# TARGET T0181 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0181.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 2 S 0.098 0.028 0.012 0.038 0.009 0.062 0.753 3 T 0.158 0.020 0.024 0.037 0.214 0.111 0.435 4 V 0.286 0.017 0.028 0.049 0.160 0.071 0.389 5 T 0.507 0.014 0.019 0.045 0.085 0.035 0.296 6 K 0.653 0.012 0.021 0.043 0.058 0.026 0.186 7 Y 0.784 0.014 0.013 0.028 0.031 0.018 0.112 8 F 0.775 0.014 0.012 0.027 0.032 0.023 0.117 9 Y 0.665 0.027 0.008 0.019 0.057 0.027 0.197 10 K 0.370 0.024 0.010 0.016 0.128 0.067 0.386 11 G 0.140 0.013 0.041 0.015 0.214 0.234 0.344 12 E 0.067 0.015 0.052 0.013 0.308 0.357 0.189 13 N 0.072 0.012 0.044 0.008 0.291 0.302 0.271 14 T 0.233 0.008 0.010 0.006 0.346 0.049 0.347 15 D 0.559 0.010 0.006 0.005 0.102 0.020 0.298 16 L 0.901 0.009 0.003 0.004 0.010 0.004 0.068 17 I 0.947 0.004 0.003 0.006 0.005 0.002 0.033 18 V 0.937 0.003 0.004 0.010 0.007 0.002 0.037 19 F 0.900 0.008 0.005 0.014 0.009 0.004 0.061 20 A 0.689 0.009 0.010 0.030 0.037 0.016 0.209 21 A 0.263 0.006 0.017 0.047 0.193 0.116 0.359 22 S 0.091 0.008 0.009 0.024 0.335 0.127 0.406 23 E 0.042 0.009 0.043 0.130 0.286 0.168 0.322 24 E 0.024 0.005 0.093 0.447 0.148 0.138 0.145 25 L 0.036 0.014 0.119 0.571 0.059 0.091 0.110 26 V 0.042 0.007 0.069 0.757 0.025 0.038 0.062 27 D 0.029 0.003 0.048 0.831 0.014 0.033 0.041 28 E 0.031 0.002 0.054 0.810 0.023 0.051 0.029 29 Y 0.050 0.008 0.068 0.703 0.032 0.105 0.034 30 L 0.051 0.009 0.044 0.601 0.062 0.156 0.077 31 K 0.031 0.015 0.033 0.464 0.124 0.209 0.124 32 N 0.012 0.005 0.020 0.072 0.331 0.076 0.485 33 P 0.006 0.004 0.114 0.066 0.149 0.536 0.125 34 S 0.011 0.016 0.129 0.043 0.126 0.538 0.138 35 I 0.017 0.016 0.129 0.068 0.230 0.245 0.295 36 G 0.032 0.010 0.069 0.087 0.201 0.197 0.405 37 K 0.053 0.019 0.111 0.208 0.148 0.181 0.281 38 L 0.055 0.014 0.102 0.506 0.059 0.106 0.159 39 S 0.082 0.013 0.104 0.566 0.047 0.056 0.132 40 E 0.175 0.009 0.087 0.495 0.039 0.082 0.113 41 V 0.265 0.018 0.064 0.444 0.033 0.088 0.087 42 V 0.416 0.015 0.067 0.277 0.045 0.038 0.141 43 E 0.564 0.007 0.068 0.144 0.054 0.038 0.125 44 L 0.673 0.005 0.047 0.071 0.071 0.052 0.082 45 F 0.798 0.006 0.016 0.046 0.029 0.023 0.081 46 E 0.873 0.006 0.004 0.028 0.016 0.008 0.065 47 V 0.821 0.005 0.003 0.020 0.026 0.010 0.115 48 F 0.770 0.013 0.003 0.014 0.037 0.010 0.153 49 T 0.387 0.028 0.003 0.012 0.064 0.013 0.493 50 P 0.149 0.012 0.022 0.020 0.148 0.209 0.441 51 Q 0.037 0.010 0.044 0.020 0.208 0.483 0.198 52 D 0.017 0.008 0.059 0.016 0.286 0.416 0.198 53 G 0.017 0.011 0.048 0.022 0.311 0.289 0.303 54 R 0.032 0.033 0.044 0.034 0.315 0.243 0.298 55 G 0.044 0.019 0.031 0.047 0.306 0.186 0.368 56 A 0.061 0.028 0.031 0.076 0.195 0.108 0.501 57 E 0.088 0.026 0.039 0.189 0.149 0.168 0.342 58 G 0.127 0.015 0.050 0.255 0.148 0.163 0.242 59 E 0.184 0.030 0.045 0.329 0.096 0.052 0.265 60 L 0.212 0.035 0.047 0.428 0.052 0.037 0.189 61 G 0.209 0.012 0.043 0.478 0.051 0.042 0.164 62 A 0.145 0.010 0.047 0.551 0.053 0.079 0.116 63 A 0.087 0.011 0.035 0.558 0.073 0.082 0.154 64 S 0.066 0.010 0.024 0.565 0.070 0.092 0.174 65 K 0.021 0.002 0.029 0.805 0.035 0.059 0.049 66 A 0.033 0.003 0.038 0.779 0.034 0.050 0.063 67 Q 0.039 0.004 0.039 0.795 0.025 0.047 0.051 68 V 0.055 0.012 0.033 0.756 0.029 0.047 0.068 69 E 0.043 0.007 0.041 0.746 0.037 0.069 0.058 70 N 0.035 0.004 0.046 0.664 0.042 0.153 0.056 71 E 0.017 0.005 0.042 0.514 0.084 0.262 0.075 72 F 0.014 0.008 0.035 0.289 0.126 0.414 0.114 73 G 0.019 0.006 0.033 0.111 0.225 0.257 0.348 74 K 0.020 0.010 0.048 0.114 0.199 0.320 0.290 75 G 0.035 0.008 0.059 0.184 0.211 0.231 0.273 76 K 0.049 0.019 0.058 0.262 0.181 0.095 0.336 77 K 0.069 0.046 0.027 0.344 0.095 0.048 0.372 78 I 0.012 0.003 0.027 0.863 0.012 0.024 0.058 79 E 0.009 0.001 0.021 0.917 0.008 0.025 0.019 80 E 0.012 0.001 0.022 0.925 0.006 0.024 0.010 81 V 0.014 0.001 0.013 0.937 0.008 0.018 0.009 82 I 0.017 0.001 0.008 0.949 0.006 0.011 0.009 83 D 0.022 0.001 0.009 0.945 0.005 0.010 0.009 84 L 0.014 0.001 0.009 0.951 0.005 0.012 0.007 85 I 0.021 0.003 0.010 0.945 0.005 0.010 0.006 86 L 0.018 0.003 0.010 0.921 0.007 0.029 0.014 87 R 0.012 0.002 0.008 0.735 0.027 0.189 0.026 88 N 0.006 0.001 0.005 0.150 0.131 0.662 0.045 89 G 0.008 0.007 0.004 0.016 0.315 0.418 0.232 90 K 0.027 0.045 0.004 0.005 0.178 0.033 0.708 91 P 0.060 0.072 0.025 0.014 0.221 0.134 0.474 92 N 0.033 0.013 0.041 0.014 0.275 0.213 0.412 93 S 0.060 0.026 0.056 0.033 0.269 0.141 0.414 94 T 0.131 0.049 0.055 0.069 0.203 0.157 0.337 95 T 0.166 0.032 0.094 0.091 0.151 0.143 0.322 96 S 0.181 0.032 0.100 0.118 0.152 0.126 0.291 97 S 0.236 0.038 0.071 0.142 0.105 0.113 0.295 98 L 0.280 0.034 0.056 0.131 0.100 0.107 0.291 99 K 0.273 0.046 0.046 0.116 0.113 0.108 0.298 100 T 0.235 0.035 0.042 0.112 0.148 0.125 0.303 101 K 0.107 0.013 0.035 0.099 0.190 0.346 0.210 102 G 0.056 0.015 0.026 0.071 0.211 0.390 0.231 103 G 0.061 0.021 0.019 0.055 0.258 0.148 0.438 104 N 0.081 0.032 0.034 0.107 0.206 0.167 0.373 105 A 0.102 0.015 0.065 0.192 0.152 0.220 0.254 106 G 0.125 0.018 0.059 0.156 0.121 0.232 0.290 107 T 0.182 0.018 0.048 0.154 0.159 0.078 0.361 108 K 0.271 0.027 0.041 0.186 0.117 0.062 0.296 109 A 0.197 0.028 0.031 0.181 0.121 0.096 0.347 110 Y 0.086 0.021 0.017 0.115 0.008 0.110 0.643 111 N 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.997