# TARGET T0164 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0164.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 195 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 N 0.011 0.006 0.010 0.038 0.255 0.679 2 S 0.007 0.006 0.016 0.116 0.249 0.607 3 T 0.003 0.002 0.035 0.563 0.203 0.194 4 D 0.002 0.002 0.031 0.798 0.103 0.064 5 V 0.002 0.002 0.027 0.871 0.059 0.039 6 E 0.002 0.001 0.013 0.928 0.031 0.026 7 E 0.001 0.001 0.009 0.958 0.014 0.016 8 T 0.001 0.001 0.016 0.974 0.006 0.003 9 L 0.001 0.001 0.008 0.985 0.004 0.002 10 K 0.001 0.001 0.019 0.973 0.006 0.002 11 R 0.001 0.001 0.011 0.973 0.011 0.004 12 I 0.001 0.001 0.013 0.959 0.016 0.011 13 Q 0.001 0.002 0.018 0.934 0.031 0.014 14 N 0.004 0.002 0.040 0.814 0.103 0.037 15 N 0.006 0.002 0.032 0.561 0.227 0.173 16 D 0.012 0.003 0.015 0.050 0.556 0.365 17 P 0.023 0.005 0.020 0.025 0.577 0.351 18 D 0.105 0.016 0.041 0.015 0.537 0.287 19 L 0.273 0.007 0.117 0.024 0.375 0.204 20 E 0.670 0.012 0.053 0.011 0.096 0.158 21 E 0.883 0.012 0.017 0.005 0.029 0.054 22 V 0.853 0.019 0.007 0.006 0.028 0.087 23 N 0.613 0.021 0.010 0.012 0.091 0.254 24 L 0.089 0.006 0.195 0.041 0.450 0.219 25 N 0.022 0.005 0.408 0.059 0.421 0.086 26 N 0.011 0.006 0.382 0.038 0.510 0.052 27 I 0.013 0.016 0.336 0.039 0.541 0.055 28 M 0.014 0.007 0.170 0.035 0.648 0.125 29 N 0.015 0.014 0.148 0.032 0.609 0.181 30 I 0.020 0.063 0.037 0.031 0.504 0.345 31 P 0.008 0.017 0.009 0.058 0.224 0.684 32 V 0.001 0.001 0.017 0.937 0.028 0.017 33 P 0.001 0.001 0.007 0.976 0.013 0.003 34 T 0.001 0.001 0.007 0.987 0.004 0.001 35 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 36 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 37 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 38 C 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 39 A 0.001 0.001 0.004 0.993 0.002 0.001 40 E 0.001 0.001 0.008 0.986 0.004 0.002 41 A 0.001 0.001 0.016 0.969 0.009 0.005 42 L 0.001 0.002 0.017 0.937 0.029 0.014 43 K 0.004 0.002 0.038 0.772 0.131 0.052 44 T 0.010 0.004 0.029 0.359 0.350 0.249 45 N 0.018 0.004 0.012 0.023 0.659 0.284 46 T 0.042 0.005 0.014 0.008 0.582 0.348 47 Y 0.268 0.020 0.017 0.004 0.420 0.271 48 V 0.554 0.007 0.027 0.006 0.225 0.182 49 K 0.777 0.008 0.014 0.004 0.065 0.133 50 K 0.916 0.010 0.005 0.002 0.020 0.046 51 F 0.855 0.008 0.003 0.003 0.033 0.097 52 S 0.745 0.021 0.004 0.005 0.070 0.155 53 I 0.365 0.025 0.047 0.016 0.386 0.161 54 V 0.081 0.007 0.128 0.022 0.649 0.112 55 G 0.042 0.010 0.174 0.021 0.674 0.079 56 T 0.060 0.024 0.092 0.022 0.690 0.113 57 R 0.038 0.041 0.022 0.019 0.517 0.364 58 S 0.022 0.037 0.017 0.035 0.373 0.516 59 N 0.007 0.009 0.005 0.071 0.168 0.741 60 D 0.001 0.001 0.004 0.982 0.008 0.006 61 P 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 62 V 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 63 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 64 F 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 65 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 66 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 67 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 68 E 0.001 0.001 0.002 0.992 0.003 0.002 69 M 0.001 0.001 0.003 0.982 0.009 0.006 70 L 0.002 0.001 0.006 0.957 0.022 0.013 71 K 0.004 0.002 0.018 0.831 0.100 0.044 72 V 0.007 0.003 0.021 0.623 0.198 0.149 73 N 0.018 0.005 0.018 0.079 0.586 0.294 74 N 0.023 0.003 0.020 0.016 0.605 0.333 75 T 0.146 0.011 0.027 0.008 0.508 0.300 76 L 0.433 0.008 0.034 0.008 0.304 0.212 77 K 0.705 0.007 0.013 0.005 0.098 0.172 78 S 0.919 0.009 0.003 0.002 0.023 0.044 79 L 0.882 0.010 0.002 0.002 0.030 0.074 80 N 0.764 0.014 0.003 0.004 0.060 0.155 81 V 0.386 0.018 0.064 0.016 0.307 0.208 82 E 0.109 0.012 0.201 0.024 0.500 0.153 83 S 0.061 0.014 0.282 0.027 0.512 0.104 84 N 0.060 0.019 0.135 0.025 0.631 0.130 85 F 0.039 0.032 0.035 0.024 0.594 0.276 86 I 0.028 0.044 0.024 0.046 0.443 0.415 87 S 0.010 0.012 0.008 0.118 0.282 0.570 88 G 0.001 0.001 0.005 0.963 0.017 0.014 89 S 0.001 0.001 0.002 0.989 0.006 0.003 90 G 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 91 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 92 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 93 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 94 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 95 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 96 E 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 97 A 0.001 0.001 0.003 0.990 0.005 0.002 98 L 0.001 0.001 0.006 0.970 0.015 0.008 99 Q 0.003 0.002 0.021 0.814 0.102 0.058 100 S 0.008 0.003 0.017 0.348 0.303 0.322 101 N 0.017 0.003 0.008 0.023 0.557 0.391 102 T 0.042 0.004 0.012 0.008 0.519 0.414 103 S 0.366 0.022 0.019 0.005 0.338 0.250 104 L 0.657 0.006 0.025 0.007 0.160 0.145 105 I 0.858 0.004 0.011 0.004 0.042 0.081 106 E 0.958 0.005 0.003 0.001 0.010 0.022 107 L 0.917 0.005 0.003 0.002 0.023 0.050 108 R 0.835 0.012 0.003 0.002 0.045 0.102 109 I 0.457 0.014 0.029 0.006 0.243 0.252 110 D 0.115 0.015 0.088 0.016 0.569 0.197 111 N 0.036 0.020 0.101 0.020 0.670 0.153 112 Q 0.025 0.033 0.039 0.010 0.807 0.086 113 S 0.016 0.013 0.062 0.026 0.766 0.117 114 Q 0.012 0.012 0.049 0.037 0.738 0.152 115 P 0.014 0.022 0.040 0.038 0.641 0.245 116 L 0.012 0.033 0.015 0.051 0.299 0.590 117 G 0.007 0.008 0.004 0.076 0.134 0.772 118 N 0.001 0.001 0.004 0.966 0.014 0.016 119 N 0.001 0.001 0.002 0.987 0.008 0.003 120 V 0.001 0.001 0.003 0.989 0.005 0.002 121 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 122 M 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 123 E 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 124 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 125 A 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 126 N 0.001 0.001 0.003 0.993 0.003 0.001 127 M 0.001 0.001 0.005 0.984 0.006 0.004 128 L 0.001 0.001 0.007 0.965 0.017 0.008 129 E 0.003 0.002 0.017 0.878 0.073 0.027 130 K 0.006 0.002 0.014 0.555 0.224 0.199 131 N 0.012 0.003 0.008 0.057 0.452 0.468 132 T 0.024 0.005 0.008 0.018 0.374 0.572 133 T 0.165 0.016 0.020 0.017 0.315 0.466 134 L 0.421 0.013 0.071 0.033 0.213 0.249 135 L 0.662 0.012 0.044 0.022 0.096 0.163 136 K 0.836 0.012 0.017 0.010 0.039 0.085 137 F 0.716 0.015 0.010 0.013 0.067 0.179 138 G 0.573 0.031 0.009 0.013 0.159 0.216 139 Y 0.253 0.022 0.034 0.028 0.396 0.267 140 H 0.106 0.016 0.068 0.033 0.576 0.200 141 F 0.092 0.027 0.092 0.037 0.605 0.148 142 T 0.091 0.030 0.068 0.045 0.549 0.218 143 Q 0.066 0.039 0.033 0.045 0.550 0.266 144 Q 0.041 0.030 0.024 0.114 0.471 0.321 145 G 0.024 0.014 0.015 0.156 0.438 0.353 146 P 0.011 0.006 0.023 0.577 0.251 0.131 147 R 0.011 0.005 0.019 0.772 0.123 0.071 148 L 0.015 0.004 0.016 0.798 0.096 0.072 149 R 0.024 0.005 0.011 0.854 0.053 0.054 150 A 0.022 0.004 0.010 0.910 0.024 0.030 151 S 0.033 0.003 0.016 0.894 0.028 0.026 152 N 0.027 0.001 0.022 0.898 0.029 0.023 153 A 0.034 0.003 0.026 0.836 0.051 0.051 154 M 0.034 0.004 0.022 0.786 0.074 0.080 155 M 0.037 0.005 0.014 0.745 0.082 0.117 156 N 0.045 0.013 0.011 0.531 0.135 0.266 157 N 0.015 0.006 0.014 0.525 0.147 0.293 158 N 0.009 0.003 0.019 0.597 0.142 0.229 159 D 0.005 0.001 0.019 0.797 0.085 0.093 160 L 0.003 0.001 0.016 0.907 0.042 0.031 161 V 0.003 0.001 0.013 0.939 0.028 0.017 162 R 0.005 0.001 0.020 0.932 0.026 0.017 163 K 0.006 0.002 0.041 0.886 0.036 0.029 164 R 0.007 0.006 0.043 0.773 0.051 0.120 165 R 0.007 0.006 0.026 0.514 0.049 0.398 166 L 0.001 0.001 0.001 0.020 0.015 0.963