# TARGET T0160 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0160.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 81 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.017 0.007 0.005 0.015 0.141 0.815 2 S 0.028 0.029 0.017 0.029 0.253 0.644 3 H 0.046 0.022 0.036 0.040 0.454 0.402 4 M 0.046 0.027 0.071 0.054 0.485 0.317 5 A 0.043 0.026 0.042 0.037 0.520 0.332 6 K 0.041 0.030 0.057 0.033 0.528 0.311 7 H 0.034 0.032 0.032 0.017 0.482 0.402 8 E 0.053 0.028 0.086 0.009 0.551 0.273 9 Q 0.111 0.009 0.081 0.009 0.428 0.362 10 I 0.364 0.021 0.063 0.008 0.221 0.322 11 L 0.690 0.046 0.011 0.006 0.073 0.175 12 V 0.781 0.011 0.006 0.005 0.060 0.137 13 L 0.789 0.047 0.003 0.003 0.045 0.112 14 D 0.434 0.020 0.010 0.004 0.426 0.105 15 P 0.070 0.004 0.028 0.004 0.838 0.056 16 P 0.027 0.003 0.020 0.001 0.897 0.051 17 S 0.078 0.013 0.013 0.001 0.824 0.071 18 D 0.357 0.011 0.005 0.002 0.218 0.408 19 L 0.874 0.019 0.002 0.001 0.031 0.073 20 K 0.924 0.009 0.001 0.001 0.020 0.045 21 F 0.868 0.005 0.002 0.002 0.036 0.088 22 K 0.749 0.010 0.002 0.001 0.058 0.180 23 G 0.455 0.022 0.004 0.002 0.160 0.358 24 P 0.254 0.010 0.009 0.001 0.444 0.282 25 F 0.123 0.015 0.027 0.002 0.690 0.144 26 T 0.079 0.006 0.030 0.001 0.774 0.111 27 D 0.189 0.007 0.025 0.001 0.639 0.138 28 V 0.514 0.009 0.007 0.001 0.206 0.263 29 V 0.824 0.007 0.002 0.001 0.051 0.116 30 T 0.923 0.003 0.001 0.001 0.017 0.057 31 T 0.966 0.002 0.001 0.001 0.008 0.024 32 N 0.973 0.001 0.001 0.001 0.008 0.018 33 L 0.983 0.001 0.001 0.001 0.003 0.013 34 K 0.984 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 35 L 0.972 0.002 0.001 0.001 0.007 0.018 36 Q 0.907 0.004 0.001 0.001 0.024 0.064 37 N 0.632 0.021 0.003 0.001 0.174 0.169 38 P 0.167 0.009 0.015 0.002 0.570 0.236 39 S 0.061 0.009 0.018 0.001 0.708 0.202 40 D 0.072 0.010 0.071 0.002 0.694 0.151 41 R 0.254 0.006 0.022 0.001 0.398 0.319 42 K 0.663 0.005 0.014 0.001 0.123 0.194 43 V 0.936 0.004 0.001 0.001 0.017 0.042 44 C 0.984 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 45 F 0.983 0.001 0.001 0.001 0.003 0.013 46 K 0.983 0.001 0.001 0.001 0.003 0.013 47 V 0.955 0.002 0.001 0.001 0.011 0.031 48 K 0.877 0.006 0.001 0.001 0.039 0.076 49 T 0.609 0.022 0.003 0.002 0.156 0.208 50 T 0.210 0.022 0.005 0.002 0.270 0.490 51 A 0.120 0.026 0.009 0.002 0.544 0.298 52 P 0.062 0.009 0.072 0.005 0.713 0.139 53 R 0.077 0.004 0.114 0.007 0.636 0.163 54 R 0.547 0.018 0.048 0.005 0.269 0.113 55 Y 0.770 0.017 0.008 0.003 0.068 0.134 56 C 0.844 0.018 0.003 0.002 0.038 0.095 57 V 0.835 0.019 0.003 0.001 0.046 0.094 58 R 0.617 0.011 0.005 0.001 0.128 0.237 59 P 0.338 0.012 0.015 0.001 0.446 0.188 60 N 0.135 0.007 0.060 0.003 0.626 0.169 61 S 0.183 0.025 0.060 0.003 0.516 0.214 62 G 0.420 0.018 0.034 0.003 0.370 0.155 63 V 0.759 0.014 0.006 0.001 0.089 0.131 64 I 0.802 0.068 0.003 0.001 0.047 0.080 65 D 0.458 0.023 0.005 0.001 0.480 0.033 66 P 0.062 0.002 0.014 0.001 0.893 0.028 67 G 0.023 0.002 0.005 0.001 0.943 0.027 68 S 0.192 0.022 0.004 0.001 0.704 0.077 69 I 0.516 0.005 0.001 0.001 0.051 0.428 70 V 0.958 0.010 0.001 0.001 0.006 0.025 71 Y 0.981 0.001 0.001 0.001 0.003 0.014 72 V 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 73 S 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 74 V 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 75 M 0.960 0.001 0.001 0.001 0.007 0.032 76 L 0.829 0.007 0.001 0.001 0.030 0.133 77 Q 0.537 0.007 0.003 0.002 0.130 0.322 78 P 0.264 0.013 0.007 0.005 0.210 0.501 79 F 0.170 0.016 0.013 0.008 0.275 0.518 80 D 0.136 0.024 0.019 0.010 0.334 0.478 81 Y 0.141 0.029 0.025 0.015 0.319 0.471 82 D 0.078 0.016 0.033 0.018 0.496 0.359 83 P 0.077 0.016 0.066 0.027 0.559 0.255 84 N 0.069 0.014 0.099 0.037 0.599 0.182 85 E 0.099 0.010 0.113 0.033 0.578 0.167 86 K 0.194 0.034 0.082 0.040 0.485 0.166 87 S 0.261 0.043 0.040 0.019 0.446 0.192 88 K 0.169 0.006 0.024 0.008 0.591 0.202 89 H 0.339 0.005 0.010 0.003 0.393 0.250 90 K 0.909 0.009 0.001 0.001 0.035 0.046 91 F 0.973 0.001 0.001 0.001 0.004 0.021 92 M 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 93 V 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 94 Q 0.981 0.001 0.001 0.001 0.004 0.014 95 T 0.952 0.001 0.001 0.001 0.010 0.036 96 I 0.872 0.004 0.001 0.001 0.038 0.084 97 F 0.665 0.021 0.003 0.002 0.088 0.222 98 A 0.245 0.021 0.005 0.004 0.226 0.499 99 P 0.048 0.013 0.013 0.006 0.636 0.285 100 P 0.006 0.005 0.042 0.024 0.724 0.200 101 N 0.006 0.007 0.082 0.060 0.712 0.133 102 I 0.007 0.005 0.176 0.201 0.535 0.076 103 S 0.012 0.008 0.114 0.363 0.299 0.204 104 D 0.022 0.018 0.126 0.474 0.207 0.153 105 M 0.008 0.003 0.054 0.774 0.078 0.083 106 E 0.006 0.001 0.027 0.838 0.061 0.067 107 A 0.003 0.001 0.037 0.913 0.031 0.016 108 V 0.002 0.001 0.024 0.945 0.021 0.007 109 W 0.001 0.001 0.029 0.934 0.027 0.008 110 K 0.002 0.001 0.033 0.907 0.043 0.015 111 E 0.001 0.001 0.027 0.824 0.094 0.053 112 A 0.003 0.006 0.029 0.598 0.190 0.174 113 K 0.005 0.007 0.053 0.139 0.510 0.286 114 P 0.012 0.005 0.063 0.058 0.606 0.255 115 D 0.037 0.004 0.039 0.025 0.586 0.308 116 E 0.176 0.022 0.022 0.016 0.428 0.335 117 L 0.416 0.010 0.011 0.010 0.182 0.371 118 M 0.691 0.006 0.010 0.010 0.087 0.196 119 D 0.839 0.007 0.007 0.007 0.050 0.091 120 S 0.866 0.006 0.005 0.006 0.040 0.077 121 K 0.882 0.002 0.003 0.003 0.037 0.072 122 P 0.890 0.003 0.002 0.002 0.035 0.068 123 R 0.909 0.003 0.001 0.001 0.027 0.058 124 C 0.963 0.002 0.001 0.001 0.006 0.028 125 V 0.953 0.002 0.001 0.001 0.006 0.039 126 F 0.893 0.006 0.001 0.001 0.009 0.091 127 E 0.672 0.013 0.001 0.002 0.021 0.291 128 M 0.009 0.001 0.001 0.001 0.013 0.976