PFRMAT AL TARGET T0175 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 1 PARENT 1kpgA REMARK SCORE 8.7572e-23 I 3 Q 31 P 4 T 32 R 5 Y 33 I 6 S 34 F 7 C 35 T 8 A 36 I 9 Y 37 S 10 F 38 E 11 E 39 S 12 R 40 E 13 D 41 H 14 D 42 R 15 M 43 I 16 T 44 H 17 L 45 N 18 Q 46 P 19 E 47 F 20 A 48 T 21 Q 49 E 22 I 50 E 23 A 51 K 24 K 52 Y 25 I 53 A 26 D 54 T 27 L 55 L 28 A 56 G 29 L 57 R 30 G 58 V 31 K 59 L 32 L 60 R 33 G 61 M 34 L 62 K 35 Q 63 P 36 P 64 G 37 G 65 T 38 M 66 R 39 T 67 I 40 L 68 L 41 L 69 D 42 D 70 L 43 V 71 G 44 G 72 S 45 C 73 G 46 G 74 S 47 W 75 G 48 G 76 E 49 A 77 M 50 T 78 L 51 M 79 C 52 M 80 T 53 R 81 W 54 A 82 A 55 V 83 R 56 E 84 D 57 K 85 H 58 Y 86 G 59 D 87 I 60 V 88 T 61 N 89 G 62 V 90 T 63 V 91 G 64 G 92 I 65 L 93 D 66 T 94 M 67 L 95 S 68 S 96 S 69 K 97 L 70 N 98 F 71 Q 99 T 72 A 100 A 73 N 101 Q 74 H 102 A 75 V 103 K 76 Q 104 R 77 Q 105 R 78 L 106 A 79 V 107 E 80 A 108 E 81 N 109 L 82 S 110 G 83 E 111 V 84 N 112 S 85 L 113 E 86 R 114 R 87 S 115 V 88 K 116 H 89 R 117 F 90 V 118 I 91 L 119 H 92 L 120 N 93 A 121 D 94 G 122 A 95 W 123 A 96 E 124 G 97 Q 125 Y 98 F 126 N 101 D 127 E 102 E 128 K 103 P 129 C 104 V 130 D 105 D 131 V 106 R 132 A 107 I 133 A 108 V 134 C 109 S 135 V 110 I 136 G 111 G 137 A 112 A 138 T 113 F 139 W 114 E 140 I 115 H 141 A 116 F 142 G 117 G 143 F 119 Y 147 A 120 D 148 G 121 A 149 A 122 F 150 E 123 F 151 E 124 S 152 L 125 L 153 L 126 A 154 A 127 H 155 Q 128 R 156 S 129 L 157 L 130 L 158 K 131 P 159 P 132 A 160 G 133 D 161 G 134 G 162 I 135 V 163 M 136 M 164 L 137 L 165 I 138 L 166 G 139 H 167 E 140 T 168 P 141 I 169 Y 142 T 170 W 143 G 171 R 144 L 172 Q 145 H 173 L 146 P 174 P 147 K 175 A 148 E 176 T 149 I 177 E 150 F 191 E 151 L 192 I 152 K 193 A 153 F 194 Q 154 I 195 A 155 V 196 C 156 T 197 G 157 E 198 V 158 I 199 S 159 F 200 S 160 P 201 T 161 G 202 S 162 G 203 D 163 R 204 F 164 L 205 L 165 P 206 T 166 S 207 L 167 I 208 P 168 P 209 G 169 M 210 L 170 V 211 V 171 Q 212 G 172 E 213 A 173 C 214 F 174 A 215 D 175 S 216 D 176 A 217 L 177 N 218 G 178 G 219 Y 179 F 220 D 180 T 221 V 181 V 222 V 182 T 223 E 183 R 224 M 184 V 225 V 185 Q 226 L 186 S 227 Y 195 L 228 E 196 Q 229 A 197 P 230 A 198 H 231 K 199 Y 232 W 200 A 233 L 201 K 234 T 202 T 235 M 203 L 236 R 204 D 237 R 205 L 238 W 206 W 239 L 207 S 240 E 208 A 241 A 209 A 242 N 210 L 243 P 211 Q 244 D 212 A 245 D 213 N 246 D 214 K 247 F 215 G 248 A 216 Q 249 A 217 A 250 E 218 I 251 V 219 A 252 R 220 L 253 A 221 Q 254 E 222 S 255 L 223 E 256 N 224 E 257 I 225 V 258 A 226 Y 259 P 227 E 260 K 228 R 261 R 229 Y 262 Y 230 M 263 V 231 K 264 T 232 Y 265 Y 233 L 266 A 234 T 267 R 235 G 268 E 236 C 269 C 237 A 270 F 238 E 271 G 239 M 272 W 240 F 273 TER END