PFRMAT AL TARGET T0171 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 2 PARENT 1a8s REMARK SCORE 2.6461e-30 N 2 T 9 N 3 Q 10 I 4 I 11 W 5 Y 12 W 6 Y 13 Q 7 K 14 T 8 D 15 K 9 W 16 G 10 G 17 Q 11 S 18 G 12 G 19 N 13 Q 20 V 14 P 21 L 16 I 22 V 17 V 23 L 18 F 24 L 19 S 25 H 20 H 26 G 21 G 27 W 22 W 28 G 23 P 29 L 24 L 30 N 25 N 31 A 26 A 32 E 27 D 33 V 28 S 34 W 29 W 35 R 30 E 36 C 31 S 37 I 32 Q 38 D 33 M 39 E 34 I 40 E 35 F 41 L 36 L 42 S 37 A 43 S 38 A 44 H 39 G 46 F 40 Y 47 T 41 R 48 L 42 V 49 H 43 I 50 L 44 A 51 V 45 H 52 D 46 D 53 L 47 R 54 P 48 R 55 G 49 G 56 F 50 H 57 G 51 G 58 R 52 R 59 S 53 S 60 R 54 S 61 G 55 Q 62 F 56 P 63 G 57 S 65 A 58 G 66 L 59 N 67 S 60 D 68 L 61 M 69 A 62 D 70 D 63 T 71 M 64 Y 72 A 65 A 73 E 66 D 74 A 67 D 75 V 68 L 76 L 69 A 77 Q 70 Q 78 Q 71 L 83 A 72 D 84 P 73 L 85 D 74 R 86 K 75 D 87 A 76 A 88 I 77 V 89 W 78 L 90 L 79 F 91 G 80 G 92 W 81 F 93 S 82 S 94 L 83 T 95 G 84 G 96 G 85 G 97 L 86 G 98 V 87 E 99 A 88 V 100 S 89 A 101 Q 90 R 102 I 91 Y 103 A 92 I 104 L 93 G 105 T 94 R 106 H 95 H 107 P 96 G 108 E 97 A 110 R 98 R 111 V 99 V 112 Q 100 A 113 A 101 K 114 L 102 A 115 V 103 G 116 T 104 L 117 V 105 I 118 A 106 S 119 S 107 A 120 S 108 V 121 P 109 P 122 C 110 P 123 F 111 L 124 S 112 M 125 A 113 L 126 R 114 K 127 D 115 T 128 E 116 E 129 W 117 A 130 P 118 N 131 G 119 G 134 I 120 L 135 K 121 P 136 P 122 M 137 D 123 E 138 V 124 V 139 L 125 F 140 A 126 D 141 G 127 G 142 F 128 I 143 Q 129 R 144 Q 130 Q 145 Q 131 A 146 L 132 S 147 S 133 L 148 D 134 A 149 D 135 D 150 F 136 R 151 Q 137 S 152 R 138 Q 153 T 139 L 154 V 140 Y 155 E 141 K 156 R 142 D 157 F 143 L 158 L 144 A 159 A 145 S 160 L 146 G 161 Q 147 P 162 T 148 F 163 M 149 P 169 G 150 G 170 T 151 A 171 E 152 K 172 T 153 S 173 A 154 S 174 R 155 A 175 Q 156 G 176 D 157 M 177 A 158 V 178 R 159 D 179 A 160 W 180 L 161 F 181 K 162 W 182 K 163 L 183 T 164 Q 184 V 165 G 185 L 166 M 186 A 167 A 187 L 168 A 188 P 169 G 189 V 173 H 190 D 174 K 191 V 175 N 192 L 176 A 193 N 177 Y 194 G 178 D 195 G 179 C 196 L 180 I 197 E 181 K 198 I 182 A 199 L 183 F 200 K 184 S 201 T 185 E 202 V 186 T 203 D 187 D 204 L 188 F 205 R 189 T 206 Q 190 E 207 P 191 D 208 L 192 L 209 Q 193 K 210 N 194 K 211 V 195 I 212 S 196 D 213 M 197 V 214 P 198 P 215 F 199 T 216 L 200 L 217 R 201 V 218 L 202 V 219 Y 203 H 220 G 204 G 221 Y 205 D 222 L 206 A 223 D 207 D 224 G 208 Q 225 L 209 V 226 V 210 V 227 P 211 P 228 R 212 I 229 K 213 A 231 V 214 S 232 V 215 G 233 P 216 I 234 M 217 A 235 L 218 S 236 D 219 A 237 K 220 A 238 L 221 L 239 W 222 V 240 P 223 K 241 H 224 G 242 S 225 S 243 E 226 T 244 S 227 L 245 Y 228 K 246 I 229 I 247 F 230 Y 248 A 231 S 249 K 232 G 250 A 233 A 251 A 234 P 252 H 235 H 253 A 236 G 254 P 237 L 255 F 238 T 256 I 239 D 257 S 240 T 258 H 241 H 259 P 242 K 260 A 243 D 261 E 244 Q 262 F 245 L 263 C 246 N 264 H 247 A 265 L 248 D 266 L 249 L 267 V 250 L 268 TER END