# TARGET T0159 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0159.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 45 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.054 0.010 0.031 0.081 0.246 0.578 2 D 0.076 0.031 0.049 0.121 0.254 0.469 3 L 0.083 0.034 0.067 0.093 0.357 0.366 4 P 0.031 0.016 0.204 0.122 0.418 0.209 5 G 0.014 0.012 0.184 0.063 0.622 0.105 6 K 0.018 0.010 0.158 0.043 0.654 0.117 7 G 0.028 0.009 0.035 0.009 0.689 0.229 8 I 0.122 0.011 0.007 0.003 0.421 0.435 9 T 0.430 0.017 0.003 0.002 0.124 0.423 10 V 0.680 0.017 0.001 0.002 0.054 0.246 11 N 0.859 0.005 0.001 0.002 0.031 0.102 12 P 0.896 0.008 0.002 0.002 0.020 0.072 13 V 0.798 0.004 0.002 0.003 0.051 0.141 14 Q 0.610 0.009 0.004 0.006 0.087 0.285 15 S 0.256 0.018 0.005 0.013 0.149 0.559 16 T 0.077 0.023 0.007 0.029 0.353 0.510 17 I 0.006 0.003 0.057 0.490 0.311 0.133 18 T 0.004 0.004 0.033 0.654 0.189 0.115 19 E 0.001 0.001 0.007 0.956 0.024 0.012 20 E 0.001 0.001 0.001 0.991 0.005 0.003 21 T 0.001 0.001 0.002 0.992 0.004 0.001 22 F 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.001 23 Q 0.001 0.001 0.002 0.988 0.006 0.004 24 T 0.001 0.001 0.001 0.993 0.003 0.004 25 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 26 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 27 V 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 28 S 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 29 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 30 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.005 0.003 31 L 0.001 0.001 0.003 0.984 0.009 0.003 32 E 0.001 0.001 0.010 0.967 0.015 0.007 33 K 0.002 0.001 0.016 0.940 0.022 0.019 34 L 0.004 0.001 0.013 0.821 0.037 0.124 35 G 0.004 0.001 0.002 0.012 0.079 0.903 36 Y 0.034 0.005 0.003 0.005 0.124 0.829 37 T 0.191 0.013 0.004 0.003 0.154 0.635 38 V 0.420 0.029 0.007 0.004 0.185 0.354 39 N 0.414 0.011 0.008 0.003 0.187 0.376 40 K 0.425 0.012 0.010 0.007 0.236 0.309 41 P 0.418 0.009 0.006 0.008 0.208 0.350 42 S 0.540 0.025 0.005 0.015 0.147 0.268 43 E 0.539 0.037 0.008 0.034 0.187 0.196 44 V 0.263 0.017 0.015 0.062 0.381 0.262 45 D 0.130 0.017 0.020 0.079 0.431 0.324 46 Y 0.149 0.019 0.020 0.350 0.235 0.226 47 N 0.108 0.007 0.008 0.662 0.052 0.164 48 V 0.052 0.002 0.005 0.918 0.008 0.014 49 G 0.026 0.001 0.004 0.963 0.004 0.003 50 Y 0.028 0.001 0.004 0.962 0.003 0.002 51 T 0.023 0.001 0.004 0.966 0.004 0.001 52 S 0.008 0.001 0.006 0.973 0.010 0.003 53 L 0.009 0.001 0.003 0.978 0.008 0.002 54 A 0.004 0.001 0.002 0.988 0.004 0.002 55 S 0.007 0.001 0.003 0.933 0.027 0.030 56 G 0.010 0.001 0.002 0.060 0.214 0.713 57 D 0.045 0.006 0.006 0.018 0.276 0.649 58 A 0.223 0.009 0.010 0.020 0.366 0.372 59 T 0.315 0.021 0.040 0.043 0.264 0.317 60 F 0.657 0.042 0.029 0.039 0.095 0.137 61 T 0.676 0.021 0.027 0.056 0.096 0.124 62 A 0.340 0.004 0.177 0.186 0.167 0.126 63 V 0.117 0.003 0.335 0.243 0.232 0.070 64 N 0.061 0.007 0.316 0.280 0.269 0.067 65 W 0.035 0.012 0.190 0.412 0.248 0.103 66 T 0.027 0.008 0.084 0.269 0.400 0.212 67 P 0.020 0.006 0.089 0.230 0.381 0.275 68 L 0.020 0.019 0.064 0.267 0.372 0.257 69 H 0.017 0.010 0.037 0.278 0.336 0.322 70 D 0.009 0.003 0.028 0.550 0.190 0.219 71 N 0.006 0.001 0.023 0.862 0.064 0.044 72 M 0.008 0.002 0.018 0.904 0.042 0.026 73 Y 0.006 0.001 0.017 0.925 0.034 0.018 74 E 0.008 0.001 0.013 0.934 0.028 0.017 75 A 0.006 0.002 0.010 0.956 0.018 0.009 76 A 0.005 0.001 0.013 0.947 0.022 0.012 77 G 0.005 0.001 0.032 0.894 0.049 0.019 78 G 0.005 0.001 0.034 0.880 0.059 0.021 79 D 0.009 0.001 0.027 0.741 0.120 0.103 80 K 0.014 0.001 0.002 0.017 0.197 0.769 81 K 0.244 0.004 0.002 0.007 0.101 0.642 82 F 0.838 0.016 0.001 0.004 0.037 0.104 83 Y 0.821 0.009 0.005 0.009 0.050 0.106 84 R 0.811 0.011 0.008 0.007 0.049 0.114 85 E 0.558 0.008 0.014 0.014 0.122 0.284 86 G 0.371 0.008 0.031 0.017 0.286 0.289 87 V 0.301 0.016 0.035 0.019 0.369 0.260 88 F 0.228 0.029 0.035 0.023 0.371 0.314 89 V 0.177 0.026 0.040 0.038 0.555 0.163 90 N 0.101 0.006 0.039 0.037 0.677 0.139 91 G 0.157 0.006 0.038 0.033 0.614 0.152 92 A 0.425 0.010 0.035 0.042 0.353 0.135 93 A 0.753 0.013 0.014 0.025 0.100 0.096 94 Q 0.841 0.005 0.009 0.020 0.060 0.065 95 G 0.851 0.004 0.006 0.024 0.049 0.066 96 Y 0.865 0.006 0.002 0.022 0.031 0.074 97 L 0.769 0.011 0.002 0.033 0.052 0.133 98 I 0.503 0.028 0.002 0.036 0.100 0.330 99 D 0.123 0.009 0.004 0.051 0.231 0.583 100 K 0.019 0.003 0.094 0.531 0.192 0.161 101 K 0.014 0.004 0.213 0.629 0.112 0.028 102 T 0.004 0.001 0.323 0.539 0.125 0.007 103 A 0.004 0.002 0.195 0.614 0.161 0.023 104 D 0.004 0.005 0.099 0.601 0.243 0.048 105 Q 0.004 0.003 0.025 0.084 0.740 0.143 106 Y 0.006 0.005 0.017 0.014 0.707 0.252 107 K 0.013 0.007 0.028 0.006 0.731 0.216 108 I 0.104 0.016 0.059 0.010 0.650 0.161 109 T 0.180 0.110 0.034 0.011 0.295 0.370 110 N 0.124 0.030 0.022 0.032 0.365 0.427 111 I 0.006 0.001 0.546 0.279 0.147 0.020 112 A 0.005 0.005 0.455 0.366 0.141 0.028 113 Q 0.003 0.001 0.407 0.437 0.130 0.023 114 L 0.008 0.004 0.139 0.574 0.151 0.124 115 K 0.008 0.007 0.070 0.600 0.181 0.134 116 D 0.006 0.003 0.042 0.453 0.221 0.275 117 P 0.009 0.003 0.080 0.205 0.341 0.362 118 K 0.011 0.010 0.163 0.291 0.363 0.162 119 I 0.017 0.006 0.258 0.361 0.270 0.088 120 A 0.021 0.009 0.235 0.333 0.284 0.118 121 K 0.057 0.017 0.153 0.325 0.230 0.219 122 L 0.099 0.033 0.038 0.149 0.266 0.415 123 F 0.072 0.049 0.018 0.060 0.248 0.553 124 D 0.040 0.035 0.012 0.024 0.507 0.381 125 T 0.015 0.012 0.069 0.045 0.693 0.166 126 N 0.006 0.005 0.143 0.047 0.690 0.108 127 G 0.009 0.011 0.126 0.031 0.739 0.085 128 D 0.027 0.028 0.062 0.034 0.586 0.264 129 G 0.032 0.024 0.039 0.057 0.410 0.438 130 K 0.101 0.047 0.044 0.048 0.417 0.343 131 A 0.138 0.031 0.087 0.068 0.387 0.289 132 D 0.315 0.020 0.099 0.066 0.299 0.200 133 L 0.473 0.040 0.092 0.089 0.193 0.113 134 T 0.456 0.019 0.049 0.085 0.215 0.176 135 G 0.326 0.015 0.013 0.030 0.259 0.356 136 C 0.105 0.058 0.007 0.015 0.251 0.564 137 N 0.044 0.040 0.013 0.015 0.573 0.316 138 P 0.015 0.012 0.052 0.047 0.665 0.209 139 G 0.008 0.014 0.069 0.082 0.699 0.128 140 W 0.011 0.015 0.067 0.210 0.604 0.092 141 G 0.015 0.017 0.042 0.426 0.266 0.233 142 C 0.006 0.006 0.030 0.830 0.076 0.052 143 E 0.005 0.003 0.015 0.876 0.052 0.050 144 G 0.003 0.001 0.013 0.922 0.031 0.029 145 A 0.003 0.001 0.007 0.962 0.014 0.012 146 I 0.002 0.001 0.004 0.978 0.008 0.008 147 N 0.001 0.001 0.003 0.982 0.008 0.006 148 H 0.001 0.001 0.003 0.983 0.008 0.004 149 Q 0.002 0.001 0.004 0.976 0.012 0.006 150 L 0.002 0.001 0.008 0.963 0.016 0.010 151 A 0.003 0.001 0.018 0.943 0.022 0.015 152 A 0.003 0.001 0.015 0.910 0.037 0.035 153 Y 0.005 0.005 0.017 0.769 0.066 0.138 154 E 0.014 0.014 0.040 0.122 0.442 0.368 155 L 0.019 0.010 0.070 0.059 0.652 0.191 156 T 0.014 0.006 0.059 0.035 0.801 0.085 157 N 0.027 0.007 0.046 0.036 0.780 0.103 158 T 0.128 0.007 0.011 0.012 0.415 0.427 159 V 0.590 0.021 0.005 0.008 0.113 0.264 160 T 0.863 0.009 0.001 0.005 0.026 0.096 161 H 0.890 0.022 0.001 0.007 0.016 0.064 162 N 0.735 0.022 0.003 0.014 0.119 0.107 163 Q 0.393 0.016 0.005 0.021 0.280 0.286 164 G 0.047 0.004 0.004 0.015 0.445 0.484 165 N 0.037 0.026 0.006 0.042 0.449 0.440 166 Y 0.008 0.007 0.028 0.682 0.148 0.127 167 A 0.003 0.002 0.027 0.878 0.065 0.024 168 A 0.004 0.002 0.020 0.940 0.025 0.010 169 M 0.002 0.001 0.006 0.978 0.008 0.004 170 M 0.002 0.001 0.003 0.981 0.010 0.005 171 A 0.002 0.001 0.001 0.989 0.005 0.003 172 D 0.002 0.001 0.001 0.985 0.006 0.005 173 T 0.001 0.001 0.001 0.983 0.006 0.008 174 I 0.001 0.001 0.001 0.986 0.005 0.007 175 S 0.001 0.001 0.001 0.985 0.009 0.005 176 R 0.001 0.001 0.002 0.985 0.009 0.004 177 Y 0.001 0.001 0.008 0.962 0.018 0.012 178 K 0.001 0.001 0.028 0.905 0.047 0.020 179 E 0.001 0.001 0.023 0.713 0.142 0.122 180 G 0.001 0.001 0.003 0.016 0.176 0.804 181 K 0.014 0.002 0.002 0.002 0.228 0.751 182 P 0.171 0.003 0.004 0.002 0.155 0.666 183 V 0.946 0.004 0.001 0.001 0.014 0.034 184 F 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 185 Y 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 186 Y 0.943 0.001 0.001 0.001 0.008 0.047 187 T 0.759 0.003 0.003 0.003 0.048 0.185 188 W 0.353 0.010 0.006 0.009 0.173 0.448 189 T 0.210 0.027 0.003 0.006 0.240 0.513 190 P 0.135 0.018 0.008 0.011 0.253 0.575 191 Y 0.111 0.021 0.015 0.012 0.253 0.588 192 W 0.187 0.019 0.147 0.049 0.366 0.232 193 V 0.162 0.007 0.229 0.087 0.365 0.151 194 S 0.114 0.015 0.309 0.116 0.314 0.133 195 N 0.128 0.018 0.178 0.150 0.341 0.185 196 E 0.126 0.021 0.084 0.134 0.385 0.251 197 L 0.114 0.113 0.024 0.108 0.314 0.327 198 K 0.039 0.036 0.011 0.020 0.821 0.073 199 P 0.011 0.001 0.010 0.010 0.909 0.059 200 G 0.023 0.005 0.013 0.006 0.895 0.058 201 K 0.194 0.086 0.013 0.006 0.614 0.086 202 D 0.408 0.066 0.006 0.006 0.105 0.409 203 V 0.427 0.046 0.057 0.039 0.115 0.316 204 V 0.422 0.022 0.052 0.049 0.146 0.309 205 W 0.363 0.054 0.052 0.061 0.149 0.321 206 L 0.196 0.028 0.033 0.066 0.292 0.384 207 Q 0.171 0.042 0.016 0.058 0.247 0.466 208 V 0.065 0.019 0.012 0.042 0.344 0.518 209 P 0.037 0.016 0.030 0.049 0.514 0.355 210 F 0.031 0.035 0.067 0.063 0.474 0.329 211 S 0.029 0.013 0.124 0.068 0.571 0.194 212 A 0.045 0.028 0.073 0.046 0.507 0.302 213 L 0.038 0.028 0.046 0.044 0.387 0.457 214 P 0.030 0.018 0.060 0.041 0.434 0.418 215 G 0.029 0.032 0.088 0.060 0.398 0.394 216 D 0.043 0.026 0.117 0.100 0.405 0.310 217 K 0.084 0.028 0.114 0.126 0.355 0.294 218 N 0.098 0.014 0.092 0.134 0.397 0.266 219 A 0.081 0.015 0.107 0.156 0.389 0.251 220 D 0.069 0.036 0.097 0.118 0.443 0.237 221 T 0.078 0.022 0.093 0.095 0.497 0.215 222 K 0.069 0.025 0.057 0.059 0.481 0.309 223 L 0.071 0.035 0.049 0.058 0.526 0.261 224 P 0.062 0.024 0.040 0.075 0.489 0.309 225 N 0.042 0.017 0.044 0.099 0.553 0.246 226 G 0.044 0.030 0.109 0.171 0.510 0.136 227 A 0.043 0.019 0.148 0.217 0.408 0.164 228 N 0.040 0.010 0.227 0.200 0.398 0.124 229 Y 0.039 0.012 0.152 0.195 0.422 0.180 230 G 0.050 0.015 0.040 0.061 0.421 0.413 231 F 0.073 0.043 0.019 0.026 0.311 0.529 232 P 0.072 0.031 0.023 0.049 0.283 0.542 233 V 0.023 0.005 0.277 0.339 0.231 0.124 234 S 0.019 0.002 0.209 0.578 0.131 0.062 235 T 0.044 0.004 0.139 0.715 0.058 0.040 236 M 0.079 0.002 0.021 0.841 0.023 0.034 237 H 0.102 0.002 0.010 0.853 0.015 0.017 238 I 0.143 0.002 0.009 0.809 0.020 0.017 239 V 0.109 0.002 0.010 0.842 0.021 0.017 240 A 0.110 0.004 0.014 0.774 0.043 0.054 241 N 0.064 0.002 0.014 0.705 0.101 0.113 242 K 0.012 0.001 0.021 0.764 0.111 0.091 243 A 0.008 0.005 0.036 0.776 0.105 0.071 244 W 0.003 0.002 0.117 0.774 0.086 0.018 245 A 0.001 0.001 0.218 0.699 0.070 0.011 246 E 0.001 0.002 0.165 0.721 0.093 0.019 247 K 0.001 0.001 0.049 0.828 0.061 0.062 248 N 0.001 0.001 0.005 0.198 0.084 0.713 249 P 0.001 0.001 0.014 0.850 0.035 0.100 250 A 0.001 0.001 0.012 0.964 0.012 0.010 251 A 0.001 0.001 0.005 0.991 0.003 0.001 252 A 0.001 0.001 0.004 0.992 0.003 0.001 253 K 0.001 0.001 0.003 0.992 0.004 0.001 254 L 0.001 0.001 0.002 0.992 0.005 0.001 255 F 0.001 0.001 0.002 0.991 0.006 0.001 256 A 0.001 0.001 0.008 0.974 0.014 0.005 257 I 0.001 0.001 0.018 0.870 0.061 0.049 258 M 0.004 0.001 0.019 0.419 0.167 0.389 259 Q 0.005 0.003 0.002 0.005 0.108 0.878 260 L 0.020 0.016 0.001 0.001 0.110 0.852 261 P 0.016 0.003 0.001 0.002 0.073 0.905 262 V 0.004 0.001 0.090 0.749 0.114 0.043 263 A 0.001 0.001 0.093 0.843 0.054 0.010 264 D 0.001 0.001 0.063 0.885 0.042 0.008 265 I 0.001 0.001 0.004 0.977 0.008 0.010 266 N 0.001 0.001 0.001 0.984 0.004 0.009 267 A 0.001 0.001 0.001 0.988 0.005 0.004 268 Q 0.002 0.001 0.001 0.986 0.005 0.006 269 N 0.001 0.001 0.001 0.992 0.003 0.002 270 A 0.001 0.001 0.002 0.990 0.004 0.003 271 I 0.001 0.001 0.004 0.984 0.007 0.005 272 M 0.001 0.001 0.003 0.983 0.006 0.005 273 H 0.001 0.001 0.005 0.960 0.017 0.017 274 A 0.001 0.001 0.011 0.863 0.056 0.069 275 G 0.001 0.002 0.027 0.562 0.159 0.248 276 A 0.001 0.007 0.053 0.408 0.259 0.271 277 A 0.001 0.007 0.082 0.230 0.476 0.204 278 S 0.002 0.003 0.084 0.147 0.545 0.218 279 E 0.002 0.008 0.072 0.159 0.507 0.252 280 G 0.003 0.010 0.026 0.161 0.379 0.421 281 D 0.002 0.009 0.009 0.153 0.121 0.706 282 I 0.001 0.001 0.004 0.962 0.011 0.022 283 Q 0.001 0.001 0.002 0.983 0.007 0.008 284 G 0.001 0.001 0.002 0.994 0.003 0.002 285 H 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 286 V 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 287 D 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 288 G 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 289 W 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 290 I 0.001 0.001 0.002 0.993 0.004 0.001 291 K 0.001 0.001 0.002 0.989 0.007 0.002 292 A 0.001 0.001 0.001 0.968 0.014 0.016 293 H 0.001 0.001 0.001 0.491 0.035 0.471 294 Q 0.001 0.001 0.010 0.946 0.016 0.027 295 Q 0.001 0.001 0.026 0.941 0.025 0.008 296 Q 0.001 0.001 0.038 0.923 0.032 0.006 297 F 0.001 0.001 0.027 0.934 0.032 0.006 298 D 0.001 0.001 0.023 0.924 0.043 0.009 299 G 0.001 0.001 0.029 0.899 0.053 0.019 300 W 0.001 0.001 0.019 0.869 0.057 0.054 301 V 0.001 0.006 0.014 0.727 0.064 0.188 302 N 0.001 0.001 0.012 0.673 0.073 0.239 303 E 0.001 0.001 0.032 0.874 0.054 0.040 304 A 0.002 0.002 0.033 0.862 0.076 0.026 305 L 0.002 0.001 0.032 0.852 0.086 0.029 306 A 0.002 0.001 0.037 0.827 0.079 0.053 307 A 0.001 0.004 0.039 0.738 0.095 0.123 308 Q 0.002 0.003 0.019 0.311 0.117 0.548 309 K 0.001 0.001 0.001 0.006 0.026 0.967