PFRMAT AL TARGET T0187 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 43 PARENT 1qopA REMARK SCORE 7.7056e-02 M 1 M 1 S 6 E 2 L 7 R 3 K 8 Y 4 K 9 E 5 L 10 N 6 A 11 L 7 I 12 F 8 E 13 A 9 I 14 Q 10 V 15 L 11 K 16 N 12 K 62 D 13 K 63 R 14 I 64 R 15 K 66 E 16 G 67 G 17 V 68 A 18 V 69 F 19 V 70 V 20 F 119 P 21 L 120 F 22 L 121 V 23 S 122 T 24 L 133 L 25 E 134 G 26 G 135 D 27 V 136 P 28 S 137 G 29 L 138 I 30 E 139 E 31 E 140 Q 32 I 141 S 33 Q 142 L 34 K 143 K 35 L 144 I 36 T 145 I 37 S 146 D 38 A 147 T 39 L 148 L 40 L 149 I 41 K 150 D 42 S 151 A 43 G 152 G 44 A 153 A 45 S 154 D 46 I 155 A 47 L 185 L 48 V 186 E 49 L 187 L 50 D 189 G 51 V 190 V 52 L 191 P 53 G 192 F 54 D 193 S 55 R 194 D 56 L 195 P 57 I 198 L 58 A 199 A 59 S 200 D 60 G 201 G 61 P 202 P 62 A 203 T 63 S 210 I 64 E 211 Q 65 D 212 N 66 A 213 A 67 K 215 N 68 V 216 L 69 L 217 R 70 E 218 A 71 K 219 F 72 Y 220 A 73 G 221 A 74 I 222 G 75 E 223 V 76 T 224 T 77 S 225 P 78 E 226 A 79 S 227 Q 80 V 228 C 81 K 229 F 82 R 230 E 83 A 231 M 84 I 232 L 85 L 233 A 86 Q 234 I 87 E 235 I 88 T 236 R 89 P 237 E 90 K 238 K 91 H 239 H 92 L 240 P 93 S 241 T 94 N 242 I 95 V 243 P 96 E 244 I 97 I 245 G 98 H 246 L 99 L 247 L 100 I 248 M 101 G 249 Y 102 N 250 A 103 V 251 N 104 Q 252 L 105 K 253 V 106 V 254 F 107 C 255 I 111 D 256 D 112 E 257 A 113 A 258 F 114 K 259 Y 115 S 260 A 116 L 261 R 117 A 262 C 118 K 263 E 119 E 264 Q 120 K 265 V 121 G 266 G 122 F 267 V 123 N 268 D 124 A 269 S 125 E 270 V 126 I 271 L 127 I 272 V 128 T 273 A 129 T 274 D 130 S 275 E 134 L 276 E 135 D 277 S 136 C 278 A 137 E 279 P 138 A 280 F 139 R 281 R 140 E 282 Q 141 A 283 A 142 G 284 A 143 R 285 L 144 F 286 R 145 I 287 H 146 A 288 D 160 S 289 D 161 I 290 L 162 M 291 L 163 K 292 R 164 E 293 Q 165 V 294 V 166 K 295 A 167 F 296 S 168 K 297 Y 169 D 298 G 170 R 299 R 171 P 300 G 172 P 304 Y 173 A 305 T 174 A 306 Y 175 L 307 L 176 I 308 L 177 F 309 S 178 G 310 R 179 G 311 S 180 E 312 G 181 T 313 V 182 V 314 T 183 K 318 G 184 G 319 A 185 N 320 E 186 G 321 N 187 I 322 R 188 G 323 G 189 N 326 P 192 Q 327 L 193 E 328 H 194 L 329 H 195 A 330 L 196 L 331 I 197 S 332 E 198 A 333 K 199 A 334 L 200 I 335 K 201 A 336 E 202 L 337 Y 203 E 338 H 204 G 339 A 205 I 340 A 206 E 341 P 207 G 342 A 208 V 343 L 209 I 344 Q 210 T 350 G 211 D 351 F 212 G 352 G 213 T 353 I 214 D 354 S 215 G 355 S 216 P 356 P 217 T 357 A 226 D 358 G 227 A 359 A 228 A 360 A 229 G 361 G 230 G 362 A 231 I 363 I 232 V 364 S 233 D 365 G 234 G 366 S 235 S 367 A 236 T 368 I 237 A 369 V 238 K 370 K 239 T 371 I 240 L 372 I 241 K 373 E 242 A 374 K 243 M 375 N 244 G 376 L 245 E 377 A 246 D 378 S 247 P 379 P 248 Y 380 K 249 Q 381 Q 250 Y 382 M 251 L 383 L 252 K 384 A 253 N 385 E 254 N 386 L 255 D 387 R 256 S 388 S 257 Y 389 F 258 N 390 V 259 A 391 S 260 L 392 A 261 K 393 M 262 K 394 K 263 S 395 A 264 G 396 A 265 A 397 S 266 L 398 R 267 TER END