# TARGET T0191 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0191.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 188 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 I 0.019 0.008 0.013 0.016 0.057 0.043 0.844 2 G 0.076 0.021 0.029 0.062 0.082 0.158 0.573 3 Y 0.089 0.020 0.038 0.131 0.247 0.178 0.297 4 N 0.077 0.018 0.027 0.256 0.171 0.117 0.334 5 T 0.070 0.032 0.019 0.370 0.109 0.072 0.329 6 D 0.037 0.009 0.011 0.675 0.068 0.055 0.144 7 G 0.015 0.002 0.004 0.908 0.015 0.020 0.036 8 I 0.003 0.001 0.002 0.980 0.005 0.006 0.004 9 G 0.002 0.001 0.003 0.982 0.003 0.007 0.004 10 A 0.001 0.001 0.003 0.986 0.001 0.006 0.002 11 R 0.001 0.001 0.003 0.987 0.002 0.005 0.002 12 M 0.001 0.001 0.003 0.983 0.002 0.009 0.002 13 A 0.001 0.001 0.003 0.977 0.002 0.013 0.003 14 L 0.001 0.001 0.007 0.970 0.003 0.012 0.006 15 E 0.001 0.001 0.016 0.936 0.004 0.038 0.005 16 E 0.001 0.001 0.022 0.836 0.008 0.127 0.006 17 E 0.002 0.002 0.038 0.514 0.047 0.364 0.033 18 I 0.010 0.005 0.033 0.102 0.100 0.565 0.185 19 G 0.055 0.014 0.029 0.052 0.148 0.099 0.604 20 R 0.068 0.038 0.034 0.027 0.073 0.061 0.698 21 V 0.051 0.009 0.238 0.036 0.103 0.164 0.399 22 K 0.008 0.002 0.158 0.014 0.077 0.722 0.020 23 D 0.014 0.001 0.086 0.003 0.079 0.788 0.028 24 K 0.175 0.004 0.003 0.001 0.128 0.020 0.669 25 N 0.732 0.005 0.001 0.001 0.079 0.003 0.180 26 I 0.986 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 27 V 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 28 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 29 Y 0.956 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.037 30 G 0.440 0.006 0.002 0.001 0.074 0.013 0.462 31 A 0.059 0.005 0.006 0.008 0.400 0.026 0.496 32 G 0.007 0.005 0.026 0.123 0.425 0.084 0.329 33 G 0.001 0.001 0.050 0.825 0.033 0.078 0.012 34 A 0.001 0.001 0.014 0.949 0.007 0.023 0.007 35 A 0.001 0.001 0.003 0.983 0.003 0.007 0.003 36 R 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.004 0.002 37 A 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.004 0.002 38 V 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.001 39 A 0.001 0.001 0.002 0.989 0.002 0.006 0.002 40 F 0.001 0.001 0.002 0.984 0.001 0.011 0.002 41 E 0.001 0.001 0.004 0.962 0.002 0.029 0.003 42 L 0.001 0.001 0.012 0.928 0.006 0.044 0.009 43 A 0.001 0.001 0.029 0.805 0.010 0.140 0.015 44 K 0.001 0.001 0.030 0.363 0.057 0.524 0.024 45 D 0.005 0.002 0.013 0.048 0.090 0.586 0.256 46 N 0.008 0.001 0.001 0.001 0.116 0.004 0.870 47 N 0.257 0.005 0.001 0.001 0.288 0.005 0.443 48 I 0.915 0.008 0.001 0.001 0.004 0.001 0.072 49 I 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 50 I 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 51 A 0.914 0.001 0.001 0.001 0.009 0.004 0.071 52 N 0.546 0.006 0.003 0.002 0.163 0.015 0.266 53 R 0.058 0.006 0.004 0.003 0.326 0.015 0.588 54 T 0.016 0.007 0.003 0.008 0.207 0.012 0.747 55 V 0.001 0.001 0.084 0.790 0.041 0.060 0.023 56 E 0.001 0.001 0.049 0.862 0.027 0.050 0.011 57 K 0.001 0.001 0.041 0.898 0.009 0.039 0.012 58 A 0.001 0.001 0.006 0.966 0.007 0.012 0.008 59 E 0.001 0.001 0.004 0.969 0.006 0.014 0.006 60 A 0.001 0.001 0.004 0.964 0.003 0.023 0.005 61 L 0.001 0.001 0.003 0.961 0.006 0.019 0.009 62 A 0.001 0.001 0.008 0.953 0.006 0.021 0.010 63 K 0.001 0.001 0.011 0.909 0.006 0.065 0.009 64 E 0.001 0.001 0.012 0.854 0.009 0.109 0.015 65 I 0.001 0.005 0.017 0.688 0.078 0.138 0.072 66 A 0.004 0.005 0.037 0.426 0.077 0.309 0.142 67 E 0.008 0.011 0.065 0.341 0.120 0.224 0.232 68 K 0.008 0.005 0.064 0.263 0.160 0.298 0.203 69 L 0.026 0.005 0.036 0.150 0.202 0.322 0.258 70 N 0.052 0.011 0.043 0.089 0.184 0.103 0.518 71 K 0.148 0.032 0.090 0.100 0.146 0.101 0.383 72 K 0.209 0.018 0.086 0.099 0.130 0.125 0.332 73 F 0.324 0.022 0.062 0.075 0.075 0.105 0.337 74 G 0.235 0.009 0.012 0.027 0.033 0.013 0.671 75 E 0.460 0.025 0.015 0.036 0.036 0.021 0.407 76 E 0.464 0.038 0.012 0.041 0.072 0.026 0.347 77 V 0.224 0.020 0.015 0.030 0.123 0.037 0.550 78 K 0.084 0.019 0.008 0.031 0.139 0.022 0.698 79 F 0.014 0.005 0.127 0.467 0.083 0.105 0.198 80 S 0.008 0.003 0.175 0.442 0.097 0.189 0.086 81 G 0.006 0.008 0.208 0.534 0.059 0.099 0.087 82 L 0.004 0.007 0.115 0.707 0.039 0.044 0.085 83 D 0.003 0.002 0.070 0.815 0.019 0.049 0.042 84 V 0.002 0.001 0.044 0.871 0.009 0.053 0.021 85 D 0.001 0.002 0.038 0.875 0.009 0.050 0.024 86 L 0.003 0.004 0.107 0.664 0.018 0.118 0.086 87 D 0.002 0.002 0.107 0.376 0.026 0.472 0.014 88 G 0.009 0.008 0.088 0.142 0.083 0.614 0.055 89 V 0.029 0.002 0.001 0.003 0.077 0.009 0.879 90 D 0.125 0.001 0.001 0.001 0.699 0.003 0.173 91 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.003 92 I 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 93 I 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 94 N 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 95 A 0.431 0.002 0.001 0.001 0.080 0.005 0.480 96 T 0.109 0.007 0.005 0.002 0.318 0.012 0.547 97 P 0.043 0.029 0.047 0.010 0.275 0.065 0.532 98 I 0.041 0.022 0.094 0.022 0.192 0.260 0.369 99 G 0.045 0.015 0.081 0.027 0.200 0.308 0.324 100 M 0.043 0.022 0.059 0.040 0.239 0.111 0.486 101 Y 0.066 0.045 0.052 0.065 0.211 0.097 0.465 102 P 0.060 0.037 0.056 0.079 0.173 0.132 0.463 103 N 0.032 0.019 0.059 0.066 0.119 0.177 0.528 104 I 0.025 0.014 0.099 0.102 0.171 0.290 0.300 105 D 0.025 0.006 0.103 0.105 0.209 0.322 0.230 106 V 0.037 0.011 0.118 0.156 0.200 0.192 0.286 107 E 0.052 0.030 0.087 0.163 0.136 0.106 0.427 108 P 0.067 0.019 0.057 0.176 0.125 0.077 0.478 109 I 0.102 0.019 0.071 0.224 0.077 0.091 0.416 110 V 0.087 0.028 0.056 0.196 0.090 0.042 0.501 111 K 0.070 0.018 0.087 0.189 0.038 0.044 0.554 112 A 0.019 0.004 0.387 0.374 0.022 0.109 0.084 113 E 0.030 0.002 0.407 0.331 0.039 0.113 0.078 114 K 0.037 0.007 0.336 0.354 0.059 0.109 0.098 115 L 0.066 0.019 0.098 0.287 0.156 0.115 0.258 116 R 0.066 0.010 0.070 0.090 0.142 0.156 0.466 117 E 0.058 0.010 0.088 0.037 0.253 0.331 0.222 118 D 0.066 0.004 0.058 0.011 0.225 0.422 0.214 119 M 0.258 0.004 0.012 0.004 0.254 0.054 0.414 120 V 0.878 0.009 0.002 0.002 0.026 0.003 0.080 121 V 0.967 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.023 122 M 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 123 D 0.940 0.001 0.001 0.002 0.006 0.002 0.047 124 L 0.825 0.005 0.004 0.003 0.024 0.016 0.122 125 I 0.589 0.007 0.007 0.006 0.101 0.038 0.252 126 Y 0.251 0.028 0.008 0.007 0.312 0.030 0.364 127 N 0.074 0.022 0.007 0.009 0.211 0.022 0.654 128 P 0.029 0.010 0.063 0.052 0.217 0.259 0.369 129 L 0.011 0.010 0.077 0.087 0.148 0.364 0.303 130 E 0.008 0.007 0.063 0.206 0.137 0.107 0.472 131 T 0.005 0.004 0.015 0.421 0.076 0.033 0.446 132 V 0.003 0.003 0.028 0.865 0.013 0.045 0.044 133 L 0.001 0.001 0.015 0.932 0.007 0.026 0.017 134 L 0.001 0.001 0.006 0.978 0.003 0.006 0.006 135 K 0.001 0.001 0.003 0.987 0.002 0.005 0.003 136 E 0.001 0.001 0.002 0.987 0.001 0.008 0.001 137 A 0.001 0.001 0.002 0.986 0.002 0.007 0.002 138 K 0.001 0.001 0.009 0.966 0.002 0.021 0.002 139 K 0.001 0.001 0.014 0.866 0.006 0.108 0.004 140 V 0.001 0.001 0.014 0.301 0.017 0.659 0.008 141 N 0.003 0.001 0.005 0.018 0.051 0.871 0.052 142 A 0.085 0.009 0.007 0.011 0.088 0.030 0.771 143 K 0.559 0.062 0.010 0.012 0.060 0.008 0.289 144 T 0.525 0.021 0.014 0.016 0.031 0.015 0.378 145 I 0.257 0.011 0.031 0.036 0.122 0.093 0.449 146 N 0.052 0.006 0.021 0.048 0.334 0.371 0.168 147 G 0.035 0.005 0.015 0.155 0.315 0.252 0.223 148 L 0.004 0.001 0.010 0.937 0.014 0.014 0.020 149 G 0.007 0.001 0.005 0.965 0.007 0.006 0.009 150 M 0.006 0.001 0.005 0.975 0.003 0.005 0.006 151 L 0.003 0.001 0.005 0.977 0.003 0.007 0.005 152 I 0.003 0.001 0.003 0.975 0.003 0.011 0.005 153 Y 0.003 0.001 0.002 0.962 0.005 0.021 0.005 154 Q 0.004 0.001 0.004 0.930 0.008 0.035 0.018 155 G 0.010 0.005 0.007 0.844 0.025 0.054 0.056 156 A 0.014 0.004 0.019 0.805 0.040 0.052 0.066 157 V 0.020 0.003 0.028 0.697 0.052 0.134 0.065 158 A 0.017 0.005 0.030 0.465 0.060 0.284 0.139 159 F 0.022 0.023 0.023 0.235 0.009 0.206 0.482 160 K 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.995