0.010 0.064 0.028 0.219 0.298 0.312 128 I 0.061 0.017 0.095 0.046 0.161 0.439 0.181 129 G 0.069 0.021 0.096 0.042 0.184 0.261 0.328 130 D 0.100 0.006 0.080 0.031 0.275 0.200 0.307 131 F 0.504 0.021 0.029 0.034 0.061 0.112 0.239 132 V 0.692 0.015 0.007 0.019 0.037 0.014 0.216 133 D 0.887 0.003 0.005 0.011 0.021 0.005 0.066 134 I 0.935 0.006 0.007 0.010 0.007 0.004 0.031 135 E 0.934 0.003 0.009 0.014 0.006 0.003 0.031 136 V 0.894 0.009 0.008 0.018 0.009 0.004 0.058 137 I 0.784 0.019 0.008 0.016 0.024 0.013 0.136 138 S 0.436 0.012 0.010 0.018 0.121 0.043 0.360 139 D 0.065 0.014 0.008 0.012 0.370 0.076 0.454 140 S 0.007 0.008 0.008 0.027 0.332 0.049 0.570 141 P 0.001 0.003 0.019 0.151 0.088 0.062 0.676 142 E 0.001 0.001 0.044 0.768 0.036 0.115 0.037 143 E 0.001 0.001 0.035 0.868 0.018 0.050 0.027 144 A 0.001 0.001 0.007 0.965 0.006 0.012 0.010 145 K 0.001 0.001 0.001 0.984 0.004 0.006 0.005 146 E 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.004 0.003 147 K 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 148 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 149 W 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 150 E 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 151 V 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 152 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 153 K 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.008 0.001 154 M 0.001 0.001 0.002 0.933 0.001 0.064 0.001 155 L 0.001 0.001 0.003 0.501 0.023 0.467 0.006 156 G 0.001 0.001 0.002 0.021 0.031 0.851 0.093 157 L 0.001 0.005 0.001 0.001 0.108 0.006 0.879 158 K 0.009 0.019 0.001 0.001 0.023 0.003 0.943 159 E 0.001 0.001 0.472 0.348 0.049 0.097 0.031 160 E 0.002 0.001 0.431 0.418 0.034 0.094 0.020 161 D 0.004 0.002 0.348 0.498 0.037 0.072 0.040 162 V 0.010 0.004 0.044 0.770 0.037 0.062 0.072 163 E 0.027 0.004 0.015 0.759 0.029 0.052 0.115 164 P 0.035 0.005 0.010 0.823 0.018 0.047 0.062 165 R 0.017 0.002 0.006 0.903 0.019 0.014 0.039 166 L 0.016 0.003 0.004 0.933 0.012 0.008 0.024 167 Y 0.006 0.001 0.003 0.975 0.005 0.004 0.006 168 L 0.008 0.001 0.003 0.977 0.002 0.005 0.005 169 E 0.006 0.001 0.005 0.973 0.003 0.009 0.003 170 L 0.005 0.001 0.006 0.963 0.005 0.015 0.005 171 I 0.004 0.001 0.008 0.947 0.006 0.025 0.010 172 N 0.003 0.002 0.022 0.848 0.012 0.095 0.018 173 E 0.004 0.001 0.026 0.689 0.039 0.191 0.049 174 L 0.005 0.005 0.044 0.518 0.067 0.233 0.128 175 S 0.011 0.016 0.031 0.237 0.206 0.165 0.334 176 G 0.010 0.008 0.019 0.080 0.242 0.168 0.473 177 R 0.014 0.014 0.016 0.070 0.266 0.146 0.473 178 S 0.009 0.011 0.008 0.036 0.012 0.078 0.847 179 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998