PFRMAT AL TARGET T0185 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 17 PARENT 1gg4A REMARK SCORE 5.2582e-59 M 1 M 1 K 2 I 2 G 10 S 3 I 11 V 4 G 12 T 5 M 13 L 6 S 14 S 7 A 15 Q 8 V 16 L 9 A 17 T 10 L 18 D 11 H 19 I 12 E 20 L 13 F 21 N 14 S 22 D 21 N 23 I 22 G 24 T 23 N 25 L 24 D 26 D 25 V 27 A 26 Y 28 V 27 G 29 T 28 S 30 T 29 N 31 D 30 I 32 T 31 E 33 R 32 E 34 K 33 T 35 L 34 E 36 T 35 R 37 P 36 T 38 G 37 A 39 C 38 Y 40 L 39 L 41 F 40 R 42 V 41 K 43 A 42 L 44 L 43 G 45 K 44 I 46 G 45 P 47 E 46 I 48 R 47 F 49 F 48 V 50 D 49 P 51 A 50 H 52 H 51 S 53 D 52 A 54 F 53 D 55 Q 56 N 56 A 57 W 57 K 58 Y 58 G 60 D 59 G 61 P 60 A 62 D 61 G 63 L 62 A 64 V 63 L 65 I 64 L 66 K 65 V 67 T 66 S 68 P 67 R 69 A 68 P 70 V 69 L 71 R 70 D 72 D 71 I 73 D 72 D 74 N 73 L 75 P 74 P 76 E 75 Q 77 I 76 L 78 M 81 I 79 E 82 V 80 R 83 K 81 V 84 D 82 P 85 T 83 I 86 R 84 E 87 L 85 N 88 A 86 R 89 F 87 L 90 G 88 H 91 E 89 Y 92 L 90 F 93 A 91 R 94 A 92 D 95 W 93 T 96 V 94 L 97 R 95 K 98 Q 96 R 99 Q 97 E 100 V 98 K 101 P 99 K 102 A 100 E 103 R 101 E 104 V 102 F 105 V 103 A 106 A 104 V 107 L 105 T 108 T 106 G 109 G 107 T 110 S 108 D 111 S 109 G 112 G 110 K 113 K 111 T 114 T 112 T 115 S 113 T 116 V 114 T 117 K 115 A 118 E 116 M 119 M 117 V 120 T 118 A 121 A 119 H 122 A 120 V 123 I 121 L 124 L 122 K 125 S 123 H 126 Q 124 L 127 C 125 R 128 G 126 K 129 N 127 S 130 T 128 P 131 L 129 T 132 Y 130 V 133 T 131 F 134 A 132 L 135 G 133 G 136 N 134 G 137 L 135 I 138 N 136 M 139 I 139 D 140 G 140 S 141 V 141 L 142 P 142 E 143 M 143 H 144 T 144 G 145 L 145 N 146 L 146 Y 147 R 147 E 148 L 148 K 149 T 149 G 150 E 151 N 151 Y 152 G 152 D 153 P 153 Y 154 V 154 A 155 V 155 V 156 Y 156 I 157 E 157 E 158 L 158 L 159 D 159 G 160 E 160 A 161 S 161 N 162 E 162 H 163 E 163 W 169 F 164 T 170 F 165 V 171 S 166 S 172 E 167 L 173 F 168 T 174 S 169 R 175 P 170 P 176 N 171 E 177 Y 172 A 178 L 173 A 179 I 174 L 180 I 175 V 181 T 176 N 182 N 177 N 183 A 178 L 184 R 179 A 185 S 189 S 194 L 190 L 195 T 191 A 196 R 192 G 197 Y 193 V 198 R 194 A 199 S 195 K 200 A 196 A 201 F 197 K 202 E 198 G 203 K 199 E 204 I 200 I 205 S 201 F 206 R 202 S 207 N 203 G 208 T 204 L 209 D 205 G 213 L 206 I 214 V 207 A 215 V 208 I 216 T 209 M 217 F 210 N 218 A 211 A 219 E 212 D 220 D 213 N 221 E 214 N 222 L 215 D 223 T 216 W 224 S 217 L 225 H 218 N 226 L 219 W 227 G 220 K 235 D 221 V 236 V 222 W 237 T 223 R 238 F 224 F 239 G 225 S 240 V 226 P 241 K 227 N 242 K 228 A 243 G 229 A 244 T 230 D 247 Y 231 F 248 T 232 T 249 L 233 A 250 E 234 T 251 M 235 N 252 R 236 I 253 S 237 H 254 A 238 V 255 S 239 T 256 R 240 S 257 A 241 H 258 E 242 G 259 Q 243 T 260 K 244 E 261 A 245 F 262 M 246 T 263 V 247 L 264 E 248 Q 265 K 249 T 266 N 250 P 267 G 251 T 268 K 252 G 269 R 253 S 270 Y 254 V 271 E 256 D 272 L 257 V 273 K 258 L 274 L 259 L 275 K 260 P 276 V 261 L 277 P 262 P 278 G 263 G 279 F 264 R 280 H 265 H 281 N 266 N 282 V 267 I 283 L 268 A 284 N 269 N 285 A 270 A 286 L 271 L 287 A 272 A 288 V 273 A 289 I 274 A 290 A 275 A 291 L 276 L 292 F 277 S 293 D 278 M 294 S 279 S 295 L 280 V 296 G 281 G 297 Y 282 A 298 D 283 T 299 L 284 L 300 A 285 D 301 P 286 A 302 V 287 I 303 L 288 K 304 E 289 A 305 A 290 G 306 L 291 L 307 E 292 A 308 E 293 N 309 F 294 L 310 R 295 K 311 G 296 A 312 V 297 V 313 H 298 P 314 R 299 G 315 R 300 R 316 F 301 L 317 S 302 F 318 I 303 P 319 A 304 I 320 D 307 Q 321 P 308 L 322 E 309 A 323 T 310 E 324 N 311 N 325 I 312 Q 326 Y 313 L 327 V 314 L 328 I 315 L 329 D 316 D 330 D 317 D 331 Y 318 Y 333 A 319 N 334 H 320 A 335 T 321 N 336 P 322 V 337 D 323 G 338 E 324 S 339 I 325 M 340 R 326 T 341 N 327 A 342 L 328 A 343 L 329 V 344 Q 330 Q 345 T 331 V 346 A 332 L 347 K 333 A 348 E 334 E 349 V 335 M 350 E 337 P 351 N 338 G 352 E 339 Y 353 K 340 R 354 I 341 V 355 V 342 L 356 V 343 V 357 I 344 V 358 F 345 G 359 D 368 D 360 E 369 M 361 V 370 A 362 V 371 E 363 V 372 L 364 T 373 G 365 E 374 A 366 V 375 E 367 Y 376 S 368 D 377 E 369 A 378 A 370 F 379 C 371 E 380 H 372 E 381 V 373 K 382 Q 374 K 383 V 375 N 384 G 376 G 385 E 377 I 386 A 378 S 387 A 379 G 388 K 380 K 389 A 381 M 390 A 382 I 391 G 383 W 392 I 384 D 393 D 385 S 394 R 386 L 395 V 387 K 396 L 388 S 397 S 389 L 398 V 390 G 399 G 391 K 400 K 392 E 401 Q 393 A 402 S 394 Y 403 H 395 V 414 A 396 I 415 I 397 S 416 S 398 V 422 T 399 F 423 A 400 L 424 S 401 F 425 G 402 V 426 V 403 G 427 G 404 A 428 E 405 G 429 H 406 D 430 F 407 I 431 A 408 I 432 D 409 Y 433 K 410 S 434 T 411 S 435 A 412 R 436 L 413 R 437 I 414 F 438 T 415 V 439 R 416 E 440 L 417 R 441 K 418 Y 442 L 419 Q 443 L 420 S 444 I 421 S 445 A 422 K 446 E 423 S 447 Q 424 S 448 Q 425 P 449 V 426 S 450 I 427 R 451 T 428 V 452 I 429 L 453 L 430 G 454 V 431 S 455 K 432 N 456 G 433 K 457 S 434 TER END