# TARGET T0192 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0192.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 291 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.031 0.010 0.005 0.009 0.181 0.763 2 A 0.121 0.022 0.010 0.011 0.139 0.697 3 K 0.256 0.009 0.014 0.013 0.145 0.562 4 F 0.738 0.013 0.007 0.008 0.059 0.175 5 V 0.882 0.009 0.002 0.004 0.023 0.080 6 I 0.893 0.006 0.002 0.003 0.016 0.080 7 R 0.715 0.005 0.007 0.004 0.053 0.217 8 P 0.579 0.009 0.019 0.004 0.120 0.268 9 A 0.170 0.009 0.007 0.002 0.247 0.566 10 T 0.044 0.011 0.005 0.004 0.276 0.660 11 A 0.008 0.001 0.402 0.131 0.364 0.094 12 A 0.003 0.002 0.422 0.233 0.280 0.061 13 D 0.002 0.002 0.314 0.544 0.094 0.045 14 C 0.001 0.001 0.032 0.907 0.027 0.033 15 S 0.001 0.001 0.014 0.956 0.017 0.012 16 D 0.001 0.001 0.016 0.971 0.007 0.004 17 I 0.002 0.001 0.007 0.984 0.005 0.003 18 L 0.001 0.001 0.004 0.988 0.005 0.002 19 R 0.001 0.001 0.003 0.982 0.008 0.006 20 L 0.002 0.001 0.003 0.974 0.012 0.009 21 I 0.002 0.001 0.004 0.965 0.016 0.013 22 K 0.001 0.001 0.007 0.943 0.027 0.020 23 E 0.001 0.001 0.009 0.913 0.041 0.036 24 L 0.003 0.001 0.010 0.847 0.065 0.073 25 A 0.008 0.003 0.030 0.640 0.155 0.164 26 K 0.009 0.003 0.046 0.648 0.169 0.126 27 Y 0.012 0.002 0.051 0.626 0.175 0.133 28 E 0.019 0.005 0.042 0.499 0.225 0.211 29 Y 0.036 0.008 0.044 0.371 0.248 0.292 30 M 0.028 0.006 0.047 0.405 0.247 0.266 31 E 0.024 0.005 0.044 0.443 0.234 0.250 32 E 0.025 0.006 0.037 0.453 0.214 0.265 33 Q 0.029 0.008 0.036 0.497 0.186 0.244 34 V 0.027 0.005 0.036 0.618 0.135 0.179 35 I 0.034 0.005 0.028 0.651 0.113 0.169 36 L 0.026 0.004 0.022 0.683 0.098 0.167 37 T 0.024 0.004 0.016 0.723 0.069 0.165 38 E 0.019 0.002 0.015 0.820 0.054 0.090 39 K 0.013 0.002 0.015 0.853 0.051 0.067 40 D 0.009 0.002 0.015 0.844 0.057 0.073 41 L 0.008 0.002 0.011 0.853 0.051 0.075 42 L 0.009 0.002 0.014 0.860 0.059 0.057 43 E 0.007 0.002 0.017 0.857 0.068 0.050 44 D 0.008 0.001 0.022 0.813 0.080 0.075 45 G 0.010 0.003 0.028 0.763 0.104 0.092 46 F 0.009 0.003 0.043 0.706 0.140 0.099 47 G 0.013 0.004 0.033 0.526 0.234 0.190 48 E 0.019 0.006 0.039 0.311 0.317 0.308 49 H 0.023 0.008 0.041 0.140 0.444 0.345 50 P 0.025 0.006 0.065 0.117 0.474 0.312 51 F 0.059 0.008 0.081 0.112 0.451 0.290 52 Y 0.192 0.011 0.070 0.105 0.345 0.277 53 H 0.504 0.011 0.038 0.077 0.150 0.221 54 C 0.808 0.007 0.011 0.045 0.044 0.085 55 L 0.884 0.004 0.005 0.039 0.020 0.048 56 V 0.870 0.004 0.004 0.053 0.019 0.051 57 A 0.785 0.004 0.007 0.085 0.036 0.083 58 E 0.619 0.006 0.022 0.127 0.080 0.145 59 V 0.451 0.012 0.036 0.097 0.152 0.252 60 P 0.307 0.016 0.039 0.075 0.175 0.388 61 K 0.344 0.013 0.049 0.095 0.193 0.307 62 E 0.311 0.009 0.072 0.199 0.223 0.186 63 H 0.309 0.008 0.089 0.248 0.218 0.128 64 W 0.246 0.008 0.122 0.310 0.232 0.081 65 T 0.275 0.013 0.103 0.243 0.271 0.094 66 P 0.223 0.014 0.064 0.202 0.392 0.106 67 E 0.124 0.015 0.050 0.098 0.623 0.090 68 G 0.053 0.005 0.035 0.026 0.787 0.093 69 H 0.072 0.003 0.021 0.005 0.736 0.162 70 S 0.598 0.008 0.004 0.001 0.216 0.172 71 I 0.932 0.005 0.001 0.001 0.017 0.046 72 V 0.979 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 73 G 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 74 F 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 75 A 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 76 M 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 77 Y 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.016 78 Y 0.954 0.003 0.001 0.001 0.019 0.023 79 F 0.874 0.006 0.003 0.002 0.048 0.067 80 T 0.578 0.013 0.009 0.007 0.202 0.190 81 Y 0.260 0.025 0.026 0.029 0.402 0.258 82 D 0.143 0.015 0.029 0.034 0.503 0.276 83 P 0.077 0.011 0.082 0.076 0.610 0.143 84 W 0.066 0.009 0.097 0.100 0.550 0.178 85 I 0.106 0.025 0.102 0.064 0.543 0.160 86 G 0.107 0.007 0.034 0.027 0.542 0.282 87 K 0.173 0.013 0.015 0.011 0.287 0.501 88 L 0.538 0.028 0.008 0.008 0.148 0.269 89 L 0.699 0.007 0.005 0.006 0.077 0.208 90 Y 0.865 0.005 0.002 0.006 0.028 0.093 91 L 0.885 0.006 0.004 0.011 0.026 0.069 92 E 0.875 0.003 0.006 0.011 0.034 0.071 93 D 0.894 0.004 0.008 0.010 0.033 0.051 94 F 0.864 0.003 0.006 0.007 0.046 0.074 95 F 0.908 0.009 0.003 0.004 0.028 0.047 96 V 0.741 0.038 0.005 0.006 0.062 0.147 97 M 0.182 0.013 0.006 0.020 0.270 0.509 98 S 0.005 0.001 0.496 0.217 0.249 0.032 99 D 0.003 0.001 0.512 0.162 0.303 0.018 100 Y 0.002 0.001 0.462 0.227 0.292 0.016 101 R 0.006 0.005 0.156 0.319 0.320 0.195 102 G 0.012 0.004 0.027 0.433 0.265 0.260 103 F 0.020 0.003 0.008 0.366 0.171 0.432 104 G 0.024 0.007 0.002 0.103 0.105 0.760 105 I 0.015 0.013 0.007 0.708 0.061 0.196 106 G 0.009 0.002 0.012 0.820 0.025 0.133 107 S 0.001 0.001 0.009 0.976 0.005 0.009 108 E 0.001 0.001 0.010 0.981 0.003 0.004 109 I 0.001 0.001 0.004 0.989 0.002 0.004 110 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 111 K 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 112 N 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 113 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 114 S 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 115 Q 0.001 0.001 0.001 0.993 0.004 0.002 116 V 0.001 0.001 0.001 0.993 0.005 0.002 117 A 0.001 0.001 0.003 0.987 0.008 0.002 118 M 0.001 0.001 0.012 0.972 0.012 0.003 119 R 0.001 0.001 0.016 0.928 0.038 0.017 120 C 0.001 0.001 0.021 0.680 0.119 0.179 121 R 0.002 0.001 0.001 0.003 0.086 0.906 122 C 0.023 0.001 0.001 0.001 0.137 0.836 123 S 0.274 0.004 0.003 0.001 0.129 0.590 124 S 0.945 0.007 0.001 0.001 0.014 0.034 125 M 0.984 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 126 H 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 127 F 0.980 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 128 L 0.943 0.001 0.001 0.002 0.017 0.036 129 V 0.825 0.008 0.001 0.005 0.057 0.104 130 A 0.588 0.018 0.004 0.013 0.202 0.175 131 E 0.232 0.013 0.012 0.038 0.450 0.256 132 W 0.055 0.006 0.018 0.076 0.558 0.287 133 N 0.047 0.019 0.020 0.186 0.423 0.305 134 E 0.027 0.006 0.032 0.610 0.198 0.126 135 P 0.016 0.006 0.034 0.820 0.061 0.063 136 S 0.005 0.001 0.013 0.962 0.011 0.008 137 I 0.002 0.001 0.005 0.982 0.007 0.003 138 N 0.003 0.001 0.002 0.986 0.005 0.003 139 F 0.004 0.001 0.002 0.988 0.004 0.001 140 Y 0.005 0.001 0.005 0.981 0.007 0.002 141 K 0.006 0.001 0.009 0.972 0.009 0.004 142 R 0.003 0.001 0.008 0.971 0.010 0.008 143 R 0.005 0.001 0.003 0.904 0.018 0.069 144 G 0.018 0.001 0.001 0.022 0.060 0.899 145 A 0.230 0.007 0.002 0.013 0.082 0.667 146 S 0.677 0.011 0.004 0.012 0.081 0.215 147 D 0.677 0.020 0.011 0.018 0.107 0.168 148 L 0.478 0.007 0.034 0.030 0.202 0.250 149 S 0.370 0.006 0.021 0.017 0.277 0.308 150 S 0.422 0.033 0.017 0.022 0.226 0.279 151 E 0.339 0.042 0.014 0.021 0.378 0.205 152 E 0.245 0.010 0.029 0.036 0.487 0.193 153 G 0.156 0.008 0.030 0.037 0.589 0.180 154 W 0.400 0.035 0.026 0.047 0.348 0.143 155 R 0.545 0.051 0.016 0.046 0.171 0.171 156 L 0.445 0.020 0.034 0.051 0.237 0.213 157 F 0.230 0.014 0.027 0.043 0.362 0.323 158 K 0.080 0.015 0.026 0.046 0.408 0.425 159 I 0.036 0.019 0.013 0.048 0.332 0.553 160 D 0.020 0.008 0.010 0.126 0.201 0.636 161 K 0.002 0.001 0.025 0.876 0.054 0.042 162 E 0.002 0.001 0.022 0.920 0.038 0.017 163 Y 0.001 0.001 0.033 0.939 0.022 0.005 164 L 0.002 0.001 0.024 0.944 0.019 0.010 165 L 0.002 0.001 0.047 0.921 0.024 0.007 166 K 0.001 0.001 0.040 0.912 0.032 0.013 167 M 0.002 0.001 0.028 0.907 0.038 0.025 168 A 0.004 0.006 0.053 0.814 0.059 0.064 169 T 0.009 0.004 0.039 0.522 0.122 0.305 170 E 0.006 0.002 0.018 0.215 0.095 0.664 171 E 0.003 0.005 0.011 0.147 0.064 0.772