# TARGET T0181 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0181.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.030 0.005 0.006 0.012 0.157 0.790 2 S 0.111 0.019 0.021 0.024 0.226 0.600 3 T 0.227 0.021 0.024 0.023 0.274 0.432 4 V 0.395 0.015 0.032 0.024 0.221 0.313 5 T 0.578 0.014 0.022 0.016 0.152 0.218 6 K 0.753 0.007 0.017 0.014 0.091 0.118 7 Y 0.782 0.011 0.012 0.012 0.072 0.111 8 F 0.804 0.009 0.010 0.012 0.073 0.092 9 Y 0.740 0.014 0.011 0.009 0.108 0.119 10 K 0.488 0.023 0.011 0.010 0.239 0.228 11 G 0.136 0.014 0.033 0.010 0.682 0.125 12 E 0.055 0.011 0.041 0.012 0.767 0.114 13 N 0.071 0.006 0.024 0.006 0.688 0.204 14 T 0.364 0.010 0.008 0.006 0.371 0.240 15 D 0.750 0.005 0.002 0.003 0.058 0.182 16 L 0.968 0.004 0.001 0.002 0.006 0.021 17 I 0.982 0.001 0.001 0.002 0.004 0.011 18 V 0.976 0.001 0.001 0.002 0.005 0.014 19 F 0.929 0.002 0.002 0.004 0.021 0.043 20 A 0.707 0.007 0.007 0.010 0.114 0.154 21 A 0.201 0.012 0.013 0.018 0.305 0.451 22 S 0.045 0.007 0.008 0.019 0.333 0.588 23 E 0.019 0.004 0.078 0.265 0.411 0.222 24 E 0.020 0.004 0.104 0.501 0.275 0.095 25 L 0.033 0.007 0.123 0.629 0.151 0.057 26 V 0.038 0.006 0.091 0.738 0.083 0.045 27 D 0.049 0.004 0.090 0.731 0.083 0.043 28 E 0.069 0.012 0.105 0.653 0.100 0.061 29 Y 0.085 0.022 0.077 0.555 0.144 0.117 30 L 0.086 0.045 0.043 0.375 0.334 0.117 31 K 0.043 0.012 0.023 0.243 0.456 0.222 32 N 0.009 0.007 0.011 0.035 0.820 0.118 33 P 0.011 0.007 0.031 0.029 0.835 0.088 34 S 0.028 0.021 0.046 0.050 0.701 0.154 35 I 0.049 0.026 0.060 0.154 0.565 0.146 36 G 0.040 0.023 0.020 0.269 0.288 0.360 37 K 0.035 0.017 0.027 0.528 0.135 0.258 38 L 0.009 0.002 0.059 0.863 0.038 0.028 39 S 0.019 0.002 0.082 0.825 0.040 0.031 40 E 0.043 0.003 0.173 0.719 0.044 0.018 41 V 0.112 0.005 0.093 0.693 0.050 0.047 42 V 0.235 0.005 0.142 0.509 0.071 0.039 43 E 0.319 0.002 0.133 0.370 0.111 0.065 44 L 0.398 0.003 0.077 0.296 0.127 0.100 45 F 0.615 0.012 0.025 0.130 0.109 0.108 46 E 0.778 0.003 0.007 0.048 0.060 0.103 47 V 0.867 0.004 0.003 0.029 0.034 0.063 48 F 0.826 0.009 0.002 0.019 0.040 0.105 49 T 0.714 0.014 0.002 0.017 0.090 0.162 50 P 0.438 0.018 0.008 0.016 0.237 0.282 51 Q 0.150 0.024 0.015 0.014 0.442 0.355 52 D 0.042 0.015 0.027 0.011 0.667 0.237 53 G 0.028 0.015 0.032 0.016 0.685 0.224 54 R 0.052 0.058 0.029 0.024 0.553 0.284 55 G 0.042 0.024 0.014 0.027 0.499 0.395 56 A 0.086 0.038 0.012 0.041 0.465 0.357 57 E 0.156 0.044 0.025 0.107 0.423 0.243 58 G 0.127 0.015 0.036 0.132 0.464 0.226 59 E 0.244 0.029 0.038 0.145 0.339 0.205 60 L 0.313 0.045 0.036 0.163 0.175 0.267 61 G 0.367 0.018 0.036 0.188 0.148 0.244 62 A 0.323 0.019 0.041 0.287 0.127 0.203 63 A 0.206 0.020 0.031 0.333 0.130 0.279 64 S 0.165 0.020 0.024 0.347 0.127 0.317 65 K 0.020 0.001 0.025 0.887 0.038 0.028 66 A 0.018 0.001 0.016 0.898 0.046 0.021 67 Q 0.012 0.002 0.015 0.916 0.039 0.017 68 V 0.014 0.003 0.010 0.917 0.036 0.019 69 E 0.012 0.002 0.012 0.910 0.043 0.022 70 N 0.008 0.002 0.018 0.857 0.073 0.042 71 E 0.007 0.002 0.020 0.763 0.114 0.094 72 F 0.009 0.013 0.020 0.653 0.140 0.165 73 G 0.012 0.007 0.025 0.321 0.330 0.305 74 K 0.011 0.004 0.031 0.345 0.308 0.301 75 G 0.026 0.007 0.034 0.346 0.298 0.289 76 K 0.040 0.010 0.037 0.442 0.251 0.220 77 K 0.070 0.033 0.036 0.477 0.122 0.262 78 I 0.032 0.004 0.038 0.798 0.055 0.073 79 E 0.010 0.001 0.010 0.955 0.012 0.012 80 E 0.007 0.001 0.004 0.979 0.004 0.006 81 V 0.004 0.001 0.001 0.991 0.001 0.002 82 I 0.002 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 83 D 0.003 0.001 0.002 0.992 0.002 0.001 84 L 0.003 0.001 0.002 0.992 0.002 0.001 85 I 0.002 0.001 0.002 0.988 0.004 0.004 86 L 0.002 0.001 0.006 0.973 0.013 0.006 87 R 0.003 0.001 0.010 0.948 0.027 0.012 88 N 0.005 0.001 0.015 0.772 0.119 0.088 89 G 0.013 0.009 0.004 0.030 0.306 0.638 90 K 0.050 0.032 0.008 0.012 0.446 0.452 91 P 0.063 0.021 0.026 0.016 0.628 0.246 92 N 0.033 0.011 0.047 0.016 0.674 0.219 93 S 0.114 0.030 0.048 0.015 0.534 0.259 94 T 0.196 0.031 0.034 0.022 0.302 0.415 95 T 0.330 0.042 0.055 0.034 0.226 0.313 96 S 0.332 0.027 0.067 0.042 0.231 0.301 97 S 0.350 0.017 0.077 0.061 0.217 0.277 98 L 0.470 0.028 0.067 0.075 0.173 0.187 99 K 0.493 0.027 0.040 0.073 0.179 0.189 100 T 0.388 0.035 0.034 0.066 0.320 0.157 101 K 0.175 0.019 0.026 0.052 0.479 0.249 102 G 0.077 0.011 0.028 0.044 0.579 0.261 103 G 0.070 0.020 0.027 0.040 0.516 0.327 104 N 0.118 0.038 0.033 0.067 0.348 0.395 105 A 0.132 0.041 0.055 0.109 0.340 0.323 106 G 0.106 0.019 0.062 0.119 0.359 0.336 107 T 0.197 0.029 0.087 0.153 0.280 0.253 108 K 0.171 0.028 0.101 0.152 0.227 0.322 109 A 0.173 0.038 0.059 0.137 0.172 0.421 110 Y 0.092 0.022 0.031 0.126 0.113 0.617 111 N 0.002 0.002 0.001 0.005 0.019 0.972