PFRMAT AL TARGET T0189 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 2 PARENT 1liiA REMARK SCORE 2.2657e-33 M 1 M 13 V 2 R 14 L 3 V 15 T 4 F 16 V 5 A 17 T 6 I 18 L 7 G 19 N 8 N 20 P 9 P 21 A 10 I 22 L 11 L 23 D 12 D 24 R 13 L 25 E 14 V 26 I 15 A 27 F 16 E 28 I 17 V 29 E 18 P 30 D 19 S 31 F 20 S 32 Q 21 F 33 V 22 L 34 N 23 D 35 R 24 E 36 L 25 F 37 N 29 L 58 D 30 D 59 L 31 Q 60 S 32 F 61 K 33 N 62 T 34 P 63 Q 35 T 64 M 36 S 65 S 37 L 66 P 38 P 67 G 39 G 68 G 40 G 69 K 41 S 70 G 42 A 71 I 43 L 72 N 44 N 73 V 45 S 74 S 46 V 75 I 47 R 76 A 48 V 77 L 49 V 78 S 50 Q 79 K 51 K 80 L 52 L 81 G 53 P 85 V 54 G 86 P 55 S 87 S 56 A 88 V 57 G 89 A 58 Y 90 T 59 M 91 G 60 G 92 F 61 A 93 V 62 I 94 G 63 G 95 G 64 D 96 Y 65 D 97 M 66 R 99 G 67 G 100 K 68 Q 101 I 69 V 102 L 70 L 103 V 71 K 104 E 72 E 105 E 73 L 106 L 74 C 107 R 75 D 108 K 76 K 109 K 79 E 110 L 80 G 111 I 81 L 112 T 82 A 113 T 83 T 114 N 84 R 115 F 85 F 116 V 86 M 117 Y 87 V 118 V 88 A 119 G 90 P 120 E 91 G 121 T 92 Q 122 R 93 S 123 E 94 T 124 N 95 G 125 I 96 T 126 E 97 C 127 I 98 A 128 I 99 V 129 D 100 L 130 E 101 I 131 K 102 N 132 N 103 E 133 K 104 K 134 T 105 E 135 I 106 R 136 T 107 T 137 A 108 L 138 I 109 C 139 N 110 T 140 F 111 H 141 P 112 L 142 G 113 G 143 P 114 A 144 D 115 C 145 V 116 G 146 T 117 S 147 D 118 F 148 M 119 R 149 D 120 I 150 V 121 P 151 N 122 E 152 H 123 N 153 K 129 W 154 M 130 T 155 T 131 T 156 L 132 F 157 S 133 A 158 K 134 S 159 V 135 G 160 D 136 A 161 C 137 L 162 V 138 I 163 V 139 F 164 I 140 Y 165 S 141 A 166 G 142 T 167 S 143 A 168 I 144 Y 169 P 145 T 170 P 146 L 171 G 147 T 172 V 148 A 173 N 149 T 174 E 150 P 175 G 151 K 176 I 152 N 177 C 153 A 178 N 154 L 179 E 155 E 180 L 156 V 181 V 157 A 182 R 158 G 183 L 159 Y 184 A 160 A 185 R 161 H 186 E 162 G 187 R 163 I 188 G 164 N 190 V 165 A 191 F 166 I 192 V 167 F 193 F 168 T 194 V 169 L 195 E 170 N 196 Q 171 L 197 T 172 S 198 P 173 A 199 R 174 P 200 L 175 F 201 L 176 C 202 E 177 V 203 R 178 E 204 I 179 M 210 Y 180 Q 211 E 181 S 212 G 182 L 213 P 183 L 214 E 184 L 215 F 185 H 216 P 186 T 217 N 187 N 218 V 188 I 219 V 189 L 220 K 190 F 221 P 191 G 222 D 192 N 223 R 194 E 224 G 195 E 225 N 196 E 226 H 197 F 227 A 198 A 228 S 199 H 229 F 200 L 230 L 201 A 231 G 202 K 232 V 203 V 233 D 204 H 234 L 205 N 235 K 206 H 251 T 207 A 252 F 208 V 253 D 209 E 254 Q 223 K 273 V 224 L 274 S 225 V 275 V 226 V 276 V 227 M 277 S 228 T 278 Y 229 R 279 E 230 G 280 V 231 H 281 K 232 N 282 N 233 P 283 D 234 V 284 I 235 I 285 V 236 A 286 A 237 A 287 T 238 E 288 R 239 Q 289 E 240 D 292 G 241 G 293 V 242 E 299 W 243 V 300 L 244 G 301 I 245 V 302 R 246 P 303 S 247 V 304 K 248 V 305 E 249 A 306 E 250 A 307 I 251 E 308 D 252 K 309 T 253 I 310 S 254 V 311 H 255 D 312 L 256 T 313 L 257 N 314 G 258 G 315 A 259 A 316 G 260 G 317 D 261 D 318 A 262 A 319 Y 263 F 320 V 264 V 321 A 265 G 322 G 266 G 323 M 267 F 324 V 268 L 325 Y 269 Y 326 Y 270 G 327 F 271 L 328 K 273 S 329 H 274 Q 330 G 275 G 331 A 276 K 332 N 277 T 333 F 278 V 334 L 279 K 335 E 280 Q 336 M 281 C 337 A 282 I 338 K 283 M 339 F 284 C 340 G 285 G 341 F 286 N 342 A 287 A 343 S 288 C 344 A 289 A 345 L 290 Q 346 A 291 D 347 A 292 V 348 T 293 I 349 R 294 Q 350 R 295 H 351 K 296 V 352 E 297 G 353 K 298 F 354 Y 299 S 355 M 300 L 356 P 301 S 357 TER END