# TARGET T0165 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0165.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 13 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 2 Q 0.008 0.027 0.024 0.044 0.004 0.050 0.844 3 L 0.006 0.008 0.162 0.058 0.124 0.184 0.458 4 F 0.014 0.007 0.205 0.059 0.183 0.256 0.276 5 D 0.022 0.022 0.144 0.064 0.190 0.147 0.411 6 L 0.021 0.054 0.035 0.042 0.300 0.042 0.506 7 P 0.017 0.019 0.012 0.044 0.070 0.022 0.816 8 L 0.002 0.001 0.136 0.789 0.015 0.042 0.016 9 D 0.001 0.001 0.143 0.804 0.010 0.034 0.007 10 Q 0.001 0.001 0.152 0.794 0.007 0.032 0.012 11 L 0.002 0.005 0.068 0.856 0.010 0.035 0.024 12 Q 0.005 0.001 0.074 0.747 0.016 0.137 0.020 13 T 0.006 0.002 0.068 0.645 0.016 0.241 0.022 14 Y 0.015 0.017 0.044 0.442 0.149 0.121 0.211 15 K 0.033 0.037 0.043 0.191 0.186 0.171 0.339 16 P 0.017 0.013 0.042 0.080 0.208 0.194 0.446 17 E 0.012 0.026 0.062 0.052 0.258 0.147 0.443 18 K 0.015 0.017 0.051 0.040 0.284 0.147 0.446 19 T 0.007 0.021 0.031 0.020 0.349 0.126 0.446 20 A 0.005 0.025 0.022 0.010 0.221 0.035 0.682 21 P 0.003 0.008 0.254 0.037 0.120 0.266 0.312 22 K 0.002 0.005 0.286 0.049 0.243 0.246 0.168 23 D 0.003 0.043 0.257 0.067 0.136 0.071 0.423 24 F 0.001 0.003 0.327 0.559 0.028 0.045 0.038 25 S 0.001 0.001 0.127 0.807 0.009 0.036 0.019 26 E 0.001 0.001 0.075 0.852 0.013 0.049 0.011 27 F 0.001 0.001 0.023 0.921 0.003 0.044 0.008 28 W 0.001 0.001 0.009 0.924 0.006 0.046 0.013 29 K 0.001 0.001 0.010 0.941 0.005 0.038 0.005 30 L 0.001 0.001 0.006 0.952 0.010 0.022 0.009 31 S 0.001 0.001 0.006 0.962 0.004 0.019 0.008 32 L 0.001 0.001 0.003 0.973 0.004 0.011 0.007 33 E 0.001 0.001 0.007 0.963 0.004 0.022 0.005 34 E 0.001 0.001 0.008 0.935 0.004 0.049 0.004 35 L 0.001 0.002 0.019 0.888 0.013 0.054 0.022 36 A 0.001 0.001 0.032 0.706 0.013 0.234 0.013 37 K 0.002 0.001 0.035 0.376 0.041 0.510 0.035 38 V 0.008 0.015 0.017 0.181 0.345 0.122 0.312 39 Q 0.013 0.017 0.007 0.023 0.163 0.103 0.674 40 A 0.046 0.025 0.012 0.029 0.160 0.065 0.663 41 E 0.101 0.007 0.024 0.020 0.207 0.077 0.563 42 P 0.419 0.014 0.035 0.039 0.087 0.044 0.362 43 D 0.757 0.016 0.014 0.041 0.025 0.015 0.133 44 L 0.719 0.024 0.009 0.029 0.019 0.010 0.189 45 Q 0.615 0.013 0.011 0.035 0.029 0.014 0.282 46 P 0.409 0.018 0.027 0.052 0.106 0.040 0.348 47 V 0.265 0.017 0.064 0.069 0.157 0.115 0.314 48 D 0.205 0.025 0.061 0.029 0.168 0.122 0.391 49 Y 0.210 0.011 0.031 0.025 0.297 0.122 0.304 50 P 0.226 0.029 0.017 0.012 0.175 0.161 0.380 51 A 0.201 0.007 0.006 0.003 0.194 0.019 0.570 52 D 0.242 0.006 0.006 0.002 0.204 0.039 0.500 53 G 0.652 0.019 0.011 0.002 0.097 0.035 0.184 54 V 0.875 0.003 0.003 0.001 0.014 0.004 0.100 55 K 0.946 0.005 0.001 0.001 0.004 0.001 0.042 56 V 0.928 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.063 57 Y 0.888 0.002 0.001 0.001 0.024 0.007 0.077 58 R 0.843 0.008 0.001 0.002 0.022 0.006 0.118 59 L 0.317 0.017 0.002 0.002 0.004 0.013 0.645 60 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998