# TARGET T0167 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0167.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 202 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.008 0.002 0.001 0.987 2 K 0.029 0.030 0.015 0.487 0.003 0.034 0.401 3 T 0.019 0.005 0.020 0.595 0.058 0.052 0.252 4 T 0.010 0.002 0.024 0.754 0.045 0.054 0.110 5 E 0.008 0.003 0.023 0.797 0.048 0.054 0.067 6 Y 0.005 0.002 0.014 0.854 0.024 0.045 0.056 7 V 0.003 0.001 0.007 0.909 0.020 0.030 0.030 8 A 0.003 0.001 0.004 0.935 0.013 0.028 0.016 9 E 0.001 0.001 0.005 0.943 0.010 0.021 0.020 10 I 0.001 0.001 0.002 0.973 0.005 0.009 0.010 11 L 0.001 0.001 0.001 0.979 0.004 0.012 0.004 12 N 0.001 0.001 0.001 0.980 0.002 0.015 0.003 13 E 0.001 0.001 0.001 0.979 0.002 0.013 0.004 14 L 0.001 0.001 0.001 0.985 0.004 0.008 0.003 15 H 0.001 0.001 0.001 0.980 0.004 0.012 0.004 16 N 0.001 0.001 0.002 0.973 0.003 0.017 0.004 17 S 0.001 0.001 0.006 0.957 0.005 0.023 0.008 18 A 0.001 0.001 0.037 0.843 0.009 0.100 0.009 19 A 0.001 0.001 0.051 0.545 0.016 0.370 0.016 20 Y 0.001 0.004 0.067 0.367 0.048 0.439 0.074 21 I 0.002 0.011 0.015 0.095 0.437 0.078 0.361 22 S 0.002 0.003 0.007 0.054 0.121 0.036 0.777 23 N 0.001 0.001 0.039 0.810 0.048 0.059 0.043 24 E 0.001 0.001 0.021 0.903 0.017 0.042 0.017 25 E 0.001 0.001 0.011 0.947 0.007 0.022 0.013 26 A 0.001 0.001 0.001 0.980 0.006 0.006 0.007 27 D 0.001 0.001 0.001 0.981 0.004 0.008 0.007 28 Q 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.008 0.003 29 L 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.006 0.004 30 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.005 0.002 31 D 0.001 0.001 0.001 0.985 0.002 0.009 0.002 32 H 0.001 0.001 0.002 0.979 0.002 0.012 0.004 33 I 0.002 0.001 0.006 0.964 0.003 0.017 0.007 34 L 0.006 0.001 0.016 0.795 0.009 0.164 0.010 35 S 0.007 0.002 0.030 0.366 0.024 0.543 0.029 36 S 0.007 0.005 0.031 0.042 0.183 0.524 0.208 37 H 0.005 0.001 0.009 0.002 0.135 0.775 0.073 38 Q 0.209 0.001 0.006 0.001 0.443 0.128 0.212 39 I 0.926 0.008 0.001 0.001 0.002 0.001 0.063 40 F 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 41 T 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 42 A 0.973 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.024 43 G 0.774 0.003 0.001 0.001 0.032 0.005 0.185 44 A 0.301 0.008 0.005 0.004 0.176 0.040 0.467 45 G 0.050 0.009 0.020 0.017 0.392 0.149 0.364 46 R 0.013 0.007 0.073 0.222 0.340 0.200 0.144 47 S 0.008 0.007 0.038 0.593 0.114 0.081 0.159 48 G 0.001 0.001 0.011 0.947 0.013 0.016 0.011 49 L 0.001 0.001 0.004 0.980 0.003 0.008 0.004 50 M 0.001 0.001 0.003 0.984 0.002 0.009 0.002 51 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.003 0.001 52 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 53 S 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 54 F 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 55 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 56 M 0.001 0.001 0.001 0.979 0.001 0.017 0.001 57 R 0.001 0.001 0.002 0.956 0.002 0.037 0.003 58 L 0.001 0.001 0.006 0.923 0.015 0.037 0.016 59 M 0.003 0.002 0.037 0.840 0.016 0.083 0.020 60 H 0.005 0.001 0.041 0.696 0.033 0.200 0.024 61 M 0.005 0.004 0.028 0.344 0.112 0.446 0.062 62 G 0.012 0.004 0.006 0.028 0.097 0.665 0.188 63 F 0.074 0.005 0.002 0.007 0.105 0.014 0.795 64 N 0.460 0.012 0.003 0.007 0.090 0.009 0.420 65 A 0.843 0.011 0.004 0.006 0.012 0.006 0.117 66 H 0.930 0.003 0.003 0.006 0.009 0.004 0.045 67 I 0.918 0.009 0.003 0.006 0.011 0.004 0.050 68 V 0.739 0.008 0.005 0.010 0.031 0.019 0.187 69 G 0.337 0.012 0.022 0.020 0.192 0.168 0.249 70 E 0.098 0.007 0.045 0.023 0.314 0.303 0.209 71 I 0.164 0.017 0.036 0.023 0.308 0.181 0.270 72 L 0.290 0.041 0.044 0.020 0.131 0.087 0.387 73 T 0.405 0.030 0.058 0.015 0.088 0.037 0.367 74 P 0.383 0.007 0.075 0.018 0.065 0.054 0.398 75 P 0.430 0.021 0.083 0.029 0.062 0.099 0.276 76 L 0.157 0.027 0.016 0.012 0.049 0.017 0.721 77 A 0.084 0.014 0.023 0.004 0.035 0.025 0.815 78 E 0.004 0.002 0.043 0.003 0.066 0.869 0.013 79 G 0.005 0.001 0.021 0.001 0.046 0.914 0.013 80 D 0.302 0.003 0.002 0.001 0.105 0.008 0.579 81 L 0.890 0.005 0.001 0.001 0.012 0.001 0.091 82 V 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 83 I 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 84 I 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 85 G 0.948 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.044 86 S 0.547 0.009 0.002 0.001 0.035 0.006 0.399 87 G 0.150 0.007 0.027 0.006 0.283 0.157 0.371 88 S 0.017 0.005 0.069 0.016 0.327 0.408 0.159 89 G 0.008 0.012 0.096 0.030 0.352 0.341 0.161 90 E 0.008 0.014 0.041 0.083 0.368 0.085 0.401 91 T 0.012 0.009 0.009 0.215 0.191 0.020 0.544 92 K 0.001 0.001 0.009 0.967 0.007 0.011 0.005 93 S 0.001 0.001 0.008 0.978 0.002 0.009 0.003 94 L 0.001 0.001 0.003 0.991 0.001 0.004 0.001 95 I 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 96 H 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.005 0.001 97 T 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 98 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 99 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 100 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 101 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 102 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 103 S 0.001 0.001 0.003 0.931 0.002 0.062 0.001 104 L 0.001 0.001 0.002 0.104 0.006 0.888 0.001 105 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.987 0.007 106 G 0.012 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 0.970 107 I 0.524 0.001 0.001 0.001 0.211 0.001 0.264 108 V 0.991 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 109 A 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 110 A 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 111 L 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 112 T 0.652 0.002 0.001 0.001 0.038 0.003 0.303 113 I 0.138 0.005 0.005 0.003 0.338 0.026 0.486 114 N 0.028 0.019 0.013 0.002 0.188 0.036 0.713 115 P 0.005 0.004 0.036 0.004 0.122 0.757 0.072 116 E 0.003 0.002 0.033 0.005 0.236 0.667 0.055 117 S 0.022 0.023 0.020 0.017 0.339 0.032 0.547 118 S 0.048 0.029 0.121 0.411 0.079 0.121 0.192 119 I 0.034 0.014 0.322 0.403 0.026 0.113 0.088 120 G 0.042 0.010 0.524 0.225 0.034 0.084 0.081 121 K 0.098 0.007 0.321 0.271 0.069 0.154 0.079 122 Q 0.173 0.019 0.185 0.134 0.100 0.260 0.129 123 A 0.207 0.006 0.008 0.015 0.154 0.034 0.576 124 D 0.267 0.001 0.001 0.001 0.509 0.022 0.199 125 L 0.965 0.004 0.001 0.001 0.011 0.002 0.018 126 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 127 I 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 128 R 0.963 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.033 129 M 0.700 0.005 0.001 0.001 0.035 0.002 0.257 130 P 0.385 0.005 0.003 0.001 0.136 0.013 0.458 131 G 0.208 0.021 0.017 0.006 0.165 0.050 0.534 132 S 0.190 0.029 0.031 0.012 0.172 0.077 0.491 133 P 0.222 0.022 0.033 0.017 0.156 0.075 0.475 134 K 0.220 0.042 0.032 0.022 0.124 0.052 0.507 135 D 0.143 0.039 0.033 0.026 0.104 0.077 0.577 136 Q 0.119 0.018 0.049 0.030 0.122 0.216 0.446 137 S 0.055 0.010 0.057 0.039 0.183 0.497 0.158 138 N 0.042 0.007 0.059 0.036 0.265 0.456 0.135 139 G 0.061 0.007 0.033 0.028 0.422 0.253 0.196 140 S 0.129 0.030 0.027 0.025 0.222 0.187 0.380 141 Y 0.297 0.064 0.022 0.025 0.119 0.094 0.379 142 K 0.306 0.033 0.031 0.030 0.107 0.087 0.406 143 T 0.281 0.026 0.068 0.056 0.142 0.103 0.324 144 I 0.313 0.033 0.066 0.084 0.093 0.065 0.347 145 Q 0.299 0.034 0.073 0.099 0.107 0.075 0.313 146 P 0.301 0.029 0.072 0.144 0.094 0.085 0.275 147 M 0.140 0.017 0.119 0.213 0.112 0.130 0.270 148 G 0.096 0.010 0.121 0.250 0.137 0.159 0.227 149 S 0.070 0.018 0.093 0.335 0.115 0.166 0.202 150 L 0.035 0.018 0.043 0.420 0.144 0.119 0.221 151 F 0.019 0.005 0.018 0.628 0.098 0.054 0.179 152 E 0.008 0.002 0.014 0.808 0.050 0.043 0.075 153 Q 0.004 0.002 0.013 0.923 0.014 0.017 0.027 154 T 0.003 0.001 0.010 0.945 0.008 0.015 0.018 155 L 0.002 0.001 0.005 0.961 0.007 0.014 0.010 156 L 0.002 0.001 0.003 0.968 0.006 0.010 0.010 157 L 0.001 0.001 0.001 0.979 0.006 0.007 0.007 158 F 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.003 0.003 159 Y 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 160 D 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 161 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 162 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 163 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 164 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 165 K 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 166 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 167 M 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 168 E 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.010 0.001 169 K 0.001 0.001 0.001 0.923 0.002 0.072 0.001 170 K 0.001 0.001 0.002 0.444 0.018 0.530 0.005 171 G 0.001 0.001 0.003 0.050 0.094 0.728 0.123 172 L 0.002 0.016 0.002 0.006 0.182 0.012 0.780 173 D 0.005 0.024 0.004 0.003 0.044 0.004 0.916 174 S 0.001 0.001 0.552 0.187 0.036 0.201 0.023 175 E 0.001 0.001 0.552 0.164 0.039 0.226 0.017 176 T 0.002 0.004 0.542 0.203 0.073 0.079 0.096 177 M 0.004 0.010 0.231 0.404 0.056 0.145 0.149 178 F 0.006 0.017 0.309 0.322 0.036 0.215 0.095 179 T 0.010 0.006 0.300 0.246 0.081 0.236 0.122 180 H 0.009 0.011 0.127 0.281 0.143 0.222 0.209 181 H 0.008 0.016 0.029 0.098 0.251 0.070 0.529 182 A 0.005 0.006 0.051 0.080 0.198 0.137 0.523 183 N 0.009 0.015 0.069 0.112 0.167 0.292 0.335 184 L 0.008 0.012 0.060 0.110 0.013 0.236 0.560 185 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998