# TARGET T0187 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0187.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 30 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 2 F 0.024 0.041 0.011 0.041 0.007 0.035 0.842 3 D 0.011 0.009 0.015 0.038 0.221 0.057 0.648 4 P 0.005 0.003 0.058 0.221 0.226 0.114 0.372 5 E 0.003 0.002 0.088 0.503 0.130 0.123 0.151 6 S 0.004 0.005 0.071 0.594 0.068 0.101 0.156 7 L 0.002 0.002 0.037 0.784 0.034 0.043 0.099 8 K 0.001 0.001 0.006 0.918 0.021 0.016 0.036 9 K 0.002 0.001 0.002 0.939 0.017 0.013 0.025 10 L 0.001 0.001 0.001 0.966 0.006 0.012 0.015 11 A 0.001 0.001 0.001 0.978 0.003 0.011 0.007 12 I 0.001 0.001 0.001 0.982 0.004 0.012 0.002 13 E 0.001 0.001 0.001 0.985 0.002 0.009 0.002 14 I 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.005 0.004 15 V 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.004 0.003 16 K 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.007 0.001 17 K 0.001 0.001 0.001 0.979 0.001 0.018 0.001 18 S 0.001 0.001 0.001 0.973 0.002 0.021 0.002 19 I 0.001 0.001 0.011 0.941 0.008 0.033 0.007 20 E 0.001 0.001 0.050 0.791 0.008 0.144 0.005 21 A 0.002 0.001 0.054 0.524 0.032 0.361 0.026 22 V 0.006 0.021 0.012 0.236 0.354 0.159 0.212 23 F 0.007 0.008 0.001 0.016 0.128 0.018 0.822 24 P 0.003 0.005 0.084 0.680 0.041 0.107 0.081 25 D 0.002 0.001 0.064 0.847 0.023 0.050 0.013 26 R 0.004 0.001 0.112 0.844 0.009 0.016 0.013 27 A 0.005 0.002 0.040 0.917 0.007 0.012 0.017 28 V 0.009 0.005 0.056 0.841 0.008 0.059 0.022 29 K 0.007 0.002 0.164 0.606 0.017 0.177 0.026 30 E 0.005 0.001 0.088 0.427 0.020 0.446 0.014 31 T 0.009 0.008 0.112 0.253 0.068 0.483 0.068 32 L 0.040 0.033 0.016 0.036 0.379 0.052 0.444 33 P 0.062 0.017 0.010 0.007 0.121 0.061 0.721 34 K 0.151 0.059 0.014 0.013 0.121 0.035 0.608 35 L 0.113 0.015 0.026 0.011 0.116 0.083 0.635 36 N 0.069 0.025 0.063 0.010 0.211 0.278 0.343 37 L 0.037 0.007 0.044 0.007 0.233 0.553 0.119 38 D 0.049 0.010 0.016 0.003 0.423 0.313 0.187 39 R 0.201 0.009 0.005 0.002 0.173 0.034 0.577 40 V 0.676 0.011 0.001 0.001 0.021 0.003 0.288 41 I 0.958 0.002 0.001 0.001 0.015 0.001 0.024 42 L 0.988 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 43 V 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 44 A 0.919 0.002 0.001 0.002 0.010 0.003 0.063 45 V 0.413 0.005 0.005 0.013 0.079 0.023 0.462 46 G 0.079 0.004 0.035 0.100 0.390 0.090 0.302 47 K 0.012 0.006 0.102 0.517 0.174 0.113 0.075 48 A 0.003 0.008 0.075 0.734 0.050 0.062 0.068 49 A 0.001 0.001 0.014 0.942 0.012 0.020 0.012 50 W 0.001 0.001 0.003 0.978 0.005 0.011 0.003 51 R 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.009 0.002 52 M 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.002 53 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 54 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 55 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.007 0.001 56 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.006 0.001 57 Y 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.007 0.001 58 E 0.001 0.001 0.004 0.953 0.002 0.039 0.002 59 V 0.001 0.001 0.007 0.870 0.004 0.113 0.005 60 L 0.002 0.006 0.012 0.667 0.048 0.201 0.065 61 G 0.007 0.003 0.064 0.388 0.078 0.309 0.151 62 K 0.023 0.004 0.153 0.245 0.138 0.207 0.231 63 K 0.040 0.010 0.196 0.190 0.141 0.209 0.214 64 I 0.109 0.023 0.124 0.105 0.177 0.246 0.216 65 R 0.190 0.013 0.072 0.030 0.191 0.156 0.348 66 K 0.211 0.004 0.024 0.011 0.251 0.290 0.210 67 G 0.506 0.003 0.007 0.003 0.148 0.115 0.218 68 V 0.929 0.004 0.001 0.001 0.006 0.002 0.057 69 V 0.970 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.025 70 V 0.934 0.004 0.001 0.001 0.005 0.001 0.057 71 T 0.770 0.014 0.001 0.001 0.018 0.003 0.194 72 K 0.406 0.011 0.007 0.001 0.065 0.035 0.476 73 Y 0.068 0.008 0.030 0.003 0.172 0.604 0.116 74 G 0.040 0.010 0.042 0.003 0.247 0.512 0.146 75 H 0.084 0.018 0.036 0.005 0.291 0.132 0.434 76 S 0.136 0.060 0.027 0.006 0.211 0.105 0.454 77 E 0.143 0.048 0.041 0.008 0.183 0.060 0.517 78 G 0.152 0.020 0.040 0.011 0.126 0.108 0.544 79 P 0.153 0.040 0.051 0.013 0.204 0.227 0.311 80 I 0.108 0.016 0.030 0.006 0.285 0.065 0.490 81 D 0.103 0.012 0.026 0.004 0.334 0.110 0.411 82 D 0.410 0.013 0.021 0.003 0.110 0.097 0.345 83 F 0.816 0.008 0.002 0.001 0.015 0.004 0.155 84 E 0.932 0.004 0.001 0.001 0.009 0.001 0.053 85 I 0.959 0.008 0.001 0.001 0.002 0.001 0.030 86 Y 0.938 0.005 0.001 0.001 0.004 0.001 0.050 87 E 0.830 0.008 0.003 0.001 0.026 0.005 0.126 88 A 0.431 0.013 0.005 0.002 0.084 0.026 0.439 89 G 0.144 0.020 0.007 0.002 0.200 0.069 0.558 90 H 0.035 0.007 0.004 0.002 0.276 0.025 0.651 91 P 0.046 0.029 0.009 0.004 0.151 0.053 0.707 92 V 0.043 0.088 0.006 0.007 0.214 0.029 0.613 93 P 0.015 0.033 0.006 0.011 0.233 0.030 0.672 94 D 0.008 0.011 0.002 0.032 0.246 0.026 0.675 95 E 0.001 0.001 0.015 0.891 0.028 0.050 0.014 96 N 0.001 0.001 0.011 0.935 0.012 0.031 0.011 97 T 0.001 0.001 0.004 0.976 0.005 0.009 0.005 98 I 0.001 0.001 0.001 0.987 0.004 0.004 0.004 99 K 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.005 0.003 100 T 0.001 0.001 0.001 0.986 0.001 0.011 0.002 101 T 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.004 0.001 102 R 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 103 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.005 0.001 104 V 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.006 0.001 105 L 0.001 0.001 0.002 0.992 0.001 0.005 0.001 106 E 0.001 0.001 0.003 0.975 0.001 0.021 0.001 107 L 0.001 0.001 0.008 0.929 0.002 0.059 0.002 108 V 0.001 0.003 0.044 0.847 0.014 0.069 0.024 109 D 0.002 0.001 0.161 0.540 0.018 0.262 0.017 110 Q 0.002 0.001 0.108 0.313 0.035 0.511 0.030 111 L 0.005 0.015 0.027 0.083 0.295 0.088 0.487 112 N 0.007 0.013 0.015 0.005 0.074 0.034 0.852 113 E 0.003 0.004 0.180 0.011 0.086 0.687 0.028 114 N 0.004 0.001 0.114 0.002 0.037 0.825 0.018 115 D 0.171 0.003 0.016 0.001 0.180 0.024 0.605 116 T 0.865 0.004 0.001 0.001 0.035 0.001 0.093 117 V 0.990 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 118 L 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 119 F 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 120 L 0.979 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 121 L 0.795 0.004 0.002 0.001 0.027 0.004 0.169 122 S 0.355 0.012 0.007 0.003 0.167 0.019 0.436 123 G 0.093 0.016 0.027 0.005 0.298 0.073 0.488 124 G 0.038 0.012 0.118 0.021 0.312 0.355 0.145 125 G 0.047 0.015 0.219 0.059 0.194 0.287 0.181 126 S 0.057 0.013 0.282 0.124 0.128 0.182 0.214 127 S 0.107 0.014 0.238 0.169 0.080 0.276 0.115 128 L 0.204 0.036 0.160 0.154 0.082 0.232 0.132 129 F 0.327 0.028 0.057 0.082 0.144 0.057 0.305 130 E 0.450 0.056 0.015 0.026 0.071 0.030 0.351 131 L 0.325 0.075 0.014 0.021 0.064 0.030 0.472 132 P 0.117 0.028 0.048 0.027 0.110 0.115 0.555 133 L 0.022 0.017 0.165 0.030 0.230 0.279 0.256 134 E 0.004 0.002 0.116 0.015 0.152 0.629 0.082 135 G 0.006 0.004 0.052 0.005 0.138 0.608 0.188 136 V 0.010 0.049 0.002 0.002 0.229 0.009 0.698 137 S 0.006 0.028 0.001 0.004 0.062 0.001 0.898 138 L 0.001 0.001 0.014 0.946 0.014 0.017 0.009 139 E 0.001 0.001 0.014 0.952 0.006 0.023 0.005 140 E 0.001 0.001 0.012 0.969 0.002 0.012 0.005 141 I 0.001 0.001 0.002 0.986 0.002 0.007 0.003 142 Q 0.001 0.001 0.001 0.978 0.004 0.013 0.004 143 K 0.001 0.001 0.001 0.969 0.003 0.020 0.005 144 L 0.001 0.001 0.003 0.961 0.008 0.008 0.020 145 T 0.002 0.001 0.007 0.958 0.006 0.016 0.009 146 S 0.002 0.001 0.011 0.932 0.007 0.043 0.005 147 A 0.001 0.001 0.011 0.894 0.011 0.070 0.012 148 L 0.001 0.001 0.015 0.731 0.021 0.194 0.036 149 L 0.004 0.009 0.032 0.360 0.003 0.300 0.293 150 K 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.991