# TARGET T0192 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0192.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 291 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 A 0.087 0.009 0.003 0.003 0.015 0.013 0.869 3 K 0.389 0.013 0.005 0.004 0.169 0.021 0.399 4 F 0.834 0.009 0.002 0.003 0.008 0.005 0.139 5 V 0.898 0.005 0.001 0.003 0.005 0.002 0.087 6 I 0.719 0.009 0.001 0.003 0.015 0.004 0.250 7 R 0.437 0.007 0.005 0.003 0.091 0.014 0.443 8 P 0.256 0.013 0.008 0.004 0.224 0.033 0.461 9 A 0.041 0.020 0.004 0.002 0.218 0.011 0.704 10 T 0.019 0.009 0.001 0.001 0.067 0.004 0.899 11 A 0.001 0.001 0.502 0.261 0.054 0.160 0.021 12 A 0.001 0.002 0.461 0.276 0.089 0.143 0.028 13 D 0.001 0.002 0.280 0.473 0.076 0.050 0.118 14 C 0.001 0.001 0.019 0.952 0.005 0.011 0.013 15 S 0.001 0.001 0.007 0.963 0.003 0.022 0.004 16 D 0.001 0.001 0.006 0.967 0.002 0.021 0.003 17 I 0.001 0.001 0.001 0.988 0.003 0.005 0.003 18 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.004 0.002 19 R 0.001 0.001 0.001 0.983 0.001 0.012 0.002 20 L 0.001 0.001 0.002 0.979 0.003 0.012 0.004 21 I 0.002 0.001 0.003 0.975 0.003 0.013 0.003 22 K 0.002 0.001 0.008 0.935 0.006 0.044 0.005 23 E 0.003 0.001 0.009 0.872 0.012 0.091 0.013 24 L 0.007 0.003 0.017 0.778 0.032 0.106 0.058 25 A 0.022 0.010 0.034 0.629 0.064 0.116 0.126 26 K 0.027 0.007 0.061 0.557 0.073 0.136 0.139 27 Y 0.026 0.006 0.065 0.514 0.096 0.162 0.131 28 E 0.037 0.008 0.054 0.427 0.108 0.194 0.172 29 Y 0.044 0.009 0.054 0.351 0.136 0.175 0.231 30 M 0.049 0.011 0.062 0.294 0.131 0.135 0.318 31 E 0.041 0.009 0.071 0.305 0.138 0.154 0.282 32 E 0.036 0.007 0.075 0.339 0.127 0.168 0.247 33 Q 0.032 0.009 0.075 0.350 0.101 0.154 0.280 34 V 0.030 0.009 0.056 0.399 0.090 0.094 0.323 35 I 0.034 0.007 0.043 0.524 0.076 0.090 0.226 36 L 0.029 0.008 0.040 0.598 0.067 0.081 0.178 37 T 0.020 0.007 0.030 0.625 0.054 0.052 0.211 38 E 0.010 0.003 0.018 0.810 0.029 0.033 0.097 39 K 0.008 0.002 0.013 0.872 0.021 0.031 0.053 40 D 0.006 0.001 0.010 0.900 0.016 0.030 0.037 41 L 0.004 0.001 0.006 0.906 0.017 0.025 0.039 42 L 0.005 0.002 0.006 0.914 0.016 0.028 0.029 43 E 0.006 0.001 0.008 0.892 0.017 0.048 0.028 44 D 0.005 0.001 0.013 0.852 0.019 0.071 0.039 45 G 0.008 0.005 0.024 0.756 0.031 0.109 0.067 46 F 0.010 0.004 0.047 0.629 0.046 0.195 0.068 47 G 0.012 0.003 0.056 0.454 0.086 0.289 0.100 48 E 0.011 0.005 0.045 0.279 0.188 0.266 0.206 49 H 0.020 0.007 0.044 0.121 0.228 0.158 0.423 50 P 0.027 0.007 0.070 0.088 0.215 0.251 0.341 51 F 0.074 0.010 0.079 0.082 0.180 0.318 0.257 52 Y 0.220 0.010 0.059 0.077 0.171 0.110 0.352 53 H 0.516 0.019 0.029 0.055 0.086 0.037 0.258 54 C 0.820 0.013 0.012 0.031 0.018 0.011 0.095 55 L 0.894 0.006 0.008 0.029 0.010 0.008 0.045 56 V 0.916 0.005 0.005 0.027 0.006 0.006 0.035 57 A 0.870 0.006 0.006 0.028 0.010 0.010 0.070 58 E 0.729 0.009 0.010 0.036 0.038 0.030 0.148 59 V 0.539 0.009 0.020 0.052 0.097 0.048 0.235 60 P 0.433 0.010 0.040 0.068 0.100 0.075 0.272 61 K 0.402 0.009 0.072 0.108 0.111 0.120 0.177 62 E 0.418 0.012 0.095 0.135 0.082 0.089 0.170 63 H 0.583 0.010 0.053 0.125 0.063 0.043 0.124 64 W 0.657 0.007 0.030 0.128 0.037 0.030 0.111 65 T 0.580 0.010 0.032 0.186 0.035 0.044 0.111 66 P 0.405 0.008 0.038 0.197 0.069 0.128 0.156 67 E 0.258 0.005 0.054 0.120 0.122 0.203 0.238 68 G 0.043 0.003 0.046 0.034 0.135 0.684 0.055 69 H 0.054 0.001 0.018 0.003 0.158 0.686 0.081 70 S 0.568 0.014 0.004 0.001 0.103 0.018 0.292 71 I 0.834 0.026 0.001 0.001 0.007 0.001 0.131 72 V 0.926 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.061 73 G 0.981 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.009 74 F 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 75 A 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 76 M 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 77 Y 0.940 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.052 78 Y 0.897 0.006 0.001 0.001 0.014 0.002 0.080 79 F 0.746 0.045 0.002 0.002 0.032 0.009 0.163 80 T 0.411 0.024 0.012 0.006 0.124 0.085 0.338 81 Y 0.195 0.023 0.038 0.018 0.257 0.286 0.183 82 D 0.065 0.019 0.075 0.031 0.281 0.245 0.284 83 P 0.043 0.008 0.083 0.049 0.272 0.312 0.233 84 W 0.050 0.009 0.073 0.063 0.203 0.357 0.244 85 I 0.065 0.012 0.048 0.048 0.207 0.147 0.471 86 G 0.105 0.012 0.049 0.043 0.174 0.179 0.438 87 K 0.139 0.016 0.051 0.039 0.297 0.146 0.313 88 L 0.391 0.027 0.027 0.020 0.124 0.062 0.350 89 L 0.599 0.014 0.007 0.010 0.046 0.014 0.311 90 Y 0.828 0.017 0.005 0.007 0.022 0.005 0.116 91 L 0.860 0.009 0.017 0.016 0.020 0.009 0.070 92 E 0.797 0.006 0.032 0.039 0.031 0.011 0.084 93 D 0.807 0.006 0.030 0.030 0.023 0.010 0.094 94 F 0.860 0.003 0.015 0.020 0.021 0.025 0.056 95 F 0.912 0.006 0.007 0.009 0.015 0.011 0.040 96 V 0.865 0.041 0.002 0.005 0.019 0.003 0.064 97 M 0.407 0.008 0.003 0.005 0.028 0.007 0.543 98 S 0.004 0.001 0.576 0.224 0.011 0.176 0.009 99 D 0.002 0.001 0.596 0.190 0.039 0.165 0.008 100 Y 0.002 0.001 0.751 0.122 0.019 0.087 0.019 101 R 0.005 0.003 0.285 0.236 0.078 0.324 0.069 102 G 0.006 0.003 0.098 0.060 0.061 0.721 0.051 103 F 0.019 0.005 0.049 0.103 0.391 0.153 0.281 104 G 0.028 0.013 0.028 0.149 0.258 0.089 0.435 105 I 0.025 0.024 0.026 0.474 0.160 0.049 0.242 106 G 0.004 0.001 0.009 0.811 0.030 0.018 0.126 107 S 0.001 0.001 0.003 0.984 0.003 0.006 0.004 108 E 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 109 I 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 110 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 111 K 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 112 N 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 113 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 114 S 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 115 Q 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 116 V 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 117 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.004 0.002 118 M 0.001 0.001 0.002 0.978 0.001 0.015 0.003 119 R 0.001 0.001 0.010 0.853 0.010 0.117 0.007 120 C 0.001 0.001 0.004 0.107 0.013 0.874 0.002 121 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.971 0.011 122 C 0.046 0.004 0.001 0.001 0.045 0.009 0.895 123 S 0.305 0.007 0.003 0.001 0.174 0.017 0.493 124 S 0.859 0.004 0.003 0.001 0.038 0.007 0.089 125 M 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.027 126 H 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 127 F 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 128 L 0.925 0.003 0.001 0.001 0.007 0.001 0.063 129 V 0.679 0.011 0.005 0.003 0.043 0.007 0.252 130 A 0.307 0.014 0.017 0.010 0.141 0.036 0.475 131 E 0.114 0.013 0.081 0.043 0.180 0.246 0.323 132 W 0.029 0.011 0.064 0.066 0.290 0.253 0.287 133 N 0.018 0.005 0.032 0.114 0.203 0.078 0.549 134 E 0.006 0.003 0.061 0.637 0.073 0.109 0.111 135 P 0.004 0.004 0.038 0.812 0.020 0.083 0.040 136 S 0.001 0.001 0.013 0.947 0.006 0.015 0.016 137 I 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.003 0.004 138 N 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 139 F 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 140 Y 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 141 K 0.001 0.001 0.002 0.986 0.001 0.010 0.001 142 R 0.001 0.001 0.003 0.942 0.002 0.051 0.001 143 R 0.001 0.001 0.004 0.510 0.013 0.468 0.004 144 G 0.002 0.001 0.002 0.030 0.042 0.875 0.049 145 A 0.065 0.012 0.003 0.022 0.046 0.017 0.836 146 S 0.481 0.032 0.011 0.043 0.036 0.011 0.385 147 D 0.552 0.017 0.038 0.056 0.035 0.021 0.281 148 L 0.476 0.014 0.067 0.073 0.067 0.072 0.231 149 S 0.424 0.007 0.052 0.059 0.120 0.106 0.232 150 S 0.469 0.015 0.036 0.063 0.122 0.066 0.229 151 E 0.451 0.022 0.031 0.079 0.072 0.041 0.303 152 E 0.294 0.011 0.068 0.099 0.119 0.208 0.200 153 G 0.219 0.012 0.081 0.088 0.119 0.285 0.197 154 W 0.291 0.039 0.072 0.103 0.121 0.113 0.261 155 R 0.333 0.035 0.060 0.096 0.099 0.113 0.263 156 L 0.196 0.020 0.076 0.074 0.144 0.198 0.292 157 F 0.114 0.011 0.067 0.083 0.174 0.252 0.300 158 K 0.067 0.014 0.055 0.073 0.208 0.231 0.351 159 I 0.058 0.030 0.021 0.069 0.269 0.084 0.469 160 D 0.031 0.016 0.009 0.104 0.153 0.046 0.641 161 K 0.002 0.001 0.021 0.915 0.019 0.023 0.020 162 E 0.001 0.001 0.010 0.969 0.005 0.009 0.006 163 Y 0.001 0.001 0.007 0.980 0.003 0.006 0.004 164 L 0.001 0.001 0.003 0.988 0.001 0.004 0.003 165 L 0.002 0.001 0.004 0.978 0.003 0.009 0.004 166 K 0.003 0.001 0.006 0.949 0.004 0.034 0.004 167 M 0.003 0.001 0.010 0.882 0.012 0.079 0.013 168 A 0.008 0.007 0.015 0.713 0.050 0.152 0.055 169 T 0.009 0.003 0.022 0.493 0.069 0.293 0.110 170 E 0.009 0.010 0.023 0.297 0.010 0.276 0.375 171 E 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.995