# TARGET T0164 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0164.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 195 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 S 0.004 0.011 0.003 0.098 0.004 0.020 0.859 3 T 0.001 0.002 0.015 0.601 0.149 0.101 0.131 4 D 0.001 0.001 0.019 0.765 0.041 0.109 0.064 5 V 0.001 0.001 0.018 0.843 0.015 0.080 0.042 6 E 0.001 0.001 0.007 0.935 0.014 0.020 0.022 7 E 0.002 0.001 0.004 0.970 0.005 0.009 0.010 8 T 0.001 0.001 0.003 0.980 0.003 0.007 0.006 9 L 0.001 0.001 0.002 0.985 0.002 0.006 0.003 10 K 0.001 0.001 0.002 0.988 0.001 0.006 0.001 11 R 0.001 0.001 0.003 0.981 0.001 0.013 0.001 12 I 0.001 0.001 0.005 0.967 0.002 0.022 0.003 13 Q 0.001 0.001 0.011 0.933 0.008 0.039 0.008 14 N 0.001 0.001 0.022 0.705 0.017 0.242 0.012 15 N 0.001 0.001 0.019 0.358 0.085 0.491 0.044 16 D 0.003 0.005 0.011 0.031 0.243 0.084 0.623 17 P 0.012 0.005 0.052 0.031 0.265 0.401 0.234 18 D 0.074 0.010 0.098 0.034 0.219 0.299 0.267 19 L 0.250 0.018 0.073 0.043 0.128 0.043 0.444 20 E 0.696 0.012 0.034 0.039 0.043 0.013 0.163 21 E 0.885 0.007 0.008 0.013 0.013 0.004 0.070 22 V 0.863 0.016 0.007 0.016 0.010 0.005 0.082 23 N 0.779 0.021 0.005 0.016 0.013 0.011 0.154 24 L 0.449 0.019 0.049 0.046 0.043 0.073 0.320 25 N 0.062 0.011 0.159 0.055 0.174 0.444 0.095 26 N 0.027 0.004 0.146 0.038 0.219 0.463 0.103 27 I 0.030 0.027 0.138 0.031 0.187 0.242 0.346 28 M 0.054 0.031 0.052 0.021 0.244 0.347 0.250 29 N 0.041 0.014 0.048 0.018 0.245 0.321 0.313 30 I 0.028 0.046 0.019 0.023 0.310 0.065 0.510 31 P 0.019 0.015 0.003 0.026 0.179 0.016 0.742 32 V 0.002 0.002 0.024 0.808 0.048 0.054 0.061 33 P 0.001 0.001 0.013 0.933 0.009 0.033 0.010 34 T 0.001 0.001 0.011 0.947 0.004 0.025 0.011 35 L 0.001 0.001 0.002 0.986 0.003 0.004 0.003 36 K 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.004 0.004 37 A 0.001 0.001 0.002 0.986 0.001 0.008 0.002 38 C 0.001 0.001 0.002 0.983 0.003 0.008 0.003 39 A 0.001 0.001 0.006 0.980 0.002 0.010 0.002 40 E 0.001 0.001 0.009 0.943 0.003 0.043 0.002 41 A 0.001 0.001 0.015 0.863 0.004 0.111 0.006 42 L 0.002 0.006 0.033 0.754 0.038 0.123 0.044 43 K 0.006 0.003 0.070 0.556 0.043 0.268 0.054 44 T 0.006 0.004 0.050 0.304 0.176 0.336 0.123 45 N 0.010 0.007 0.032 0.061 0.254 0.168 0.469 46 T 0.035 0.007 0.054 0.047 0.264 0.282 0.311 47 Y 0.165 0.012 0.071 0.043 0.183 0.157 0.369 48 V 0.442 0.014 0.044 0.034 0.084 0.042 0.341 49 K 0.698 0.007 0.027 0.028 0.051 0.015 0.173 50 K 0.862 0.010 0.010 0.014 0.019 0.006 0.079 51 F 0.847 0.009 0.006 0.011 0.014 0.005 0.108 52 S 0.799 0.015 0.005 0.010 0.016 0.010 0.144 53 I 0.573 0.023 0.025 0.030 0.035 0.042 0.272 54 V 0.170 0.013 0.079 0.049 0.196 0.290 0.203 55 G 0.066 0.009 0.073 0.037 0.334 0.337 0.144 56 T 0.042 0.017 0.052 0.024 0.297 0.231 0.336 57 R 0.055 0.036 0.027 0.016 0.239 0.207 0.421 58 S 0.037 0.031 0.027 0.025 0.295 0.185 0.401 59 N 0.026 0.009 0.006 0.043 0.334 0.055 0.527 60 D 0.003 0.002 0.025 0.810 0.066 0.039 0.056 61 P 0.001 0.001 0.014 0.960 0.005 0.015 0.005 62 V 0.001 0.001 0.014 0.957 0.002 0.022 0.004 63 A 0.001 0.001 0.004 0.989 0.002 0.004 0.002 64 F 0.001 0.001 0.002 0.993 0.001 0.002 0.001 65 A 0.001 0.001 0.002 0.992 0.001 0.004 0.001 66 L 0.001 0.001 0.003 0.990 0.001 0.006 0.001 67 A 0.001 0.001 0.005 0.985 0.001 0.008 0.001 68 E 0.001 0.001 0.007 0.964 0.001 0.026 0.001 69 M 0.001 0.001 0.012 0.921 0.004 0.058 0.004 70 L 0.002 0.005 0.033 0.852 0.018 0.065 0.025 71 K 0.006 0.002 0.072 0.613 0.030 0.244 0.033 72 V 0.005 0.002 0.052 0.349 0.098 0.436 0.058 73 N 0.010 0.007 0.040 0.056 0.208 0.128 0.550 74 N 0.026 0.006 0.088 0.043 0.256 0.382 0.199 75 T 0.138 0.007 0.108 0.031 0.192 0.301 0.223 76 L 0.397 0.012 0.044 0.027 0.100 0.041 0.379 77 K 0.793 0.006 0.015 0.020 0.037 0.012 0.116 78 S 0.921 0.006 0.004 0.008 0.009 0.004 0.048 79 L 0.864 0.009 0.003 0.008 0.011 0.003 0.102 80 N 0.747 0.013 0.003 0.007 0.016 0.006 0.208 81 V 0.468 0.018 0.040 0.031 0.045 0.078 0.320 82 E 0.114 0.008 0.095 0.045 0.200 0.370 0.168 83 S 0.048 0.006 0.117 0.034 0.308 0.368 0.119 84 N 0.040 0.016 0.070 0.027 0.315 0.203 0.329 85 F 0.060 0.039 0.038 0.024 0.228 0.202 0.409 86 I 0.036 0.041 0.032 0.040 0.270 0.148 0.433 87 S 0.026 0.008 0.008 0.089 0.268 0.051 0.550 88 G 0.002 0.001 0.017 0.901 0.023 0.031 0.025 89 S 0.001 0.001 0.007 0.968 0.005 0.015 0.005 90 G 0.001 0.001 0.006 0.968 0.002 0.020 0.004 91 I 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.003 0.001 92 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.001 93 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 94 L 0.001 0.001 0.002 0.990 0.001 0.006 0.001 95 V 0.001 0.001 0.004 0.987 0.001 0.007 0.001 96 E 0.001 0.001 0.005 0.966 0.002 0.025 0.001 97 A 0.001 0.001 0.011 0.896 0.003 0.085 0.004 98 L 0.002 0.006 0.027 0.794 0.025 0.114 0.032 99 Q 0.008 0.004 0.055 0.566 0.043 0.262 0.061 100 S 0.008 0.004 0.034 0.302 0.216 0.299 0.137 101 N 0.011 0.006 0.022 0.048 0.253 0.139 0.521 102 T 0.031 0.006 0.071 0.051 0.263 0.314 0.263 103 S 0.184 0.010 0.093 0.051 0.184 0.174 0.304 104 L 0.524 0.010 0.039 0.040 0.072 0.036 0.279 105 I 0.798 0.005 0.016 0.031 0.030 0.010 0.111 106 E 0.901 0.007 0.005 0.013 0.010 0.004 0.060 107 L 0.825 0.014 0.006 0.016 0.013 0.005 0.121 108 R 0.779 0.025 0.005 0.018 0.020 0.009 0.143 109 I 0.487 0.022 0.031 0.045 0.043 0.058 0.314 110 D 0.165 0.015 0.082 0.062 0.179 0.276 0.221 111 N 0.077 0.012 0.073 0.068 0.288 0.299 0.183 112 Q 0.031 0.015 0.058 0.040 0.259 0.259 0.338 113 S 0.034 0.021 0.052 0.035 0.274 0.274 0.310 114 Q 0.035 0.016 0.072 0.043 0.241 0.284 0.310 115 P 0.026 0.015 0.061 0.041 0.142 0.153 0.563 116 L 0.024 0.041 0.049 0.062 0.154 0.124 0.546 117 G 0.015 0.016 0.009 0.099 0.293 0.034 0.534 118 N 0.001 0.001 0.016 0.872 0.039 0.041 0.030 119 N 0.001 0.001 0.007 0.950 0.008 0.024 0.010 120 V 0.001 0.001 0.006 0.964 0.003 0.017 0.009 121 E 0.001 0.001 0.001 0.985 0.004 0.004 0.004 122 M 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.004 0.004 123 E 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.006 0.003 124 I 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.005 0.003 125 A 0.001 0.001 0.002 0.988 0.002 0.006 0.001 126 N 0.001 0.001 0.002 0.974 0.002 0.021 0.001 127 M 0.001 0.001 0.004 0.951 0.003 0.037 0.005 128 L 0.001 0.002 0.008 0.924 0.011 0.038 0.015 129 E 0.002 0.001 0.020 0.771 0.019 0.168 0.020 130 K 0.002 0.001 0.017 0.479 0.077 0.370 0.054 131 N 0.004 0.007 0.018 0.108 0.211 0.117 0.536 132 T 0.013 0.006 0.077 0.097 0.213 0.348 0.246 133 T 0.068 0.013 0.147 0.087 0.156 0.266 0.262 134 L 0.136 0.018 0.184 0.112 0.137 0.095 0.317 135 L 0.393 0.019 0.102 0.126 0.081 0.052 0.227 136 K 0.524 0.033 0.058 0.105 0.058 0.036 0.187 137 F 0.442 0.033 0.034 0.064 0.080 0.038 0.310 138 G 0.378 0.036 0.024 0.035 0.075 0.064 0.389 139 Y 0.292 0.049 0.042 0.048 0.122 0.127 0.320 140 H 0.134 0.019 0.049 0.045 0.197 0.233 0.323 141 F 0.066 0.014 0.081 0.051 0.280 0.273 0.234 142 T 0.049 0.024 0.058 0.040 0.306 0.193 0.330 143 Q 0.047 0.033 0.049 0.058 0.272 0.168 0.374 144 Q 0.026 0.031 0.047 0.118 0.245 0.185 0.348 145 G 0.015 0.011 0.028 0.137 0.239 0.133 0.438 146 P 0.011 0.009 0.038 0.419 0.140 0.158 0.225 147 R 0.017 0.006 0.023 0.627 0.072 0.139 0.116 148 L 0.022 0.009 0.019 0.673 0.076 0.073 0.127 149 R 0.024 0.010 0.012 0.733 0.056 0.024 0.142 150 A 0.017 0.007 0.009 0.867 0.017 0.022 0.061 151 S 0.014 0.002 0.009 0.875 0.022 0.036 0.043 152 N 0.015 0.002 0.014 0.875 0.018 0.043 0.034 153 A 0.016 0.002 0.018 0.846 0.024 0.033 0.060 154 M 0.016 0.004 0.022 0.850 0.020 0.045 0.044 155 M 0.011 0.003 0.017 0.755 0.048 0.103 0.063 156 N 0.005 0.004 0.014 0.628 0.073 0.174 0.101 157 N 0.003 0.003 0.011 0.527 0.112 0.097 0.246 158 N 0.003 0.003 0.018 0.600 0.065 0.141 0.170 159 D 0.004 0.003 0.025 0.656 0.056 0.151 0.105 160 L 0.008 0.004 0.031 0.681 0.081 0.071 0.125 161 V 0.019 0.007 0.028 0.728 0.067 0.060 0.091 162 R 0.040 0.004 0.036 0.658 0.048 0.081 0.132 163 K 0.052 0.008 0.053 0.558 0.070 0.097 0.161 164 R 0.070 0.009 0.041 0.395 0.100 0.133 0.253 165 R 0.032 0.015 0.029 0.235 0.004 0.180 0.506 166 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.997