PFRMAT AL TARGET T0165 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 47 PARENT 1jkmA REMARK SCORE 1.2278e-17 M 1 P 13 Q 2 P 27 L 3 R 28 F 4 F 29 D 5 S 30 L 6 P 31 P 7 A 32 L 8 M 33 D 9 V 34 Q 10 E 35 L 11 A 36 Q 12 L 37 T 13 A 38 Y 14 T 39 K 15 F 40 P 16 G 41 E 17 L 42 K 18 D 43 T 19 A 44 A 20 V 45 P 21 A 46 K 22 A 47 D 23 A 48 F 24 P 49 S 25 P 50 E 26 V 51 F 27 S 52 W 28 A 53 K 29 S 54 L 30 D 55 S 31 D 56 L 32 L 57 E 33 P 58 E 34 T 59 L 35 V 60 A 36 L 61 K 37 A 62 V 38 A 63 Q 39 V 64 A 40 G 65 E 41 A 66 P 42 S 67 D 43 H 68 L 44 A 79 Q 45 L 80 P 46 D 81 V 47 L 82 D 48 P 83 Y 49 T 84 P 50 D 85 A 51 R 86 D 52 D 87 G 53 D 88 V 54 V 89 K 55 E 90 V 56 T 91 Y 57 S 92 R 58 T 93 L 59 E 94 T 60 T 95 Y 61 I 96 K 62 L 97 S 63 G 98 F 64 V 99 G 65 D 100 N 66 G 101 A 67 N 102 R 68 E 103 I 69 I 104 T 70 T 105 G 71 L 106 W 72 H 107 Y 73 V 108 A 74 F 109 V 75 R 110 P 76 P 111 D 77 G 113 K 78 V 114 E 79 E 115 G 80 G 116 P 81 V 117 H 82 L 118 P 83 P 119 A 84 G 120 I 85 L 121 V 86 V 122 K 87 Y 123 Y 88 T 124 H 89 H 125 G 90 G 126 Y 91 G 127 N 92 G 128 A 93 M 129 S 94 T 130 Y 95 I 131 D 96 L 132 G 97 V 138 E 98 H 139 I 99 R 140 H 100 R 141 E 101 W 142 M 102 C 143 V 103 T 144 N 104 D 145 W 105 L 146 A 106 A 147 L 107 A 148 H 108 A 149 G 109 G 150 Y 110 S 151 A 111 V 152 T 112 V 153 F 113 V 154 G 114 M 155 M 115 V 156 L 116 D 157 V 117 F 158 R 118 R 159 G 119 N 160 Q 120 A 161 Q 121 W 162 S 122 T 163 S 123 A 164 E 124 E 165 D 125 G 166 T 126 H 167 S 127 H 168 I 128 P 169 S 129 F 170 R 151 P 171 G 152 S 172 V 153 G 173 Y 154 V 174 L 155 E 175 D 156 D 176 A 157 C 177 V 158 L 178 R 159 A 179 A 160 A 180 L 161 V 181 E 162 L 182 V 163 W 183 I 164 V 184 S 165 D 185 S 166 E 186 F 167 H 187 D 168 E 189 E 169 S 190 V 170 L 191 D 171 G 192 E 172 L 193 T 173 S 194 R 174 G 195 I 175 V 196 G 176 V 197 V 177 V 198 T 178 Q 199 G 179 G 200 G 180 E 201 S 181 S 202 Q 182 G 203 G 183 G 204 G 184 G 205 G 185 N 206 L 186 L 207 T 187 A 208 I 188 I 209 A 189 A 210 A 190 T 211 A 191 T 212 A 192 L 213 L 193 L 214 S 194 R 218 D 195 G 219 I 196 R 220 P 197 L 221 K 198 D 222 A 199 A 223 A 200 I 224 V 201 D 225 A 202 G 226 D 203 V 227 Y 204 Y 228 P 205 A 229 Y 206 S 230 L 207 I 231 S 208 P 232 N 209 Y 233 F 210 I 234 E 211 S 235 R 212 G 236 A 213 G 237 I 214 Y 238 D 215 A 239 V 216 W 240 A 217 D 241 L 218 H 242 E 219 E 243 Q 220 R 244 P 221 R 245 Y 222 L 246 L 223 T 247 E 224 E 248 I 225 L 249 N 226 P 250 S 227 S 251 F 228 L 252 F 229 V 253 R 230 E 254 R 231 N 255 N 232 D 256 G 233 G 257 S 234 Y 258 P 235 F 259 E 236 I 260 T 237 E 261 E 238 N 262 V 239 G 263 Q 240 G 264 A 241 M 265 M 242 A 266 K 243 L 267 T 244 L 268 L 245 V 269 S 246 R 270 Y 247 A 271 F 248 Y 272 D 249 D 273 I 250 P 274 M 251 T 275 N 252 G 276 L 253 E 277 A 254 H 278 D 255 A 279 R 256 E 280 V 257 D 281 K 258 P 282 V 259 P 298 P 260 P 299 V 261 F 300 L 262 V 301 M 263 V 302 S 264 A 303 I 265 V 304 G 266 N 305 L 267 E 306 I 268 L 307 D 269 D 308 K 270 P 309 V 271 L 310 P 274 R 311 S 275 D 312 T 276 E 313 V 277 G 314 F 278 I 315 A 279 A 316 A 280 F 317 Y 281 A 318 N 282 R 319 H 283 R 320 L 284 L 321 E 285 A 322 T 286 R 323 K 287 A 324 K 288 G 325 E 289 V 326 L 290 D 327 K 291 V 328 V 292 A 329 Y 293 A 330 R 294 R 331 Y 295 V 332 F 296 N 333 G 297 I 334 H 298 G 335 E 299 L 336 Y 300 V 337 I 301 H 338 P 302 G 339 A 303 I 343 F 304 F 344 Q 305 R 345 T 306 H 346 E 307 W 347 K 308 L 348 L 309 P 349 A 310 A 350 F 311 A 351 F 312 L 352 K 313 R 366 Q 314 A 367 H 315 R 368 L 316 L 369 K 317 R 370 TER END