# TARGET T0180
# Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    7 (1 EBGHSTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0180.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 1
#
Pos	AA	E	B	G	H	S	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.998
2	V	0.118	0.061	0.013	0.042	0.004	0.049	0.712
3	G	0.134	0.019	0.019	0.027	0.227	0.104	0.469
4	R	0.150	0.036	0.025	0.033	0.239	0.067	0.450
5	R	0.092	0.029	0.020	0.030	0.197	0.051	0.582
6	P	0.065	0.017	0.032	0.030	0.166	0.258	0.431
7	G	0.042	0.026	0.045	0.024	0.219	0.298	0.346
8	G	0.039	0.015	0.041	0.027	0.360	0.200	0.317
9	G	0.060	0.030	0.060	0.041	0.225	0.182	0.403
10	L	0.094	0.067	0.101	0.054	0.192	0.156	0.337
11	K	0.091	0.047	0.096	0.044	0.189	0.191	0.341
12	D	0.095	0.028	0.059	0.045	0.170	0.245	0.359
13	T	0.115	0.025	0.022	0.029	0.311	0.106	0.391
14	K	0.172	0.016	0.011	0.016	0.278	0.032	0.476
15	P	0.367	0.013	0.010	0.011	0.079	0.023	0.497
16	V	0.778	0.011	0.010	0.013	0.031	0.010	0.148
17	V	0.889	0.009	0.006	0.011	0.012	0.004	0.070
18	V	0.892	0.005	0.006	0.013	0.009	0.004	0.070
19	R	0.850	0.007	0.005	0.011	0.020	0.006	0.102
20	L	0.597	0.014	0.005	0.015	0.057	0.010	0.301
21	Y	0.231	0.009	0.003	0.014	0.091	0.010	0.642
22	P	0.034	0.003	0.097	0.344	0.146	0.195	0.182
23	D	0.017	0.007	0.135	0.470	0.095	0.194	0.082
24	E	0.015	0.005	0.132	0.613	0.056	0.087	0.093
25	I	0.023	0.006	0.060	0.738	0.028	0.056	0.089
26	E	0.043	0.005	0.061	0.688	0.038	0.092	0.072
27	A	0.046	0.007	0.082	0.604	0.054	0.137	0.070
28	L	0.037	0.007	0.077	0.603	0.059	0.112	0.105
29	K	0.046	0.008	0.114	0.520	0.058	0.149	0.104
30	S	0.047	0.004	0.083	0.379	0.091	0.227	0.168
31	R	0.047	0.020	0.068	0.263	0.140	0.193	0.269
32	V	0.056	0.041	0.021	0.139	0.229	0.040	0.474
33	P	0.033	0.017	0.026	0.079	0.085	0.076	0.684
34	A	0.018	0.008	0.079	0.181	0.121	0.323	0.270
35	N	0.018	0.006	0.085	0.168	0.148	0.334	0.241
36	T	0.021	0.009	0.077	0.307	0.230	0.123	0.233
37	S	0.041	0.022	0.045	0.417	0.099	0.091	0.285
38	M	0.024	0.007	0.049	0.686	0.039	0.060	0.134
39	S	0.024	0.003	0.026	0.829	0.020	0.033	0.065
40	A	0.024	0.002	0.018	0.885	0.016	0.026	0.030
41	Y	0.025	0.002	0.012	0.906	0.011	0.025	0.018
42	I	0.033	0.002	0.009	0.915	0.008	0.018	0.016
43	R	0.040	0.001	0.011	0.912	0.009	0.016	0.012
44	R	0.055	0.001	0.014	0.893	0.009	0.017	0.012
45	I	0.044	0.003	0.021	0.890	0.007	0.021	0.014
46	I	0.060	0.005	0.019	0.842	0.013	0.038	0.023
47	L	0.036	0.002	0.041	0.768	0.023	0.085	0.044
48	N	0.033	0.002	0.049	0.639	0.057	0.159	0.062
49	H	0.038	0.006	0.069	0.519	0.080	0.130	0.158
50	L	0.042	0.014	0.075	0.355	0.138	0.128	0.249
51	E	0.058	0.010	0.057	0.259	0.139	0.211	0.266
52	D	0.032	0.010	0.026	0.164	0.028	0.162	0.577
53	D	0.001	0.001	0.001	0.007	0.002	0.002	0.988