PFRMAT AL TARGET T0185 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 47 PARENT 1dssG REMARK SCORE 2.0916e-03 M 1 S 1 K 2 K 2 I 3 I 3 H 4 G 4 F 5 I 5 V 6 N 6 G 7 G 7 I 8 F 8 G 9 G 9 G 10 R 10 I 11 I 11 G 12 G 12 M 13 R 13 S 14 L 14 A 15 V 15 A 17 L 16 L 18 R 17 H 19 A 18 E 20 A 19 F 21 L 20 S 22 E 21 N 23 M 22 G 24 G 23 N 25 A 25 D 26 Q 26 V 27 V 27 Y 28 V 28 G 29 A 29 S 30 V 30 N 31 N 31 I 32 D 32 E 33 P 33 P 47 T 72 I 48 V 73 F 49 F 74 V 50 N 75 P 51 E 76 H 52 M 77 S 53 K 78 A 54 P 79 D 55 E 80 N 56 N 81 W 57 I 82 Y 58 A 87 D 59 G 88 P 60 A 89 D 61 E 90 L 62 Y 91 V 63 I 92 I 64 V 93 K 65 E 94 T 66 S 95 P 67 T 96 A 68 G 97 V 69 V 98 R 70 F 99 N 88 T 100 R 89 T 101 L 90 I 102 H 91 E 103 Y 92 K 104 F 93 A 105 R 94 S 106 D 95 A 107 T 96 H 108 L 97 F 109 K 98 K 110 R 99 G 111 E 100 G 112 K 101 A 113 K 102 K 114 E 103 K 115 E 104 V 116 F 105 I 117 A 106 I 118 L 135 S 119 G 136 A 120 G 137 P 121 I 138 S 122 M 139 A 123 D 140 D 124 S 141 A 125 L 142 P 126 E 143 M 127 H 144 F 128 G 145 V 129 N 146 C 130 Y 147 G 131 E 163 V 132 F 164 N 133 F 165 L 134 S 166 E 135 E 167 K 136 F 168 Y 137 S 169 S 138 P 170 K 139 N 171 D 140 Y 172 M 141 L 173 K 142 I 174 V 143 I 175 V 144 T 176 S 145 N 177 N 146 A 178 A 147 R 179 S 148 G 180 C 149 D 181 T 150 G 187 T 151 N 188 N 152 S 189 C 153 L 190 L 154 T 191 A 155 R 192 P 156 Y 193 V 157 R 194 A 158 S 195 K 159 A 196 V 160 F 197 L 161 E 198 H 162 K 199 E 163 I 200 N 164 S 201 F 165 R 202 E 166 N 203 I 167 T 204 V 168 D 205 M 172 L 206 T 173 V 207 T 174 V 208 V 175 T 209 H 176 F 210 A 177 D 213 V 178 E 214 T 179 L 215 A 180 T 216 T 181 S 217 Q 182 H 218 K 183 L 219 T 184 G 220 N 202 D 221 I 203 V 222 I 204 T 223 P 205 F 224 S 206 G 225 S 207 V 226 T 208 K 227 G 209 K 228 T 234 G 229 P 235 T 230 N 236 Y 231 V 237 T 232 S 238 L 233 V 239 E 234 V 240 K 244 D 241 A 245 L 242 M 246 T 243 V 247 V 244 E 248 R 245 K 249 L 246 N 250 G 247 G 251 K 248 K 252 E 249 Y 282 C 250 D 283 S 251 L 284 Y 252 A 285 D 253 P 286 D 254 V 287 I 255 L 288 K 256 E 289 A 257 A 290 A 258 L 291 M 259 E 292 K 260 E 293 A 261 F 294 A 262 R 295 S 263 G 296 E 264 D 307 G 265 P 308 P 266 E 309 L 267 T 310 Q 268 N 311 G 269 I 312 V 270 Y 313 L 271 V 314 G 272 I 315 Y 273 D 316 T 274 D 317 E 275 H 320 D 276 T 321 D 277 P 322 V 278 E 334 D 282 V 335 F 283 F 336 T 284 E 337 G 285 N 338 D 286 E 339 N 287 K 340 R 288 I 341 S 289 V 342 S 290 V 343 I 291 I 344 F 292 F 345 D 293 A 363 A 294 L 364 K 295 Q 365 A 296 L 366 G 297 A 367 I 298 D 368 Q 299 A 378 L 300 F 379 S 301 E 380 K 302 E 381 T 303 S 394 F 304 L 395 V 305 K 396 K 306 S 397 V 307 L 398 V 308 G 399 S 309 K 400 W 310 E 401 Y 311 A 402 D 312 E 406 N 313 K 407 E 314 L 408 F 315 P 409 G 316 E 410 Y 317 L 411 S 318 E 412 Q 319 K 413 R 320 V 414 V 321 I 415 I 322 S 416 D 323 V 417 L 324 S 418 I 325 E 419 K 326 N 420 H 327 T 421 M 328 V 422 Q 329 F 423 K 330 L 424 V 331 F 425 D 332 V 426 S 333 G 427 A 334 TER END