# TARGET T0182 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0182.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 300 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.018 0.002 0.007 0.010 0.008 0.005 0.951 2 I 0.318 0.041 0.036 0.056 0.027 0.047 0.474 3 R 0.392 0.030 0.032 0.035 0.103 0.062 0.345 4 I 0.190 0.026 0.026 0.019 0.088 0.079 0.573 5 K 0.032 0.025 0.003 0.007 0.309 0.020 0.604 6 T 0.005 0.003 0.001 0.011 0.193 0.003 0.785 7 P 0.001 0.001 0.009 0.967 0.006 0.014 0.004 8 S 0.001 0.001 0.006 0.981 0.002 0.009 0.002 9 E 0.001 0.001 0.004 0.988 0.001 0.004 0.003 10 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 11 E 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.002 12 K 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.008 0.001 13 M 0.001 0.001 0.001 0.992 0.003 0.003 0.002 14 K 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 15 K 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.009 0.001 16 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.009 0.001 17 G 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.006 0.001 18 K 0.001 0.001 0.001 0.987 0.003 0.006 0.003 19 A 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.007 0.004 20 V 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.006 0.003 21 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.007 0.002 22 V 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.002 23 A 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.009 0.002 24 L 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.008 0.002 25 R 0.001 0.001 0.001 0.979 0.002 0.014 0.003 26 E 0.001 0.001 0.001 0.963 0.003 0.028 0.005 27 V 0.001 0.001 0.005 0.953 0.006 0.023 0.011 28 R 0.003 0.001 0.044 0.906 0.007 0.032 0.009 29 K 0.007 0.001 0.070 0.769 0.008 0.137 0.009 30 V 0.005 0.003 0.073 0.654 0.015 0.234 0.017 31 I 0.022 0.013 0.027 0.436 0.212 0.068 0.222 32 V 0.027 0.005 0.069 0.061 0.115 0.081 0.642 33 P 0.003 0.001 0.043 0.033 0.046 0.859 0.014 34 G 0.004 0.001 0.016 0.008 0.036 0.910 0.025 35 K 0.046 0.025 0.005 0.023 0.227 0.017 0.656 36 T 0.074 0.066 0.001 0.026 0.047 0.006 0.779 37 A 0.001 0.001 0.009 0.962 0.008 0.011 0.008 38 W 0.001 0.001 0.006 0.980 0.003 0.008 0.002 39 D 0.001 0.001 0.004 0.985 0.002 0.007 0.002 40 V 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.002 41 E 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 42 T 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 43 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.002 44 V 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.003 45 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.006 0.001 46 E 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.006 0.002 47 I 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.004 0.004 48 F 0.001 0.001 0.001 0.986 0.004 0.004 0.005 49 K 0.001 0.001 0.002 0.975 0.003 0.016 0.003 50 K 0.001 0.001 0.002 0.884 0.004 0.103 0.004 51 L 0.001 0.001 0.003 0.472 0.022 0.479 0.021 52 R 0.002 0.004 0.008 0.156 0.079 0.605 0.145 53 V 0.010 0.018 0.024 0.058 0.116 0.059 0.714 54 K 0.035 0.038 0.097 0.114 0.159 0.078 0.479 55 P 0.033 0.017 0.142 0.145 0.178 0.148 0.337 56 A 0.026 0.011 0.167 0.128 0.155 0.238 0.274 57 F 0.030 0.009 0.173 0.080 0.143 0.287 0.277 58 K 0.035 0.010 0.183 0.061 0.169 0.273 0.270 59 G 0.044 0.015 0.156 0.054 0.184 0.273 0.274 60 Y 0.057 0.026 0.124 0.032 0.199 0.171 0.391 61 G 0.069 0.041 0.057 0.023 0.190 0.120 0.499 62 G 0.091 0.057 0.040 0.027 0.199 0.162 0.424 63 Y 0.131 0.038 0.023 0.034 0.199 0.067 0.509 64 K 0.160 0.019 0.034 0.032 0.131 0.081 0.544 65 Y 0.323 0.019 0.043 0.032 0.134 0.097 0.351 66 A 0.562 0.043 0.039 0.036 0.079 0.061 0.179 67 T 0.619 0.042 0.022 0.034 0.063 0.037 0.184 68 C 0.579 0.035 0.013 0.020 0.073 0.049 0.230 69 V 0.386 0.035 0.012 0.016 0.156 0.065 0.331 70 S 0.208 0.027 0.014 0.015 0.189 0.089 0.457 71 V 0.081 0.018 0.076 0.078 0.238 0.349 0.160 72 N 0.085 0.016 0.097 0.080 0.203 0.300 0.220 73 E 0.104 0.014 0.157 0.138 0.165 0.211 0.212 74 E 0.209 0.032 0.114 0.127 0.141 0.163 0.215 75 V 0.276 0.041 0.115 0.111 0.124 0.125 0.208 76 V 0.260 0.045 0.095 0.085 0.116 0.159 0.239 77 H 0.186 0.021 0.056 0.059 0.181 0.191 0.307 78 G 0.139 0.042 0.041 0.030 0.240 0.125 0.382 79 L 0.114 0.067 0.033 0.015 0.184 0.062 0.524 80 P 0.065 0.031 0.070 0.011 0.166 0.253 0.404 81 L 0.033 0.009 0.084 0.007 0.155 0.528 0.183 82 K 0.054 0.011 0.084 0.006 0.196 0.413 0.237 83 E 0.222 0.017 0.042 0.004 0.233 0.093 0.389 84 K 0.475 0.029 0.008 0.003 0.117 0.010 0.358 85 V 0.638 0.120 0.003 0.002 0.021 0.005 0.211 86 F 0.350 0.080 0.003 0.002 0.013 0.006 0.547 87 K 0.101 0.014 0.010 0.002 0.064 0.057 0.751 88 E 0.003 0.001 0.009 0.001 0.119 0.859 0.008 89 G 0.007 0.001 0.008 0.001 0.082 0.880 0.023 90 D 0.255 0.009 0.004 0.001 0.125 0.029 0.578 91 I 0.875 0.019 0.001 0.001 0.011 0.001 0.093 92 V 0.978 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.015 93 S 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 94 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 95 D 0.897 0.001 0.001 0.001 0.016 0.006 0.077 96 V 0.760 0.003 0.009 0.002 0.052 0.041 0.133 97 G 0.612 0.007 0.015 0.004 0.108 0.054 0.199 98 A 0.745 0.014 0.012 0.005 0.061 0.036 0.127 99 V 0.761 0.049 0.007 0.006 0.030 0.031 0.115 100 Y 0.659 0.035 0.015 0.006 0.053 0.070 0.163 101 Q 0.113 0.007 0.025 0.006 0.158 0.633 0.059 102 G 0.071 0.004 0.028 0.004 0.236 0.573 0.084 103 L 0.482 0.036 0.020 0.005 0.107 0.119 0.230 104 Y 0.675 0.076 0.007 0.004 0.045 0.045 0.149 105 G 0.596 0.021 0.012 0.004 0.108 0.035 0.224 106 D 0.504 0.008 0.019 0.008 0.140 0.069 0.251 107 A 0.612 0.013 0.028 0.012 0.089 0.129 0.118 108 A 0.756 0.016 0.023 0.013 0.035 0.057 0.101 109 V 0.754 0.010 0.020 0.013 0.050 0.040 0.114 110 T 0.744 0.011 0.010 0.007 0.048 0.018 0.164 111 Y 0.739 0.030 0.006 0.005 0.040 0.007 0.173 112 I 0.637 0.048 0.006 0.007 0.029 0.011 0.262 113 V 0.357 0.032 0.013 0.008 0.101 0.065 0.424 114 G 0.079 0.010 0.012 0.006 0.436 0.178 0.280 115 E 0.024 0.018 0.009 0.007 0.481 0.096 0.364 116 T 0.009 0.025 0.007 0.022 0.266 0.031 0.640 117 D 0.002 0.002 0.001 0.019 0.094 0.009 0.873 118 E 0.001 0.001 0.037 0.909 0.007 0.042 0.005 119 R 0.001 0.001 0.016 0.949 0.004 0.027 0.004 120 G 0.001 0.001 0.006 0.982 0.003 0.007 0.003 121 K 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.002 0.002 122 E 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.002 123 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 124 V 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 125 R 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 126 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 127 T 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 128 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 129 E 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.006 0.001 130 V 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.003 131 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.002 132 E 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.007 0.002 133 K 0.001 0.001 0.001 0.981 0.002 0.014 0.002 134 A 0.001 0.001 0.002 0.977 0.003 0.013 0.005 135 I 0.002 0.001 0.018 0.949 0.004 0.021 0.006 136 K 0.006 0.001 0.048 0.757 0.006 0.177 0.006 137 M 0.005 0.002 0.056 0.467 0.014 0.439 0.016 138 I 0.023 0.017 0.015 0.212 0.333 0.060 0.340 139 K 0.034 0.005 0.029 0.028 0.139 0.039 0.727 140 P 0.010 0.005 0.065 0.037 0.056 0.798 0.029 141 G 0.014 0.001 0.033 0.014 0.060 0.826 0.052 142 I 0.176 0.032 0.009 0.023 0.216 0.020 0.524 143 R 0.179 0.102 0.002 0.018 0.039 0.008 0.652 144 L 0.007 0.002 0.085 0.755 0.024 0.070 0.056 145 G 0.002 0.001 0.073 0.788 0.023 0.098 0.015 146 D 0.001 0.001 0.049 0.875 0.010 0.053 0.011 147 V 0.001 0.001 0.007 0.963 0.006 0.014 0.009 148 S 0.001 0.001 0.001 0.982 0.005 0.006 0.005 149 H 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.003 0.002 150 C 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 151 I 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 152 Q 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 153 E 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 154 T 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.002 155 V 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.004 0.001 156 E 0.001 0.001 0.003 0.975 0.001 0.019 0.001 157 S 0.001 0.001 0.005 0.868 0.007 0.115 0.004 158 V 0.001 0.001 0.005 0.324 0.020 0.642 0.008 159 G 0.001 0.002 0.006 0.028 0.058 0.810 0.094 160 F 0.017 0.009 0.007 0.007 0.064 0.022 0.874 161 N 0.118 0.016 0.021 0.009 0.135 0.051 0.649 162 V 0.228 0.033 0.055 0.023 0.162 0.077 0.422 163 I 0.313 0.044 0.042 0.024 0.091 0.042 0.445 164 R 0.352 0.014 0.060 0.018 0.124 0.125 0.308 165 D 0.284 0.015 0.066 0.016 0.179 0.240 0.199 166 Y 0.331 0.054 0.061 0.021 0.155 0.130 0.247 167 V 0.431 0.033 0.031 0.016 0.128 0.126 0.236 168 G 0.462 0.036 0.025 0.012 0.167 0.119 0.179 169 H 0.415 0.025 0.025 0.011 0.143 0.114 0.269 170 G 0.398 0.035 0.031 0.012 0.103 0.186 0.236 171 V 0.306 0.058 0.039 0.020 0.110 0.302 0.165 172 G 0.218 0.016 0.030 0.017 0.250 0.236 0.232 173 R 0.347 0.040 0.025 0.035 0.141 0.061 0.352 174 E 0.474 0.080 0.018 0.038 0.054 0.048 0.288 175 L 0.401 0.050 0.049 0.065 0.088 0.100 0.247 176 H 0.289 0.022 0.059 0.052 0.145 0.196 0.237 177 E 0.117 0.017 0.056 0.064 0.320 0.175 0.251 178 D 0.106 0.017 0.035 0.056 0.259 0.064 0.463 179 P 0.160 0.016 0.051 0.062 0.137 0.156 0.417 180 Q 0.220 0.037 0.067 0.065 0.149 0.131 0.332 181 I 0.281 0.046 0.063 0.069 0.131 0.054 0.356 182 P 0.242 0.036 0.067 0.089 0.078 0.084 0.404 183 N 0.189 0.037 0.079 0.082 0.132 0.134 0.347 184 Y 0.119 0.025 0.079 0.067 0.156 0.207 0.346 185 G 0.071 0.021 0.061 0.053 0.153 0.243 0.399 186 T 0.024 0.008 0.038 0.018 0.086 0.047 0.778 187 P 0.034 0.024 0.106 0.033 0.106 0.405 0.291 188 G 0.033 0.018 0.103 0.021 0.182 0.443 0.200 189 T 0.077 0.021 0.070 0.014 0.231 0.224 0.363 190 G 0.281 0.022 0.029 0.008 0.165 0.099 0.395 191 V 0.393 0.015 0.006 0.003 0.133 0.011 0.439 192 V 0.573 0.062 0.002 0.001 0.028 0.007 0.327 193 L 0.417 0.063 0.001 0.001 0.014 0.003 0.502 194 R 0.151 0.010 0.004 0.001 0.065 0.011 0.759 195 K 0.008 0.002 0.009 0.001 0.129 0.838 0.013 196 G 0.014 0.001 0.010 0.001 0.072 0.882 0.019 197 M 0.494 0.024 0.002 0.001 0.019 0.005 0.455 198 T 0.924 0.012 0.001 0.001 0.004 0.002 0.057 199 L 0.951 0.005 0.001 0.001 0.007 0.002 0.034 200 A 0.943 0.002 0.001 0.001 0.007 0.003 0.043 201 I 0.922 0.004 0.001 0.001 0.014 0.003 0.055 202 E 0.737 0.004 0.004 0.002 0.036 0.006 0.211 203 P 0.464 0.004 0.023 0.009 0.096 0.065 0.338 204 M 0.612 0.018 0.024 0.009 0.094 0.058 0.185 205 V 0.632 0.028 0.021 0.013 0.081 0.024 0.201 206 S 0.505 0.049 0.014 0.017 0.062 0.023 0.330 207 E 0.374 0.034 0.019 0.022 0.130 0.065 0.356 208 G 0.201 0.013 0.025 0.016 0.121 0.117 0.506 209 D 0.111 0.011 0.055 0.025 0.194 0.390 0.214 210 W 0.121 0.007 0.067 0.020 0.272 0.332 0.181 211 R 0.299 0.016 0.052 0.029 0.194 0.077 0.333 212 V 0.529 0.042 0.033 0.036 0.083 0.035 0.241 213 V 0.628 0.038 0.026 0.030 0.054 0.034 0.190 214 V 0.510 0.058 0.030 0.030 0.076 0.061 0.235 215 K 0.270 0.016 0.038 0.017 0.120 0.126 0.413 216 E 0.093 0.006 0.043 0.014 0.180 0.496 0.168 217 D 0.080 0.009 0.032 0.011 0.247 0.485 0.136 218 G 0.197 0.006 0.012 0.004 0.389 0.108 0.285 219 W 0.383 0.024 0.007 0.003 0.123 0.025 0.434 220 T 0.701 0.076 0.005 0.003 0.028 0.007 0.181 221 A 0.797 0.009 0.009 0.003 0.026 0.015 0.141 222 V 0.817 0.016 0.010 0.005 0.033 0.020 0.099 223 T 0.648 0.025 0.017 0.007 0.037 0.028 0.239 224 V 0.369 0.009 0.040 0.006 0.144 0.229 0.203 225 D 0.117 0.005 0.031 0.004 0.146 0.639 0.059 226 G 0.164 0.003 0.017 0.002 0.231 0.464 0.119 227 S 0.651 0.009 0.004 0.001 0.061 0.035 0.240 228 R 0.860 0.018 0.002 0.001 0.024 0.006 0.090 229 C 0.937 0.004 0.001 0.001 0.013 0.002 0.042 230 A 0.968 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.025 231 H 0.964 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.029 232 F 0.939 0.003 0.002 0.001 0.006 0.003 0.047 233 E 0.870 0.007 0.013 0.001 0.032 0.012 0.065 234 H 0.795 0.002 0.018 0.001 0.053 0.018 0.113 235 T 0.871 0.002 0.006 0.001 0.034 0.008 0.079 236 I 0.961 0.009 0.001 0.001 0.005 0.001 0.023 237 L 0.973 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.018 238 I 0.914 0.033 0.001 0.001 0.006 0.001 0.045 239 T 0.362 0.017 0.002 0.001 0.019 0.018 0.581 240 E 0.033 0.003 0.005 0.001 0.102 0.809 0.048 241 N 0.018 0.004 0.006 0.001 0.246 0.681 0.043 242 G 0.039 0.003 0.002 0.002 0.744 0.048 0.162 243 A 0.232 0.026 0.003 0.003 0.088 0.020 0.629 244 E 0.743 0.091 0.003 0.003 0.016 0.004 0.140 245 I 0.818 0.025 0.003 0.005 0.013 0.003 0.132 246 L 0.658 0.015 0.006 0.012 0.033 0.014 0.262 247 T 0.323 0.016 0.007 0.026 0.180 0.059 0.389 248 K 0.106 0.017 0.005 0.012 0.298 0.061 0.501 249 E 0.025 0.011 0.001 0.003 0.013 0.022 0.924 250 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999