PFRMAT AL TARGET T0187 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 1 PARENT 2pgi REMARK SCORE 1.0776e-01 K 8 F 58 K 9 S 59 L 10 R 60 A 11 I 61 I 12 K 62 E 13 Q 63 I 14 A 64 V 15 A 65 K 16 E 66 K 17 R 67 V 28 I 68 K 29 R 69 E 30 N 70 N 36 H 71 L 37 S 72 D 38 D 73 R 39 A 74 V 40 L 75 I 41 V 76 L 42 V 77 V 43 I 78 A 44 G 79 V 45 I 80 G 46 G 81 K 47 G 82 A 48 S 83 A 49 Y 84 W 50 L 85 R 51 G 86 M 52 A 87 A 53 R 88 K 54 A 89 A 55 A 90 A 56 I 91 Y 57 E 92 E 58 A 93 V 59 L 94 L 60 S 95 G 61 H 96 K 62 T 97 K 63 F 98 S 76 H 99 E 77 N 100 G 78 Q 101 P 79 M 102 I 80 N 103 D 81 D 104 D 82 T 105 F 83 T 106 E 84 Q 107 I 85 I 108 Y 86 Y 109 E 87 F 110 A 88 A 111 G 89 G 112 H 90 Q 113 P 91 N 114 V 92 I 115 P 93 S 116 D 94 S 117 E 95 T 118 N 96 Y 119 V 104 I 120 L 105 S 121 E 106 H 122 L 107 L 123 V 108 L 124 D 109 D 125 Q 110 V 126 L 111 L 127 N 112 E 128 E 113 G 129 N 114 K 130 D 115 D 131 T 116 L 132 V 117 S 133 L 118 I 134 F 119 N 135 L 120 V 136 L 121 I 137 S 122 S 138 G 123 K 139 G 124 S 140 G 125 G 141 S 126 T 142 S 127 T 143 L 128 T 144 F 129 E 145 E 130 P 146 E 139 A 147 E 140 I 148 I 141 A 149 Q 142 F 150 K 143 R 151 L 144 I 152 T 145 F 153 S 146 R 154 A 147 D 155 L 148 Y 156 L 149 M 157 K 150 E 158 S 151 K 159 G 152 K 160 A 153 Y 161 S 154 G 162 I 155 K 163 N 159 E 164 T 160 E 165 V 161 A 166 R 162 R 167 K 163 K 168 H 164 R 169 L 165 I 170 Q 167 D 175 V 168 R 176 K 169 T 177 G 170 K 178 G 171 G 179 R 172 A 180 F 173 L 181 A 174 K 182 E 175 K 183 R 176 L 184 V 177 A 185 F 178 D 186 P 179 Q 187 A 180 E 188 K 181 G 189 V 182 Y 190 V 183 E 191 A 184 T 192 L 185 F 193 V 186 V 194 L 187 I 195 S 188 P 196 D 189 D 197 V 190 N 198 L 191 I 199 G 192 G 200 D 193 G 201 R 194 R 202 L 195 Y 203 D 196 S 204 V 197 V 205 I 198 L 206 A 199 T 207 E 211 A 208 D 212 V 209 A 213 G 210 L 214 L 211 K 215 L 212 V 216 P 213 L 217 I 214 E 218 A 215 K 219 V 216 Y 220 A 217 G 221 G 218 I 222 L 219 E 223 N 220 T 224 I 221 S 225 D 222 E 226 R 223 S 227 M 224 V 228 M 225 K 229 E 226 R 230 G 227 A 231 A 228 I 232 A 229 L 233 S 230 Q 234 K 234 E 235 Y 235 T 236 N 236 P 237 N 237 K 238 P 238 H 239 D 239 L 240 L 240 S 241 L 241 N 242 T 242 N 250 N 243 V 251 E 244 Q 252 S 245 K 253 Y 246 V 254 Q 247 C 255 Y 248 D 256 A 249 E 257 A 250 A 258 V 251 K 259 R 252 S 260 N 253 L 261 I 254 A 262 L 255 K 263 Y 256 E 264 R 257 K 265 K 258 G 266 G 259 F 267 K 260 N 268 A 261 A 269 I 262 E 270 E 263 I 271 L 264 I 272 L 265 T 273 V 266 T 274 N 267 L 276 Y 268 D 277 E 269 C 278 P 270 E 279 S 271 A 280 L 272 R 281 H 273 E 282 Y 274 A 283 V 275 G 284 S 276 R 285 E 277 F 286 W 278 I 287 W 279 A 288 K 280 S 289 Q 281 I 290 L 282 M 291 F 283 K 292 G 284 E 293 E 285 V 294 S 286 K 295 E 287 F 296 G 288 K 297 K 289 D 298 D 290 R 299 Q 291 P 300 K 292 L 301 G 293 K 302 L 294 K 303 F 295 P 304 P 296 A 305 A 297 A 306 S 298 L 307 V 299 S 332 S 307 A 333 G 309 A 334 Q 310 I 335 Y 311 A 336 V 312 L 337 Q 313 E 338 E 314 G 339 G 315 I 340 R 316 E 341 R 317 G 342 N 318 V 343 L 319 I 344 I 320 L 345 E 321 C 346 T 322 S 347 V 323 A 348 L 324 G 349 D 338 T 350 P 339 D 351 E 340 G 352 N 341 T 353 I 342 D 354 D 343 G 355 G 344 P 356 L 345 T 357 N 346 D 358 F 347 A 359 L 348 A 360 A 349 G 361 G 350 G 362 K 351 I 363 T 352 V 364 L 353 D 365 D 354 G 366 E 355 S 367 V 356 T 368 N 357 A 369 K 358 K 370 K 359 T 371 A 360 L 372 F 361 K 373 Q 362 TER END