PFRMAT AL TARGET T0163 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 20 PARENT 1c0pA REMARK SCORE 2.5504e-39 M 1 M 1001 K 2 H 1002 R 3 S 1003 H 4 Q 1004 Y 5 K 1005 E 6 R 1006 A 7 V 1007 V 8 V 1008 V 9 V 1009 I 10 L 1010 G 11 G 1011 G 12 S 1012 G 13 G 1013 I 14 V 1014 I 15 I 1015 G 16 G 1016 S 17 L 1017 A 18 S 1018 I 19 S 1019 A 20 A 1020 Y 21 L 1021 Y 22 I 1022 L 23 L 1023 A 24 A 1024 K 25 R 1025 E 26 K 1026 N 27 G 1027 K 28 Y 1028 N 29 S 1029 T 30 V 1030 A 31 H 1031 L 32 I 1032 F 33 L 1033 E 34 A 1034 S 35 R 1035 G 36 D 1036 T 37 L 1037 M 38 P 1038 G 39 E 1039 G 40 D 1040 R 41 V 1041 T 42 A 1047 T 43 S 1048 S 44 P 1049 A 45 W 1050 A 46 A 1051 A 47 G 1052 G 48 A 1053 M 49 N 1054 L 50 W 1055 G 51 T 1056 A 52 P 1057 H 53 F 1058 A 54 M 1059 E 55 T 1060 C 56 L 1061 E 57 T 1062 E 58 D 1063 R 59 G 1064 D 60 P 1065 A 61 R 1066 F 62 Q 1067 F 63 A 1068 D 64 K 1069 F 65 W 1070 A 66 E 1071 M 67 E 1072 H 68 S 1073 S 69 T 1074 Q 70 F 1075 R 71 K 1076 L 72 K 1077 Y 73 W 1078 K 74 V 1079 G 75 E 1080 L 76 L 1081 G 77 V 1082 E 78 P 1083 E 79 T 1084 L 80 G 1085 D 87 H 1086 I 88 A 1087 R 89 M 1088 Q 90 W 1089 H 91 L 1090 G 93 K 1091 G 94 G 1092 M 95 T 1093 F 96 R 1094 K 97 R 1095 L 98 F 1096 A 99 A 1097 F 100 Q 1098 S 101 N 1099 E 102 E 1100 E 103 D 1101 D 104 G 1102 V 105 L 1103 L 106 L 1104 Q 107 G 1105 L 108 H 1106 R 109 W 1107 Q 110 Y 1108 M 111 K 1109 D 112 D 1110 D 113 I 1111 L 114 T 1112 D 115 P 1113 S 116 N 1114 V 117 Y 1115 S 118 R 1116 W 119 P 1117 Y 120 L 1118 S 121 P 1119 K 122 S 1120 E 123 S 1121 E 124 E 1122 V 125 C 1123 L 126 P 1124 E 127 P 1125 F 137 G 1126 G 138 A 1127 A 139 I 1128 S 140 G 1129 F 141 V 1130 I 142 T 1131 Q 143 Y 1132 D 144 D 1133 D 145 T 1134 V 146 L 1135 H 147 S 1136 V 148 V 1137 E 149 H 1138 P 150 A 1139 Y 151 P 1140 F 152 K 1141 V 153 Y 1142 C 154 C 1143 K 155 Q 1144 A 156 Y 1145 Y 157 L 1146 V 158 A 1147 K 159 R 1148 A 160 E 1149 A 161 L 1150 K 162 Q 1151 M 163 K 1152 L 164 L 1153 G 165 G 1154 A 166 A 1155 E 167 T 1156 I 168 F 1157 F 169 E 1158 E 170 R 1159 H 171 R 1160 P 173 T 1161 V 174 V 1162 L 175 T 1163 H 176 S 1164 V 177 L 1165 E 178 E 1166 R 179 Q 1167 D 180 A 1168 G 181 D 1170 E 182 G 1171 A 195 A 1172 N 196 D 1173 H 197 L 1174 V 198 V 1175 V 199 V 1176 V 200 N 1177 A 201 A 1178 S 202 T 1179 G 203 G 1180 V 204 L 1181 W 205 G 1182 S 206 A 1183 G 207 K 1184 M 208 S 1185 F 209 I 1186 F 210 A 1187 K 211 G 1188 Q 212 I 1189 L 213 D 1190 N 216 D 1191 N 217 Q 1192 A 218 A 1193 F 219 A 1194 L 220 E 1195 P 221 P 1196 V 222 I 1197 K 223 R 1198 G 224 G 1199 E 225 Q 1200 C 226 T 1201 L 227 V 1202 S 228 L 1203 V 229 V 1204 W 230 K 1205 N 231 S 1206 D 232 P 1207 D 233 C 1208 I 234 K 1209 P 235 T 1212 L 236 M 1213 T 237 D 1214 K 238 S 1215 T 239 S 1216 L 240 D 1217 Y 241 P 1218 H 242 A 1219 H 244 P 1221 C 245 A 1222 Y 246 Y 1223 I 247 I 1224 V 248 I 1225 P 249 P 1226 R 250 R 1227 K 251 P 1228 S 252 G 1229 G 253 G 1230 R 254 E 1231 L 255 V 1232 V 256 I 1233 V 257 C 1234 G 258 G 1235 A 259 G 1236 T 260 T 1237 M 261 Y 1238 K 262 G 1239 P 263 V 1240 G 264 G 1241 D 265 D 1242 W 266 W 1243 S 267 D 1244 E 268 L 1245 T 269 S 1246 P 270 V 1247 D 271 N 1248 L 272 P 1249 G 273 E 1250 G 274 T 1251 L 275 V 1252 E 276 Q 1253 S 277 R 1254 V 278 I 1255 M 279 L 1256 K 280 K 1257 K 281 H 1258 A 282 C 1259 K 283 L 1260 T 284 R 1261 M 285 L 1262 L 286 D 1263 P 287 P 1264 A 288 T 1265 I 289 I 1266 Q 290 E 1273 N 291 G 1274 M 292 I 1275 K 293 E 1276 V 294 V 1277 D 295 L 1278 R 296 R 1279 F 297 H 1280 W 298 N 1281 A 299 V 1282 G 300 G 1283 L 301 L 1284 R 302 R 1285 P 303 P 1286 G 304 A 1287 T 305 R 1288 K 306 R 1289 D 307 G 1290 G 308 G 1291 K 309 P 1292 P 310 R 1293 Y 311 V 1294 I 312 E 1295 G 313 A 1296 R 314 E 1297 H 315 R 1298 I 321 L 1327 L 322 V 1328 F 323 H 1329 A 324 A 1330 A 325 Y 1331 G 326 G 1332 H 327 F 1333 F 328 S 1334 R 329 S 1335 N 330 A 1336 G 331 G 1337 I 332 Y 1338 L 333 Q 1339 L 334 Q 1340 A 335 S 1341 P 336 W 1342 A 337 G 1343 T 338 A 1344 G 339 A 1345 A 340 E 1346 L 341 D 1347 I 342 V 1348 S 343 A 1349 D 344 Q 1350 L 345 L 1351 I 346 V 1352 M 347 D 1353 TER END