PFRMAT AL TARGET T0171 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 5 PARENT 1a8q REMARK SCORE 5.7871e-40 M 1 P 1 N 2 I 2 N 3 E 10 I 4 I 11 W 5 F 12 W 6 Y 13 Q 7 K 14 T 8 D 15 K 9 W 16 G 10 G 17 Q 11 Q 18 G 12 G 19 N 13 R 20 V 14 P 21 L 16 V 22 V 17 V 23 L 18 F 24 L 19 I 25 H 20 H 26 G 21 G 27 W 22 W 28 G 23 P 29 L 24 L 30 N 25 N 31 A 26 G 32 E 27 D 33 V 28 A 34 W 29 W 35 R 30 Q 36 C 31 D 37 I 32 Q 38 D 33 L 39 E 34 K 40 E 35 A 41 L 36 V 42 S 37 V 43 S 38 D 44 H 39 G 46 F 40 Y 47 T 41 R 48 L 42 G 49 H 43 I 50 L 44 A 51 V 45 H 52 D 46 D 53 L 47 R 54 P 48 R 55 G 49 G 56 F 50 H 57 G 51 G 58 R 52 H 59 S 53 S 60 R 54 T 61 G 55 P 62 F 56 V 63 G 57 D 65 A 58 G 66 L 59 Y 67 S 60 D 68 L 61 F 69 A 62 D 70 D 63 T 71 M 64 F 72 A 65 A 73 E 66 D 74 A 67 D 75 V 68 L 76 L 69 N 77 Q 70 D 78 Q 71 L 83 A 72 D 84 P 73 L 85 D 74 R 86 K 75 D 87 A 76 V 88 I 77 T 89 W 78 L 90 L 79 V 91 G 80 A 92 W 81 H 93 S 82 S 94 L 83 M 95 G 84 G 96 G 85 G 97 L 86 G 98 V 87 E 99 A 88 L 100 S 89 A 101 Q 90 R 102 I 91 Y 103 A 92 V 104 L 93 G 105 T 94 R 106 H 95 H 107 P 96 G 108 E 97 G 110 R 98 R 111 V 99 L 112 Q 100 R 113 A 101 S 114 L 102 A 115 V 103 V 116 T 104 L 117 V 105 L 118 A 106 S 119 S 107 A 120 S 108 I 121 P 109 P 122 C 110 P 123 F 111 V 124 S 112 M 125 A 113 I 126 R 114 K 127 D 115 S 128 E 116 D 129 W 117 K 130 P 118 N 131 G 119 E 138 I 120 V 139 K 121 F 140 P 122 D 141 D 123 A 142 V 124 L 143 L 125 K 144 A 126 N 145 G 127 G 146 F 128 V 147 Q 129 L 148 Q 130 T 149 Q 131 E 150 L 132 R 151 S 133 S 152 D 134 Q 153 D 135 F 154 F 136 W 155 Q 137 K 156 R 138 D 157 T 139 T 158 V 140 A 159 E 141 E 160 R 142 G 161 F 143 F 162 L 144 F 163 A 145 S 164 L 146 A 165 Q 147 N 166 T 148 R 167 M 149 P 168 G 150 G 169 T 151 N 170 E 152 K 171 T 153 V 172 A 154 T 173 R 155 Q 174 Q 156 G 175 D 157 N 176 A 158 K 177 R 159 D 178 A 160 A 179 L 161 F 180 K 162 W 181 K 163 Y 182 T 164 M 183 V 165 A 184 L 166 M 185 A 167 A 186 L 168 Q 187 P 169 T 188 V 173 I 189 D 174 E 190 V 175 G 191 L 176 G 192 N 177 V 193 G 178 R 194 G 179 C 195 L 180 V 196 E 181 D 197 I 182 A 198 L 183 F 199 K 184 G 200 T 185 Y 201 V 186 T 202 D 187 D 203 L 188 F 204 R 189 T 205 Q 190 E 206 P 191 D 207 L 192 L 208 Q 193 K 209 N 194 K 210 V 195 F 211 S 196 D 212 M 197 I 213 P 198 P 214 F 199 T 215 L 200 L 216 R 201 V 217 L 202 V 218 Y 203 H 219 G 204 G 220 Y 205 D 221 L 206 D 222 D 207 D 223 G 208 Q 224 L 209 V 225 V 210 V 226 P 211 P 227 R 212 I 228 K 213 A 230 V 214 T 231 V 215 G 232 P 216 R 233 M 217 K 234 L 218 S 235 D 219 A 236 K 220 Q 237 L 221 I 238 W 222 I 239 P 223 P 240 H 224 N 241 S 225 A 242 E 226 E 243 S 227 L 244 Y 228 K 245 I 229 V 246 F 230 Y 247 A 231 E 248 K 232 G 249 A 233 S 250 A 234 S 251 H 235 H 252 A 236 G 253 P 237 I 254 F 238 A 255 I 239 M 256 S 240 V 257 H 241 D 260 P 242 K 261 A 243 E 262 E 244 K 263 F 245 F 264 C 246 N 265 H 247 R 266 L 248 D 267 L 249 L 268 V 250 L 269 A 251 E 270 L 252 F 271 K 253 L 272 Q 254 N 273 R 255 K 274 TER END