PFRMAT AL TARGET T0171 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 45 PARENT 1a88A REMARK SCORE 1.5504e-29 N 2 T 9 N 3 N 10 I 4 I 11 W 5 F 12 W 6 Y 13 Q 7 K 14 T 8 D 15 K 9 W 16 G 10 G 17 Q 11 P 18 G 12 R 19 N 13 D 20 V 14 L 22 H 15 P 23 L 16 V 24 V 17 V 25 L 18 F 26 L 19 H 27 H 20 H 28 G 21 G 29 W 22 W 30 G 23 P 31 L 24 L 32 N 25 S 33 A 26 A 34 E 27 D 35 V 28 D 36 W 29 W 37 R 30 D 38 C 31 N 39 I 32 Q 40 D 33 M 41 E 34 L 42 E 35 F 43 L 36 F 44 S 37 L 45 S 38 S 46 H 39 G 48 F 40 Y 49 T 41 R 50 L 42 V 51 H 43 I 52 L 44 A 53 V 45 H 54 D 46 D 55 L 47 R 56 P 48 R 57 G 49 G 58 F 50 H 59 G 51 G 60 R 52 R 61 S 53 S 62 R 54 D 63 G 55 Q 64 F 56 P 65 G 57 T 67 A 58 G 68 L 59 H 69 S 60 D 70 L 61 M 71 A 62 D 72 D 63 T 73 M 64 Y 74 A 65 A 75 E 66 A 76 A 67 D 77 V 68 V 78 L 69 A 79 Q 70 A 80 Q 71 L 85 A 72 D 86 P 73 L 87 D 74 R 88 K 75 G 89 A 76 A 90 I 77 V 91 W 78 H 92 L 79 I 93 G 80 G 94 W 81 H 95 S 82 S 96 L 83 T 97 G 84 G 98 G 85 G 99 L 86 G 100 V 87 E 101 A 88 V 102 S 89 A 103 Q 90 R 104 I 91 Y 105 A 92 V 106 L 93 A 107 T 94 R 108 H 95 A 109 P 96 P 111 E 97 G 112 R 98 R 113 V 99 V 114 Q 100 A 115 A 101 K 116 L 102 A 117 V 103 V 118 T 104 L 119 V 105 V 120 A 106 S 121 S 107 A 122 S 108 V 123 P 109 P 124 C 110 P 125 F 111 V 126 S 112 M 127 A 113 V 128 R 114 K 129 D 115 S 130 E 116 D 131 W 117 T 132 P 118 N 133 G 119 G 136 I 120 L 137 K 121 P 138 P 122 L 139 D 123 E 140 V 124 V 141 L 125 F 142 A 126 D 143 G 127 E 144 F 128 F 145 Q 129 R 146 Q 130 A 147 Q 131 A 148 L 132 L 149 S 133 A 150 D 134 A 151 D 135 N 152 F 136 R 153 Q 137 A 154 R 138 Q 155 T 139 F 156 V 140 Y 157 E 141 I 158 R 142 D 159 F 143 V 160 L 144 P 161 A 145 G 167 L 146 F 168 Q 147 N 169 T 148 R 170 M 149 E 171 G 150 G 172 T 151 A 173 E 152 T 174 T 153 V 175 A 154 S 176 R 155 Q 177 Q 156 G 178 D 157 L 179 A 158 I 180 R 159 D 181 A 160 H 182 L 161 W 183 K 162 W 184 K 163 L 185 T 164 Q 186 V 165 G 187 L 166 M 188 A 167 M 189 L 168 G 190 P 169 A 191 V 173 A 192 D 174 N 193 V 175 A 194 L 176 H 195 N 177 Y 196 G 178 E 197 G 179 C 198 L 180 I 199 E 181 A 200 I 182 A 201 L 183 F 202 K 184 S 203 T 185 E 204 V 186 T 205 D 187 D 206 L 188 F 207 R 189 T 208 Q 190 D 209 P 191 D 210 L 192 L 211 Q 193 K 212 N 194 R 213 V 195 I 214 S 196 D 215 M 197 V 216 P 198 P 217 F 199 V 218 L 200 L 219 R 201 V 220 L 202 A 221 Y 203 H 222 G 204 G 223 Y 205 T 224 L 206 D 225 D 207 D 226 G 208 Q 227 L 209 V 228 V 210 V 229 P 211 P 230 R 212 Y 231 K 213 D 233 V 214 A 234 V 215 A 235 P 216 P 236 M 217 K 237 L 218 S 238 D 219 A 239 K 220 E 240 L 221 L 241 W 222 L 242 P 223 A 243 H 224 N 244 S 225 A 245 E 226 T 246 S 227 L 247 Y 228 K 248 I 229 S 249 F 230 Y 250 A 231 E 251 K 232 G 252 A 233 L 253 A 234 P 254 H 235 H 255 A 236 G 256 P 237 M 257 F 238 L 258 I 239 S 259 S 240 T 260 H 241 H 261 P 242 P 262 A 243 E 263 E 244 V 264 F 245 L 265 C 246 N 266 H 247 P 267 L 248 D 268 L 249 L 269 V 250 L 270 TER END