PFRMAT AL TARGET T0179 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 1 PARENT 1inlA REMARK SCORE 7.4124e-42 E 3 H 16 L 4 L 17 W 5 W 18 Y 6 Y 19 T 7 F 20 E 8 E 21 K 9 Y 22 Q 10 Y 23 T 11 T 24 K 12 G 25 N 13 N 27 F 14 V 28 G 15 G 29 I 16 L 30 T 17 F 31 M 18 M 32 K 19 K 33 V 20 M 34 N 21 N 35 K 22 R 36 T 23 V 37 L 24 I 38 H 25 Y 39 T 26 S 40 E 27 G 41 Q 28 Q 42 T 29 S 43 E 30 D 44 F 31 I 45 Q 32 Q 46 H 33 R 47 L 34 I 48 E 35 D 49 M 36 I 50 V 37 F 51 E 38 E 52 T 39 N 53 E 40 P 54 E 41 D 55 F 42 L 56 G 43 G 57 N 44 V 58 M 45 V 59 L 46 F 60 F 47 A 61 L 48 L 62 D 49 D 63 G 50 G 64 M 51 I 65 V 52 T 66 M 53 M 67 T 54 T 68 S 55 T 69 E 56 E 70 K 57 K 71 D 58 D 72 E 59 E 73 F 60 F 74 V 61 M 75 Y 62 Y 76 H 63 H 77 E 64 E 78 M 65 M 79 V 66 L 80 A 67 A 81 H 68 H 82 V 69 V 83 P 70 P 84 L 71 M 85 F 72 F 86 T 73 L 87 H 74 H 88 P 75 P 89 N 76 N 90 P 77 P 91 E 78 K 92 H 79 K 93 V 80 V 94 L 81 L 95 V 82 I 96 V 83 I 97 G 84 G 98 G 85 G 99 G 86 G 100 D 87 D 101 G 88 G 102 G 89 G 103 V 90 T 104 I 91 L 105 R 92 R 106 E 93 E 107 I 94 V 108 L 95 L 109 K 96 K 110 H 97 H 111 P 98 D 112 S 99 S 113 V 100 V 114 K 101 E 115 K 102 K 116 A 103 A 117 T 104 I 118 L 105 L 119 V 106 C 120 D 107 E 121 I 108 V 122 D 109 D 123 G 110 G 124 K 111 L 125 V 112 V 126 I 113 I 127 E 114 E 128 Y 115 A 129 S 116 A 130 K 117 R 131 K 118 K 132 F 119 Y 133 L 120 L 134 P 121 K 135 S 122 Q 136 I 123 T 137 A 124 S 138 G 125 C 139 K 126 G 140 L 127 F 141 D 128 D 142 D 129 D 143 P 130 P 144 R 131 R 145 V 132 A 146 D 133 E 147 V 134 I 148 Q 135 V 149 V 136 I 150 D 137 A 151 D 138 N 152 G 139 G 153 F 140 A 154 M 141 E 155 H 142 Y 156 I 143 V 157 A 144 R 158 K 145 K 159 S 146 F 160 E 147 K 161 N 148 N 162 Q 149 E 163 Y 150 F 164 D 151 D 165 V 152 V 166 I 153 I 167 M 154 I 168 V 155 I 169 D 156 D 170 S 157 S 171 L 167 L 182 F 168 F 183 T 169 T 184 K 170 E 185 G 171 E 186 F 172 F 187 Y 173 Y 188 A 174 Q 189 G 175 A 190 I 176 C 191 A 177 Y 192 K 178 D 193 A 179 A 194 L 180 L 195 K 181 K 196 E 182 E 197 D 183 D 198 G 184 G 199 I 185 V 200 F 186 F 201 V 187 S 202 A 188 A 203 Q 189 E 204 T 190 T 205 D 191 E 206 N 192 D 207 P 193 P 208 W 194 F 209 F 195 Y 210 T 196 D 211 P 197 I 212 E 198 G 213 L 199 W 214 I 200 F 215 T 201 K 216 N 202 L 217 V 203 A 218 Q 204 Y 219 R 205 R 220 D 206 R 221 V 207 I 222 K 208 S 223 E 209 K 224 I 210 V 225 F 211 F 226 P 212 P 227 I 213 I 228 T 214 T 229 K 215 R 230 L 216 V 231 Y 217 Y 232 T 218 L 233 A 219 G 234 N 220 F 235 I 221 M 236 P 222 T 237 T 223 T 238 Y 224 Y 239 P 225 P 240 S 226 S 241 G 227 G 242 L 228 M 243 W 229 W 244 T 230 S 245 F 231 Y 246 T 232 T 247 I 233 F 248 G 234 A 249 S 235 S 250 K 236 K 251 K 237 G 252 Y 238 I 253 D 239 D 254 P 240 P 255 L 241 I 256 A 242 K 257 V 243 D 258 E 244 F 259 D 245 D 260 S 246 P 261 R 247 E 262 F 248 K 263 F 249 V 264 D 250 R 265 I 251 K 269 E 252 E 270 T 253 L 271 K 254 K 272 Y 255 Y 273 Y 256 Y 274 T 257 N 275 K 258 E 276 D 259 E 277 I 260 V 278 H 261 H 279 K 262 V 280 A 263 A 281 A 264 S 282 F 265 F 283 V 266 A 284 L 267 L 285 P 268 P 286 K 269 N 287 F 270 F 288 V 271 V 289 S 272 K 290 D 273 K 291 L 274 E 292 I 275 L 293 TER END