# TARGET T0196 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0196.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 545 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.012 0.005 0.147 0.061 0.475 0.299 2 H 0.019 0.010 0.096 0.059 0.452 0.364 3 H 0.024 0.011 0.047 0.098 0.449 0.371 4 H 0.025 0.026 0.067 0.174 0.435 0.273 5 H 0.028 0.011 0.099 0.321 0.417 0.124 6 H 0.022 0.010 0.088 0.524 0.256 0.100 7 H 0.018 0.015 0.075 0.605 0.154 0.133 8 G 0.011 0.004 0.023 0.647 0.086 0.229 9 S 0.006 0.001 0.032 0.859 0.041 0.061 10 G 0.003 0.003 0.022 0.933 0.017 0.022 11 L 0.001 0.001 0.006 0.989 0.002 0.002 12 F 0.001 0.001 0.003 0.992 0.003 0.002 13 D 0.001 0.001 0.004 0.989 0.005 0.002 14 F 0.001 0.001 0.005 0.986 0.006 0.002 15 L 0.001 0.001 0.004 0.985 0.006 0.004 16 K 0.001 0.001 0.012 0.964 0.012 0.011 17 R 0.002 0.001 0.006 0.757 0.072 0.162 18 K 0.006 0.005 0.012 0.400 0.139 0.438 19 E 0.015 0.010 0.009 0.175 0.167 0.624 20 V 0.027 0.009 0.012 0.156 0.219 0.577 21 K 0.031 0.018 0.010 0.188 0.183 0.569 22 E 0.020 0.007 0.009 0.147 0.134 0.684 23 E 0.042 0.007 0.019 0.115 0.147 0.670 24 E 0.029 0.012 0.025 0.174 0.169 0.591 25 K 0.034 0.014 0.038 0.281 0.194 0.437 26 I 0.037 0.007 0.053 0.318 0.244 0.340 27 E 0.043 0.008 0.065 0.278 0.324 0.282 28 I 0.024 0.008 0.069 0.226 0.373 0.300 29 L 0.022 0.019 0.044 0.164 0.363 0.388 30 S 0.020 0.008 0.036 0.059 0.392 0.485 31 K 0.017 0.016 0.022 0.037 0.396 0.513 32 K 0.020 0.017 0.026 0.031 0.371 0.536 33 P 0.037 0.013 0.018 0.013 0.438 0.481 34 A 0.079 0.008 0.063 0.015 0.373 0.461 35 G 0.272 0.021 0.034 0.007 0.353 0.313 36 K 0.565 0.015 0.016 0.004 0.151 0.248 37 V 0.608 0.021 0.002 0.002 0.057 0.310 38 V 0.445 0.018 0.007 0.005 0.114 0.412 39 V 0.387 0.017 0.173 0.023 0.225 0.175 40 E 0.317 0.003 0.210 0.032 0.281 0.156 41 E 0.510 0.010 0.166 0.019 0.204 0.092 42 V 0.693 0.013 0.022 0.020 0.108 0.144 43 V 0.809 0.018 0.013 0.016 0.075 0.069 44 N 0.814 0.010 0.008 0.010 0.082 0.077 45 I 0.541 0.008 0.011 0.012 0.200 0.227 46 M 0.266 0.010 0.005 0.008 0.365 0.346 47 G 0.149 0.015 0.008 0.006 0.544 0.279 48 K 0.142 0.004 0.005 0.004 0.435 0.409 49 D 0.638 0.011 0.004 0.003 0.127 0.217 50 V 0.858 0.012 0.001 0.002 0.033 0.095 51 I 0.860 0.013 0.001 0.002 0.029 0.095 52 I 0.720 0.003 0.003 0.003 0.074 0.197 53 G 0.869 0.004 0.002 0.002 0.037 0.087 54 T 0.933 0.012 0.001 0.001 0.018 0.035 55 V 0.909 0.007 0.002 0.001 0.035 0.046 56 E 0.834 0.003 0.009 0.003 0.083 0.068 57 S 0.596 0.012 0.038 0.006 0.217 0.131 58 G 0.448 0.006 0.022 0.006 0.332 0.186 59 M 0.569 0.015 0.009 0.003 0.202 0.203 60 I 0.707 0.071 0.004 0.002 0.093 0.123 61 G 0.306 0.044 0.004 0.003 0.621 0.022 62 V 0.064 0.004 0.006 0.002 0.908 0.016 63 G 0.024 0.001 0.001 0.001 0.957 0.017 64 F 0.545 0.006 0.001 0.001 0.418 0.031 65 K 0.957 0.006 0.001 0.001 0.006 0.031 66 V 0.989 0.003 0.001 0.001 0.001 0.007 67 K 0.982 0.001 0.001 0.001 0.004 0.014 68 G 0.950 0.003 0.001 0.001 0.008 0.039 69 P 0.637 0.004 0.001 0.001 0.080 0.278 70 S 0.255 0.003 0.001 0.001 0.138 0.604 71 G 0.177 0.016 0.001 0.001 0.231 0.575 72 I 0.238 0.014 0.002 0.001 0.240 0.505 73 G 0.520 0.003 0.003 0.001 0.128 0.346 74 G 0.845 0.004 0.001 0.001 0.034 0.115 75 I 0.931 0.005 0.001 0.001 0.011 0.053 76 V 0.908 0.002 0.001 0.001 0.015 0.073 77 R 0.938 0.002 0.001 0.002 0.010 0.048 78 I 0.936 0.002 0.002 0.005 0.016 0.039 79 E 0.880 0.003 0.005 0.012 0.034 0.065 80 R 0.753 0.013 0.028 0.029 0.084 0.093 81 N 0.422 0.013 0.042 0.030 0.237 0.256 82 R 0.210 0.005 0.044 0.031 0.395 0.314 83 E 0.199 0.026 0.068 0.057 0.403 0.247 84 K 0.267 0.044 0.059 0.086 0.329 0.216 85 V 0.093 0.012 0.256 0.198 0.358 0.083 86 E 0.079 0.004 0.267 0.172 0.367 0.111 87 F 0.123 0.010 0.238 0.214 0.319 0.095 88 A 0.224 0.048 0.043 0.110 0.306 0.269 89 I 0.232 0.057 0.027 0.044 0.495 0.146 90 A 0.167 0.023 0.050 0.038 0.594 0.127 91 G 0.060 0.004 0.042 0.011 0.804 0.079 92 D 0.112 0.006 0.039 0.009 0.743 0.090 93 R 0.476 0.016 0.015 0.007 0.290 0.196 94 I 0.715 0.016 0.008 0.006 0.134 0.121 95 G 0.872 0.005 0.004 0.005 0.049 0.065 96 I 0.955 0.007 0.002 0.002 0.015 0.020 97 S 0.947 0.004 0.002 0.002 0.021 0.023 98 I 0.907 0.003 0.004 0.004 0.050 0.032 99 E 0.553 0.007 0.010 0.017 0.273 0.140 100 G 0.379 0.021 0.004 0.007 0.310 0.280 101 K 0.412 0.014 0.003 0.009 0.194 0.368 102 I 0.316 0.016 0.013 0.137 0.194 0.324 103 G 0.225 0.015 0.023 0.322 0.164 0.252 104 K 0.210 0.012 0.041 0.353 0.206 0.177 105 V 0.230 0.010 0.055 0.331 0.205 0.169 106 K 0.337 0.042 0.037 0.168 0.333 0.083 107 K 0.254 0.018 0.044 0.119 0.444 0.122 108 G 0.103 0.002 0.012 0.028 0.581 0.274 109 D 0.368 0.035 0.010 0.011 0.367 0.210 110 V 0.610 0.075 0.004 0.009 0.108 0.195 111 L 0.529 0.046 0.010 0.016 0.183 0.215 112 E 0.487 0.068 0.011 0.008 0.198 0.228 113 I 0.087 0.022 0.020 0.007 0.742 0.123 114 Y 0.019 0.011 0.040 0.006 0.753 0.171 115 Q 0.005 0.006 0.017 0.006 0.676 0.291 116 T 0.002 0.014 0.009 0.004 0.371 0.601