# TARGET T0176 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0176.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 31 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.002 0.991 2 D 0.017 0.019 0.030 0.099 0.014 0.078 0.743 3 G 0.022 0.019 0.044 0.123 0.151 0.153 0.488 4 V 0.034 0.012 0.091 0.247 0.098 0.132 0.386 5 M 0.066 0.010 0.136 0.298 0.075 0.159 0.256 6 S 0.129 0.008 0.174 0.316 0.083 0.095 0.196 7 A 0.268 0.018 0.150 0.309 0.041 0.063 0.151 8 V 0.502 0.018 0.048 0.242 0.028 0.036 0.127 9 T 0.613 0.012 0.033 0.190 0.021 0.044 0.086 10 V 0.531 0.012 0.028 0.198 0.043 0.090 0.097 11 N 0.279 0.009 0.055 0.102 0.095 0.288 0.172 12 D 0.031 0.005 0.045 0.015 0.218 0.635 0.052 13 D 0.012 0.001 0.017 0.002 0.191 0.751 0.027 14 G 0.267 0.002 0.005 0.001 0.194 0.161 0.370 15 L 0.832 0.008 0.001 0.001 0.010 0.002 0.147 16 V 0.979 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 17 L 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 18 R 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 19 L 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 20 Y 0.972 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.024 21 I 0.842 0.023 0.001 0.001 0.008 0.001 0.126 22 Q 0.277 0.010 0.002 0.001 0.050 0.008 0.653 23 P 0.015 0.004 0.023 0.006 0.164 0.729 0.059 24 K 0.006 0.004 0.029 0.006 0.134 0.765 0.057 25 A 0.043 0.026 0.056 0.017 0.191 0.118 0.549 26 S 0.102 0.050 0.052 0.026 0.139 0.144 0.487 27 R 0.118 0.044 0.122 0.039 0.147 0.277 0.253 28 D 0.146 0.017 0.077 0.035 0.190 0.251 0.284 29 S 0.255 0.023 0.040 0.024 0.192 0.182 0.283 30 I 0.439 0.085 0.016 0.014 0.073 0.024 0.349 31 V 0.416 0.032 0.025 0.020 0.075 0.044 0.387 32 G 0.347 0.026 0.025 0.013 0.116 0.139 0.334 33 L 0.176 0.021 0.023 0.011 0.192 0.184 0.393 34 H 0.088 0.015 0.016 0.003 0.294 0.154 0.429 35 G 0.055 0.011 0.096 0.007 0.339 0.340 0.152 36 D 0.070 0.007 0.077 0.003 0.240 0.475 0.128 37 E 0.571 0.012 0.026 0.001 0.091 0.054 0.244 38 V 0.921 0.010 0.001 0.001 0.004 0.001 0.063 39 K 0.978 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.017 40 V 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 41 A 0.965 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.031 42 I 0.897 0.005 0.001 0.001 0.006 0.001 0.090 43 T 0.679 0.004 0.002 0.001 0.068 0.009 0.237 44 A 0.182 0.011 0.001 0.002 0.351 0.008 0.444 45 P 0.048 0.018 0.001 0.005 0.115 0.006 0.807 46 P 0.013 0.013 0.021 0.063 0.117 0.070 0.704 47 V 0.006 0.007 0.040 0.190 0.166 0.285 0.306 48 D 0.004 0.003 0.057 0.369 0.105 0.237 0.225 49 G 0.004 0.002 0.021 0.600 0.171 0.085 0.117 50 Q 0.006 0.005 0.015 0.789 0.048 0.041 0.096 51 A 0.002 0.002 0.009 0.893 0.027 0.023 0.045 52 N 0.001 0.001 0.001 0.962 0.009 0.011 0.015 53 S 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.005 0.003 54 H 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.002 55 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 56 V 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 57 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 58 F 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 59 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 60 G 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 61 K 0.001 0.001 0.002 0.972 0.001 0.025 0.001 62 Q 0.001 0.001 0.003 0.859 0.003 0.132 0.002 63 F 0.001 0.004 0.003 0.391 0.086 0.473 0.042 64 R 0.004 0.006 0.003 0.008 0.118 0.451 0.410 65 V 0.023 0.031 0.001 0.001 0.223 0.008 0.714 66 A 0.070 0.013 0.001 0.001 0.030 0.005 0.880 67 K 0.039 0.010 0.440 0.032 0.204 0.172 0.103 68 S 0.047 0.008 0.404 0.050 0.189 0.228 0.073 69 Q 0.328 0.010 0.263 0.037 0.090 0.108 0.163 70 V 0.813 0.008 0.007 0.017 0.013 0.005 0.137 71 V 0.922 0.016 0.001 0.005 0.004 0.003 0.048 72 I 0.923 0.010 0.002 0.005 0.005 0.005 0.050 73 E 0.785 0.006 0.007 0.008 0.048 0.046 0.100 74 K 0.375 0.010 0.015 0.015 0.216 0.167 0.202 75 G 0.219 0.008 0.018 0.008 0.306 0.171 0.270 76 E 0.267 0.020 0.035 0.016 0.211 0.119 0.333 77 L 0.331 0.034 0.053 0.022 0.197 0.098 0.264 78 G 0.277 0.016 0.063 0.024 0.167 0.119 0.334 79 R 0.298 0.014 0.065 0.018 0.170 0.165 0.270 80 H 0.394 0.010 0.051 0.015 0.144 0.079 0.306 81 K 0.662 0.013 0.021 0.006 0.074 0.014 0.209 82 Q 0.835 0.010 0.006 0.003 0.021 0.006 0.119 83 I 0.908 0.005 0.002 0.002 0.010 0.004 0.068 84 K 0.928 0.011 0.001 0.002 0.006 0.003 0.050 85 I 0.726 0.029 0.002 0.002 0.017 0.006 0.218 86 I 0.279 0.014 0.004 0.002 0.242 0.050 0.408 87 N 0.042 0.009 0.005 0.005 0.626 0.051 0.261 88 P 0.016 0.010 0.057 0.024 0.302 0.159 0.432 89 Q 0.023 0.007 0.099 0.052 0.234 0.250 0.335 90 Q 0.023 0.051 0.119 0.093 0.220 0.111 0.383 91 I 0.014 0.034 0.018 0.132 0.113 0.018 0.670 92 P 0.004 0.003 0.028 0.652 0.021 0.033 0.258 93 P 0.003 0.001 0.034 0.885 0.010 0.039 0.029 94 E 0.004 0.001 0.051 0.885 0.010 0.030 0.019 95 V 0.005 0.002 0.033 0.918 0.011 0.016 0.015 96 A 0.009 0.001 0.035 0.897 0.011 0.028 0.019 97 A 0.013 0.001 0.041 0.815 0.018 0.093 0.021 98 L 0.010 0.002 0.032 0.711 0.035 0.167 0.043 99 I 0.014 0.014 0.023 0.487 0.008 0.218 0.236 100 N 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.989