PFRMAT AL TARGET T0195 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 40 PARENT 1jkmA REMARK SCORE 1.2654e-09 M 1 P 13 K 2 G 14 V 3 R 15 V 4 L 16 K 5 G 17 E 6 D 18 F 7 E 19 S 8 S 20 V 9 S 21 C 10 R 86 G 11 D 87 G 12 D 88 R 13 V 89 L 14 E 90 I 15 T 91 K 16 S 92 L 17 T 93 S 18 E 94 H 19 T 95 N 20 I 96 S 21 L 97 N 22 G 98 S 23 V 99 T 24 D 100 K 25 G 101 T 26 N 102 S 27 E 103 M 28 I 104 N 29 T 105 V 30 L 106 N 31 H 107 I 32 V 108 Y 33 F 109 L 34 R 110 P 35 P 111 K 36 A 112 H 37 G 113 Y 38 V 114 N 46 E 115 K 47 G 116 R 48 V 117 I 49 L 118 P 50 P 119 T 51 G 120 V 52 L 121 F 53 V 122 Y 54 Y 123 L 55 T 124 S 56 H 125 G 57 G 126 L 58 G 127 T 59 G 128 C 60 M 129 T 61 T 130 P 62 I 131 D 63 T 134 N 64 D 135 A 65 N 136 S 66 R 137 E 67 V 138 K 68 H 139 A 69 R 140 F 70 R 141 W 71 W 142 Q 72 C 143 F 73 T 144 Q 74 D 145 A 75 L 146 D 76 A 147 K 77 A 148 Y 78 A 149 G 79 G 150 F 80 S 151 A 81 V 152 I 82 V 153 V 83 V 154 F 84 M 155 P 85 V 156 D 86 D 157 F 110 F 158 Y 111 R 159 L 112 N 160 N 113 A 161 A 114 W 162 T 115 T 163 Q 116 A 164 E 117 E 165 P 118 G 166 Y 119 H 167 A 120 H 168 Q 121 P 169 H 122 F 170 Y 123 P 171 Q 124 S 172 E 132 G 173 L 133 V 174 P 134 E 175 Q 135 D 176 T 136 C 177 L 137 L 178 D 138 A 179 S 139 A 180 H 140 V 181 F 141 L 182 N 142 W 183 K 143 V 184 N 144 D 185 G 145 E 186 D 146 H 187 V 147 R 188 K 148 E 189 L 149 S 190 D 150 L 191 F 151 G 192 L 152 L 193 D 153 S 194 N 154 G 195 V 155 V 196 A 156 V 197 I 157 V 198 T 158 Q 199 G 159 G 200 H 160 E 201 S 161 S 202 M 162 G 203 G 163 G 204 G 164 G 205 Y 165 N 206 G 166 L 207 A 167 A 208 I 168 I 209 C 169 A 210 G 170 T 211 Y 171 A 215 L 172 K 216 K 173 R 217 G 174 R 218 Y 175 G 219 S 176 R 220 G 177 L 221 K 178 D 222 R 179 A 223 Y 180 I 224 K 181 D 225 S 182 G 226 C 183 V 227 S 184 Y 228 A 185 A 229 F 186 S 230 A 187 I 231 P 188 P 232 I 189 Y 233 V 190 I 234 N 191 D 256 P 192 G 257 S 193 Y 258 N 194 F 259 V 195 I 260 P 196 E 261 W 197 N 262 G 198 G 263 Q 199 G 264 K 200 M 265 A 201 A 266 F 202 L 267 K 203 R 270 G 204 A 271 Y 205 Y 272 L 206 D 273 G 207 P 274 E 208 T 275 E 209 G 276 K 210 E 277 A 211 H 278 Q 212 A 279 W 213 E 280 E 214 D 281 A 215 P 282 Y 216 I 283 D 217 A 284 P 218 W 285 C 219 P 286 L 220 Y 287 L 221 F 288 I 222 A 289 K 223 S 290 N 224 E 291 I 225 D 292 R 226 E 293 H 227 L 294 V 228 R 295 G 229 G 296 D 230 L 297 D 231 P 298 R 232 P 299 I 233 F 300 L 234 V 301 I 235 V 302 H 236 A 303 V 237 V 304 G 238 N 305 D 239 E 306 S 240 L 307 D 241 D 308 P 242 P 309 F 243 L 310 L 244 R 311 E 245 D 312 E 246 E 313 L 252 G 314 L 253 I 315 L 254 A 316 E 255 F 317 A 256 A 318 V 257 R 319 K 258 R 320 A 259 L 321 T 260 A 322 S 261 R 323 W 262 A 324 Q 263 G 325 D 264 V 326 Y 265 D 327 V 266 V 328 E 267 A 329 I 268 A 330 K 269 R 331 K 270 V 332 V 271 N 333 H 272 I 334 G 273 G 335 F 274 L 336 D 275 H 346 H 276 W 347 S 277 L 348 Y 278 P 349 Y 279 A 350 F 280 A 351 V 281 L 352 S 282 E 353 T 283 S 354 F 284 T 355 V 285 V 356 P 286 R 357 E 287 D 358 H 288 V 359 A 289 A 360 E 290 G 361 F 291 F 362 H 292 A 363 A 293 A 364 R 294 D 365 N 295 R 366 L 296 A 367 G 297 R 368 L 298 L 369 I 299 R 370 TER END