# TARGET T0196 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0196.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 545 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 2 H 0.004 0.013 0.019 0.127 0.007 0.065 0.765 3 H 0.003 0.005 0.061 0.182 0.257 0.150 0.342 4 H 0.005 0.003 0.136 0.242 0.099 0.316 0.199 5 H 0.011 0.010 0.186 0.323 0.107 0.164 0.200 6 H 0.016 0.018 0.148 0.339 0.150 0.150 0.180 7 H 0.016 0.017 0.056 0.337 0.118 0.157 0.299 8 G 0.006 0.005 0.033 0.623 0.045 0.036 0.252 9 S 0.001 0.001 0.034 0.921 0.006 0.024 0.013 10 G 0.001 0.001 0.043 0.911 0.004 0.034 0.007 11 L 0.001 0.001 0.048 0.926 0.003 0.020 0.003 12 F 0.001 0.001 0.045 0.928 0.003 0.017 0.005 13 D 0.002 0.001 0.084 0.866 0.005 0.035 0.007 14 F 0.001 0.001 0.103 0.818 0.007 0.059 0.011 15 L 0.002 0.006 0.116 0.759 0.019 0.069 0.029 16 K 0.004 0.002 0.113 0.645 0.021 0.191 0.024 17 R 0.003 0.001 0.071 0.619 0.029 0.241 0.035 18 K 0.010 0.006 0.038 0.367 0.177 0.162 0.241 19 E 0.023 0.022 0.007 0.050 0.245 0.065 0.588 20 V 0.017 0.015 0.006 0.020 0.152 0.039 0.751 21 K 0.014 0.011 0.026 0.046 0.146 0.071 0.687 22 E 0.025 0.017 0.052 0.078 0.080 0.110 0.639 23 E 0.012 0.008 0.057 0.098 0.034 0.054 0.737 24 E 0.007 0.004 0.045 0.114 0.019 0.022 0.790 25 K 0.018 0.009 0.126 0.322 0.045 0.118 0.362 26 I 0.024 0.015 0.125 0.290 0.123 0.196 0.227 27 E 0.033 0.022 0.100 0.189 0.180 0.185 0.292 28 I 0.034 0.019 0.071 0.123 0.248 0.242 0.262 29 L 0.038 0.020 0.037 0.072 0.046 0.181 0.606 30 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.993 31 K 0.008 0.014 0.012 0.012 0.009 0.065 0.881 32 K 0.009 0.010 0.017 0.013 0.327 0.119 0.505 33 P 0.015 0.003 0.020 0.024 0.519 0.073 0.346 34 A 0.090 0.012 0.014 0.019 0.117 0.043 0.705 35 G 0.284 0.012 0.014 0.012 0.144 0.026 0.509 36 K 0.776 0.029 0.009 0.006 0.038 0.013 0.129 37 V 0.832 0.019 0.002 0.004 0.013 0.003 0.129 38 V 0.721 0.008 0.002 0.003 0.011 0.004 0.252 39 V 0.464 0.013 0.112 0.045 0.067 0.105 0.195 40 E 0.192 0.013 0.278 0.053 0.169 0.184 0.111 41 E 0.241 0.008 0.322 0.051 0.075 0.134 0.170 42 V 0.594 0.016 0.048 0.023 0.058 0.086 0.175 43 V 0.811 0.020 0.011 0.013 0.029 0.024 0.091 44 N 0.879 0.013 0.004 0.005 0.016 0.015 0.068 45 I 0.755 0.013 0.008 0.004 0.034 0.043 0.145 46 M 0.241 0.006 0.018 0.005 0.263 0.411 0.057 47 G 0.280 0.004 0.018 0.004 0.137 0.455 0.102 48 K 0.877 0.004 0.002 0.001 0.016 0.013 0.088 49 D 0.947 0.004 0.001 0.001 0.005 0.002 0.042 50 V 0.907 0.004 0.001 0.001 0.015 0.001 0.072 51 I 0.871 0.007 0.001 0.001 0.019 0.003 0.098 52 I 0.816 0.003 0.004 0.002 0.026 0.008 0.141 53 G 0.844 0.004 0.006 0.003 0.053 0.008 0.081 54 T 0.885 0.012 0.005 0.003 0.014 0.006 0.075 55 V 0.885 0.003 0.009 0.006 0.020 0.027 0.051 56 E 0.804 0.007 0.012 0.011 0.038 0.071 0.058 57 S 0.711 0.008 0.013 0.006 0.049 0.092 0.120 58 G 0.611 0.003 0.005 0.002 0.129 0.068 0.181 59 M 0.849 0.012 0.001 0.001 0.045 0.010 0.082 60 I 0.779 0.058 0.001 0.001 0.011 0.001 0.150 61 G 0.403 0.010 0.003 0.001 0.021 0.006 0.559 62 V 0.035 0.003 0.034 0.001 0.084 0.818 0.024 63 G 0.014 0.002 0.024 0.001 0.072 0.874 0.013 64 F 0.223 0.005 0.008 0.001 0.110 0.031 0.622 65 K 0.788 0.007 0.001 0.001 0.037 0.006 0.161 66 V 0.967 0.011 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 67 K 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 68 G 0.964 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.030 69 P 0.717 0.004 0.001 0.001 0.024 0.004 0.250 70 S 0.347 0.003 0.001 0.001 0.238 0.024 0.387 71 G 0.358 0.009 0.001 0.001 0.215 0.010 0.406 72 I 0.572 0.006 0.001 0.001 0.097 0.005 0.318 73 G 0.761 0.004 0.001 0.001 0.029 0.002 0.203 74 G 0.931 0.010 0.001 0.001 0.014 0.001 0.043 75 I 0.904 0.003 0.001 0.001 0.007 0.002 0.083 76 V 0.859 0.003 0.003 0.001 0.044 0.010 0.079 77 R 0.763 0.006 0.005 0.003 0.030 0.010 0.182 78 I 0.739 0.004 0.012 0.007 0.063 0.048 0.127 79 E 0.837 0.015 0.004 0.009 0.032 0.018 0.084 80 R 0.598 0.027 0.017 0.017 0.056 0.047 0.238 81 N 0.353 0.025 0.015 0.019 0.134 0.108 0.347 82 R 0.240 0.022 0.066 0.029 0.194 0.153 0.297 83 E 0.144 0.016 0.139 0.074 0.234 0.163 0.229 84 K 0.148 0.016 0.180 0.083 0.177 0.166 0.230 85 V 0.084 0.015 0.298 0.104 0.098 0.084 0.316 86 E 0.102 0.006 0.206 0.117 0.158 0.195 0.216 87 F 0.198 0.014 0.174 0.126 0.089 0.203 0.197 88 A 0.170 0.021 0.035 0.067 0.149 0.057 0.501 89 I 0.104 0.017 0.017 0.014 0.087 0.037 0.724 90 A 0.033 0.005 0.155 0.027 0.162 0.488 0.130 91 G 0.015 0.002 0.221 0.008 0.103 0.603 0.048 92 D 0.048 0.006 0.204 0.012 0.234 0.328 0.168 93 R 0.324 0.038 0.030 0.006 0.137 0.090 0.375 94 I 0.568 0.034 0.009 0.002 0.034 0.022 0.331 95 G 0.818 0.010 0.011 0.002 0.024 0.026 0.107 96 I 0.864 0.009 0.008 0.003 0.024 0.021 0.071 97 S 0.873 0.008 0.006 0.004 0.015 0.018 0.076 98 I 0.777 0.016 0.006 0.006 0.017 0.028 0.151 99 E 0.480 0.021 0.013 0.010 0.106 0.142 0.227 100 G 0.230 0.010 0.011 0.011 0.279 0.185 0.274 101 K 0.216 0.023 0.007 0.020 0.142 0.041 0.550 102 I 0.354 0.029 0.016 0.083 0.090 0.046 0.381 103 G 0.400 0.012 0.029 0.147 0.101 0.046 0.266 104 K 0.404 0.015 0.060 0.206 0.070 0.064 0.180 105 V 0.420 0.017 0.055 0.220 0.088 0.047 0.153 106 K 0.373 0.017 0.048 0.279 0.050 0.046 0.187 107 K 0.160 0.005 0.036 0.191 0.120 0.390 0.098 108 G 0.080 0.002 0.019 0.034 0.110 0.648 0.108 109 D 0.303 0.017 0.009 0.021 0.070 0.031 0.549 110 V 0.679 0.041 0.008 0.022 0.028 0.010 0.211 111 L 0.655 0.016 0.007 0.022 0.036 0.018 0.246 112 E 0.445 0.021 0.009 0.028 0.107 0.046 0.345 113 I 0.277 0.029 0.003 0.017 0.148 0.040 0.486 114 Y 0.085 0.014 0.009 0.020 0.133 0.339 0.399 115 Q 0.017 0.007 0.005 0.009 0.028 0.236 0.697 116 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996