# TARGET T0191 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0191.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 105 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.015 0.008 0.003 0.010 0.184 0.779 2 I 0.068 0.094 0.007 0.023 0.235 0.573 3 N 0.061 0.032 0.004 0.010 0.264 0.629 4 A 0.071 0.021 0.018 0.045 0.482 0.363 5 K 0.141 0.016 0.014 0.022 0.471 0.335 6 T 0.337 0.009 0.020 0.023 0.300 0.311 7 K 0.668 0.023 0.014 0.017 0.131 0.146 8 V 0.831 0.012 0.006 0.010 0.059 0.081 9 I 0.888 0.003 0.004 0.012 0.033 0.059 10 G 0.914 0.003 0.002 0.009 0.021 0.051 11 L 0.925 0.008 0.002 0.009 0.021 0.035 12 I 0.821 0.008 0.003 0.020 0.058 0.090 13 G 0.441 0.017 0.011 0.024 0.215 0.292 14 H 0.197 0.020 0.010 0.010 0.359 0.403 15 P 0.108 0.020 0.025 0.012 0.511 0.324 16 V 0.099 0.040 0.045 0.023 0.546 0.246 17 E 0.130 0.031 0.057 0.027 0.458 0.296 18 H 0.095 0.031 0.040 0.025 0.561 0.247 19 S 0.082 0.040 0.021 0.034 0.468 0.356 20 F 0.039 0.040 0.015 0.034 0.362 0.511 21 S 0.010 0.014 0.002 0.018 0.213 0.742 22 P 0.009 0.006 0.005 0.144 0.144 0.692 23 I 0.015 0.019 0.005 0.486 0.098 0.376 24 M 0.005 0.004 0.002 0.924 0.016 0.048 25 H 0.002 0.001 0.002 0.983 0.007 0.005 26 N 0.001 0.001 0.001 0.987 0.008 0.002 27 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.004 0.001 28 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.007 0.001 29 F 0.001 0.001 0.002 0.990 0.006 0.001 30 K 0.001 0.001 0.004 0.984 0.009 0.003 31 D 0.001 0.001 0.007 0.980 0.009 0.004 32 K 0.001 0.001 0.011 0.906 0.031 0.051 33 G 0.002 0.001 0.002 0.017 0.099 0.879 34 L 0.020 0.003 0.002 0.004 0.147 0.824 35 N 0.078 0.005 0.004 0.003 0.149 0.760 36 Y 0.593 0.015 0.018 0.011 0.122 0.241 37 V 0.886 0.005 0.011 0.010 0.031 0.058 38 Y 0.924 0.005 0.008 0.009 0.018 0.035 39 V 0.886 0.004 0.010 0.009 0.036 0.055 40 A 0.762 0.004 0.016 0.012 0.070 0.136 41 F 0.584 0.006 0.012 0.014 0.133 0.250 42 D 0.582 0.018 0.010 0.004 0.133 0.252 43 V 0.315 0.049 0.006 0.003 0.158 0.470 44 L 0.084 0.016 0.013 0.008 0.352 0.527 45 P 0.003 0.001 0.531 0.138 0.284 0.044 46 E 0.001 0.001 0.493 0.216 0.253 0.035 47 N 0.001 0.001 0.396 0.392 0.161 0.048 48 L 0.001 0.001 0.017 0.938 0.020 0.025 49 K 0.002 0.001 0.005 0.963 0.020 0.010 50 Y 0.003 0.001 0.008 0.953 0.024 0.012 51 V 0.004 0.001 0.004 0.965 0.018 0.008 52 I 0.003 0.001 0.005 0.965 0.019 0.007 53 D 0.002 0.001 0.003 0.978 0.011 0.005 54 G 0.002 0.001 0.004 0.977 0.012 0.005 55 A 0.002 0.001 0.007 0.970 0.014 0.006 56 K 0.001 0.001 0.021 0.943 0.025 0.010 57 A 0.002 0.001 0.026 0.875 0.066 0.030 58 L 0.006 0.001 0.033 0.452 0.250 0.258 59 G 0.012 0.001 0.003 0.008 0.213 0.763 60 I 0.128 0.008 0.004 0.002 0.265 0.594 61 V 0.380 0.008 0.005 0.001 0.193 0.412 62 G 0.792 0.008 0.004 0.001 0.083 0.112 63 F 0.887 0.004 0.003 0.001 0.038 0.067 64 N 0.847 0.007 0.003 0.001 0.051 0.091 65 V 0.773 0.010 0.003 0.001 0.075 0.139 66 T 0.494 0.012 0.003 0.004 0.143 0.343 67 I 0.233 0.020 0.006 0.031 0.257 0.453 68 P 0.060 0.005 0.023 0.154 0.421 0.336 69 H 0.009 0.002 0.077 0.786 0.089 0.038 70 K 0.005 0.001 0.028 0.936 0.021 0.009 71 I 0.005 0.001 0.026 0.946 0.014 0.009 72 E 0.002 0.001 0.019 0.972 0.004 0.003 73 I 0.002 0.001 0.011 0.982 0.003 0.002 74 M 0.001 0.001 0.026 0.964 0.007 0.002 75 K 0.001 0.001 0.018 0.960 0.018 0.004 76 Y 0.001 0.001 0.018 0.954 0.019 0.008 77 L 0.002 0.002 0.024 0.928 0.033 0.011 78 D 0.003 0.001 0.062 0.843 0.069 0.022 79 E 0.004 0.002 0.053 0.710 0.125 0.105 80 I 0.005 0.005 0.020 0.377 0.125 0.468 81 D 0.001 0.001 0.003 0.064 0.075 0.857 82 K 0.001 0.001 0.022 0.950 0.015 0.013 83 D 0.001 0.001 0.035 0.936 0.026 0.003 84 A 0.001 0.001 0.058 0.905 0.033 0.002 85 Q 0.003 0.001 0.041 0.907 0.039 0.009 86 L 0.006 0.002 0.040 0.861 0.076 0.015 87 I 0.016 0.004 0.022 0.715 0.175 0.069 88 G 0.041 0.005 0.012 0.171 0.326 0.446 89 A 0.276 0.064 0.009 0.061 0.225 0.364 90 V 0.545 0.011 0.010 0.028 0.135 0.270 91 N 0.589 0.007 0.011 0.019 0.115 0.258 92 T 0.837 0.005 0.007 0.007 0.050 0.093 93 I 0.902 0.007 0.005 0.003 0.034 0.048 94 K 0.932 0.005 0.002 0.003 0.029 0.029 95 I 0.864 0.007 0.003 0.003 0.099 0.025 96 E 0.368 0.011 0.008 0.009 0.552 0.054 97 D 0.044 0.001 0.011 0.006 0.903 0.035 98 G 0.074 0.004 0.015 0.009 0.846 0.051 99 K 0.538 0.036 0.007 0.011 0.243 0.165 100 A 0.773 0.047 0.003 0.007 0.062 0.108 101 I 0.752 0.016 0.003 0.011 0.080 0.138 102 G 0.641 0.023 0.010 0.017 0.170 0.139 103 Y 0.357 0.025 0.019 0.029 0.312 0.258 104 N 0.289 0.023 0.029 0.033 0.341 0.286 105 T 0.193 0.023 0.032 0.030 0.331 0.390 106 D 0.161 0.022 0.046 0.033 0.352 0.385 107 G 0.099 0.021 0.072 0.054 0.358 0.396 108 I 0.096 0.027 0.051 0.052 0.223 0.551 109 G 0.093 0.021 0.047 0.077 0.184 0.578 110 A 0.011 0.009 0.009 0.020 0.073 0.878