# TARGET T0196 # Using neural net t2k-5631-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-CB-burial-14-7-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0196.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 545 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.658 0.206 0.087 0.039 0.008 0.001 0.001 2 H 0.659 0.212 0.076 0.038 0.013 0.002 0.001 3 H 0.539 0.260 0.117 0.057 0.021 0.005 0.001 4 H 0.451 0.257 0.138 0.099 0.042 0.012 0.001 5 H 0.194 0.227 0.245 0.209 0.101 0.022 0.002 6 H 0.376 0.267 0.166 0.124 0.055 0.012 0.001 7 H 0.221 0.394 0.228 0.115 0.036 0.007 0.001 8 G 0.049 0.132 0.199 0.301 0.241 0.075 0.003 9 S 0.113 0.360 0.322 0.161 0.039 0.005 0.001 10 G 0.078 0.287 0.343 0.223 0.060 0.008 0.001 11 L 0.013 0.027 0.037 0.128 0.400 0.372 0.022 12 F 0.007 0.041 0.133 0.354 0.359 0.103 0.004 13 D 0.050 0.402 0.368 0.146 0.029 0.005 0.001 14 F 0.005 0.034 0.163 0.414 0.311 0.070 0.002 15 L 0.002 0.006 0.013 0.072 0.340 0.512 0.054 16 K 0.041 0.182 0.320 0.296 0.127 0.031 0.003 17 R 0.191 0.432 0.244 0.096 0.030 0.008 0.001 18 K 0.022 0.088 0.244 0.359 0.224 0.060 0.004 19 E 0.135 0.252 0.287 0.213 0.096 0.017 0.001 20 V 0.270 0.266 0.228 0.159 0.065 0.011 0.001 21 K 0.497 0.281 0.126 0.073 0.020 0.003 0.001 22 E 0.573 0.254 0.110 0.048 0.013 0.002 0.001 23 E 0.580 0.263 0.102 0.042 0.010 0.002 0.001 24 E 0.526 0.214 0.131 0.089 0.033 0.007 0.001 25 K 0.517 0.268 0.124 0.061 0.023 0.006 0.001 26 I 0.204 0.141 0.212 0.245 0.157 0.038 0.003 27 E 0.616 0.217 0.101 0.048 0.014 0.003 0.001 28 I 0.690 0.228 0.055 0.019 0.006 0.001 0.001 29 L 0.498 0.307 0.139 0.050 0.006 0.001 0.001 30 S 0.751 0.171 0.054 0.019 0.004 0.001 0.001 31 K 0.540 0.250 0.120 0.068 0.019 0.003 0.001 32 K 0.664 0.210 0.073 0.036 0.014 0.003 0.001 33 P 0.343 0.311 0.178 0.110 0.045 0.012 0.001 34 A 0.167 0.199 0.198 0.228 0.136 0.059 0.012 35 G 0.078 0.068 0.087 0.165 0.247 0.259 0.096 36 K 0.090 0.140 0.153 0.189 0.204 0.176 0.047 37 V 0.068 0.084 0.116 0.180 0.222 0.240 0.090 38 V 0.069 0.109 0.124 0.195 0.190 0.214 0.099 39 V 0.062 0.082 0.102 0.186 0.246 0.238 0.084 40 E 0.126 0.188 0.207 0.225 0.167 0.074 0.014 41 E 0.074 0.163 0.210 0.235 0.201 0.106 0.011 42 V 0.095 0.135 0.179 0.261 0.214 0.107 0.009 43 V 0.072 0.130 0.162 0.278 0.240 0.108 0.009 44 N 0.212 0.386 0.240 0.117 0.037 0.008 0.001 45 I 0.091 0.161 0.210 0.283 0.204 0.048 0.003 46 M 0.469 0.374 0.116 0.033 0.006 0.001 0.001 47 G 0.282 0.310 0.201 0.143 0.053 0.010 0.001 48 K 0.243 0.286 0.205 0.159 0.078 0.026 0.003 49 D 0.188 0.321 0.203 0.143 0.104 0.037 0.005 50 V 0.040 0.086 0.151 0.262 0.243 0.182 0.036 51 I 0.023 0.080 0.128 0.244 0.265 0.208 0.051 52 I 0.017 0.080 0.150 0.281 0.242 0.165 0.065 53 G 0.018 0.050 0.068 0.144 0.283 0.342 0.095 54 T 0.021 0.120 0.251 0.284 0.209 0.089 0.027 55 V 0.011 0.033 0.083 0.183 0.273 0.345 0.072 56 E 0.035 0.122 0.192 0.278 0.251 0.112 0.011 57 S 0.090 0.251 0.285 0.214 0.109 0.046 0.005 58 G 0.041 0.148 0.211 0.314 0.201 0.079 0.007 59 M 0.080 0.301 0.291 0.204 0.098 0.025 0.001 60 I 0.018 0.044 0.088 0.265 0.362 0.208 0.014 61 G 0.080 0.324 0.321 0.201 0.063 0.009 0.001 62 V 0.095 0.195 0.267 0.282 0.131 0.029 0.001 63 G 0.235 0.399 0.222 0.110 0.030 0.004 0.001 64 F 0.146 0.350 0.271 0.170 0.055 0.008 0.001 65 K 0.100 0.364 0.324 0.163 0.042 0.007 0.001 66 V 0.011 0.032 0.072 0.223 0.398 0.250 0.013 67 K 0.029 0.160 0.284 0.299 0.170 0.055 0.003 68 G 0.015 0.026 0.054 0.139 0.270 0.431 0.065 69 P 0.023 0.086 0.150 0.273 0.301 0.153 0.013 70 S 0.088 0.202 0.233 0.238 0.154 0.074 0.011 71 G 0.185 0.295 0.230 0.181 0.081 0.024 0.004 72 I 0.297 0.422 0.191 0.068 0.018 0.003 0.001 73 G 0.049 0.152 0.227 0.311 0.198 0.059 0.003 74 G 0.084 0.270 0.322 0.241 0.071 0.013 0.001 75 I 0.022 0.030 0.054 0.155 0.409 0.309 0.022 76 V 0.048 0.233 0.358 0.268 0.078 0.013 0.001 77 R 0.073 0.163 0.208 0.253 0.188 0.102 0.013 78 I 0.031 0.071 0.102 0.195 0.297 0.274 0.030 79 E 0.094 0.186 0.241 0.244 0.153 0.075 0.008 80 R 0.136 0.204 0.208 0.201 0.163 0.079 0.009 81 N 0.139 0.182 0.189 0.219 0.176 0.089 0.007 82 R 0.171 0.209 0.218 0.241 0.129 0.030 0.002 83 E 0.394 0.377 0.159 0.054 0.013 0.002 0.001 84 K 0.367 0.277 0.183 0.118 0.045 0.009 0.001 85 V 0.127 0.148 0.195 0.270 0.198 0.057 0.004 86 E 0.415 0.347 0.154 0.064 0.017 0.003 0.001 87 F 0.509 0.291 0.121 0.057 0.018 0.004 0.001 88 A 0.120 0.136 0.164 0.239 0.227 0.101 0.013 89 I 0.235 0.244 0.197 0.169 0.109 0.041 0.006 90 A 0.229 0.207 0.199 0.180 0.106 0.064 0.015 91 G 0.225 0.194 0.147 0.175 0.146 0.090 0.022 92 D 0.152 0.226 0.205 0.191 0.130 0.072 0.025 93 R 0.110 0.123 0.133 0.176 0.217 0.175 0.067 94 I 0.034 0.053 0.088 0.189 0.207 0.298 0.132 95 G 0.034 0.052 0.092 0.177 0.238 0.302 0.105 96 I 0.020 0.021 0.033 0.070 0.186 0.451 0.218 97 S 0.020 0.076 0.181 0.318 0.263 0.126 0.016 98 I 0.015 0.028 0.069 0.178 0.340 0.321 0.049 99 E 0.106 0.316 0.272 0.201 0.082 0.021 0.002 100 G 0.233 0.342 0.230 0.135 0.048 0.010 0.001 101 K 0.175 0.252 0.251 0.198 0.095 0.027 0.001 102 I 0.217 0.264 0.231 0.186 0.084 0.017 0.001 103 G 0.442 0.336 0.140 0.061 0.017 0.004 0.001 104 K 0.253 0.301 0.226 0.149 0.058 0.012 0.001 105 V 0.083 0.110 0.178 0.292 0.260 0.074 0.004 106 K 0.308 0.384 0.181 0.087 0.031 0.008 0.001 107 K 0.176 0.239 0.250 0.215 0.088 0.028 0.005 108 G 0.128 0.160 0.169 0.231 0.207 0.092 0.012 109 D 0.084 0.144 0.222 0.254 0.200 0.084 0.012 110 V 0.093 0.083 0.116 0.183 0.254 0.233 0.037 111 L 0.144 0.146 0.163 0.194 0.187 0.146 0.019 112 E 0.143 0.130 0.173 0.225 0.201 0.114 0.013 113 I 0.365 0.321 0.166 0.097 0.040 0.010 0.001 114 Y 0.403 0.244 0.151 0.128 0.060 0.012 0.001 115 Q 0.701 0.200 0.068 0.024 0.005 0.001 0.001 116 T 0.783 0.143 0.046 0.021 0.006 0.001 0.001