PFRMAT AL TARGET T0173 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 15 PARENT 1hmy REMARK SCORE 6.0713e-02 M 1 M 1 S 2 I 2 E 3 T 10 T 4 G 11 P 5 L 12 R 6 R 13 L 7 F 14 L 8 I 15 F 9 D 16 V 10 L 17 H 11 F 18 A 12 A 19 S 20 G 20 N 21 L 21 G 22 G 22 A 23 G 23 T 24 F 24 I 25 R 25 A 26 L 26 H 27 A 27 Y 28 L 28 T 29 E 29 S 30 S 30 R 31 C 31 G 32 G 32 A 33 A 33 Q 34 E 34 V 35 C 35 H 36 V 36 V 37 Y 37 V 38 S 38 L 42 N 39 E 44 E 40 E 45 W 41 H 60 D 42 Y 67 K 43 R 68 Y 44 I 69 A 45 G 70 Q 46 E 71 E 47 L 72 V 48 T 73 Y 49 A 74 E 50 A 75 M 51 A 78 N 52 L 79 F 53 G 80 G 54 A 90 E 55 G 91 K 56 R 92 P 57 W 93 E 58 R 94 G 59 D 95 D 60 S 96 I 61 G 97 T 62 M 98 Q 63 A 99 V 64 G 100 N 65 T 101 E 66 D 102 K 67 Q 103 T 68 R 104 I 69 S 105 P 70 Q 106 D 71 V 110 F 93 D 111 E 94 A 112 D 95 D 113 S 96 P 114 R 97 R 115 G 98 Q 116 T 99 T 117 L 100 V 118 F 101 G 119 F 102 A 120 D 103 L 121 I 104 V 122 A 105 A 123 R 106 I 124 I 107 I 125 V 108 R 126 R 109 E 127 E 110 L 128 K 111 R 129 K 112 P 130 P 113 H 131 K 114 V 132 V 115 V 133 V 116 V 134 F 117 T 135 M 118 Y 136 E 119 D 137 N 120 P 138 V 121 N 139 K 122 G 140 N 123 G 141 F 124 Y 142 A 125 G 143 S 126 H 144 H 127 D 146 D 128 H 147 N 129 V 148 G 130 H 149 N 131 T 150 T 132 H 151 L 133 T 152 E 134 V 153 V 135 T 154 V 136 T 155 K 137 A 156 N 138 A 157 T 139 V 158 M 140 A 159 N 141 A 160 E 142 A 161 L 143 G 162 D 144 V 163 Y 145 G 164 S 146 S 165 F 147 G 166 H 148 T 167 A 149 A 168 K 150 D 169 V 151 H 170 L 152 P 171 Y 157 G 172 G 158 D 173 I 159 P 174 P 160 W 175 Q 161 T 176 K 162 V 177 R 163 P 178 E 164 K 179 R 165 F 180 I 166 Y 181 Y 167 W 182 M 168 T 183 I 169 V 184 C 170 L 185 F 171 G 186 R 172 L 187 N 173 S 188 D 174 A 196 L 175 L 197 N 176 V 198 I 177 P 199 Q 178 D 200 N 179 D 201 F 180 L 202 Q 181 R 203 F 182 P 204 P 183 E 205 K 184 W 206 P 185 V 207 F 186 L 208 E 187 P 209 L 188 R 210 N 189 A 211 T 190 D 212 F 191 E 213 V 192 I 214 K 193 A 215 D 194 F 216 L 195 G 217 L 196 Y 218 L 197 S 219 P 198 D 220 D 199 D 221 S 200 G 222 E 201 I 223 V 202 D 224 E 203 A 225 H 204 V 226 L 205 V 227 V 206 E 228 I 207 A 229 D 208 D 230 R 209 E 231 K 210 Q 232 D 211 A 233 L 212 R 234 V 213 A 245 T 215 T 246 N 216 Q 247 Q 217 V 248 E 218 G 251 I 219 P 252 E 220 T 253 Q 221 G 254 T 222 R 255 T 223 A 256 P 224 A 257 K 225 A 258 T 226 L 259 V 227 S 260 R 228 N 261 L 229 N 262 G 230 L 263 I 231 A 264 V 232 L 265 G 233 P 266 K 234 I 267 G 235 L 268 G 236 A 269 Q 237 D 270 G 238 E 271 E 239 H 272 R 240 Y 273 I 241 V 274 Y 242 L 275 S 243 A 276 T 244 G 277 R 245 G 278 G 246 S 279 I 247 A 280 A 248 G 281 I 249 A 282 T 250 R 283 L 251 D 284 S 252 E 285 A 253 R 286 Y 254 G 287 G 255 W 288 G 256 E 289 G 257 T 290 I 258 D 291 F 259 L 292 A 260 L 293 K 261 A 294 T 262 G 295 G 263 L 296 G 264 G 297 Y 265 F 298 L 266 T 299 V 267 A 300 N 268 S 301 G 269 TER END