PFRMAT AL TARGET T0185 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 1 PARENT 1uag REMARK SCORE 1.4434e-65 M 1 K 6 K 2 N 7 I 3 V 8 H 4 V 9 F 5 I 10 V 6 I 11 G 7 G 12 I 8 L 13 G 9 G 14 G 10 L 15 I 11 T 16 G 12 G 17 M 13 L 18 S 14 S 19 A 15 C 20 A 17 V 21 L 18 D 22 H 19 F 23 E 20 F 24 F 21 L 25 S 22 A 26 N 23 R 27 G 24 G 28 N 25 V 29 D 26 T 30 V 27 P 31 Y 28 R 32 G 29 V 33 S 30 M 34 N 31 D 35 I 32 T 36 E 33 R 37 E 34 M 38 T 35 T 39 E 36 P 40 R 37 P 41 T 38 G 42 A 39 L 43 Y 40 D 44 L 41 K 45 R 42 L 46 K 43 P 47 L 44 E 48 G 45 A 49 I 46 V 50 P 47 E 51 I 48 R 52 F 49 H 53 V 50 T 54 P 51 G 55 H 52 S 56 S 53 L 57 A 54 N 58 D 55 E 60 N 56 W 61 W 57 L 62 Y 58 M 63 D 59 A 64 P 60 A 65 D 61 D 66 L 62 L 67 V 63 I 68 I 64 V 69 K 65 A 70 T 66 S 71 P 67 P 72 A 68 G 73 V 69 I 74 R 70 A 75 D 71 L 76 D 72 A 77 N 73 H 78 P 74 P 79 E 75 S 80 I 76 L 81 V 77 S 82 R 78 A 83 A 79 A 84 R 80 A 85 M 81 D 86 E 82 A 87 R 83 G 88 V 84 I 89 P 85 E 90 I 86 I 91 E 87 V 92 N 88 G 93 R 89 D 94 L 90 I 95 H 91 E 96 Y 92 L 97 F 93 F 98 R 94 C 99 D 95 R 100 T 96 E 101 L 97 A 102 K 98 Q 103 K 102 A 104 E 103 P 105 E 104 I 106 F 105 V 107 A 106 A 108 V 107 I 109 T 108 T 110 G 109 G 111 T 110 S 112 D 111 N 113 G 112 G 114 K 113 K 115 T 114 S 116 T 115 T 117 T 116 V 118 T 117 T 119 A 118 T 120 M 119 L 121 V 120 V 122 A 121 G 123 H 122 E 124 V 123 M 125 L 124 A 126 K 125 K 127 H 126 A 128 L 127 A 129 R 128 G 130 K 129 V 131 S 130 N 132 P 131 V 133 T 132 G 134 V 133 V 135 G 136 G 136 G 137 G 137 I 138 N 138 M 139 I 139 D 140 G 140 S 141 L 141 L 142 P 142 E 143 A 143 H 144 L 144 G 145 M 145 N 146 L 146 Y 147 L 147 E 148 D 148 K 149 D 149 G 150 E 150 N 151 C 151 G 152 E 152 P 153 L 153 V 154 Y 154 V 155 V 155 Y 156 L 156 E 157 E 157 L 158 L 158 D 159 S 159 E 160 S 160 S 161 F 161 E 162 Q 162 E 163 E 164 F 164 T 165 F 165 T 166 S 166 S 167 E 167 S 168 F 168 L 169 S 169 Q 170 P 170 A 171 N 171 V 172 Y 172 A 173 L 173 A 174 I 174 T 175 I 175 I 176 T 176 L 177 N 177 N 178 A 178 V 179 R 179 T 180 G 180 E 181 D 181 D 182 H 182 H 183 L 183 M 184 E 184 D 185 N 185 R 186 Y 186 Y 187 G 187 P 188 N 188 F 189 S 189 G 190 L 190 L 191 T 191 Q 192 R 192 Q 193 Y 193 Y 194 R 194 R 195 S 195 A 196 A 196 A 197 F 197 K 198 E 198 L 199 K 199 R 200 I 200 I 201 S 201 Y 202 R 202 E 203 N 203 N 204 T 204 A 205 D 205 K 206 L 206 V 207 V 207 C 208 V 208 V 209 T 209 V 210 F 210 N 211 A 211 A 212 E 212 D 213 D 213 D 214 E 214 A 215 L 215 L 216 T 216 T 217 S 217 M 218 H 218 P 219 L 219 I 220 G 220 R 226 D 221 C 227 V 222 V 228 T 223 S 229 F 224 F 230 G 225 G 231 V 226 V 232 K 227 N 233 K 228 M 234 G 229 G 235 T 230 D 236 Y 231 Y 237 T 232 H 238 L 233 L 239 E 234 N 240 Q 243 E 245 K 244 T 246 A 245 W 247 M 246 L 248 V 247 R 249 E 248 V 250 K 249 K 251 N 250 G 252 G 251 E 253 K 252 K 254 R 253 V 255 Y 254 L 256 L 255 N 257 E 256 V 258 L 257 K 259 K 258 E 260 L 259 M 261 K 260 K 262 V 261 L 263 P 262 S 264 G 263 G 265 F 264 Q 266 H 265 H 267 N 266 N 268 V 267 Y 269 L 268 T 270 N 269 N 271 A 270 A 272 L 271 L 273 A 272 A 274 V 273 A 275 I 274 L 276 A 275 A 277 L 276 L 278 F 277 A 279 D 278 D 280 S 279 A 281 L 280 A 282 G 281 G 283 Y 282 L 284 D 283 P 285 L 284 R 286 A 285 A 287 P 286 S 288 V 287 S 289 L 288 L 290 E 289 K 291 A 290 A 292 L 291 L 293 E 292 T 294 E 293 T 295 F 294 F 296 R 295 T 297 G 296 G 298 V 297 L 299 H 298 P 300 R 299 H 301 R 300 R 302 F 301 F 303 S 302 E 304 I 303 V 305 A 304 V 306 D 307 L 307 P 308 E 308 E 309 H 309 T 310 N 310 N 311 G 311 I 312 V 312 Y 313 R 313 V 314 W 314 I 315 I 315 D 316 N 316 D 317 D 317 Y 318 K 319 A 319 A 320 H 320 T 321 T 321 N 322 P 322 V 323 D 323 G 324 E 324 S 325 I 325 T 326 R 326 E 327 N 327 A 328 L 328 A 329 L 329 L 330 Q 330 N 331 T 331 G 332 A 332 L 333 V 335 H 334 F 336 V 335 E 337 D 336 N 338 G 337 E 339 T 338 K 340 L 339 I 341 H 340 V 342 L 341 V 343 L 342 I 344 L 343 F 345 G 344 K 362 G 345 A 363 D 346 L 364 G 347 Q 365 K 348 L 366 S 349 A 367 A 350 D 368 D 351 E 369 F 352 V 370 S 353 V 371 P 354 V 372 L 355 T 373 A 356 E 374 R 357 V 375 Y 358 Y 376 L 359 D 377 D 362 A 378 N 363 F 379 V 364 E 380 R 365 E 381 L 366 K 382 Y 367 K 383 C 368 N 384 F 369 G 385 G 370 I 386 R 371 S 387 D 372 G 388 G 373 K 389 A 374 M 390 Q 375 I 391 L 376 W 392 A 377 D 393 A 378 S 394 L 379 L 395 R 380 L 424 P 381 F 425 E 382 V 426 V 383 G 427 A 384 A 428 E 385 G 429 Q 386 D 430 T 387 I 431 E 388 I 432 T 389 Y 433 M 390 S 434 E 391 S 435 Q 392 R 436 A 393 R 437 M 394 F 438 R 395 V 439 L 396 E 440 L 397 R 441 A 398 Y 442 P 399 Q 443 R 400 S 444 V 401 S 445 Q 402 K 446 P 403 S 447 G 404 S 448 D 405 P 449 M 406 S 450 V 407 R 451 L 408 V 452 L 409 L 453 S 410 TER END