# TARGET T0169 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0169.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 246 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.055 0.002 0.001 0.002 0.093 0.848 2 D 0.440 0.024 0.001 0.002 0.027 0.506 3 I 0.739 0.014 0.001 0.002 0.013 0.231 4 R 0.749 0.003 0.006 0.003 0.025 0.214 5 T 0.756 0.015 0.013 0.003 0.036 0.178 6 I 0.342 0.017 0.008 0.001 0.121 0.511 7 T 0.089 0.010 0.007 0.004 0.324 0.566 8 S 0.006 0.001 0.392 0.099 0.420 0.082 9 S 0.002 0.002 0.385 0.172 0.374 0.065 10 D 0.001 0.002 0.309 0.497 0.135 0.056 11 Y 0.001 0.001 0.030 0.878 0.040 0.050 12 E 0.001 0.001 0.011 0.950 0.023 0.014 13 M 0.001 0.001 0.014 0.969 0.009 0.006 14 V 0.003 0.001 0.009 0.975 0.008 0.005 15 T 0.002 0.001 0.006 0.980 0.008 0.004 16 S 0.002 0.001 0.006 0.975 0.010 0.006 17 V 0.003 0.001 0.006 0.966 0.016 0.010 18 L 0.002 0.001 0.008 0.955 0.021 0.013 19 N 0.001 0.001 0.016 0.927 0.034 0.021 20 E 0.001 0.001 0.017 0.868 0.057 0.057 21 W 0.003 0.002 0.017 0.604 0.139 0.235 22 W 0.004 0.005 0.025 0.209 0.263 0.493 23 G 0.005 0.004 0.055 0.235 0.333 0.368 24 G 0.005 0.002 0.063 0.233 0.351 0.345 25 R 0.006 0.003 0.077 0.275 0.355 0.284 26 Q 0.012 0.004 0.080 0.323 0.327 0.254 27 L 0.011 0.007 0.060 0.386 0.249 0.286 28 K 0.011 0.006 0.037 0.523 0.182 0.240 29 E 0.007 0.002 0.021 0.770 0.091 0.109 30 K 0.010 0.003 0.016 0.838 0.063 0.070 31 L 0.015 0.003 0.015 0.855 0.051 0.060 32 P 0.021 0.002 0.011 0.887 0.036 0.043 33 R 0.019 0.001 0.012 0.912 0.032 0.025 34 L 0.012 0.001 0.012 0.927 0.026 0.022 35 F 0.011 0.001 0.019 0.905 0.033 0.032 36 F 0.011 0.002 0.024 0.891 0.039 0.033 37 E 0.011 0.003 0.025 0.800 0.080 0.081 38 H 0.019 0.006 0.027 0.390 0.297 0.261 39 F 0.020 0.009 0.046 0.107 0.570 0.248 40 Q 0.023 0.007 0.070 0.050 0.663 0.186 41 D 0.104 0.006 0.043 0.018 0.613 0.216 42 T 0.557 0.005 0.013 0.009 0.216 0.201 43 S 0.919 0.006 0.002 0.003 0.023 0.048 44 F 0.976 0.002 0.001 0.001 0.006 0.014 45 I 0.978 0.001 0.001 0.001 0.006 0.011 46 T 0.976 0.001 0.001 0.001 0.009 0.012 47 S 0.891 0.002 0.002 0.001 0.093 0.011 48 E 0.447 0.004 0.006 0.003 0.513 0.027 49 H 0.054 0.001 0.005 0.001 0.927 0.011 50 N 0.077 0.002 0.012 0.002 0.882 0.024 51 S 0.862 0.005 0.001 0.001 0.079 0.053 52 M 0.980 0.003 0.001 0.001 0.007 0.010 53 T 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 54 G 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 55 F 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 56 L 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 57 I 0.982 0.001 0.001 0.001 0.004 0.013 58 G 0.936 0.003 0.001 0.001 0.013 0.047 59 F 0.828 0.008 0.002 0.001 0.068 0.094 60 Q 0.553 0.012 0.013 0.002 0.218 0.202 61 S 0.282 0.015 0.021 0.006 0.438 0.237 62 Q 0.117 0.010 0.060 0.020 0.623 0.170 63 S 0.099 0.010 0.060 0.029 0.600 0.202 64 D 0.133 0.018 0.065 0.029 0.609 0.145 65 P 0.153 0.007 0.063 0.028 0.599 0.150 66 E 0.346 0.011 0.043 0.022 0.358 0.220 67 T 0.816 0.011 0.008 0.007 0.078 0.079 68 A 0.921 0.003 0.002 0.003 0.020 0.052 69 Y 0.967 0.001 0.001 0.002 0.006 0.022 70 I 0.968 0.002 0.001 0.004 0.007 0.017 71 H 0.948 0.001 0.003 0.006 0.015 0.027 72 F 0.948 0.002 0.005 0.007 0.018 0.021 73 S 0.924 0.002 0.005 0.005 0.032 0.031 74 G 0.932 0.007 0.004 0.005 0.026 0.026 75 V 0.727 0.040 0.008 0.009 0.082 0.133 76 H 0.122 0.012 0.007 0.016 0.359 0.484 77 P 0.002 0.001 0.502 0.198 0.272 0.025 78 D 0.002 0.001 0.537 0.159 0.292 0.010 79 F 0.001 0.001 0.496 0.219 0.275 0.009 80 R 0.004 0.004 0.176 0.356 0.310 0.150 81 K 0.011 0.004 0.028 0.474 0.269 0.215 82 M 0.017 0.003 0.009 0.398 0.186 0.387 83 Q 0.024 0.007 0.003 0.109 0.113 0.744 84 I 0.014 0.010 0.009 0.770 0.053 0.144 85 G 0.008 0.001 0.014 0.882 0.020 0.074 86 K 0.002 0.001 0.011 0.970 0.006 0.011 87 Q 0.002 0.001 0.011 0.978 0.004 0.005 88 L 0.001 0.001 0.004 0.988 0.002 0.005 89 Y 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 90 D 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 91 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.002 92 F 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.002 93 I 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 94 E 0.001 0.001 0.001 0.993 0.005 0.002 95 T 0.001 0.001 0.001 0.991 0.006 0.002 96 V 0.001 0.001 0.004 0.984 0.009 0.002 97 K 0.001 0.001 0.013 0.966 0.016 0.004 98 Q 0.001 0.001 0.019 0.927 0.038 0.015 99 R 0.001 0.001 0.021 0.712 0.109 0.156 100 G 0.002 0.001 0.001 0.003 0.083 0.910 101 C 0.023 0.001 0.001 0.001 0.107 0.868 102 T 0.364 0.003 0.002 0.001 0.094 0.536 103 R 0.967 0.006 0.001 0.001 0.007 0.020 104 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 105 K 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 106 C 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.013 107 V 0.940 0.001 0.001 0.001 0.016 0.041 108 T 0.767 0.015 0.001 0.002 0.063 0.152 109 S 0.385 0.035 0.003 0.008 0.390 0.179 110 P 0.063 0.007 0.011 0.031 0.686 0.202 111 V 0.011 0.003 0.011 0.051 0.747 0.178 112 N 0.015 0.014 0.016 0.332 0.429 0.194 113 K 0.005 0.001 0.006 0.906 0.045 0.037 114 V 0.003 0.001 0.007 0.969 0.013 0.008 115 S 0.003 0.001 0.005 0.985 0.004 0.002 116 I 0.001 0.001 0.002 0.992 0.003 0.001 117 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.001 118 Y 0.002 0.001 0.001 0.994 0.002 0.001 119 H 0.003 0.001 0.003 0.989 0.004 0.002 120 T 0.003 0.001 0.006 0.983 0.005 0.003 121 K 0.004 0.001 0.008 0.969 0.010 0.009 122 L 0.007 0.001 0.004 0.868 0.025 0.095 123 G 0.023 0.001 0.001 0.014 0.059 0.903 124 F 0.229 0.005 0.001 0.008 0.072 0.684 125 D 0.700 0.010 0.003 0.008 0.065 0.215 126 I 0.787 0.014 0.005 0.008 0.062 0.124 127 E 0.718 0.003 0.012 0.010 0.101 0.156 128 K 0.674 0.004 0.007 0.007 0.118 0.190 129 G 0.747 0.013 0.005 0.007 0.079 0.150 130 T 0.793 0.013 0.005 0.007 0.082 0.100 131 K 0.793 0.014 0.007 0.014 0.081 0.091 132 T 0.551 0.019 0.012 0.016 0.280 0.122 133 V 0.212 0.010 0.023 0.028 0.565 0.162 134 N 0.107 0.005 0.018 0.020 0.620 0.230 135 G 0.266 0.015 0.027 0.027 0.492 0.174 136 I 0.485 0.014 0.015 0.035 0.195 0.256 137 S 0.694 0.019 0.016 0.031 0.097 0.144 138 V 0.736 0.012 0.013 0.033 0.084 0.122 139 F 0.729 0.011 0.012 0.034 0.078 0.136 140 A 0.714 0.014 0.012 0.027 0.093 0.140 141 N 0.562 0.016 0.016 0.026 0.242 0.140 142 Y 0.430 0.015 0.018 0.023 0.337 0.178 143 D 0.148 0.016 0.017 0.022 0.554 0.244 144 G 0.072 0.017 0.017 0.021 0.633 0.240 145 P 0.052 0.011 0.018 0.034 0.459 0.427 146 G 0.086 0.025 0.067 0.151 0.408 0.263 147 Q 0.138 0.010 0.057 0.213 0.325 0.256 148 D 0.285 0.009 0.058 0.213 0.172 0.263 149 R 0.588 0.012 0.039 0.228 0.060 0.073 150 V 0.709 0.009 0.020 0.185 0.029 0.047 151 L 0.736 0.005 0.014 0.181 0.025 0.039 152 F 0.655 0.002 0.014 0.198 0.038 0.092 153 V 0.504 0.012 0.020 0.218 0.064 0.182 154 K 0.304 0.010 0.031 0.196 0.113 0.346 155 N 0.073 0.008 0.013 0.077 0.124 0.705 156 I 0.002 0.002 0.001 0.005 0.031 0.959