# TARGET T0159 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0159.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 24 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 K 0.041 0.004 0.006 0.013 0.153 0.783 2 K 0.193 0.022 0.014 0.029 0.115 0.628 3 F 0.428 0.036 0.016 0.028 0.100 0.392 4 Y 0.486 0.021 0.023 0.040 0.109 0.321 5 R 0.493 0.018 0.018 0.035 0.116 0.320 6 E 0.281 0.017 0.039 0.060 0.202 0.401 7 G 0.212 0.010 0.033 0.036 0.304 0.405 8 V 0.315 0.024 0.037 0.034 0.319 0.271 9 F 0.290 0.033 0.027 0.034 0.309 0.308 10 V 0.221 0.035 0.028 0.045 0.415 0.256 11 N 0.127 0.015 0.030 0.053 0.550 0.224 12 G 0.101 0.008 0.055 0.054 0.597 0.185 13 A 0.195 0.020 0.056 0.060 0.477 0.192 14 A 0.350 0.023 0.057 0.071 0.329 0.170 15 Q 0.332 0.012 0.057 0.083 0.322 0.194 16 G 0.375 0.009 0.021 0.054 0.279 0.262 17 Y 0.596 0.022 0.008 0.043 0.112 0.219 18 L 0.546 0.037 0.004 0.040 0.086 0.288 19 I 0.355 0.034 0.004 0.048 0.116 0.444 20 D 0.083 0.007 0.007 0.058 0.229 0.615 21 K 0.016 0.004 0.078 0.437 0.212 0.252 22 K 0.014 0.006 0.181 0.629 0.119 0.052 23 T 0.006 0.002 0.288 0.520 0.170 0.014 24 A 0.006 0.003 0.198 0.555 0.207 0.030 25 D 0.005 0.006 0.123 0.535 0.278 0.055 26 Q 0.005 0.003 0.035 0.086 0.745 0.125 27 Y 0.006 0.007 0.028 0.019 0.719 0.221 28 K 0.011 0.007 0.039 0.007 0.723 0.212 29 I 0.075 0.013 0.073 0.009 0.682 0.148 30 T 0.168 0.118 0.036 0.008 0.302 0.368 31 N 0.095 0.026 0.027 0.022 0.394 0.437 32 I 0.003 0.001 0.731 0.126 0.126 0.014 33 A 0.003 0.003 0.705 0.154 0.121 0.015 34 Q 0.002 0.001 0.698 0.176 0.111 0.012 35 L 0.013 0.005 0.080 0.468 0.245 0.189 36 K 0.010 0.023 0.038 0.516 0.204 0.210 37 D 0.011 0.010 0.006 0.122 0.270 0.580 38 P 0.018 0.002 0.071 0.312 0.310 0.288 39 K 0.045 0.021 0.158 0.328 0.353 0.094 40 I 0.069 0.011 0.266 0.387 0.218 0.049 41 A 0.048 0.021 0.391 0.328 0.178 0.034 42 K 0.057 0.011 0.294 0.405 0.175 0.058 43 L 0.093 0.011 0.118 0.428 0.203 0.147 44 F 0.093 0.086 0.020 0.128 0.206 0.467 45 D 0.034 0.071 0.010 0.042 0.559 0.283 46 T 0.005 0.005 0.094 0.076 0.741 0.079 47 N 0.002 0.002 0.104 0.024 0.827 0.041 48 G 0.005 0.010 0.067 0.012 0.869 0.037 49 D 0.028 0.024 0.027 0.012 0.553 0.355 50 G 0.060 0.038 0.033 0.032 0.385 0.451 51 K 0.187 0.038 0.045 0.023 0.406 0.301 52 A 0.278 0.038 0.068 0.039 0.335 0.241 53 D 0.471 0.024 0.073 0.045 0.219 0.167 54 L 0.600 0.033 0.066 0.055 0.143 0.104 55 T 0.537 0.012 0.032 0.049 0.207 0.163 56 G 0.397 0.019 0.011 0.022 0.250 0.301 57 C 0.133 0.070 0.005 0.010 0.279 0.503 58 N 0.057 0.042 0.011 0.010 0.640 0.242 59 P 0.019 0.011 0.064 0.049 0.717 0.140 60 G 0.010 0.010 0.091 0.111 0.690 0.088 61 W 0.018 0.014 0.118 0.264 0.521 0.065 62 G 0.028 0.025 0.061 0.482 0.198 0.206 63 C 0.007 0.005 0.027 0.884 0.040 0.037 64 E 0.006 0.002 0.015 0.881 0.051 0.044 65 G 0.005 0.002 0.015 0.885 0.048 0.045 66 A 0.006 0.003 0.010 0.936 0.026 0.019 67 I 0.003 0.001 0.007 0.958 0.020 0.011 68 N 0.001 0.001 0.004 0.968 0.018 0.009 69 H 0.002 0.001 0.004 0.972 0.015 0.007 70 Q 0.003 0.001 0.005 0.967 0.016 0.007 71 L 0.003 0.001 0.010 0.957 0.019 0.011 72 A 0.003 0.001 0.022 0.939 0.021 0.014 73 A 0.005 0.001 0.020 0.901 0.037 0.036 74 Y 0.006 0.006 0.019 0.748 0.064 0.157 75 E 0.013 0.013 0.031 0.084 0.446 0.413 76 L 0.019 0.010 0.060 0.034 0.641 0.236 77 T 0.019 0.006 0.043 0.015 0.777 0.140 78 N 0.071 0.013 0.035 0.021 0.714 0.146 79 T 0.235 0.009 0.010 0.012 0.294 0.439 80 V 0.671 0.021 0.005 0.011 0.085 0.207 81 T 0.861 0.008 0.002 0.008 0.034 0.087 82 H 0.865 0.016 0.002 0.011 0.025 0.081 83 N 0.657 0.018 0.004 0.019 0.154 0.148 84 Q 0.303 0.015 0.007 0.028 0.329 0.318 85 G 0.051 0.007 0.007 0.020 0.448 0.466 86 N 0.051 0.029 0.013 0.042 0.437 0.428 87 Y 0.015 0.008 0.076 0.498 0.228 0.176 88 A 0.007 0.004 0.076 0.752 0.108 0.053 89 A 0.009 0.004 0.051 0.865 0.048 0.023 90 M 0.005 0.002 0.015 0.954 0.014 0.010 91 M 0.008 0.001 0.006 0.955 0.018 0.012 92 A 0.005 0.001 0.002 0.978 0.008 0.006 93 D 0.009 0.001 0.002 0.971 0.010 0.007 94 T 0.004 0.001 0.001 0.972 0.010 0.012 95 I 0.003 0.001 0.001 0.976 0.008 0.012 96 S 0.001 0.001 0.001 0.978 0.012 0.007 97 R 0.001 0.001 0.002 0.981 0.011 0.004 98 Y 0.001 0.001 0.006 0.967 0.016 0.010 99 K 0.001 0.001 0.029 0.901 0.048 0.021 100 E 0.001 0.001 0.025 0.730 0.142 0.102 101 G 0.001 0.001 0.004 0.026 0.205 0.763 102 K 0.010 0.002 0.004 0.004 0.292 0.688 103 P 0.119 0.003 0.009 0.006 0.220 0.643 104 V 0.893 0.008 0.004 0.003 0.036 0.055 105 F 0.969 0.003 0.001 0.002 0.007 0.018 106 Y 0.964 0.002 0.002 0.003 0.007 0.022 107 Y 0.870 0.002 0.005 0.004 0.026 0.092 108 T 0.626 0.006 0.012 0.013 0.103 0.239 109 W 0.233 0.015 0.022 0.032 0.247 0.452 110 T 0.140 0.033 0.008 0.015 0.354 0.451 111 P 0.099 0.006 0.017 0.021 0.341 0.515 112 Y 0.153 0.018 0.032 0.023 0.314 0.460 113 W 0.348 0.024 0.124 0.052 0.296 0.156 114 V 0.370 0.008 0.158 0.082 0.262 0.120 115 S 0.249 0.014 0.245 0.115 0.246 0.130 116 N 0.233 0.017 0.169 0.133 0.287 0.161 117 E 0.204 0.015 0.101 0.115 0.358 0.208 118 L 0.193 0.082 0.024 0.078 0.340 0.282 119 K 0.069 0.046 0.011 0.018 0.797 0.059 120 P 0.015 0.001 0.011 0.012 0.911 0.049 121 G 0.031 0.005 0.015 0.007 0.887 0.054 122 K 0.260 0.067 0.012 0.006 0.572 0.083 123 D 0.486 0.053 0.005 0.005 0.096 0.355 124 V 0.559 0.036 0.036 0.025 0.089 0.254 125 V 0.576 0.021 0.039 0.033 0.103 0.228 126 W 0.540 0.032 0.039 0.041 0.101 0.248 127 L 0.342 0.016 0.027 0.052 0.201 0.362 128 Q 0.320 0.051 0.015 0.050 0.185 0.379 129 V 0.125 0.021 0.012 0.038 0.294 0.510 130 P 0.055 0.013 0.055 0.053 0.423 0.401 131 F 0.035 0.034 0.159 0.043 0.468 0.261 132 S 0.037 0.015 0.237 0.050 0.517 0.144 133 A 0.053 0.031 0.114 0.042 0.505 0.255 134 L 0.041 0.033 0.044 0.028 0.451 0.404 135 P 0.024 0.022 0.051 0.024 0.528 0.352 136 G 0.017 0.020 0.119 0.043 0.517 0.285 137 D 0.021 0.010 0.259 0.043 0.516 0.151 138 K 0.059 0.015 0.193 0.042 0.484 0.206 139 N 0.146 0.034 0.098 0.038 0.435 0.250 140 A 0.186 0.020 0.084 0.082 0.396 0.232 141 D 0.206 0.012 0.073 0.081 0.376 0.251 142 T 0.371 0.031 0.056 0.108 0.255 0.178 143 K 0.411 0.029 0.030 0.112 0.193 0.225 144 L 0.311 0.040 0.024 0.108 0.273 0.245 145 P 0.144 0.030 0.019 0.050 0.594 0.164 146 N 0.054 0.007 0.019 0.027 0.683 0.210 147 G 0.059 0.009 0.020 0.016 0.653 0.244 148 A 0.188 0.066 0.025 0.014 0.412 0.296 149 N 0.217 0.113 0.011 0.012 0.152 0.495 150 Y 0.093 0.030 0.009 0.014 0.117 0.736 151 G 0.003 0.005 0.001 0.003 0.038 0.950