PFRMAT AL TARGET T0171 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 31 PARENT 1cv2A REMARK SCORE 1.6012e-33 N 3 R 20 I 4 M 21 W 5 A 22 W 6 Y 23 Q 7 I 24 T 8 D 25 K 9 E 26 G 10 G 27 Q 11 T 28 G 12 G 29 N 13 D 30 V 14 P 31 L 16 I 32 V 17 L 33 L 18 F 34 L 19 Q 35 H 20 H 36 G 21 G 37 W 22 N 38 G 23 P 39 L 24 T 40 N 25 S 41 A 26 S 42 E 27 Y 43 V 28 L 44 W 29 W 45 R 30 R 46 C 31 N 47 I 32 I 48 D 33 M 49 E 34 P 50 E 35 H 51 L 36 C 52 S 37 A 53 S 38 G 54 H 39 L 55 F 40 G 56 T 41 R 57 L 42 L 58 H 43 I 59 L 44 A 60 V 45 C 61 D 46 D 62 L 47 L 63 P 48 I 64 G 49 G 65 F 50 M 66 G 51 G 67 R 52 D 68 S 53 S 69 R 54 D 70 G 55 K 71 F 56 L 72 G 57 E 78 A 58 R 79 L 59 Y 80 S 60 A 81 L 61 Y 82 A 62 A 83 D 63 E 84 M 64 H 85 A 65 R 86 E 66 D 87 A 67 Y 88 V 68 L 89 L 69 D 90 Q 70 A 91 Q 71 L 96 A 72 D 97 P 73 L 98 D 74 D 100 K 75 R 101 A 76 V 102 I 77 V 103 W 78 L 104 L 79 V 105 G 80 V 106 W 81 H 107 S 82 D 108 L 83 W 109 G 84 G 110 G 85 S 111 L 86 A 112 V 87 L 113 A 88 G 114 S 89 F 115 Q 90 D 116 I 91 W 117 A 92 A 118 L 93 R 119 T 94 R 120 H 95 H 121 P 96 R 122 E 97 E 123 R 98 R 124 V 99 V 125 Q 100 Q 126 A 101 G 127 L 102 I 128 V 103 A 129 T 104 Y 130 V 105 M 131 A 106 E 132 S 107 A 133 S 108 I 134 P 109 A 135 C 110 M 136 F 111 P 137 S 112 I 138 A 113 E 139 R 114 W 140 D 115 A 141 E 116 D 142 W 117 F 143 P 118 P 144 G 119 E 145 I 120 Q 146 K 121 D 147 P 122 R 148 D 123 D 149 V 124 L 150 L 125 F 151 A 126 Q 152 G 127 A 153 F 128 F 154 Q 129 R 155 Q 130 S 156 Q 131 Q 157 L 132 A 158 S 133 G 159 D 134 E 160 D 135 E 161 F 136 L 162 Q 137 V 163 R 138 L 164 T 139 Q 165 V 140 D 166 E 141 N 167 R 142 V 168 F 143 F 169 L 144 V 170 A 145 L 174 L 146 P 175 Q 147 G 176 T 148 L 177 M 149 I 178 G 150 L 179 T 151 R 180 E 152 P 181 T 153 L 182 A 154 S 183 R 155 E 184 Q 156 A 185 D 157 E 186 A 158 M 187 R 159 A 188 A 160 A 189 L 161 Y 190 K 162 R 191 K 163 E 192 T 164 P 193 V 165 F 194 L 166 L 195 A 167 A 196 L 168 A 197 P 169 G 198 M 170 E 199 P 171 A 200 E 172 R 201 V 173 R 202 D 174 P 203 V 175 T 204 L 176 L 205 N 177 S 206 G 178 W 207 G 179 P 208 L 180 R 209 E 181 Q 210 I 182 I 211 L 183 P 212 K 184 I 213 T 185 A 214 V 186 G 215 D 187 T 216 L 188 Y 227 R 189 A 228 Q 190 G 229 P 191 W 230 L 192 L 231 Q 193 S 232 N 194 E 233 V 195 S 234 S 196 P 235 M 197 I 236 P 198 P 237 F 199 K 238 L 200 L 239 R 201 F 240 L 202 I 241 Y 203 N 242 G 204 A 243 Y 205 E 244 L 206 P 245 D 207 G 246 G 208 A 247 L 209 L 248 V 210 T 249 P 211 T 250 K 213 G 251 V 214 R 252 V 215 M 253 P 216 R 254 M 217 D 255 L 218 F 256 D 219 C 257 K 220 R 258 L 221 T 259 W 222 W 260 P 223 P 261 H 224 N 262 S 225 Q 263 E 226 T 264 S 227 E 265 Y 228 I 266 I 229 T 267 F 230 V 268 A 231 A 269 A 233 G 270 A 234 A 271 H 235 H 272 A 236 F 273 P 237 I 274 F 238 Q 275 I 239 E 276 S 240 D 277 H 241 S 278 P 242 P 279 A 243 D 280 E 244 E 281 F 245 I 282 C 246 G 283 H 247 A 284 L 248 A 285 L 249 I 286 V 250 A 287 A 251 A 288 L 252 F 289 K 253 V 290 Q 254 R 291 R 255 R 292 V 256 L 293 TER END