# TARGET T0170 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0170.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 30 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 Q 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.997 2 P 0.013 0.014 0.006 0.249 0.002 0.037 0.679 3 A 0.009 0.005 0.015 0.352 0.129 0.090 0.400 4 K 0.009 0.003 0.029 0.483 0.089 0.096 0.291 5 K 0.011 0.003 0.045 0.603 0.095 0.075 0.167 6 T 0.018 0.004 0.062 0.622 0.075 0.075 0.144 7 Y 0.015 0.005 0.081 0.613 0.068 0.083 0.136 8 T 0.020 0.003 0.044 0.675 0.041 0.101 0.116 9 W 0.014 0.007 0.032 0.568 0.062 0.148 0.169 10 N 0.011 0.007 0.020 0.548 0.086 0.091 0.237 11 T 0.003 0.004 0.015 0.643 0.050 0.085 0.199 12 K 0.001 0.001 0.004 0.930 0.020 0.014 0.031 13 E 0.001 0.001 0.002 0.971 0.005 0.009 0.012 14 E 0.001 0.001 0.002 0.979 0.004 0.010 0.005 15 A 0.001 0.001 0.002 0.976 0.003 0.015 0.004 16 K 0.001 0.001 0.001 0.986 0.003 0.008 0.002 17 Q 0.001 0.001 0.001 0.981 0.002 0.013 0.003 18 A 0.001 0.001 0.001 0.971 0.002 0.020 0.006 19 F 0.001 0.001 0.001 0.974 0.005 0.010 0.009 20 K 0.001 0.001 0.004 0.979 0.003 0.010 0.004 21 E 0.001 0.001 0.002 0.968 0.003 0.022 0.003 22 L 0.001 0.001 0.003 0.959 0.004 0.027 0.006 23 L 0.001 0.002 0.007 0.918 0.021 0.035 0.016 24 K 0.002 0.002 0.025 0.804 0.015 0.123 0.028 25 E 0.004 0.004 0.046 0.513 0.031 0.361 0.041 26 K 0.006 0.002 0.023 0.126 0.121 0.604 0.118 27 R 0.009 0.019 0.019 0.021 0.116 0.524 0.292 28 V 0.010 0.075 0.006 0.006 0.103 0.012 0.788 29 P 0.006 0.009 0.017 0.002 0.066 0.017 0.883 30 S 0.002 0.001 0.051 0.005 0.122 0.787 0.032 31 N 0.003 0.003 0.037 0.005 0.089 0.806 0.056 32 A 0.035 0.058 0.010 0.009 0.241 0.020 0.627 33 S 0.063 0.126 0.004 0.025 0.071 0.015 0.695 34 W 0.002 0.001 0.067 0.876 0.011 0.023 0.018 35 E 0.001 0.001 0.036 0.928 0.008 0.017 0.010 36 Q 0.001 0.001 0.026 0.942 0.004 0.020 0.006 37 A 0.001 0.001 0.010 0.945 0.005 0.028 0.009 38 M 0.002 0.001 0.006 0.953 0.007 0.023 0.009 39 K 0.001 0.001 0.011 0.956 0.004 0.021 0.006 40 M 0.001 0.001 0.014 0.951 0.007 0.018 0.008 41 I 0.002 0.004 0.035 0.915 0.008 0.027 0.010 42 I 0.002 0.001 0.027 0.742 0.017 0.199 0.013 43 N 0.001 0.001 0.012 0.546 0.027 0.394 0.020 44 D 0.001 0.001 0.007 0.085 0.312 0.047 0.547 45 P 0.001 0.002 0.096 0.108 0.050 0.695 0.048 46 R 0.004 0.003 0.193 0.075 0.049 0.616 0.060 47 Y 0.035 0.033 0.325 0.105 0.070 0.100 0.332 48 S 0.221 0.061 0.125 0.115 0.061 0.119 0.298 49 A 0.188 0.024 0.129 0.098 0.108 0.172 0.281 50 L 0.120 0.069 0.081 0.079 0.180 0.126 0.346 51 A 0.036 0.016 0.033 0.079 0.337 0.137 0.362 52 N 0.009 0.006 0.012 0.068 0.303 0.079 0.523 53 L 0.001 0.001 0.053 0.714 0.063 0.100 0.069 54 S 0.001 0.001 0.057 0.785 0.034 0.090 0.031 55 E 0.001 0.002 0.060 0.829 0.026 0.050 0.031 56 K 0.001 0.002 0.018 0.915 0.011 0.028 0.025 57 K 0.001 0.001 0.005 0.948 0.010 0.024 0.012 58 Q 0.002 0.001 0.004 0.962 0.005 0.020 0.009 59 A 0.001 0.001 0.002 0.968 0.004 0.014 0.010 60 F 0.001 0.001 0.001 0.986 0.003 0.005 0.004 61 N 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.005 0.002 62 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.001 63 Y 0.001 0.001 0.002 0.986 0.002 0.007 0.003 64 K 0.004 0.001 0.002 0.972 0.003 0.014 0.003 65 V 0.009 0.001 0.007 0.904 0.006 0.065 0.008 66 Q 0.015 0.002 0.010 0.766 0.032 0.139 0.036 67 T 0.035 0.005 0.016 0.546 0.071 0.172 0.154 68 E 0.028 0.012 0.019 0.252 0.007 0.144 0.538 69 K 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.993