# TARGET T0176 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0176.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 31 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.008 0.003 0.006 0.036 0.125 0.822 2 D 0.025 0.018 0.016 0.148 0.145 0.649 3 G 0.032 0.014 0.017 0.185 0.152 0.599 4 V 0.028 0.006 0.108 0.517 0.162 0.179 5 M 0.042 0.005 0.137 0.407 0.227 0.182 6 S 0.050 0.004 0.182 0.389 0.242 0.134 7 A 0.094 0.014 0.126 0.449 0.193 0.125 8 V 0.178 0.014 0.070 0.440 0.164 0.135 9 T 0.409 0.008 0.054 0.301 0.142 0.087 10 V 0.528 0.013 0.030 0.184 0.153 0.092 11 N 0.375 0.020 0.017 0.104 0.368 0.116 12 D 0.070 0.003 0.016 0.037 0.813 0.061 13 D 0.032 0.003 0.019 0.014 0.864 0.067 14 G 0.326 0.004 0.005 0.002 0.497 0.166 15 L 0.925 0.003 0.001 0.001 0.021 0.050 16 V 0.982 0.002 0.001 0.001 0.002 0.014 17 L 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 18 R 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 19 L 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 20 Y 0.970 0.001 0.001 0.001 0.005 0.024 21 I 0.844 0.010 0.001 0.001 0.021 0.125 22 Q 0.351 0.020 0.002 0.001 0.341 0.284 23 P 0.058 0.007 0.013 0.005 0.704 0.214 24 K 0.020 0.006 0.016 0.004 0.780 0.174 25 A 0.025 0.025 0.037 0.014 0.762 0.137 26 S 0.064 0.027 0.039 0.028 0.364 0.478 27 R 0.154 0.029 0.136 0.074 0.366 0.241 28 D 0.204 0.013 0.091 0.062 0.343 0.288 29 S 0.306 0.031 0.065 0.046 0.291 0.261 30 I 0.413 0.037 0.033 0.041 0.279 0.198 31 V 0.482 0.022 0.031 0.043 0.230 0.192 32 G 0.413 0.014 0.025 0.023 0.308 0.217 33 L 0.317 0.029 0.017 0.013 0.366 0.258 34 H 0.175 0.021 0.017 0.006 0.425 0.356 35 G 0.075 0.004 0.088 0.009 0.661 0.163 36 D 0.177 0.006 0.090 0.009 0.528 0.190 37 E 0.705 0.017 0.021 0.003 0.142 0.112 38 V 0.917 0.003 0.001 0.001 0.019 0.059 39 K 0.969 0.001 0.001 0.001 0.004 0.026 40 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 41 A 0.979 0.001 0.001 0.001 0.004 0.016 42 I 0.931 0.002 0.001 0.001 0.009 0.058 43 T 0.691 0.005 0.001 0.001 0.047 0.254 44 A 0.233 0.023 0.001 0.002 0.112 0.630 45 P 0.039 0.006 0.001 0.002 0.109 0.843 46 P 0.029 0.023 0.009 0.014 0.236 0.688 47 V 0.017 0.019 0.015 0.035 0.253 0.662 48 D 0.013 0.008 0.024 0.366 0.223 0.366 49 G 0.003 0.002 0.015 0.653 0.115 0.213 50 Q 0.001 0.001 0.008 0.971 0.010 0.010 51 A 0.001 0.001 0.008 0.983 0.005 0.002 52 N 0.001 0.001 0.003 0.993 0.002 0.002 53 S 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 54 H 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 55 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 56 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 57 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 58 F 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 59 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 60 G 0.001 0.001 0.001 0.995 0.004 0.001 61 K 0.001 0.001 0.003 0.986 0.009 0.003 62 Q 0.001 0.001 0.003 0.960 0.021 0.016 63 F 0.001 0.001 0.004 0.802 0.038 0.153 64 R 0.001 0.001 0.001 0.003 0.031 0.964 65 V 0.011 0.012 0.001 0.001 0.062 0.913 66 A 0.049 0.020 0.004 0.003 0.367 0.557 67 K 0.047 0.005 0.106 0.016 0.693 0.133 68 S 0.129 0.002 0.078 0.009 0.678 0.103 69 Q 0.555 0.009 0.031 0.008 0.332 0.064 70 V 0.875 0.008 0.001 0.005 0.020 0.092 71 V 0.950 0.010 0.001 0.002 0.006 0.031 72 I 0.919 0.008 0.001 0.003 0.018 0.052 73 E 0.831 0.008 0.003 0.004 0.076 0.079 74 K 0.356 0.007 0.007 0.006 0.288 0.337 75 G 0.114 0.008 0.007 0.004 0.430 0.438 76 E 0.132 0.042 0.015 0.004 0.406 0.400 77 L 0.133 0.044 0.050 0.008 0.413 0.352 78 G 0.067 0.016 0.111 0.011 0.612 0.183 79 R 0.065 0.010 0.158 0.011 0.586 0.170 80 H 0.098 0.010 0.096 0.012 0.556 0.228 81 K 0.310 0.021 0.035 0.008 0.291 0.335 82 Q 0.658 0.026 0.007 0.006 0.078 0.226 83 I 0.796 0.016 0.005 0.004 0.056 0.122 84 K 0.778 0.024 0.004 0.005 0.059 0.129 85 I 0.543 0.036 0.007 0.008 0.214 0.193 86 I 0.115 0.014 0.007 0.009 0.473 0.382 87 N 0.028 0.007 0.007 0.005 0.699 0.255 88 P 0.024 0.006 0.056 0.045 0.729 0.141 89 Q 0.059 0.018 0.077 0.132 0.452 0.261 90 Q 0.103 0.051 0.056 0.177 0.391 0.223 91 I 0.074 0.017 0.017 0.185 0.171 0.536 92 P 0.010 0.002 0.028 0.815 0.056 0.088 93 P 0.003 0.001 0.038 0.873 0.046 0.040 94 E 0.002 0.001 0.042 0.914 0.031 0.011 95 V 0.003 0.001 0.025 0.920 0.039 0.011 96 A 0.004 0.001 0.030 0.919 0.033 0.014 97 A 0.005 0.001 0.069 0.823 0.070 0.032 98 L 0.004 0.001 0.055 0.702 0.101 0.137 99 I 0.005 0.012 0.018 0.392 0.093 0.479 100 N 0.001 0.001 0.001 0.007 0.018 0.974