PFRMAT AL TARGET T0171 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 26 PARENT 1qtrA REMARK SCORE 2.6642e-35 N 2 H 25 N 3 R 26 I 4 I 27 W 5 Y 28 W 6 W 29 Q 7 E 30 T 8 L 31 K 9 S 32 G 10 G 33 Q 11 N 34 G 12 P 35 N 13 N 36 V 14 K 38 H 15 P 39 L 16 A 40 V 17 V 41 L 18 F 42 L 19 I 43 H 20 H 44 G 21 G 45 W 22 G 46 G 23 P 47 L 24 G 48 N 25 G 49 A 26 G 50 E 27 I 51 V 28 S 52 W 29 P 53 R 30 H 54 C 31 H 55 I 32 R 56 D 33 Q 57 E 34 L 58 E 35 F 59 L 36 D 60 S 37 P 61 S 38 E 62 H 39 R 63 F 40 Y 64 T 41 K 65 L 42 V 66 H 43 L 67 L 44 L 68 V 45 F 69 D 46 D 70 L 47 Q 71 P 48 R 72 G 49 G 73 F 50 C 74 G 51 G 75 R 52 R 76 S 53 S 77 R 54 R 78 G 55 P 79 F 56 H 80 G 57 D 84 A 58 N 85 L 59 N 86 S 60 T 87 L 61 T 88 A 62 W 89 D 63 H 90 M 64 L 91 A 65 V 92 E 66 A 93 A 67 D 94 V 68 I 95 L 69 E 96 Q 70 R 97 Q 71 A 102 A 72 G 103 P 73 V 104 D 74 E 105 K 75 Q 106 A 76 W 107 I 77 L 108 W 78 V 109 L 79 F 110 G 80 G 111 W 81 G 112 S 82 S 113 L 83 W 114 G 84 G 115 G 85 S 116 L 86 T 117 V 87 L 118 A 88 A 119 S 89 L 120 Q 90 A 121 I 91 Y 122 A 92 A 123 L 93 Q 124 T 94 T 125 H 95 H 126 P 96 P 127 E 97 E 128 R 98 R 129 V 99 V 130 Q 100 S 131 A 101 E 132 L 102 M 133 V 103 V 134 T 104 L 135 V 105 R 136 A 106 G 137 S 107 I 138 S 108 F 139 P 109 T 140 C 110 L 141 F 111 R 142 S 112 K 143 A 113 Q 144 R 114 R 145 D 115 L 146 E 116 H 147 W 117 W 148 P 118 Y 149 G 119 R 156 I 120 F 157 K 121 F 158 P 122 P 159 D 123 E 160 V 124 K 161 L 125 W 162 A 126 E 163 G 127 R 164 F 128 V 165 Q 129 L 166 Q 130 S 167 Q 131 I 168 L 132 L 169 S 133 S 170 D 134 D 171 D 135 D 172 F 136 E 173 Q 137 R 174 R 138 K 175 T 139 D 176 V 140 V 177 E 141 I 178 R 142 A 179 F 143 A 180 L 144 Y 181 A 145 P 212 L 146 S 213 Q 147 R 214 T 148 E 215 M 149 S 216 G 150 A 217 T 151 S 218 E 152 F 219 T 153 G 220 A 154 E 221 R 155 D 222 Q 156 D 223 D 157 F 224 A 158 A 225 R 159 L 226 A 160 A 227 L 161 F 228 K 162 A 229 K 163 R 230 V 173 I 231 D 174 E 232 V 175 N 233 L 176 H 234 N 177 Y 235 G 178 F 236 G 179 T 237 L 180 H 238 E 181 L 239 I 182 G 240 L 183 F 241 K 184 L 242 T 185 E 243 V 186 S 244 D 187 D 245 L 188 L 248 R 189 L 249 Q 190 R 250 P 191 N 251 L 192 V 252 Q 193 P 253 N 194 L 254 V 195 I 255 S 196 H 257 M 197 I 258 P 198 P 259 F 199 A 260 L 200 V 261 R 201 I 262 L 202 V 263 Y 203 H 264 G 204 G 265 Y 205 R 266 L 206 Y 267 D 207 D 268 G 208 M 269 L 209 A 270 V 210 C 271 P 211 Q 272 R 212 V 273 K 213 Q 274 V 214 N 275 V 215 A 276 P 216 W 277 M 217 D 278 L 218 L 279 D 219 A 280 K 220 K 281 L 221 A 282 W 222 W 283 P 223 P 284 H 224 E 285 S 225 A 286 E 226 E 287 S 227 L 288 Y 228 H 289 I 229 I 290 F 230 V 291 A 231 E 292 K 232 G 293 A 233 A 294 A 234 G 295 H 235 H 296 A 236 S 297 I 239 Y 298 S 240 D 299 H 241 E 300 P 242 P 301 A 243 G 302 E 244 I 303 F 245 L 304 C 246 H 305 H 247 Q 306 L 248 L 307 L 249 M 308 V 250 I 309 A 251 R 313 L 252 F 314 K 253 A 315 Q 254 G 316 R 255 K 317 TER END