# TARGET T0191 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0191.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 188 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 I 0.057 0.028 0.013 0.025 0.290 0.587 2 G 0.059 0.030 0.009 0.024 0.326 0.551 3 Y 0.064 0.034 0.009 0.043 0.334 0.516 4 N 0.037 0.012 0.010 0.163 0.329 0.450 5 T 0.032 0.025 0.008 0.244 0.177 0.513 6 D 0.013 0.011 0.012 0.808 0.039 0.117 7 G 0.001 0.001 0.005 0.978 0.007 0.008 8 I 0.001 0.001 0.003 0.989 0.004 0.002 9 G 0.001 0.001 0.002 0.992 0.003 0.002 10 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 11 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 12 M 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 13 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 14 L 0.001 0.001 0.003 0.992 0.004 0.001 15 E 0.001 0.001 0.014 0.966 0.015 0.005 16 E 0.001 0.001 0.025 0.896 0.055 0.023 17 E 0.006 0.002 0.030 0.619 0.156 0.188 18 I 0.015 0.008 0.030 0.060 0.346 0.541 19 G 0.076 0.044 0.035 0.021 0.344 0.479 20 R 0.113 0.028 0.041 0.016 0.496 0.307 21 V 0.018 0.007 0.119 0.016 0.824 0.015 22 K 0.010 0.002 0.100 0.012 0.861 0.016 23 D 0.022 0.002 0.053 0.004 0.899 0.020 24 K 0.333 0.004 0.004 0.002 0.503 0.154 25 N 0.886 0.007 0.001 0.001 0.016 0.091 26 I 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 27 V 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 28 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 29 Y 0.955 0.002 0.001 0.001 0.007 0.035 30 G 0.359 0.008 0.002 0.002 0.082 0.547 31 A 0.031 0.005 0.019 0.088 0.279 0.578 32 G 0.001 0.002 0.037 0.240 0.280 0.440 33 G 0.001 0.001 0.028 0.960 0.008 0.003 34 A 0.001 0.001 0.007 0.991 0.002 0.001 35 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 36 R 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 37 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 38 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 39 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 40 F 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 41 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 42 L 0.001 0.001 0.002 0.993 0.003 0.002 43 A 0.001 0.001 0.004 0.975 0.014 0.007 44 K 0.001 0.001 0.005 0.789 0.090 0.116 45 D 0.002 0.001 0.004 0.055 0.228 0.710 46 N 0.023 0.004 0.004 0.008 0.289 0.673 47 N 0.278 0.008 0.006 0.006 0.217 0.485 48 I 0.892 0.005 0.001 0.003 0.031 0.068 49 I 0.974 0.001 0.001 0.001 0.008 0.016 50 I 0.986 0.002 0.001 0.001 0.003 0.009 51 A 0.961 0.001 0.001 0.001 0.008 0.030 52 N 0.772 0.006 0.002 0.001 0.069 0.150 53 R 0.155 0.024 0.004 0.003 0.279 0.534 54 T 0.035 0.009 0.001 0.007 0.210 0.738 55 V 0.001 0.001 0.043 0.850 0.086 0.020 56 E 0.001 0.001 0.021 0.924 0.044 0.010 57 K 0.001 0.001 0.023 0.957 0.016 0.003 58 A 0.001 0.001 0.004 0.984 0.005 0.006 59 E 0.001 0.001 0.002 0.988 0.005 0.004 60 A 0.001 0.001 0.006 0.984 0.006 0.003 61 L 0.001 0.001 0.004 0.983 0.008 0.004 62 A 0.001 0.001 0.008 0.971 0.014 0.006 63 K 0.002 0.001 0.008 0.944 0.028 0.017 64 E 0.002 0.001 0.010 0.878 0.054 0.055 65 I 0.006 0.006 0.013 0.781 0.089 0.105 66 A 0.005 0.003 0.050 0.489 0.270 0.182 67 E 0.007 0.002 0.068 0.414 0.333 0.176 68 K 0.013 0.004 0.065 0.311 0.357 0.250 69 L 0.026 0.006 0.032 0.175 0.362 0.399 70 N 0.063 0.008 0.037 0.133 0.329 0.431 71 K 0.140 0.013 0.057 0.145 0.327 0.318 72 K 0.235 0.014 0.064 0.152 0.276 0.259 73 F 0.324 0.014 0.050 0.114 0.207 0.291 74 G 0.373 0.008 0.037 0.073 0.163 0.346 75 E 0.500 0.008 0.024 0.059 0.120 0.289 76 E 0.641 0.020 0.017 0.039 0.073 0.209 77 V 0.443 0.053 0.008 0.028 0.100 0.369 78 K 0.149 0.009 0.009 0.034 0.165 0.634 79 F 0.012 0.002 0.267 0.270 0.284 0.166 80 S 0.003 0.002 0.343 0.319 0.226 0.108 81 G 0.002 0.001 0.315 0.462 0.158 0.062 82 L 0.003 0.002 0.060 0.756 0.100 0.080 83 D 0.002 0.002 0.066 0.789 0.107 0.033 84 V 0.002 0.002 0.107 0.683 0.166 0.040 85 D 0.004 0.001 0.148 0.517 0.262 0.067 86 L 0.003 0.003 0.396 0.350 0.217 0.031 87 D 0.005 0.002 0.284 0.273 0.338 0.098 88 G 0.018 0.002 0.240 0.134 0.341 0.266 89 V 0.097 0.006 0.036 0.038 0.357 0.466 90 D 0.233 0.002 0.014 0.017 0.236 0.497 91 I 0.924 0.003 0.001 0.005 0.019 0.049 92 I 0.986 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 93 I 0.983 0.002 0.001 0.001 0.003 0.011 94 N 0.925 0.001 0.001 0.002 0.012 0.059 95 A 0.673 0.006 0.004 0.003 0.053 0.261 96 T 0.327 0.024 0.009 0.008 0.157 0.475 97 P 0.184 0.033 0.013 0.006 0.353 0.412 98 I 0.086 0.030 0.038 0.012 0.475 0.359 99 G 0.030 0.009 0.066 0.014 0.613 0.269 100 M 0.040 0.022 0.083 0.027 0.601 0.227 101 Y 0.032 0.032 0.038 0.028 0.476 0.393 102 P 0.034 0.035 0.042 0.047 0.446 0.395 103 N 0.035 0.030 0.040 0.050 0.501 0.344 104 I 0.028 0.018 0.093 0.119 0.522 0.220 105 D 0.026 0.010 0.074 0.117 0.497 0.275 106 V 0.035 0.017 0.076 0.133 0.428 0.311 107 E 0.038 0.023 0.050 0.155 0.293 0.441 108 P 0.031 0.012 0.041 0.188 0.224 0.504 109 I 0.030 0.015 0.057 0.278 0.214 0.407 110 V 0.025 0.011 0.041 0.371 0.183 0.368 111 K 0.026 0.006 0.049 0.475 0.172 0.272 112 A 0.014 0.004 0.173 0.599 0.142 0.068 113 E 0.013 0.005 0.205 0.515 0.185 0.078 114 K 0.013 0.003 0.203 0.465 0.210 0.106 115 L 0.015 0.009 0.078 0.395 0.272 0.231 116 R 0.013 0.012 0.030 0.115 0.481 0.350 117 E 0.020 0.005 0.025 0.032 0.522 0.396 118 D 0.064 0.002 0.013 0.007 0.503 0.411 119 M 0.554 0.005 0.007 0.004 0.216 0.213 120 V 0.957 0.004 0.001 0.001 0.010 0.028 121 V 0.981 0.002 0.001 0.001 0.003 0.013 122 M 0.969 0.001 0.001 0.002 0.005 0.021 123 D 0.901 0.004 0.003 0.006 0.022 0.064 124 L 0.636 0.005 0.010 0.012 0.114 0.223 125 I 0.317 0.031 0.014 0.020 0.350 0.269 126 Y 0.092 0.041 0.015 0.018 0.429 0.405 127 N 0.019 0.017 0.010 0.011 0.760 0.182 128 P 0.008 0.004 0.066 0.030 0.769 0.123 129 L 0.006 0.006 0.051 0.040 0.749 0.148 130 E 0.009 0.010 0.056 0.168 0.575 0.182 131 T 0.011 0.005 0.017 0.298 0.269 0.401 132 V 0.008 0.005 0.034 0.720 0.113 0.121 133 L 0.013 0.004 0.038 0.809 0.074 0.062 134 L 0.007 0.002 0.037 0.861 0.060 0.033 135 K 0.005 0.001 0.024 0.891 0.050 0.029 136 E 0.002 0.001 0.024 0.942 0.021 0.010 137 A 0.004 0.002 0.039 0.915 0.032 0.007 138 K 0.003 0.001 0.074 0.871 0.041 0.010 139 K 0.005 0.001 0.054 0.824 0.085 0.032 140 V 0.009 0.001 0.041 0.649 0.134 0.167 141 N 0.020 0.002 0.004 0.025 0.159 0.790 142 A 0.246 0.011 0.008 0.010 0.189 0.536 143 K 0.762 0.035 0.005 0.006 0.077 0.115 144 T 0.687 0.032 0.009 0.013 0.224 0.035 145 I 0.354 0.003 0.015 0.044 0.513 0.070 146 N 0.041 0.002 0.011 0.070 0.836 0.040 147 G 0.015 0.005 0.043 0.499 0.423 0.015 148 L 0.019 0.003 0.026 0.848 0.080 0.024 149 G 0.033 0.004 0.042 0.854 0.049 0.018 150 M 0.079 0.005 0.028 0.837 0.024 0.027 151 L 0.203 0.013 0.017 0.737 0.012 0.018 152 I 0.214 0.001 0.014 0.745 0.011 0.015 153 Y 0.142 0.001 0.012 0.821 0.013 0.011 154 Q 0.048 0.001 0.009 0.893 0.026 0.022 155 G 0.014 0.001 0.005 0.944 0.019 0.018 156 A 0.014 0.001 0.012 0.901 0.041 0.032 157 V 0.005 0.001 0.034 0.848 0.070 0.042 158 A 0.003 0.002 0.039 0.737 0.082 0.137 159 F 0.004 0.003 0.020 0.292 0.105 0.578 160 K 0.001 0.001 0.004 0.042 0.057 0.895